MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_015183	ACA	2	6	2112372	2112377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293546
45502	NC_015183	GC	3	6	2112421	2112426	0 %	0 %	50 %	50 %	325293546
45503	NC_015183	CTGC	2	8	2112427	2112434	0 %	25 %	25 %	50 %	325293546
45504	NC_015183	TCG	2	6	2112468	2112473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293546
45505	NC_015183	GATT	2	8	2112486	2112493	25 %	50 %	25 %	0 %	325293546
45506	NC_015183	GCC	2	6	2112506	2112511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293546
45507	NC_015183	TCG	2	6	2112591	2112596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293546
45508	NC_015183	GGAACT	2	12	2112609	2112620	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325293546
45509	NC_015183	GGC	2	6	2112688	2112693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45510	NC_015183	GC	3	6	2112692	2112697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45511	NC_015183	CGCGC	2	10	2112702	2112711	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45512	NC_015183	CGCA	2	8	2112757	2112764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45513	NC_015183	A	6	6	2112779	2112784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45514	NC_015183	GTT	2	6	2112787	2112792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45515	NC_015183	A	6	6	2112801	2112806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45516	NC_015183	TCC	2	6	2112845	2112850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45517	NC_015183	CGG	2	6	2112922	2112927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45518	NC_015183	T	7	7	2112933	2112939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45519	NC_015183	ATG	2	6	2112977	2112982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45520	NC_015183	GCCT	2	8	2113032	2113039	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45521	NC_015183	CGG	2	6	2113105	2113110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45522	NC_015183	T	8	8	2113114	2113121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45523	NC_015183	GC	3	6	2113122	2113127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45524	NC_015183	GGA	2	6	2113233	2113238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293547
45525	NC_015183	GCAG	2	8	2113407	2113414	25 %	0 %	50 %	25 %	325293547
45526	NC_015183	AAAG	2	8	2113431	2113438	75 %	0 %	25 %	0 %	325293547
45527	NC_015183	TC	3	6	2113569	2113574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45528	NC_015183	GC	3	6	2113596	2113601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45529	NC_015183	CAA	2	6	2113744	2113749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293548
45530	NC_015183	AGC	2	6	2113770	2113775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293548
45531	NC_015183	GC	3	6	2113774	2113779	0 %	0 %	50 %	50 %	325293548
45532	NC_015183	AAG	2	6	2113859	2113864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293548
45533	NC_015183	CGG	2	6	2113912	2113917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293548
45534	NC_015183	TCG	2	6	2113923	2113928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293548
45535	NC_015183	ATC	2	6	2114030	2114035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293548
45536	NC_015183	ATG	2	6	2114037	2114042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293548
45537	NC_015183	CGA	2	6	2114092	2114097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293548
45538	NC_015183	ACCGG	2	10	2114121	2114130	20 %	0 %	40 %	40 %	325293548
45539	NC_015183	CG	4	8	2114131	2114138	0 %	0 %	50 %	50 %	325293548
45540	NC_015183	GCC	2	6	2114177	2114182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293548
45541	NC_015183	ACCA	2	8	2114219	2114226	50 %	0 %	0 %	50 %	325293548
45542	NC_015183	CGA	2	6	2114233	2114238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293548
45543	NC_015183	GGC	2	6	2114243	2114248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293548
45544	NC_015183	TCGA	2	8	2114249	2114256	25 %	25 %	25 %	25 %	325293548
45545	NC_015183	TCC	2	6	2114271	2114276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293548
45546	NC_015183	AGA	2	6	2114299	2114304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293548
45547	NC_015183	CGCC	2	8	2114346	2114353	0 %	0 %	25 %	75 %	325293548
45548	NC_015183	GAA	2	6	2114402	2114407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293548
45549	NC_015183	TGT	2	6	2114437	2114442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293548
45550	NC_015183	GGT	2	6	2114456	2114461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293548
45551	NC_015183	CG	3	6	2114463	2114468	0 %	0 %	50 %	50 %	325293548
45552	NC_015183	GCC	2	6	2114513	2114518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293548
45553	NC_015183	GCGG	2	8	2114528	2114535	0 %	0 %	75 %	25 %	325293548
45554	NC_015183	CAA	2	6	2114554	2114559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293548
45555	NC_015183	CGC	2	6	2114676	2114681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293548
45556	NC_015183	TGG	2	6	2114710	2114715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293548
45557	NC_015183	CGC	2	6	2114774	2114779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45558	NC_015183	GCG	2	6	2114796	2114801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45559	NC_015183	GCA	2	6	2114837	2114842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293549
45560	NC_015183	TCA	2	6	2114925	2114930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293549
45561	NC_015183	AG	3	6	2114949	2114954	50 %	0 %	50 %	0 %	325293549
45562	NC_015183	AGC	2	6	2114957	2114962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293549
45563	NC_015183	GC	4	8	2114967	2114974	0 %	0 %	50 %	50 %	325293549
45564	NC_015183	TCA	2	6	2114993	2114998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293549
45565	NC_015183	AGC	2	6	2115071	2115076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293549
45566	NC_015183	ATA	2	6	2115085	2115090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325293549
45567	NC_015183	CAG	2	6	2115106	2115111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293549
45568	NC_015183	CGG	2	6	2115164	2115169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293549
45569	NC_015183	ATG	2	6	2115228	2115233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293550
45570	NC_015183	CCG	2	6	2115239	2115244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293550
45571	NC_015183	CCG	2	6	2115293	2115298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293550
45572	NC_015183	ATCG	2	8	2115300	2115307	25 %	25 %	25 %	25 %	325293550
45573	NC_015183	ATTTC	2	10	2115380	2115389	20 %	60 %	0 %	20 %	325293550
45574	NC_015183	GAAC	2	8	2115410	2115417	50 %	0 %	25 %	25 %	325293550
45575	NC_015183	CAGC	2	8	2115422	2115429	25 %	0 %	25 %	50 %	325293550
45576	NC_015183	GCC	2	6	2115449	2115454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293550
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45578	NC_015183	CTG	2	6	2115638	2115643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293550
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45581	NC_015183	CGC	2	6	2115781	2115786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293550
