MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46501	NC_015183	GCC	2	6	2157009	2157014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293594
46502	NC_015183	ACG	2	6	2157041	2157046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293594
46503	NC_015183	CCA	2	6	2157224	2157229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293595
46504	NC_015183	GCC	2	6	2157270	2157275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293595
46505	NC_015183	CGG	2	6	2157353	2157358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293595
46506	NC_015183	GCC	2	6	2157360	2157365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293595
46507	NC_015183	GTC	2	6	2157378	2157383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293595
46508	NC_015183	GGT	2	6	2157474	2157479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293595
46509	NC_015183	CGG	2	6	2157518	2157523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293595
46510	NC_015183	CACGG	2	10	2157624	2157633	20 %	0 %	40 %	40 %	325293595
46511	NC_015183	GC	3	6	2157640	2157645	0 %	0 %	50 %	50 %	325293595
46512	NC_015183	GAT	2	6	2157678	2157683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293595
46513	NC_015183	TGG	2	6	2157806	2157811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46514	NC_015183	CCG	2	6	2157833	2157838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46515	NC_015183	GTC	2	6	2157933	2157938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293596
46516	NC_015183	TCG	2	6	2157973	2157978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293596
46517	NC_015183	TGC	2	6	2157992	2157997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293596
46518	NC_015183	AAT	2	6	2158025	2158030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325293596
46519	NC_015183	TCGC	2	8	2158084	2158091	0 %	25 %	25 %	50 %	325293596
46520	NC_015183	AGC	2	6	2158148	2158153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293597
46521	NC_015183	ACGG	2	8	2158188	2158195	25 %	0 %	50 %	25 %	325293597
46522	NC_015183	TCC	2	6	2158239	2158244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293597
46523	NC_015183	TTG	2	6	2158322	2158327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293598
46524	NC_015183	ACCATG	2	12	2158382	2158393	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325293598
46525	NC_015183	GCG	2	6	2158482	2158487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293598
46526	NC_015183	CGT	3	9	2158491	2158499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293598
46527	NC_015183	CGG	2	6	2158522	2158527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293598
46528	NC_015183	CAG	2	6	2158621	2158626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293598
46529	NC_015183	GCC	2	6	2158645	2158650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293598
46530	NC_015183	CCG	2	6	2158661	2158666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293598
46531	NC_015183	CGC	2	6	2158713	2158718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293598
46532	NC_015183	GC	3	6	2158717	2158722	0 %	0 %	50 %	50 %	325293598
46533	NC_015183	AGC	2	6	2158730	2158735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293598
46534	NC_015183	GGT	2	6	2158745	2158750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293598
46535	NC_015183	GCA	3	9	2158766	2158774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293598
46536	NC_015183	GCA	2	6	2158880	2158885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293598
46537	NC_015183	GGAA	2	8	2158932	2158939	50 %	0 %	50 %	0 %	325293598
46538	NC_015183	GGCA	2	8	2158956	2158963	25 %	0 %	50 %	25 %	325293598
46539	NC_015183	CTC	2	6	2159050	2159055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293598
46540	NC_015183	TGA	2	6	2159061	2159066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293598
46541	NC_015183	CCG	2	6	2159078	2159083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293598
46542	NC_015183	TGG	2	6	2159103	2159108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293598
46543	NC_015183	CTC	2	6	2159122	2159127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293598
46544	NC_015183	CGC	2	6	2159128	2159133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293598
46545	NC_015183	GCG	3	9	2159138	2159146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293598
46546	NC_015183	CTT	2	6	2159188	2159193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293598
46547	NC_015183	GTC	2	6	2159198	2159203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46548	NC_015183	TCCT	2	8	2159205	2159212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46549	NC_015183	GGC	2	6	2159228	2159233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293599
46550	NC_015183	TCT	2	6	2159248	2159253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293599
46551	NC_015183	GGC	2	6	2159255	2159260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293599
46552	NC_015183	CGC	2	6	2159301	2159306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293599
46553	NC_015183	ATG	2	6	2159334	2159339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293599
46554	NC_015183	GAA	2	6	2159345	2159350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293599
46555	NC_015183	CCAA	2	8	2159462	2159469	50 %	0 %	0 %	50 %	325293599
46556	NC_015183	ATG	2	6	2159472	2159477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293599
46557	NC_015183	AGA	2	6	2159497	2159502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293599
46558	NC_015183	CGG	2	6	2159527	2159532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293599
46559	NC_015183	GAA	2	6	2159564	2159569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293599
46560	NC_015183	GAT	2	6	2159576	2159581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293599
46561	NC_015183	ATCG	2	8	2159618	2159625	25 %	25 %	25 %	25 %	325293599
46562	NC_015183	GC	3	6	2159646	2159651	0 %	0 %	50 %	50 %	325293599
46563	NC_015183	GGTA	2	8	2159667	2159674	25 %	25 %	50 %	0 %	325293599
46564	NC_015183	ATG	2	6	2159721	2159726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293599
46565	NC_015183	AGA	2	6	2159761	2159766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293599
46566	NC_015183	GAC	2	6	2159921	2159926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293599
46567	NC_015183	GAA	2	6	2159963	2159968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293599
46568	NC_015183	GCC	2	6	2159999	2160004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293599
46569	NC_015183	CTG	2	6	2160014	2160019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293599
46570	NC_015183	GAA	2	6	2160050	2160055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293599
46571	NC_015183	CAT	2	6	2160128	2160133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293599
46572	NC_015183	AGAT	2	8	2160138	2160145	50 %	25 %	25 %	0 %	325293599
46573	NC_015183	CA	3	6	2160146	2160151	50 %	0 %	0 %	50 %	325293599
46574	NC_015183	TAA	2	6	2160195	2160200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325293599
46575	NC_015183	GAA	3	9	2160233	2160241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293599
46576	NC_015183	CAGC	2	8	2160272	2160279	25 %	0 %	25 %	50 %	325293599
