MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_015183	GCG	2	6	2249616	2249621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293685
48502	NC_015183	TCG	2	6	2249708	2249713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293685
48503	NC_015183	TCC	2	6	2249864	2249869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293685
48504	NC_015183	CCAG	2	8	2249889	2249896	25 %	0 %	25 %	50 %	325293685
48505	NC_015183	TGGC	2	8	2249906	2249913	0 %	25 %	50 %	25 %	325293685
48506	NC_015183	CTTC	2	8	2249928	2249935	0 %	50 %	0 %	50 %	325293685
48507	NC_015183	GC	3	6	2249959	2249964	0 %	0 %	50 %	50 %	325293685
48508	NC_015183	GCC	2	6	2250027	2250032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293685
48509	NC_015183	GC	3	6	2250102	2250107	0 %	0 %	50 %	50 %	325293685
48510	NC_015183	CGA	2	6	2250108	2250113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293685
48511	NC_015183	CAG	2	6	2250121	2250126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293685
48512	NC_015183	CGC	2	6	2250165	2250170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293685
48513	NC_015183	TGA	2	6	2250183	2250188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293685
48514	NC_015183	TGCG	2	8	2250204	2250211	0 %	25 %	50 %	25 %	325293685
48515	NC_015183	CCA	2	6	2250252	2250257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293685
48516	NC_015183	AAC	2	6	2250343	2250348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48517	NC_015183	ACACG	2	10	2250379	2250388	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
48518	NC_015183	ACGG	2	8	2250406	2250413	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48519	NC_015183	T	6	6	2250464	2250469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48520	NC_015183	AGC	2	6	2250613	2250618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293686
48521	NC_015183	GCACG	2	10	2250635	2250644	20 %	0 %	40 %	40 %	325293686
48522	NC_015183	GCT	2	6	2250657	2250662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293686
48523	NC_015183	CCGC	2	8	2250776	2250783	0 %	0 %	25 %	75 %	325293686
48524	NC_015183	GCG	2	6	2250803	2250808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293686
48525	NC_015183	CG	3	6	2250807	2250812	0 %	0 %	50 %	50 %	325293686
48526	NC_015183	CAC	2	6	2250831	2250836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293686
48527	NC_015183	A	6	6	2250847	2250852	100 %	0 %	0 %	0 %	325293686
48528	NC_015183	CTA	2	6	2250908	2250913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293686
48529	NC_015183	TGCC	2	8	2250940	2250947	0 %	25 %	25 %	50 %	325293686
48530	NC_015183	CAA	2	6	2250969	2250974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293686
48531	NC_015183	GATC	2	8	2251082	2251089	25 %	25 %	25 %	25 %	325293686
48532	NC_015183	CGG	2	6	2251095	2251100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293686
48533	NC_015183	GCC	2	6	2251147	2251152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293686
48534	NC_015183	ATGG	2	8	2251185	2251192	25 %	25 %	50 %	0 %	325293686
48535	NC_015183	CGC	2	6	2251215	2251220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48536	NC_015183	ACG	2	6	2251281	2251286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48537	NC_015183	CA	3	6	2251379	2251384	50 %	0 %	0 %	50 %	325293687
48538	NC_015183	GCA	2	6	2251396	2251401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293687
48539	NC_015183	GCC	2	6	2251440	2251445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293687
48540	NC_015183	CCA	2	6	2251484	2251489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293687
48541	NC_015183	CAC	2	6	2251563	2251568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293687
48542	NC_015183	GCAT	2	8	2251572	2251579	25 %	25 %	25 %	25 %	325293687
48543	NC_015183	TCG	2	6	2251603	2251608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293687
48544	NC_015183	GCA	2	6	2251726	2251731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293687
48545	NC_015183	GGC	2	6	2251740	2251745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293687
48546	NC_015183	CGA	2	6	2251832	2251837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293687
48547	NC_015183	TCG	2	6	2251858	2251863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293687
48548	NC_015183	CGA	2	6	2251866	2251871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293687
48549	NC_015183	CCGC	2	8	2251877	2251884	0 %	0 %	25 %	75 %	325293687
48550	NC_015183	CGAG	2	8	2251898	2251905	25 %	0 %	50 %	25 %	325293687
48551	NC_015183	ACG	2	6	2251906	2251911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293687
48552	NC_015183	GGA	2	6	2251949	2251954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293687
48553	NC_015183	ATC	2	6	2251972	2251977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293687
48554	NC_015183	CAGC	2	8	2251997	2252004	25 %	0 %	25 %	50 %	325293687
48555	NC_015183	CGC	2	6	2252031	2252036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293687
48556	NC_015183	TGC	2	6	2252144	2252149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293687
48557	NC_015183	CGG	2	6	2252198	2252203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293687
48558	NC_015183	CTT	2	6	2252274	2252279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293687
48559	NC_015183	CGC	2	6	2252327	2252332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293687
48560	NC_015183	CAG	3	9	2252361	2252369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293687
48561	NC_015183	CT	3	6	2252386	2252391	0 %	50 %	0 %	50 %	325293687
48562	NC_015183	GCC	2	6	2252421	2252426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293687
48563	NC_015183	CGA	2	6	2252429	2252434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293687
48564	NC_015183	GAG	2	6	2252436	2252441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293687
48565	NC_015183	CCGC	2	8	2252572	2252579	0 %	0 %	25 %	75 %	325293688
48566	NC_015183	GA	3	6	2252717	2252722	50 %	0 %	50 %	0 %	325293688
