MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_015183	CAG	2	6	2226837	2226842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293660
48002	NC_015183	AAC	2	6	2226907	2226912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293660
48003	NC_015183	AGA	2	6	2226938	2226943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293660
48004	NC_015183	GAA	2	6	2227083	2227088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293660
48005	NC_015183	GAAA	2	8	2227103	2227110	75 %	0 %	25 %	0 %	325293660
48006	NC_015183	CG	3	6	2227134	2227139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48007	NC_015183	ATT	2	6	2227153	2227158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48008	NC_015183	GAA	2	6	2227210	2227215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48009	NC_015183	CGA	2	6	2227217	2227222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48010	NC_015183	CGG	2	6	2227247	2227252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48011	NC_015183	GCC	2	6	2227319	2227324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293661
48012	NC_015183	GCA	2	6	2227343	2227348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293661
48013	NC_015183	CGG	2	6	2227430	2227435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293661
48014	NC_015183	CGA	2	6	2227445	2227450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293661
48015	NC_015183	TCA	2	6	2227475	2227480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293661
48016	NC_015183	GCG	2	6	2227491	2227496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293661
48017	NC_015183	TGA	2	6	2227544	2227549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293661
48018	NC_015183	AAG	2	6	2227566	2227571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293661
48019	NC_015183	CCG	2	6	2227576	2227581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293661
48020	NC_015183	GCA	2	6	2227604	2227609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293661
48021	NC_015183	GC	3	6	2227660	2227665	0 %	0 %	50 %	50 %	325293661
48022	NC_015183	GGC	3	9	2227713	2227721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293661
48023	NC_015183	CAG	3	9	2227763	2227771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293661
48024	NC_015183	CAA	2	6	2227787	2227792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293661
48025	NC_015183	TGA	2	6	2227805	2227810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293661
48026	NC_015183	CGT	2	6	2227842	2227847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293661
48027	NC_015183	CGG	2	6	2227913	2227918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293661
48028	NC_015183	GCA	2	6	2227919	2227924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293661
48029	NC_015183	GAA	2	6	2227937	2227942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293661
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48032	NC_015183	CCG	2	6	2227996	2228001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293661
48033	NC_015183	ACG	2	6	2228011	2228016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293661
48034	NC_015183	CGAG	2	8	2228033	2228040	25 %	0 %	50 %	25 %	325293661
48035	NC_015183	CGC	2	6	2228063	2228068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293661
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48039	NC_015183	CCG	2	6	2228357	2228362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293661
48040	NC_015183	CAT	2	6	2228379	2228384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293661
48041	NC_015183	GAA	2	6	2228390	2228395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293661
48042	NC_015183	CAT	2	6	2228436	2228441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293661
48043	NC_015183	GCA	2	6	2228557	2228562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293661
48044	NC_015183	TTG	2	6	2228573	2228578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293661
48045	NC_015183	TTG	2	6	2228597	2228602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293661
48046	NC_015183	CG	3	6	2228657	2228662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48047	NC_015183	CG	3	6	2228665	2228670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48048	NC_015183	GA	3	6	2228673	2228678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48049	NC_015183	GCTG	2	8	2228703	2228710	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48050	NC_015183	GAGG	2	8	2228735	2228742	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
48051	NC_015183	CAC	2	6	2228823	2228828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48052	NC_015183	TTC	2	6	2228860	2228865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293662
48053	NC_015183	GC	3	6	2228900	2228905	0 %	0 %	50 %	50 %	325293662
48054	NC_015183	TCG	3	9	2228932	2228940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293662
48055	NC_015183	ATG	2	6	2229007	2229012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293662
48056	NC_015183	CGC	2	6	2229013	2229018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293662
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48058	NC_015183	T	6	6	2229118	2229123	0 %	100 %	0 %	0 %	325293662
48059	NC_015183	CTG	2	6	2229177	2229182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293662
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48061	NC_015183	CGG	2	6	2229243	2229248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293662
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48065	NC_015183	TGA	2	6	2229329	2229334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293662
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48072	NC_015183	CGCC	2	8	2229618	2229625	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48073	NC_015183	TAA	2	6	2229630	2229635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48094	NC_015183	ACGG	2	8	2230734	2230741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48095	NC_015183	GCCC	2	8	2230868	2230875	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48096	NC_015183	GCAT	2	8	2230928	2230935	25 %	25 %	25 %	25 %	325293664
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48100	NC_015183	ACC	2	6	2231099	2231104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293664
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48116	NC_015183	GCG	2	6	2231622	2231627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293665
48117	NC_015183	GCC	2	6	2231646	2231651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293665
48118	NC_015183	GGC	2	6	2231685	2231690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293665
48119	NC_015183	AAT	2	6	2231701	2231706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325293665
