MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 11717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_015184	TCGA	2	8	461583	461590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9002	NC_015184	GCT	2	6	461659	461664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9003	NC_015184	GTG	2	6	461684	461689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_015184	ATG	2	6	461837	461842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_015184	GTC	2	6	461870	461875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9006	NC_015184	GCG	2	6	461979	461984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_015184	GACG	2	8	462022	462029	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9008	NC_015184	TGA	2	6	462034	462039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_015184	CGGG	2	8	462081	462088	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9010	NC_015184	CAC	2	6	462259	462264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168799
9011	NC_015184	GAC	2	6	462466	462471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168799
9012	NC_015184	ATC	2	6	462473	462478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168799
9013	NC_015184	TCC	2	6	462527	462532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168799
9014	NC_015184	TGC	2	6	462561	462566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168799
9015	NC_015184	GCC	2	6	462682	462687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168799
9016	NC_015184	ATC	2	6	462738	462743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168799
9017	NC_015184	GCAG	2	8	462839	462846	25 %	0 %	50 %	25 %	325168799
9018	NC_015184	TTG	2	6	462870	462875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168799
9019	NC_015184	ACT	2	6	462891	462896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168799
9020	NC_015184	TCA	2	6	462918	462923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168799
9021	NC_015184	GCA	2	6	462977	462982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168799
9022	NC_015184	CGA	2	6	463051	463056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168799
9023	NC_015184	TCA	2	6	463104	463109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168799
9024	NC_015184	CCGCC	2	10	463147	463156	0 %	0 %	20 %	80 %	325168799
9025	NC_015184	AGA	2	6	463169	463174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_015184	GAA	2	6	463186	463191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168800
9027	NC_015184	CCT	2	6	463230	463235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168800
9028	NC_015184	AG	3	6	463302	463307	50 %	0 %	50 %	0 %	325168800
9029	NC_015184	GTC	2	6	463484	463489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168800
9030	NC_015184	TCG	2	6	463518	463523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168800
9031	NC_015184	CAG	2	6	463544	463549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168800
9032	NC_015184	AAC	2	6	463554	463559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168800
9033	NC_015184	CGATGA	2	12	463584	463595	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325168800
9034	NC_015184	CT	3	6	463602	463607	0 %	50 %	0 %	50 %	325168800
9035	NC_015184	ATC	2	6	463703	463708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168800
9036	NC_015184	CGA	2	6	463714	463719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168800
9037	NC_015184	CCG	2	6	463806	463811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168800
9038	NC_015184	GGC	2	6	463878	463883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168800
9039	NC_015184	TCT	2	6	463969	463974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168800
9040	NC_015184	GGA	2	6	464044	464049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168800
9041	NC_015184	C	6	6	464127	464132	0 %	0 %	0 %	100 %	325168800
9042	NC_015184	TCG	2	6	464137	464142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168800
9043	NC_015184	AG	3	6	464195	464200	50 %	0 %	50 %	0 %	325168800
9044	NC_015184	T	6	6	464213	464218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_015184	CGC	2	6	464249	464254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9046	NC_015184	AC	3	6	464271	464276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9047	NC_015184	ATC	2	6	464316	464321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9048	NC_015184	CTG	2	6	464399	464404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168801
9049	NC_015184	AAC	2	6	464482	464487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168801
9050	NC_015184	ACG	2	6	464515	464520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168801
9051	NC_015184	A	6	6	464537	464542	100 %	0 %	0 %	0 %	325168801
9052	NC_015184	TCAG	2	8	464550	464557	25 %	25 %	25 %	25 %	325168801
9053	NC_015184	AGC	2	6	464576	464581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168801
9054	NC_015184	GTG	2	6	464606	464611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168801
9055	NC_015184	AGC	2	6	464622	464627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168801
9056	NC_015184	AAG	2	6	464640	464645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168801
9057	NC_015184	GTA	2	6	464816	464821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_015184	GACA	2	8	464848	464855	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9059	NC_015184	CGG	2	6	464887	464892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168802
9060	NC_015184	GAC	2	6	464918	464923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168802
9061	NC_015184	AGC	2	6	464926	464931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168802
9062	NC_015184	GCCC	2	8	465045	465052	0 %	0 %	25 %	75 %	325168802
9063	NC_015184	GGA	2	6	465053	465058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168802
9064	NC_015184	CTGAA	2	10	465138	465147	40 %	20 %	20 %	20 %	325168802
9065	NC_015184	GCA	2	6	465209	465214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168802
9066	NC_015184	GAT	2	6	465328	465333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168802
9067	NC_015184	AGA	2	6	465384	465389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168802
9068	NC_015184	CCA	2	6	465497	465502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168803
9069	NC_015184	GCG	2	6	465531	465536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168803
9070	NC_015184	GAT	2	6	465639	465644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168803
9071	NC_015184	CGA	2	6	465713	465718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168803
9072	NC_015184	GCG	2	6	465733	465738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168803
9073	NC_015184	G	6	6	465743	465748	0 %	0 %	100 %	0 %	325168803
9074	NC_015184	GGC	2	6	465794	465799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168803
9075	NC_015184	GCG	2	6	465822	465827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168803