46577	NC_015183	CGT	2	6	2160326	2160331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293599
46578	NC_015183	GCG	2	6	2160336	2160341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293599
46579	NC_015183	ACG	2	6	2160357	2160362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293599
46580	NC_015183	CAGC	2	8	2160391	2160398	25 %	0 %	25 %	50 %	325293599
46581	NC_015183	GCG	2	6	2160618	2160623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293600
46582	NC_015183	CCG	2	6	2160645	2160650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293600
46583	NC_015183	AACC	2	8	2160680	2160687	50 %	0 %	0 %	50 %	325293600
46584	NC_015183	CGG	2	6	2160774	2160779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293600
46585	NC_015183	GC	3	6	2160826	2160831	0 %	0 %	50 %	50 %	325293600
46586	NC_015183	CCG	2	6	2160954	2160959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293600
46587	NC_015183	GCG	2	6	2161037	2161042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293600
46588	NC_015183	CGT	2	6	2161110	2161115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293600
46589	NC_015183	GCTC	2	8	2161128	2161135	0 %	25 %	25 %	50 %	325293600
46590	NC_015183	TCC	2	6	2161182	2161187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46591	NC_015183	TGAC	2	8	2161283	2161290	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46592	NC_015183	CA	3	6	2161306	2161311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46593	NC_015183	T	6	6	2161354	2161359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46594	NC_015183	CTG	2	6	2161586	2161591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293601
46595	NC_015183	TCA	2	6	2161638	2161643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293601
46596	NC_015183	TGT	2	6	2161737	2161742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293601
46597	NC_015183	CGC	2	6	2161765	2161770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293601
46598	NC_015183	GGC	2	6	2161834	2161839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293601
46599	NC_015183	GCA	2	6	2161867	2161872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293601
46600	NC_015183	GCT	2	6	2161893	2161898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293601
46601	NC_015183	GCT	2	6	2161945	2161950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293601
46602	NC_015183	TCGCCA	2	12	2161995	2162006	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325293601
46603	NC_015183	CGC	2	6	2162038	2162043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293601
46604	NC_015183	CGA	2	6	2162068	2162073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293601
46605	NC_015183	CGC	2	6	2162191	2162196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293601
46606	NC_015183	GAA	2	6	2162206	2162211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293601
46607	NC_015183	CGA	2	6	2162238	2162243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293601
46608	NC_015183	ACC	2	6	2162309	2162314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293601
46609	NC_015183	GCC	2	6	2162401	2162406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293602
46610	NC_015183	GCC	2	6	2162424	2162429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293602
46611	NC_015183	CGAGA	2	10	2162469	2162478	40 %	0 %	40 %	20 %	325293602
46612	NC_015183	CGA	2	6	2162498	2162503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293602
46613	NC_015183	AGC	2	6	2162538	2162543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293602
46614	NC_015183	CGC	2	6	2162616	2162621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293602
46615	NC_015183	TCG	2	6	2162653	2162658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293602
46616	NC_015183	GCGCTG	2	12	2162706	2162717	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325293602
46617	NC_015183	CCG	2	6	2162719	2162724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293602
46618	NC_015183	CGC	2	6	2162735	2162740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293602
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46623	NC_015183	CGA	2	6	2163056	2163061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293602
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46726	NC_015183	T	6	6	2167729	2167734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46727	NC_015183	TTA	2	6	2167816	2167821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46730	NC_015183	CCG	2	6	2167856	2167861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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46732	NC_015183	CCA	2	6	2167890	2167895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293606
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46826	NC_015183	CG	4	8	2172184	2172191	0 %	0 %	50 %	50 %	325293611
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46831	NC_015183	A	6	6	2172311	2172316	100 %	0 %	0 %	0 %	325293611
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46833	NC_015183	GAT	2	6	2172425	2172430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293611
46834	NC_015183	TCG	2	6	2172441	2172446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293611
46835	NC_015183	GGC	2	6	2172523	2172528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293611
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46840	NC_015183	GC	3	6	2172645	2172650	0 %	0 %	50 %	50 %	325293611
46841	NC_015183	CAA	2	6	2172652	2172657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293611
46842	NC_015183	CGT	2	6	2172674	2172679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293611
46843	NC_015183	ATCGAC	2	12	2172686	2172697	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325293611
46844	NC_015183	GTT	2	6	2172703	2172708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293611
46845	NC_015183	GCC	2	6	2172731	2172736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293611
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46847	NC_015183	CCCG	2	8	2172811	2172818	0 %	0 %	25 %	75 %	325293611
46848	NC_015183	GCT	2	6	2172824	2172829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293611
46849	NC_015183	CCG	2	6	2172867	2172872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293612
46850	NC_015183	ACGA	2	8	2173042	2173049	50 %	0 %	25 %	25 %	325293612
46851	NC_015183	GCC	2	6	2173163	2173168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293612
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46956	NC_015183	GC	3	6	2177581	2177586	0 %	0 %	50 %	50 %	325293616
46957	NC_015183	GCCGA	2	10	2177688	2177697	20 %	0 %	40 %	40 %	325293616
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46961	NC_015183	GCA	2	6	2177916	2177921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293616
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46964	NC_015183	CTCG	2	8	2178116	2178123	0 %	25 %	25 %	50 %	325293616
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46976	NC_015183	CG	3	6	2178658	2178663	0 %	0 %	50 %	50 %	325293616
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46989	NC_015183	GCG	2	6	2179205	2179210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293617
46990	NC_015183	GCG	2	6	2179214	2179219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293617
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