MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_015183	CCTT	2	8	2272073	2272080	0 %	50 %	0 %	50 %	325293704
49002	NC_015183	TTTTTA	2	12	2272196	2272207	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49003	NC_015183	GTA	2	6	2272276	2272281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293705
49004	NC_015183	ACC	2	6	2272282	2272287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293705
49005	NC_015183	CGA	2	6	2272290	2272295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293705
49006	NC_015183	AAC	2	6	2272351	2272356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293705
49007	NC_015183	GAG	2	6	2272583	2272588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293705
49008	NC_015183	ATG	2	6	2272589	2272594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293705
49009	NC_015183	TAA	2	6	2272649	2272654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325293705
49010	NC_015183	AGG	2	6	2272661	2272666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293705
49011	NC_015183	AGA	3	9	2272800	2272808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293705
49012	NC_015183	GTT	2	6	2272813	2272818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293705
49013	NC_015183	GTC	2	6	2272819	2272824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293705
49014	NC_015183	CCG	2	6	2272832	2272837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293705
49015	NC_015183	GTA	2	6	2272939	2272944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293705
49016	NC_015183	CGC	2	6	2272953	2272958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293705
49017	NC_015183	CTG	2	6	2272999	2273004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293705
49018	NC_015183	TCGA	2	8	2273042	2273049	25 %	25 %	25 %	25 %	325293705
49019	NC_015183	TCG	3	9	2273117	2273125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293705
49020	NC_015183	GCT	2	6	2273163	2273168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293705
49021	NC_015183	TTG	2	6	2273177	2273182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293705
49022	NC_015183	GC	3	6	2273197	2273202	0 %	0 %	50 %	50 %	325293705
49023	NC_015183	AGC	2	6	2273272	2273277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293705
49024	NC_015183	GCC	2	6	2273291	2273296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293705
49025	NC_015183	AAT	2	6	2273305	2273310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325293705
49026	NC_015183	CT	3	6	2273323	2273328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49027	NC_015183	TTG	2	6	2273354	2273359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293706
49028	NC_015183	GAA	2	6	2273390	2273395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293706
49029	NC_015183	CTC	2	6	2273447	2273452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293706
49030	NC_015183	AT	3	6	2273528	2273533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49031	NC_015183	TCTTCG	2	12	2273620	2273631	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325293707
49032	NC_015183	TGC	2	6	2273644	2273649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293707
49033	NC_015183	GC	3	6	2273648	2273653	0 %	0 %	50 %	50 %	325293707
49034	NC_015183	GAG	2	6	2273694	2273699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293707
49035	NC_015183	GCC	4	12	2273718	2273729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293707
49036	NC_015183	CGG	2	6	2273746	2273751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293707
49037	NC_015183	AG	3	6	2273803	2273808	50 %	0 %	50 %	0 %	325293707
49038	NC_015183	GTG	2	6	2273815	2273820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293707
49039	NC_015183	GCG	2	6	2273923	2273928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293707
49040	NC_015183	TCA	2	6	2274085	2274090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293707
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49042	NC_015183	TCCA	2	8	2274129	2274136	25 %	25 %	0 %	50 %	325293707
49043	NC_015183	GC	3	6	2274152	2274157	0 %	0 %	50 %	50 %	325293707
49044	NC_015183	TGG	2	6	2274163	2274168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293707
49045	NC_015183	GCC	2	6	2274245	2274250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293707
49046	NC_015183	GC	3	6	2274253	2274258	0 %	0 %	50 %	50 %	325293707
49047	NC_015183	TCA	2	6	2274319	2274324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293707
49048	NC_015183	GTG	2	6	2274336	2274341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293707
49049	NC_015183	CAG	2	6	2274417	2274422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293707
49050	NC_015183	GTC	2	6	2274468	2274473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293707
49051	NC_015183	CAT	2	6	2274485	2274490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293707
49052	NC_015183	CAC	2	6	2274491	2274496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293707
49053	NC_015183	GCC	2	6	2274512	2274517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293707
49054	NC_015183	GCT	2	6	2274527	2274532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293707
49055	NC_015183	TA	3	6	2274608	2274613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49056	NC_015183	GTCG	2	8	2274679	2274686	0 %	25 %	50 %	25 %	325293708
49057	NC_015183	AGA	2	6	2274709	2274714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293708
49058	NC_015183	GCC	2	6	2274733	2274738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293708
49059	NC_015183	TCG	2	6	2274774	2274779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293708
49060	NC_015183	CTCG	2	8	2274919	2274926	0 %	25 %	25 %	50 %	325293708
49061	NC_015183	CAG	2	6	2274936	2274941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293708
49062	NC_015183	CCAT	2	8	2274948	2274955	25 %	25 %	0 %	50 %	325293708
49063	NC_015183	CCG	2	6	2274966	2274971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293708
49064	NC_015183	GCGCC	2	10	2274988	2274997	0 %	0 %	40 %	60 %	325293708
49065	NC_015183	ATC	2	6	2275011	2275016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293708
49066	NC_015183	TGC	2	6	2275101	2275106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293708
49067	NC_015183	CGT	2	6	2275173	2275178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293709