48567	NC_015183	CGG	2	6	2252930	2252935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293688
48568	NC_015183	GAC	2	6	2252965	2252970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293688
48569	NC_015183	GTG	2	6	2252986	2252991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293688
48570	NC_015183	GCG	2	6	2252993	2252998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293688
48571	NC_015183	G	6	6	2253129	2253134	0 %	0 %	100 %	0 %	325293688
48572	NC_015183	GCC	2	6	2253151	2253156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293688
48573	NC_015183	CCG	2	6	2253168	2253173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293688
48574	NC_015183	GCC	2	6	2253184	2253189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293688
48575	NC_015183	CAG	2	6	2253276	2253281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48576	NC_015183	ATC	2	6	2253394	2253399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293689
48577	NC_015183	CTG	2	6	2253405	2253410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293689
48578	NC_015183	GAT	2	6	2253457	2253462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293689
48579	NC_015183	GCCG	2	8	2253471	2253478	0 %	0 %	50 %	50 %	325293689
48580	NC_015183	GCC	2	6	2253485	2253490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293689
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48583	NC_015183	CGG	2	6	2253564	2253569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293689
48584	NC_015183	CTC	2	6	2253577	2253582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293689
48585	NC_015183	CTT	2	6	2253598	2253603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293689
48586	NC_015183	CGA	2	6	2253612	2253617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293689
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48588	NC_015183	CGT	2	6	2253672	2253677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293689
48589	NC_015183	CCA	2	6	2253687	2253692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293689
48590	NC_015183	CGT	2	6	2253730	2253735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293689
48591	NC_015183	CGC	2	6	2253752	2253757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293689
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48593	NC_015183	GC	3	6	2253836	2253841	0 %	0 %	50 %	50 %	325293689
48594	NC_015183	CAC	2	6	2253859	2253864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293689
48595	NC_015183	CGCGCC	2	12	2253890	2253901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293689
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48598	NC_015183	ATG	2	6	2254067	2254072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293689
48599	NC_015183	CCT	2	6	2254101	2254106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293689
48600	NC_015183	GCA	2	6	2254107	2254112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293689
48601	NC_015183	GCG	2	6	2254186	2254191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293689
48602	NC_015183	CGT	2	6	2254197	2254202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293689
48603	NC_015183	TCG	2	6	2254205	2254210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293689
48604	NC_015183	AAG	2	6	2254246	2254251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293689
48605	NC_015183	CGC	2	6	2254262	2254267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293689
48606	NC_015183	CAC	2	6	2254327	2254332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293689
48607	NC_015183	GACC	2	8	2254362	2254369	25 %	0 %	25 %	50 %	325293689
48608	NC_015183	GCC	2	6	2254401	2254406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293689
48609	NC_015183	AATGCC	2	12	2254468	2254479	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325293689
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48612	NC_015183	GATC	2	8	2254650	2254657	25 %	25 %	25 %	25 %	325293689
48613	NC_015183	GAC	2	6	2254660	2254665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293689
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48616	NC_015183	CCG	2	6	2254728	2254733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293689
48617	NC_015183	TGA	2	6	2254800	2254805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293689
48618	NC_015183	GAT	2	6	2254834	2254839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293689
48619	NC_015183	CG	3	6	2254978	2254983	0 %	0 %	50 %	50 %	325293689
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48624	NC_015183	CT	3	6	2255146	2255151	0 %	50 %	0 %	50 %	325293689
48625	NC_015183	GCC	2	6	2255171	2255176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293689
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48632	NC_015183	CCG	2	6	2255459	2255464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293689
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48634	NC_015183	CG	3	6	2255517	2255522	0 %	0 %	50 %	50 %	325293689
48635	NC_015183	AGC	2	6	2255543	2255548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293689
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48663	NC_015183	CGT	2	6	2257022	2257027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48664	NC_015183	T	6	6	2257087	2257092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48665	NC_015183	ATT	2	6	2257100	2257105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48666	NC_015183	GCCT	2	8	2257138	2257145	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48667	NC_015183	GCA	2	6	2257261	2257266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48668	NC_015183	AGA	2	6	2257315	2257320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48669	NC_015183	CCG	2	6	2257401	2257406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48670	NC_015183	CAG	2	6	2257409	2257414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48671	NC_015183	CT	3	6	2257486	2257491	0 %	50 %	0 %	50 %	325293690
