MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_015183	TTC	2	6	2066053	2066058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293511
44502	NC_015183	GC	3	6	2066066	2066071	0 %	0 %	50 %	50 %	325293511
44503	NC_015183	CT	3	6	2066225	2066230	0 %	50 %	0 %	50 %	325293511
44504	NC_015183	CTG	2	6	2066251	2066256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293511
44505	NC_015183	GTG	2	6	2066257	2066262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293511
44506	NC_015183	TCA	2	6	2066318	2066323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293511
44507	NC_015183	CATCGT	2	12	2066349	2066360	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325293511
44508	NC_015183	ACA	2	6	2066381	2066386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293511
44509	NC_015183	GCG	2	6	2066530	2066535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293511
44510	NC_015183	GAC	2	6	2066556	2066561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293511
44511	NC_015183	CAT	2	6	2066574	2066579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293511
44512	NC_015183	GCC	2	6	2066656	2066661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293511
44513	NC_015183	GCT	2	6	2066697	2066702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293511
44514	NC_015183	GC	3	6	2066807	2066812	0 %	0 %	50 %	50 %	325293511
44515	NC_015183	GTC	2	6	2066891	2066896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293512
44516	NC_015183	ACC	2	6	2066966	2066971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293512
44517	NC_015183	TGC	2	6	2066973	2066978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293512
44518	NC_015183	GGC	2	6	2067008	2067013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293512
44519	NC_015183	TCA	2	6	2067021	2067026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293512
44520	NC_015183	GAC	2	6	2067040	2067045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293512
44521	NC_015183	CATC	2	8	2067199	2067206	25 %	25 %	0 %	50 %	325293512
44522	NC_015183	GGC	2	6	2067245	2067250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293512
44523	NC_015183	CAG	3	9	2067251	2067259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293512
44524	NC_015183	CTG	2	6	2067305	2067310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293512
44525	NC_015183	GAA	2	6	2067359	2067364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293512
44526	NC_015183	CAC	2	6	2067394	2067399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293512
44527	NC_015183	ACA	2	6	2067504	2067509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293512
44528	NC_015183	CCT	2	6	2067531	2067536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293512
44529	NC_015183	TCG	2	6	2067537	2067542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293512
44530	NC_015183	CGT	2	6	2067568	2067573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293512
44531	NC_015183	A	6	6	2067651	2067656	100 %	0 %	0 %	0 %	325293512
44532	NC_015183	CGG	2	6	2067781	2067786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293512
44533	NC_015183	GCACC	2	10	2067822	2067831	20 %	0 %	20 %	60 %	325293512
44534	NC_015183	GCCC	2	8	2067832	2067839	0 %	0 %	25 %	75 %	325293512
44535	NC_015183	CGA	2	6	2067956	2067961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44536	NC_015183	GC	4	8	2067976	2067983	0 %	0 %	50 %	50 %	325293513
44537	NC_015183	T	6	6	2067984	2067989	0 %	100 %	0 %	0 %	325293513
44538	NC_015183	CCTG	2	8	2068024	2068031	0 %	25 %	25 %	50 %	325293513
44539	NC_015183	ACCG	2	8	2068039	2068046	25 %	0 %	25 %	50 %	325293513
44540	NC_015183	CGG	2	6	2068048	2068053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293513
44541	NC_015183	GT	3	6	2068280	2068285	0 %	50 %	50 %	0 %	325293513
44542	NC_015183	GCC	2	6	2068400	2068405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293513
44543	NC_015183	GGC	2	6	2068466	2068471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293513
44544	NC_015183	TGGC	2	8	2068475	2068482	0 %	25 %	50 %	25 %	325293513
44545	NC_015183	GCG	3	9	2068494	2068502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293513
44546	NC_015183	CAT	2	6	2068516	2068521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293513
44547	NC_015183	GTC	2	6	2068547	2068552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293513
44548	NC_015183	CCA	2	6	2068608	2068613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293513
44549	NC_015183	CGG	3	9	2068663	2068671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293513
44550	NC_015183	CTG	2	6	2068711	2068716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293513
44551	NC_015183	GCCA	2	8	2068789	2068796	25 %	0 %	25 %	50 %	325293513
44552	NC_015183	GAT	2	6	2068882	2068887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293513
44553	NC_015183	GCC	2	6	2068923	2068928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293513
44554	NC_015183	GCATCA	2	12	2068989	2069000	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325293513
44555	NC_015183	CG	3	6	2069104	2069109	0 %	0 %	50 %	50 %	325293514
44556	NC_015183	CGG	2	6	2069137	2069142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293514
44557	NC_015183	CGG	2	6	2069206	2069211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293514
44558	NC_015183	CGA	2	6	2069229	2069234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293514
44559	NC_015183	CCGA	2	8	2069277	2069284	25 %	0 %	25 %	50 %	325293514
44560	NC_015183	AGC	2	6	2069330	2069335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293514