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49071	NC_015183	CGA	2	6	2275380	2275385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293709
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49082	NC_015183	CGGC	2	8	2275943	2275950	0 %	0 %	50 %	50 %	325293710
49083	NC_015183	GTC	2	6	2276032	2276037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293710
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49086	NC_015183	AAAT	2	8	2276210	2276217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49087	NC_015183	GAT	2	6	2276221	2276226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49088	NC_015183	TAA	2	6	2276239	2276244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49089	NC_015183	AAAAG	2	10	2276300	2276309	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49090	NC_015183	ATT	2	6	2276314	2276319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49091	NC_015183	TAC	2	6	2276437	2276442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49092	NC_015183	GAA	2	6	2276466	2276471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49093	NC_015183	ACA	2	6	2276486	2276491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49094	NC_015183	CAG	2	6	2276520	2276525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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49096	NC_015183	GAAA	2	8	2276607	2276614	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49097	NC_015183	AACC	2	8	2276626	2276633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49098	NC_015183	GATTCC	2	12	2276691	2276702	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49099	NC_015183	GGC	2	6	2276940	2276945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49100	NC_015183	TA	3	6	2276981	2276986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49101	NC_015183	ATT	2	6	2277043	2277048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325293711
49102	NC_015183	GCG	2	6	2277112	2277117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293711
49103	NC_015183	CCG	2	6	2277119	2277124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293711
49104	NC_015183	AGCG	2	8	2277132	2277139	25 %	0 %	50 %	25 %	325293711
49105	NC_015183	GC	3	6	2277148	2277153	0 %	0 %	50 %	50 %	325293711
49106	NC_015183	CGA	2	6	2277186	2277191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293711
49107	NC_015183	GCA	2	6	2277200	2277205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293711
49108	NC_015183	CTG	2	6	2277220	2277225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293711
49109	NC_015183	CGGCG	2	10	2277270	2277279	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49110	NC_015183	CCT	2	6	2277287	2277292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49111	NC_015183	GCAA	2	8	2277306	2277313	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49112	NC_015183	ATG	2	6	2277397	2277402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49113	NC_015183	GTC	2	6	2277433	2277438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293712
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49115	NC_015183	GC	3	6	2277495	2277500	0 %	0 %	50 %	50 %	325293712
49116	NC_015183	GCC	2	6	2277529	2277534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293712
49117	NC_015183	CTG	2	6	2277565	2277570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293712
49118	NC_015183	CCT	2	6	2277624	2277629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293712
49119	NC_015183	TGGC	2	8	2277641	2277648	0 %	25 %	50 %	25 %	325293712
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49122	NC_015183	CTG	2	6	2277721	2277726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293712
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49171	NC_015183	GCAT	2	8	2279752	2279759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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49217	NC_015183	CCCG	2	8	2281272	2281279	0 %	0 %	25 %	75 %	325293714
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49221	NC_015183	GCCGC	2	10	2281444	2281453	0 %	0 %	40 %	60 %	325293715
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49223	NC_015183	AAGA	2	8	2281525	2281532	75 %	0 %	25 %	0 %	325293715
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49228	NC_015183	GCA	2	6	2281773	2281778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293715
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49231	NC_015183	TAA	2	6	2281901	2281906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325293715
49232	NC_015183	CGA	2	6	2281911	2281916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293715
49233	NC_015183	CGT	2	6	2281948	2281953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293715
49234	NC_015183	CGG	2	6	2282046	2282051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293715
49235	NC_015183	CGC	2	6	2282068	2282073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293715
49236	NC_015183	GCC	2	6	2282089	2282094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293715
49237	NC_015183	GGA	2	6	2282102	2282107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293715
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49241	NC_015183	GTC	2	6	2282279	2282284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293716
49242	NC_015183	GCC	2	6	2282294	2282299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293716
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49257	NC_015183	TC	3	6	2282948	2282953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49258	NC_015183	GCGAA	2	10	2282969	2282978	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
49259	NC_015183	GC	3	6	2282994	2282999	0 %	0 %	50 %	50 %	325293717
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49261	NC_015183	CG	3	6	2283108	2283113	0 %	0 %	50 %	50 %	325293717
49262	NC_015183	TCG	2	6	2283224	2283229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293717
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49264	NC_015183	GC	5	10	2283258	2283267	0 %	0 %	50 %	50 %	325293717
49265	NC_015183	GC	3	6	2283275	2283280	0 %	0 %	50 %	50 %	325293717
49266	NC_015183	TGC	3	9	2283281	2283289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293717
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49270	NC_015183	CGGTG	2	10	2283429	2283438	0 %	20 %	60 %	20 %	325293717
