MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47001	NC_015183	CG	3	6	2179678	2179683	0 %	0 %	50 %	50 %	325293617
47002	NC_015183	GAT	2	6	2179735	2179740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293617
47003	NC_015183	GGT	2	6	2179759	2179764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293617
47004	NC_015183	CGG	2	6	2179766	2179771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293617
47005	NC_015183	GAA	2	6	2179795	2179800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293617
47006	NC_015183	CG	3	6	2179856	2179861	0 %	0 %	50 %	50 %	325293617
47007	NC_015183	CAA	2	6	2179866	2179871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293617
47008	NC_015183	AAC	2	6	2179921	2179926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293617
47009	NC_015183	TGC	2	6	2179970	2179975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293617
47010	NC_015183	GC	3	6	2180004	2180009	0 %	0 %	50 %	50 %	325293617
47011	NC_015183	CCT	2	6	2180019	2180024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293617
47012	NC_015183	CCG	2	6	2180071	2180076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293617
47013	NC_015183	TCA	2	6	2180168	2180173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293617
47014	NC_015183	TGC	2	6	2180201	2180206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293617
47015	NC_015183	GCG	2	6	2180249	2180254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293617
47016	NC_015183	CGC	2	6	2180309	2180314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293617
47017	NC_015183	TGC	2	6	2180324	2180329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293617
47018	NC_015183	GCC	2	6	2180436	2180441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293617
47019	NC_015183	GCC	2	6	2180478	2180483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293617
47020	NC_015183	GCT	2	6	2180523	2180528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293617
47021	NC_015183	TGC	2	6	2180564	2180569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293617
47022	NC_015183	GGCT	2	8	2180581	2180588	0 %	25 %	50 %	25 %	325293617
47023	NC_015183	GGC	3	9	2180608	2180616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293617
47024	NC_015183	TGA	2	6	2180654	2180659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293617
47025	NC_015183	GAA	2	6	2180677	2180682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293617
47026	NC_015183	GC	4	8	2180692	2180699	0 %	0 %	50 %	50 %	325293617
47027	NC_015183	CGA	2	6	2180739	2180744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293617
47028	NC_015183	CAA	2	6	2180799	2180804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293617
47029	NC_015183	CCA	2	6	2180969	2180974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293617
47030	NC_015183	CCTG	2	8	2181030	2181037	0 %	25 %	25 %	50 %	325293617
47031	NC_015183	CGA	2	6	2181090	2181095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293617
47032	NC_015183	GCC	2	6	2181151	2181156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293617
47033	NC_015183	TGG	2	6	2181181	2181186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293617
47034	NC_015183	GCC	2	6	2181258	2181263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47035	NC_015183	TGG	2	6	2181350	2181355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293618
47036	NC_015183	TCA	3	9	2181398	2181406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293618
47037	NC_015183	CGA	2	6	2181414	2181419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293618
47038	NC_015183	CGG	2	6	2181435	2181440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293618
47039	NC_015183	GGCT	2	8	2181463	2181470	0 %	25 %	50 %	25 %	325293618
47040	NC_015183	GAAA	2	8	2181710	2181717	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47041	NC_015183	GCA	2	6	2181727	2181732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47042	NC_015183	CGC	2	6	2181752	2181757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293619
47043	NC_015183	ATC	2	6	2181770	2181775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293619
47044	NC_015183	CAGC	2	8	2181789	2181796	25 %	0 %	25 %	50 %	325293619
47045	NC_015183	CAG	2	6	2181799	2181804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293619
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47048	NC_015183	AGC	2	6	2181980	2181985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293619
47049	NC_015183	GCC	2	6	2182024	2182029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293619
47050	NC_015183	AGCG	2	8	2182033	2182040	25 %	0 %	50 %	25 %	325293619
47051	NC_015183	CAG	2	6	2182066	2182071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293619
47052	NC_015183	GGC	2	6	2182120	2182125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293619
47053	NC_015183	CCA	2	6	2182155	2182160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293619
47054	NC_015183	ATA	2	6	2182237	2182242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325293619
47055	NC_015183	ATG	2	6	2182277	2182282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293619
47056	NC_015183	GC	3	6	2182365	2182370	0 %	0 %	50 %	50 %	325293619
47057	NC_015183	ACC	2	6	2182379	2182384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293619
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47061	NC_015183	CAT	2	6	2182648	2182653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293619
47062	NC_015183	GCC	2	6	2182675	2182680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293619
47063	NC_015183	AAG	2	6	2182711	2182716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293619
