MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 11717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_015184	GTTTT	2	10	487266	487275	0 %	80 %	20 %	0 %	325168825
9502	NC_015184	CAG	2	6	487342	487347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168825
9503	NC_015184	CCT	2	6	487374	487379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168825
9504	NC_015184	CGA	2	6	487477	487482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168825
9505	NC_015184	TGT	2	6	487521	487526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168825
9506	NC_015184	GCG	2	6	487563	487568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168825
9507	NC_015184	CA	3	6	487572	487577	50 %	0 %	0 %	50 %	325168825
9508	NC_015184	AGTCGT	2	12	487584	487595	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325168825
9509	NC_015184	CGGC	2	8	487634	487641	0 %	0 %	50 %	50 %	325168825
9510	NC_015184	AAC	2	6	487781	487786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168825
9511	NC_015184	GAC	2	6	487825	487830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168825
9512	NC_015184	AGC	2	6	487847	487852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168825
9513	NC_015184	ACC	2	6	487867	487872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168825
9514	NC_015184	G	6	6	487927	487932	0 %	0 %	100 %	0 %	325168825
9515	NC_015184	GACA	2	8	488035	488042	50 %	0 %	25 %	25 %	325168825
9516	NC_015184	ACA	2	6	488057	488062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168825
9517	NC_015184	CGCT	2	8	488066	488073	0 %	25 %	25 %	50 %	325168825
9518	NC_015184	GCA	2	6	488079	488084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168825
9519	NC_015184	TGC	2	6	488102	488107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168825
9520	NC_015184	GCA	2	6	488111	488116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168825
9521	NC_015184	GCA	2	6	488121	488126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168825
9522	NC_015184	TCG	2	6	488166	488171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168825
9523	NC_015184	CGA	2	6	488181	488186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168825
9524	NC_015184	CTG	2	6	488244	488249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168825
9525	NC_015184	TCA	2	6	488268	488273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168825
9526	NC_015184	CCAT	2	8	488287	488294	25 %	25 %	0 %	50 %	325168825
9527	NC_015184	GAGTGC	2	12	488314	488325	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325168825
9528	NC_015184	GCA	2	6	488436	488441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168825
9529	NC_015184	CAG	2	6	488488	488493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168825
9530	NC_015184	GAA	2	6	488512	488517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168825
9531	NC_015184	TCA	2	6	488552	488557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168825
9532	NC_015184	CGC	2	6	488586	488591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168825
9533	NC_015184	AGG	2	6	488634	488639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168825
9534	NC_015184	GAA	2	6	488644	488649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168825
9535	NC_015184	GAGC	2	8	488672	488679	25 %	0 %	50 %	25 %	325168825
9536	NC_015184	GTC	2	6	488683	488688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168825
9537	NC_015184	TTGG	2	8	488721	488728	0 %	50 %	50 %	0 %	325168825
9538	NC_015184	TGTA	2	8	488762	488769	25 %	50 %	25 %	0 %	325168825
9539	NC_015184	GCG	2	6	488851	488856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168825
9540	NC_015184	CGA	2	6	489114	489119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168825
9541	NC_015184	AAG	2	6	489220	489225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9542	NC_015184	GC	3	6	489243	489248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9543	NC_015184	GGC	2	6	489265	489270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168826
9544	NC_015184	ACG	2	6	489322	489327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168826
9545	NC_015184	AGC	2	6	489329	489334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168826
9546	NC_015184	GA	3	6	489356	489361	50 %	0 %	50 %	0 %	325168826
9547	NC_015184	TCG	2	6	489417	489422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168826
9548	NC_015184	TCGG	2	8	489445	489452	0 %	25 %	50 %	25 %	325168826
9549	NC_015184	GCC	3	9	489545	489553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168826
9550	NC_015184	CAGC	2	8	489586	489593	25 %	0 %	25 %	50 %	325168826
9551	NC_015184	GCG	2	6	489605	489610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168826
9552	NC_015184	CGT	3	9	489699	489707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168826
9553	NC_015184	GC	3	6	489762	489767	0 %	0 %	50 %	50 %	325168826
9554	NC_015184	GAT	3	9	489855	489863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168826
9555	NC_015184	TAT	2	6	489930	489935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9556	NC_015184	GTG	2	6	489939	489944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9557	NC_015184	TCA	2	6	489969	489974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9558	NC_015184	CAA	2	6	489987	489992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9559	NC_015184	GCC	2	6	489995	490000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9560	NC_015184	CCCG	2	8	490125	490132	0 %	0 %	25 %	75 %	325168827
9561	NC_015184	CCG	2	6	490151	490156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168827
9562	NC_015184	GCG	2	6	490176	490181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168827
9563	NC_015184	TGA	2	6	490188	490193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168827
9564	NC_015184	GCCT	2	8	490201	490208	0 %	25 %	25 %	50 %	325168827
9565	NC_015184	CG	3	6	490235	490240	0 %	0 %	50 %	50 %	325168827
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9569	NC_015184	TGG	2	6	490395	490400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168827
9570	NC_015184	GAC	2	6	490434	490439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168827
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9584	NC_015184	TCG	2	6	491237	491242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168827
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9588	NC_015184	CGAT	2	8	491468	491475	25 %	25 %	25 %	25 %	325168827
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9590	NC_015184	GTA	2	6	491540	491545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9591	NC_015184	TGA	2	6	491564	491569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9592	NC_015184	CG	3	6	491624	491629	0 %	0 %	50 %	50 %	325168828
9593	NC_015184	CG	4	8	491651	491658	0 %	0 %	50 %	50 %	325168828
9594	NC_015184	GTC	2	6	491669	491674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168828
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9599	NC_015184	GCGCG	2	10	491887	491896	0 %	0 %	60 %	40 %	325168828
9600	NC_015184	CTG	2	6	491901	491906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168828
9601	NC_015184	TGG	2	6	492043	492048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168828
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9605	NC_015184	AC	3	6	492216	492221	50 %	0 %	0 %	50 %	325168828
9606	NC_015184	GCCA	2	8	492422	492429	25 %	0 %	25 %	50 %	325168828
9607	NC_015184	TCT	2	6	492544	492549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9608	NC_015184	GTG	2	6	492603	492608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9609	NC_015184	T	6	6	492644	492649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9610	NC_015184	GC	3	6	492657	492662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9611	NC_015184	TCC	2	6	492666	492671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9612	NC_015184	CGA	2	6	492946	492951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168829
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9619	NC_015184	CA	3	6	493307	493312	50 %	0 %	0 %	50 %	325168829
9620	NC_015184	GGC	2	6	493319	493324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168829
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9622	NC_015184	GGAACC	2	12	493373	493384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168829
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9988	NC_015184	GAC	2	6	512553	512558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168847
9989	NC_015184	GAT	2	6	512577	512582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168847
9990	NC_015184	GAG	2	6	512674	512679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168847
9991	NC_015184	GCC	2	6	512682	512687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168847
9992	NC_015184	GAC	2	6	512700	512705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168847
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