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49274	NC_015183	AAC	2	6	2283835	2283840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49275	NC_015183	CG	3	6	2283882	2283887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49276	NC_015183	ATC	2	6	2283936	2283941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293718
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49300	NC_015183	GAG	2	6	2285160	2285165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293718
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49304	NC_015183	T	6	6	2285401	2285406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49305	NC_015183	ATA	2	6	2285415	2285420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49306	NC_015183	GGA	2	6	2285424	2285429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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49308	NC_015183	TAT	2	6	2285564	2285569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49309	NC_015183	TGA	2	6	2285652	2285657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49310	NC_015183	AAC	2	6	2285683	2285688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49311	NC_015183	AT	3	6	2285694	2285699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49312	NC_015183	TTG	2	6	2285707	2285712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49313	NC_015183	AC	3	6	2285761	2285766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49314	NC_015183	CAA	2	6	2285782	2285787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293719
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49322	NC_015183	GC	3	6	2286145	2286150	0 %	0 %	50 %	50 %	325293719
49323	NC_015183	CGG	2	6	2286217	2286222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293719
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49331	NC_015183	GAT	2	6	2286701	2286706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293719
49332	NC_015183	CAT	2	6	2286785	2286790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293719
49333	NC_015183	TCA	2	6	2286894	2286899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293719
49334	NC_015183	GAA	2	6	2286929	2286934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49335	NC_015183	CCA	2	6	2287049	2287054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293720
49336	NC_015183	CGA	2	6	2287118	2287123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293720
49337	NC_015183	GCGA	2	8	2287151	2287158	25 %	0 %	50 %	25 %	325293720
49338	NC_015183	CAT	2	6	2287227	2287232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293720
49339	NC_015183	GGCA	2	8	2287254	2287261	25 %	0 %	50 %	25 %	325293720
49340	NC_015183	CAG	2	6	2287320	2287325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293720
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49342	NC_015183	TTC	2	6	2287444	2287449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293720
49343	NC_015183	CGC	2	6	2287487	2287492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293720
49344	NC_015183	GGGC	2	8	2287500	2287507	0 %	0 %	75 %	25 %	325293720
49345	NC_015183	GCC	3	9	2287584	2287592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293720
49346	NC_015183	CAT	2	6	2287596	2287601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293720
49347	NC_015183	GCA	2	6	2287616	2287621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293720
49348	NC_015183	CCG	2	6	2287672	2287677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293720
49349	NC_015183	GC	3	6	2287740	2287745	0 %	0 %	50 %	50 %	325293720
49350	NC_015183	GGC	2	6	2287830	2287835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293720
49351	NC_015183	CGGC	2	8	2287858	2287865	0 %	0 %	50 %	50 %	325293720
49352	NC_015183	GCCC	2	8	2287910	2287917	0 %	0 %	25 %	75 %	325293720
49353	NC_015183	GATT	2	8	2287976	2287983	25 %	50 %	25 %	0 %	325293720
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49377	NC_015183	AACAT	2	10	2289233	2289242	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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49462	NC_015183	GGC	2	6	2293186	2293191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293727
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49469	NC_015183	CTG	3	9	2293563	2293571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293727
49470	NC_015183	CGC	2	6	2293653	2293658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293727
49471	NC_015183	CTC	2	6	2293680	2293685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293727
49472	NC_015183	GCT	2	6	2293697	2293702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293727
49473	NC_015183	CGG	2	6	2293786	2293791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293727
49474	NC_015183	CTT	2	6	2293848	2293853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293727
49475	NC_015183	ATC	2	6	2293857	2293862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293727
49476	NC_015183	GCT	2	6	2293875	2293880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293727
49477	NC_015183	GTC	2	6	2293888	2293893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293727
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49481	NC_015183	GC	3	6	2294036	2294041	0 %	0 %	50 %	50 %	325293727
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49488	NC_015183	CGG	2	6	2294307	2294312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293727
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49491	NC_015183	TCG	2	6	2294404	2294409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293727
49492	NC_015183	AT	3	6	2294425	2294430	50 %	50 %	0 %	0 %	325293727
49493	NC_015183	GCC	2	6	2294518	2294523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49494	NC_015183	CCTCAT	2	12	2294567	2294578	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
49495	NC_015183	CCA	2	6	2294579	2294584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49496	NC_015183	CAG	2	6	2294592	2294597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49497	NC_015183	GGC	2	6	2294613	2294618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293728
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49499	NC_015183	A	6	6	2294708	2294713	100 %	0 %	0 %	0 %	325293728
49500	NC_015183	TCG	2	6	2294736	2294741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293728

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