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47070	NC_015183	GAAA	2	8	2183098	2183105	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47071	NC_015183	GAATT	2	10	2183108	2183117	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47072	NC_015183	CGT	2	6	2183324	2183329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293620
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47074	NC_015183	CGT	2	6	2183402	2183407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293620
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47076	NC_015183	CCG	2	6	2183544	2183549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293620
47077	NC_015183	GGC	2	6	2183550	2183555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293620
47078	NC_015183	CAT	2	6	2183693	2183698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293620
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47080	NC_015183	CTT	2	6	2183786	2183791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293620
47081	NC_015183	TGA	2	6	2183795	2183800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293620
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47083	NC_015183	CGT	2	6	2183813	2183818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293620
47084	NC_015183	AGCGTC	2	12	2183931	2183942	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47085	NC_015183	TGG	2	6	2184168	2184173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293621
47086	NC_015183	AGCGC	2	10	2184228	2184237	20 %	0 %	40 %	40 %	325293621
47087	NC_015183	GC	3	6	2184270	2184275	0 %	0 %	50 %	50 %	325293621
47088	NC_015183	ACC	2	6	2184321	2184326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293621
47089	NC_015183	TCGC	2	8	2184335	2184342	0 %	25 %	25 %	50 %	325293621
47090	NC_015183	GTC	2	6	2184413	2184418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293621
47091	NC_015183	ACC	2	6	2184489	2184494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293621
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47094	NC_015183	ATT	2	6	2184672	2184677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325293621
47095	NC_015183	GC	3	6	2184691	2184696	0 %	0 %	50 %	50 %	325293621
47096	NC_015183	ACG	2	6	2184714	2184719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293621
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47098	NC_015183	CCA	2	6	2184765	2184770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293621
47099	NC_015183	GGA	2	6	2184838	2184843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293621
47100	NC_015183	CCG	2	6	2184844	2184849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293621
47101	NC_015183	CAC	2	6	2184895	2184900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293621
47102	NC_015183	CCG	2	6	2184949	2184954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293621
47103	NC_015183	ATT	2	6	2185050	2185055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325293621
47104	NC_015183	CGC	3	9	2185160	2185168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293622
47105	NC_015183	AGT	2	6	2185173	2185178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293622
47106	NC_015183	CGC	2	6	2185186	2185191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293622
47107	NC_015183	GGC	3	9	2185212	2185220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293622
47108	NC_015183	GGCG	2	8	2185225	2185232	0 %	0 %	75 %	25 %	325293622
47109	NC_015183	GA	3	6	2185253	2185258	50 %	0 %	50 %	0 %	325293622
47110	NC_015183	A	6	6	2185262	2185267	100 %	0 %	0 %	0 %	325293622
47111	NC_015183	T	7	7	2185294	2185300	0 %	100 %	0 %	0 %	325293622
47112	NC_015183	TGC	2	6	2185350	2185355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293622
47113	NC_015183	CAG	2	6	2185444	2185449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293622
47114	NC_015183	CGC	2	6	2185470	2185475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293622
47115	NC_015183	CAT	2	6	2185530	2185535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293622
47116	NC_015183	ACGG	2	8	2185623	2185630	25 %	0 %	50 %	25 %	325293622
47117	NC_015183	TC	3	6	2185645	2185650	0 %	50 %	0 %	50 %	325293622
47118	NC_015183	GCC	2	6	2185720	2185725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47119	NC_015183	ACTT	2	8	2185776	2185783	25 %	50 %	0 %	25 %	325293623
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47127	NC_015183	GC	3	6	2186061	2186066	0 %	0 %	50 %	50 %	325293623
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47142	NC_015183	C	6	6	2186711	2186716	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47143	NC_015183	CTGCC	2	10	2186718	2186727	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
47144	NC_015183	ATTC	2	8	2186775	2186782	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47145	NC_015183	C	6	6	2186823	2186828	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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47218	NC_015183	GACG	2	8	2191016	2191023	25 %	0 %	50 %	25 %	325293627
47219	NC_015183	TCA	2	6	2191041	2191046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293627
47220	NC_015183	GC	3	6	2191067	2191072	0 %	0 %	50 %	50 %	325293627
47221	NC_015183	CCCCTG	2	12	2191074	2191085	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	325293627
47222	NC_015183	GC	3	6	2191106	2191111	0 %	0 %	50 %	50 %	325293627
47223	NC_015183	ACA	2	6	2191177	2191182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293627
47224	NC_015183	C	6	6	2191210	2191215	0 %	0 %	0 %	100 %	325293627
47225	NC_015183	CAG	2	6	2191253	2191258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293627
47226	NC_015183	GCA	2	6	2191315	2191320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293627
47227	NC_015183	CGG	2	6	2191385	2191390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293627