44561	NC_015183	GCC	2	6	2069381	2069386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293514
44562	NC_015183	T	6	6	2069392	2069397	0 %	100 %	0 %	0 %	325293514
44563	NC_015183	CTG	2	6	2069510	2069515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293514
44564	NC_015183	CTTCC	2	10	2069539	2069548	0 %	40 %	0 %	60 %	325293514
44565	NC_015183	GCA	2	6	2069618	2069623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293514
44566	NC_015183	A	6	6	2069623	2069628	100 %	0 %	0 %	0 %	325293514
44567	NC_015183	GGCATC	2	12	2069641	2069652	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325293514
44568	NC_015183	CAG	2	6	2069655	2069660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293514
44569	NC_015183	AT	3	6	2069738	2069743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44570	NC_015183	AATAT	2	10	2069840	2069849	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44571	NC_015183	CTC	2	6	2069851	2069856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44572	NC_015183	CCG	2	6	2069859	2069864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44573	NC_015183	GCT	2	6	2070062	2070067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293515
44574	NC_015183	GGC	2	6	2070077	2070082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293515
44575	NC_015183	GC	3	6	2070212	2070217	0 %	0 %	50 %	50 %	325293515
44576	NC_015183	GCA	2	6	2070404	2070409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293515
44577	NC_015183	AGC	2	6	2070472	2070477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293515
44578	NC_015183	CGTC	2	8	2070494	2070501	0 %	25 %	25 %	50 %	325293515
44579	NC_015183	GTG	2	6	2070514	2070519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293515
44580	NC_015183	ATC	2	6	2070528	2070533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293515
44581	NC_015183	CGA	2	6	2070571	2070576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293515
44582	NC_015183	TTA	2	6	2070578	2070583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325293515
44583	NC_015183	CGA	2	6	2070587	2070592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293515
44584	NC_015183	ATG	2	6	2070616	2070621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293515
44585	NC_015183	GCG	2	6	2070644	2070649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293515
44586	NC_015183	AAG	2	6	2070753	2070758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44587	NC_015183	CAC	3	9	2070774	2070782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293516
44588	NC_015183	CAGG	2	8	2070807	2070814	25 %	0 %	50 %	25 %	325293516
44589	NC_015183	CGG	2	6	2070843	2070848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293516
44590	NC_015183	TCA	2	6	2070869	2070874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293516
44591	NC_015183	TTC	2	6	2070910	2070915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293516
44592	NC_015183	CCG	2	6	2070916	2070921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293516
44593	NC_015183	TGA	2	6	2070941	2070946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293516
44594	NC_015183	CGC	2	6	2070966	2070971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293516
44595	NC_015183	GGC	2	6	2070994	2070999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293516
44596	NC_015183	CCA	2	6	2071109	2071114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293516
44597	NC_015183	TGC	2	6	2071154	2071159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293516
44598	NC_015183	CGG	2	6	2071173	2071178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293516
44599	NC_015183	CGC	2	6	2071225	2071230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293516
44600	NC_015183	CT	3	6	2071264	2071269	0 %	50 %	0 %	50 %	325293516
44601	NC_015183	CAT	2	6	2071275	2071280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293516
44602	NC_015183	GCA	2	6	2071324	2071329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293516
44603	NC_015183	GGC	2	6	2071335	2071340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293516
44604	NC_015183	CGG	2	6	2071368	2071373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293516
44605	NC_015183	GCTG	2	8	2071406	2071413	0 %	25 %	50 %	25 %	325293516
44606	NC_015183	AAGTCG	2	12	2071444	2071455	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325293516
44607	NC_015183	GCG	2	6	2071502	2071507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293516
44608	NC_015183	GCT	2	6	2071521	2071526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293516
44609	NC_015183	TCG	2	6	2071550	2071555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293516
44610	NC_015183	TGA	2	6	2071565	2071570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293516
44611	NC_015183	AC	3	6	2071601	2071606	50 %	0 %	0 %	50 %	325293516
44612	NC_015183	GGCA	2	8	2071620	2071627	25 %	0 %	50 %	25 %	325293516
44613	NC_015183	TCA	2	6	2071661	2071666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293516
44614	NC_015183	GATC	2	8	2071680	2071687	25 %	25 %	25 %	25 %	325293516
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44616	NC_015183	GCC	2	6	2071714	2071719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293516
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44733	NC_015183	GCC	2	6	2076522	2076527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293518
44734	NC_015183	TCC	2	6	2076528	2076533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293518