9076	NC_015184	GCA	2	6	465840	465845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168803
9077	NC_015184	CTC	2	6	465903	465908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168803
9078	NC_015184	TGA	2	6	465923	465928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168803
9079	NC_015184	CCG	3	9	465998	466006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168803
9080	NC_015184	GGC	2	6	466068	466073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168803
9081	NC_015184	CGG	2	6	466132	466137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168803
9082	NC_015184	TTG	2	6	466159	466164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168803
9083	NC_015184	TCC	2	6	466209	466214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9084	NC_015184	CGG	2	6	466255	466260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168804
9085	NC_015184	T	7	7	466324	466330	0 %	100 %	0 %	0 %	325168804
9086	NC_015184	GCC	2	6	466334	466339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168804
9087	NC_015184	GAA	2	6	466439	466444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168804
9088	NC_015184	AAG	2	6	466526	466531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168804
9089	NC_015184	CGA	2	6	466558	466563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168804
9090	NC_015184	GCA	2	6	466666	466671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168804
9091	NC_015184	TTCGG	2	10	466674	466683	0 %	40 %	40 %	20 %	325168804
9092	NC_015184	GTG	2	6	466707	466712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168804
9093	NC_015184	GCC	2	6	466751	466756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168804
9094	NC_015184	GGAT	2	8	466797	466804	25 %	25 %	50 %	0 %	325168804
9095	NC_015184	CCA	2	6	466810	466815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168804
9096	NC_015184	GAT	2	6	466850	466855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168804
9097	NC_015184	CGA	2	6	466945	466950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168804
9098	NC_015184	GCG	2	6	467014	467019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168804
9099	NC_015184	ATG	2	6	467022	467027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168804
9100	NC_015184	GCC	2	6	467119	467124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168804
9101	NC_015184	ATC	2	6	467160	467165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168804
9102	NC_015184	GC	3	6	467245	467250	0 %	0 %	50 %	50 %	325168805
9103	NC_015184	TCGCG	2	10	467253	467262	0 %	20 %	40 %	40 %	325168805
9104	NC_015184	TGCC	2	8	467279	467286	0 %	25 %	25 %	50 %	325168805
9105	NC_015184	GCG	2	6	467330	467335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168805
9106	NC_015184	GGT	2	6	467430	467435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168805
9107	NC_015184	GC	4	8	467523	467530	0 %	0 %	50 %	50 %	325168805
9108	NC_015184	GC	3	6	467592	467597	0 %	0 %	50 %	50 %	325168805
9109	NC_015184	GC	3	6	467628	467633	0 %	0 %	50 %	50 %	325168805
9110	NC_015184	GC	3	6	467655	467660	0 %	0 %	50 %	50 %	325168805
9111	NC_015184	GGC	2	6	467776	467781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168805
9112	NC_015184	TCC	2	6	467829	467834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168805
9113	NC_015184	GTG	2	6	467846	467851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168805
9114	NC_015184	CGT	2	6	467884	467889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168805
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9117	NC_015184	CG	3	6	468051	468056	0 %	0 %	50 %	50 %	325168805
9118	NC_015184	GCG	2	6	468146	468151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168805
9119	NC_015184	GCC	2	6	468178	468183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168805
9120	NC_015184	CAGC	2	8	468199	468206	25 %	0 %	25 %	50 %	325168805
9121	NC_015184	CAGC	2	8	468256	468263	25 %	0 %	25 %	50 %	325168805
9122	NC_015184	AGGC	2	8	468295	468302	25 %	0 %	50 %	25 %	325168805
9123	NC_015184	CGG	2	6	468474	468479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168805
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9233	NC_015184	GGGC	2	8	473281	473288	0 %	0 %	75 %	25 %	325168810
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9237	NC_015184	GAA	2	6	473483	473488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168810
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9240	NC_015184	CAG	2	6	473598	473603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168810
9241	NC_015184	GGCGCT	2	12	473621	473632	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325168810
9242	NC_015184	GCT	2	6	473642	473647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168810
9243	NC_015184	CGA	2	6	473654	473659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168810
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9245	NC_015184	GC	3	6	473720	473725	0 %	0 %	50 %	50 %	325168810
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9369	NC_015184	ACG	2	6	479780	479785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168815
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9478	NC_015184	CTCG	2	8	485886	485893	0 %	25 %	25 %	50 %	325168822
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9483	NC_015184	GGGA	2	8	486432	486439	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9484	NC_015184	CGAT	2	8	486488	486495	25 %	25 %	25 %	25 %	325168824
9485	NC_015184	CGA	2	6	486576	486581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168824
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9487	NC_015184	GTC	2	6	486650	486655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168824
9488	NC_015184	CGT	2	6	486693	486698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168824
9489	NC_015184	CGG	2	6	486710	486715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168824
9490	NC_015184	AGT	2	6	486783	486788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168824
9491	NC_015184	CTTGCC	2	12	486847	486858	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325168824
9492	NC_015184	CGAGG	2	10	486874	486883	20 %	0 %	60 %	20 %	325168824
9493	NC_015184	CCT	2	6	486987	486992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168824
9494	NC_015184	GA	3	6	487046	487051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9495	NC_015184	CT	3	6	487057	487062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9496	NC_015184	GAT	2	6	487072	487077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9497	NC_015184	GTT	3	9	487087	487095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9498	NC_015184	GCC	2	6	487165	487170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168825
9499	NC_015184	AGG	2	6	487199	487204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168825
9500	NC_015184	TCGTCA	2	12	487208	487219	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325168825

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