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47229	NC_015183	AC	3	6	2191462	2191467	50 %	0 %	0 %	50 %	325293627
47230	NC_015183	C	7	7	2191469	2191475	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47231	NC_015183	CGG	2	6	2191510	2191515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47232	NC_015183	ACC	2	6	2191561	2191566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293628
47233	NC_015183	CTGT	2	8	2191585	2191592	0 %	50 %	25 %	25 %	325293628
47234	NC_015183	TCTT	2	8	2191593	2191600	0 %	75 %	0 %	25 %	325293628
47235	NC_015183	A	6	6	2191681	2191686	100 %	0 %	0 %	0 %	325293628
47236	NC_015183	A	6	6	2191708	2191713	100 %	0 %	0 %	0 %	325293628
47237	NC_015183	TGCA	2	8	2191718	2191725	25 %	25 %	25 %	25 %	325293628
47238	NC_015183	A	6	6	2191754	2191759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47239	NC_015183	ATG	2	6	2191766	2191771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47240	NC_015183	GCCG	2	8	2191797	2191804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47241	NC_015183	ATC	2	6	2191838	2191843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47242	NC_015183	TGAA	2	8	2191849	2191856	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47243	NC_015183	A	6	6	2191855	2191860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47244	NC_015183	CT	3	6	2191888	2191893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47245	NC_015183	CGA	2	6	2191932	2191937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293629
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47267	NC_015183	CAA	2	6	2192586	2192591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47331	NC_015183	ACG	2	6	2195309	2195314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293633
47332	NC_015183	CGA	2	6	2195328	2195333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293633
47333	NC_015183	AT	3	6	2195342	2195347	50 %	50 %	0 %	0 %	325293633
47334	NC_015183	CAA	2	6	2195430	2195435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293633
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47336	NC_015183	CCA	2	6	2195488	2195493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293633
47337	NC_015183	GAAA	2	8	2195521	2195528	75 %	0 %	25 %	0 %	325293633
47338	NC_015183	T	6	6	2195583	2195588	0 %	100 %	0 %	0 %	325293633
47339	NC_015183	CGAA	2	8	2195604	2195611	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47340	NC_015183	CG	3	6	2195642	2195647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47341	NC_015183	TGG	2	6	2195895	2195900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293634
47342	NC_015183	GCGTC	2	10	2195919	2195928	0 %	20 %	40 %	40 %	325293634
47343	NC_015183	ATG	2	6	2195932	2195937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293634
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47346	NC_015183	CGA	2	6	2196249	2196254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293635
47347	NC_015183	CGA	2	6	2196292	2196297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293635
47348	NC_015183	TGA	2	6	2196369	2196374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293635
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47350	NC_015183	GCA	2	6	2196494	2196499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293635
47351	NC_015183	TTC	2	6	2196515	2196520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293635
47352	NC_015183	CCG	2	6	2196605	2196610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293635
47353	NC_015183	AGA	2	6	2196653	2196658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293635
47354	NC_015183	CCG	2	6	2196677	2196682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293635
47355	NC_015183	GC	3	6	2196726	2196731	0 %	0 %	50 %	50 %	325293635
47356	NC_015183	ATGA	2	8	2196844	2196851	50 %	25 %	25 %	0 %	325293635
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47361	NC_015183	ATC	2	6	2196989	2196994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293635
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47371	NC_015183	CCGA	2	8	2197396	2197403	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47372	NC_015183	CGC	2	6	2197609	2197614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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47374	NC_015183	GGC	2	6	2197626	2197631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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47381	NC_015183	GGA	2	6	2197955	2197960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293636
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47400	NC_015183	CCG	2	6	2198900	2198905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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47416	NC_015183	TA	3	6	2199345	2199350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47421	NC_015183	CA	3	6	2199516	2199521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47422	NC_015183	ACC	2	6	2199564	2199569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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47456	NC_015183	CGAAAG	2	12	2200987	2200998	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	325293639
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47459	NC_015183	GCGCC	2	10	2201299	2201308	0 %	0 %	40 %	60 %	325293639
47460	NC_015183	GAT	2	6	2201332	2201337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293639
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47462	NC_015183	TGA	3	9	2201406	2201414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293639
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47465	NC_015183	CGA	2	6	2201490	2201495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293639
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