48120	NC_015183	GC	4	8	2231763	2231770	0 %	0 %	50 %	50 %	325293666
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48148	NC_015183	CGA	2	6	2233413	2233418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293667
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48153	NC_015183	GGCG	2	8	2233579	2233586	0 %	0 %	75 %	25 %	325293667
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48187	NC_015183	TAT	2	6	2235160	2235165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325293667
48188	NC_015183	TCGA	2	8	2235196	2235203	25 %	25 %	25 %	25 %	325293667
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48203	NC_015183	CGG	2	6	2235937	2235942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293668
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48209	NC_015183	CGA	2	6	2236244	2236249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293668
48210	NC_015183	GGGA	2	8	2236315	2236322	25 %	0 %	75 %	0 %	325293668
48211	NC_015183	CCG	2	6	2236390	2236395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293668
48212	NC_015183	TGC	2	6	2236423	2236428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293668
48213	NC_015183	CG	3	6	2236582	2236587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48214	NC_015183	CG	3	6	2236600	2236605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48215	NC_015183	A	6	6	2236638	2236643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48216	NC_015183	TGA	2	6	2236659	2236664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48217	NC_015183	GCC	3	9	2236789	2236797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293669
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48219	NC_015183	CTG	2	6	2236870	2236875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293669
48220	NC_015183	GAA	2	6	2236876	2236881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293669
48221	NC_015183	TCA	2	6	2236901	2236906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293669
48222	NC_015183	ACC	2	6	2237020	2237025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293669
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48224	NC_015183	ATC	2	6	2237210	2237215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293669
48225	NC_015183	TGC	2	6	2237219	2237224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293669
48226	NC_015183	TGC	2	6	2237243	2237248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293669
48227	NC_015183	CGG	2	6	2237271	2237276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293669
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48229	NC_015183	TCT	2	6	2237295	2237300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293669
48230	NC_015183	CAT	2	6	2237310	2237315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293669
48231	NC_015183	TGG	2	6	2237332	2237337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293669
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48345	NC_015183	CTG	2	6	2242741	2242746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48346	NC_015183	CAT	2	6	2242795	2242800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48347	NC_015183	GAA	2	6	2242851	2242856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293675
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48465	NC_015183	ATG	2	6	2248036	2248041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293681
48466	NC_015183	GCC	2	6	2248054	2248059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293681
48467	NC_015183	ATCAC	2	10	2248094	2248103	40 %	20 %	0 %	40 %	325293681
48468	NC_015183	GGA	2	6	2248188	2248193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293682
48469	NC_015183	GA	3	6	2248196	2248201	50 %	0 %	50 %	0 %	325293682
48470	NC_015183	ACC	2	6	2248244	2248249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293682
48471	NC_015183	AAT	2	6	2248266	2248271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325293682
48472	NC_015183	TGC	2	6	2248325	2248330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293682
48473	NC_015183	CAT	2	6	2248393	2248398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293682
48474	NC_015183	GAA	2	6	2248424	2248429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293682
48475	NC_015183	TGAA	2	8	2248451	2248458	50 %	25 %	25 %	0 %	325293682
48476	NC_015183	GGC	2	6	2248474	2248479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293682
48477	NC_015183	CATC	2	8	2248482	2248489	25 %	25 %	0 %	50 %	325293682
48478	NC_015183	GCC	2	6	2248572	2248577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293683
48479	NC_015183	GAC	2	6	2248584	2248589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293683
48480	NC_015183	TCC	2	6	2248621	2248626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293683
48481	NC_015183	CGT	2	6	2248650	2248655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293683
48482	NC_015183	CCA	2	6	2248670	2248675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293683
48483	NC_015183	CG	3	6	2248730	2248735	0 %	0 %	50 %	50 %	325293683
48484	NC_015183	CCG	2	6	2248850	2248855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48485	NC_015183	GCA	2	6	2248876	2248881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293684
48486	NC_015183	GCCGTC	2	12	2248920	2248931	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325293684
48487	NC_015183	CGC	2	6	2248943	2248948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293684
48488	NC_015183	GA	3	6	2248977	2248982	50 %	0 %	50 %	0 %	325293684
48489	NC_015183	ATG	2	6	2249013	2249018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293684
48490	NC_015183	GC	3	6	2249066	2249071	0 %	0 %	50 %	50 %	325293684
48491	NC_015183	CTC	2	6	2249075	2249080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293684
48492	NC_015183	CGG	2	6	2249128	2249133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293684
48493	NC_015183	GC	4	8	2249176	2249183	0 %	0 %	50 %	50 %	325293684
48494	NC_015183	GGC	2	6	2249210	2249215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293684
48495	NC_015183	CAT	2	6	2249281	2249286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293684
48496	NC_015183	AC	3	6	2249320	2249325	50 %	0 %	0 %	50 %	325293684
48497	NC_015183	GCG	2	6	2249474	2249479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293685
48498	NC_015183	TCA	2	6	2249520	2249525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293685
48499	NC_015183	GC	3	6	2249532	2249537	0 %	0 %	50 %	50 %	325293685
48500	NC_015183	GAA	2	6	2249587	2249592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293685

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