45582	NC_015183	GCC	2	6	2115804	2115809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293550
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45584	NC_015183	TGC	2	6	2115881	2115886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293550
45585	NC_015183	GCA	2	6	2115947	2115952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293550
45586	NC_015183	GGA	2	6	2115979	2115984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293550
45587	NC_015183	GCC	2	6	2116018	2116023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293550
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45590	NC_015183	CAA	2	6	2116134	2116139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293550
45591	NC_015183	CCA	2	6	2116165	2116170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293551
45592	NC_015183	CAA	2	6	2116178	2116183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293551
45593	NC_015183	CTG	2	6	2116208	2116213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293551
45594	NC_015183	AT	3	6	2116230	2116235	50 %	50 %	0 %	0 %	325293551
45595	NC_015183	CTT	2	6	2116250	2116255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293551
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45601	NC_015183	GCC	3	9	2116569	2116577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293551
45602	NC_015183	ATC	2	6	2116644	2116649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293551
45603	NC_015183	TGC	2	6	2116660	2116665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293551
45604	NC_015183	ATC	2	6	2116671	2116676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293551
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45606	NC_015183	GCG	2	6	2116748	2116753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293551
45607	NC_015183	GCA	2	6	2116787	2116792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293551
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45610	NC_015183	TCA	2	6	2116936	2116941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293551
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45612	NC_015183	GCTC	2	8	2116963	2116970	0 %	25 %	25 %	50 %	325293551
45613	NC_015183	GAA	2	6	2116992	2116997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293551
45614	NC_015183	GC	3	6	2117088	2117093	0 %	0 %	50 %	50 %	325293551
45615	NC_015183	CGC	2	6	2117179	2117184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293551
45616	NC_015183	TGCCG	2	10	2117187	2117196	0 %	20 %	40 %	40 %	325293551
45617	NC_015183	CGC	2	6	2117257	2117262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293551
45618	NC_015183	ACG	2	6	2117264	2117269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293551
45619	NC_015183	AGAC	2	8	2117322	2117329	50 %	0 %	25 %	25 %	325293552
45620	NC_015183	CGG	2	6	2117398	2117403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293553
45621	NC_015183	CCGG	2	8	2117430	2117437	0 %	0 %	50 %	50 %	325293553
45622	NC_015183	CGC	2	6	2117439	2117444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293553
45623	NC_015183	TCA	2	6	2117498	2117503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293553
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45625	NC_015183	CTG	2	6	2117515	2117520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293553
45626	NC_015183	GCA	2	6	2117525	2117530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293553
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45628	NC_015183	TAGG	2	8	2117561	2117568	25 %	25 %	50 %	0 %	325293553
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45631	NC_015183	ACA	2	6	2117721	2117726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45634	NC_015183	GGGAA	2	10	2117833	2117842	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
45635	NC_015183	TGC	2	6	2117881	2117886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293554
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45656	NC_015183	CGT	2	6	2118626	2118631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293554
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45664	NC_015183	A	7	7	2118961	2118967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45665	NC_015183	CAG	2	6	2119061	2119066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293555
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45687	NC_015183	TCT	2	6	2120265	2120270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45704	NC_015183	CCAGA	2	10	2121321	2121330	40 %	0 %	20 %	40 %	325293556
45705	NC_015183	AATA	2	8	2121407	2121414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45729	NC_015183	CGG	2	6	2122156	2122161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293558
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45731	NC_015183	CGA	2	6	2122197	2122202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293558
45732	NC_015183	GCA	2	6	2122204	2122209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293558
45733	NC_015183	CGT	2	6	2122288	2122293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293558
45734	NC_015183	TGA	2	6	2122338	2122343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293558
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45736	NC_015183	CAT	2	6	2122411	2122416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293558
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45753	NC_015183	TTGC	2	8	2123038	2123045	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45754	NC_015183	GCA	2	6	2123061	2123066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45755	NC_015183	CTGC	2	8	2123219	2123226	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45756	NC_015183	TGC	2	6	2123254	2123259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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45822	NC_015183	GGCG	2	8	2126547	2126554	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45823	NC_015183	GCG	2	6	2126599	2126604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293565
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45836	NC_015183	AAGAC	2	10	2127046	2127055	60 %	0 %	20 %	20 %	325293565
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45842	NC_015183	A	6	6	2127573	2127578	100 %	0 %	0 %	0 %	325293565
45843	NC_015183	ATC	2	6	2127609	2127614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293565
45844	NC_015183	GC	3	6	2127615	2127620	0 %	0 %	50 %	50 %	325293565
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45846	NC_015183	CAT	3	9	2127716	2127724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293565
45847	NC_015183	TGA	3	9	2127731	2127739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293565
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45851	NC_015183	AGC	2	6	2127942	2127947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45852	NC_015183	GA	3	6	2127949	2127954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45853	NC_015183	GTT	2	6	2128049	2128054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45854	NC_015183	GCG	2	6	2128179	2128184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293566
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