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48674	NC_015183	GCA	2	6	2257621	2257626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293690
48675	NC_015183	CAT	2	6	2257638	2257643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293690
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48682	NC_015183	TGG	2	6	2257847	2257852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293690
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48702	NC_015183	CGGC	2	8	2258801	2258808	0 %	0 %	50 %	50 %	325293690
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48705	NC_015183	CGG	2	6	2258841	2258846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293690
48706	NC_015183	CTG	2	6	2258870	2258875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293690
48707	NC_015183	GC	3	6	2258895	2258900	0 %	0 %	50 %	50 %	325293690
48708	NC_015183	TAACT	2	10	2258942	2258951	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48709	NC_015183	ACCC	2	8	2259107	2259114	25 %	0 %	0 %	75 %	325293691
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48711	NC_015183	CA	3	6	2259273	2259278	50 %	0 %	0 %	50 %	325293691
48712	NC_015183	GCA	2	6	2259343	2259348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293691
48713	NC_015183	CGG	2	6	2259376	2259381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293691
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48716	NC_015183	GACA	2	8	2259520	2259527	50 %	0 %	25 %	25 %	325293691
48717	NC_015183	GAT	2	6	2259584	2259589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293691
48718	NC_015183	GAA	2	6	2259601	2259606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293691
48719	NC_015183	CGT	2	6	2259620	2259625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293691
48720	NC_015183	TGCTC	2	10	2259658	2259667	0 %	40 %	20 %	40 %	325293691
48721	NC_015183	GAA	2	6	2259719	2259724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293691
48722	NC_015183	GCC	2	6	2259727	2259732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293691
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48727	NC_015183	AGC	3	9	2259900	2259908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293691
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48729	NC_015183	GCC	2	6	2260311	2260316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293692
48730	NC_015183	GCC	2	6	2260333	2260338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293692
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48732	NC_015183	TCG	2	6	2260349	2260354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293692
48733	NC_015183	AGC	2	6	2260420	2260425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293692
48734	NC_015183	ATG	2	6	2260432	2260437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293692
48735	NC_015183	GA	3	6	2260471	2260476	50 %	0 %	50 %	0 %	325293692
48736	NC_015183	GTG	2	6	2260514	2260519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48737	NC_015183	CCA	2	6	2260645	2260650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48738	NC_015183	A	6	6	2260670	2260675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48739	NC_015183	T	6	6	2260696	2260701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48740	NC_015183	GCA	2	6	2260743	2260748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293693
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48743	NC_015183	GCC	2	6	2260888	2260893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293693
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48752	NC_015183	CGC	2	6	2261254	2261259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293693
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48783	NC_015183	GC	3	6	2262449	2262454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48784	NC_015183	ATCCCC	2	12	2262492	2262503	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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48787	NC_015183	CCA	2	6	2262624	2262629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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48791	NC_015183	A	6	6	2262728	2262733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48792	NC_015183	TTGCA	2	10	2262760	2262769	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48793	NC_015183	A	6	6	2262792	2262797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48794	NC_015183	CGC	2	6	2262845	2262850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293695
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48848	NC_015183	GA	3	6	2265097	2265102	50 %	0 %	50 %	0 %	325293696
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48852	NC_015183	CGC	2	6	2265500	2265505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293697
48853	NC_015183	CGAC	2	8	2265626	2265633	25 %	0 %	25 %	50 %	325293697
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48968	NC_015183	CGA	2	6	2270527	2270532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293703
48969	NC_015183	CGACC	2	10	2270576	2270585	20 %	0 %	20 %	60 %	325293703
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48971	NC_015183	TTC	2	6	2270633	2270638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293704
48972	NC_015183	GC	3	6	2270657	2270662	0 %	0 %	50 %	50 %	325293704
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48974	NC_015183	CGA	2	6	2270703	2270708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293704
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48979	NC_015183	GCC	2	6	2270929	2270934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293704
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48987	NC_015183	CG	3	6	2271405	2271410	0 %	0 %	50 %	50 %	325293704
48988	NC_015183	TCT	2	6	2271422	2271427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293704
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48998	NC_015183	CGC	2	6	2271825	2271830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293704
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