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44833	NC_015183	C	6	6	2081527	2081532	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44834	NC_015183	T	8	8	2081557	2081564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44835	NC_015183	CG	3	6	2081569	2081574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44836	NC_015183	GAA	2	6	2081647	2081652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293524
44837	NC_015183	CGGCG	2	10	2081696	2081705	0 %	0 %	60 %	40 %	325293524
44838	NC_015183	CG	5	10	2081718	2081727	0 %	0 %	50 %	50 %	325293524
44839	NC_015183	TCC	2	6	2081753	2081758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293524
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44843	NC_015183	CCG	2	6	2081936	2081941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293524
44844	NC_015183	ACTC	2	8	2081991	2081998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44845	NC_015183	GTTT	2	8	2082000	2082007	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44846	NC_015183	CCCG	2	8	2082052	2082059	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44847	NC_015183	CAG	2	6	2082086	2082091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44848	NC_015183	CGG	2	6	2082176	2082181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293525
44849	NC_015183	TCA	2	6	2082305	2082310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293525
44850	NC_015183	GAC	2	6	2082328	2082333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293525
44851	NC_015183	TCG	2	6	2082350	2082355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293525
44852	NC_015183	A	7	7	2082375	2082381	100 %	0 %	0 %	0 %	325293525
44853	NC_015183	TG	3	6	2082442	2082447	0 %	50 %	50 %	0 %	325293525
44854	NC_015183	GCCT	2	8	2082481	2082488	0 %	25 %	25 %	50 %	325293525
44855	NC_015183	GTGG	2	8	2082538	2082545	0 %	25 %	75 %	0 %	325293525
44856	NC_015183	TCT	2	6	2082561	2082566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293525
44857	NC_015183	GGC	2	6	2082671	2082676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44858	NC_015183	A	6	6	2082714	2082719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44859	NC_015183	GAC	2	6	2082772	2082777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44860	NC_015183	GA	3	6	2082813	2082818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44861	NC_015183	CCG	2	6	2083007	2083012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293526
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44864	NC_015183	TGC	2	6	2083091	2083096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293526
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44882	NC_015183	ACA	2	6	2083907	2083912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293526
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44886	NC_015183	CTG	2	6	2084104	2084109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293526
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44913	NC_015183	TCG	2	6	2085466	2085471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44914	NC_015183	TCC	2	6	2085534	2085539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293527
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44939	NC_015183	GCA	2	6	2086399	2086404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293527
44940	NC_015183	TCCCT	2	10	2086427	2086436	0 %	40 %	0 %	60 %	325293527
44941	NC_015183	CA	3	6	2086521	2086526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44942	NC_015183	A	6	6	2086562	2086567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44943	NC_015183	CG	3	6	2086705	2086710	0 %	0 %	50 %	50 %	325293528
44944	NC_015183	CTG	2	6	2086721	2086726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293528
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44949	NC_015183	GTC	3	9	2086824	2086832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293528
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44952	NC_015183	GCA	2	6	2087044	2087049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293528
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44955	NC_015183	CCA	2	6	2087156	2087161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293528
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44960	NC_015183	GGC	2	6	2087489	2087494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293528
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44963	NC_015183	CAGCGA	2	12	2087675	2087686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293528
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44967	NC_015183	CTT	2	6	2087804	2087809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293528
44968	NC_015183	GCA	2	6	2087871	2087876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293528
44969	NC_015183	TCG	3	9	2087892	2087900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293528
44970	NC_015183	CTT	2	6	2087905	2087910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293528
44971	NC_015183	CGG	2	6	2087918	2087923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293528
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44974	NC_015183	GCA	2	6	2088103	2088108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293528
44975	NC_015183	CGT	2	6	2088110	2088115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293528
44976	NC_015183	TCG	2	6	2088129	2088134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293528
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44979	NC_015183	CGGC	2	8	2088198	2088205	0 %	0 %	50 %	50 %	325293528
44980	NC_015183	TGGCGA	2	12	2088217	2088228	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325293528
44981	NC_015183	CG	3	6	2088238	2088243	0 %	0 %	50 %	50 %	325293528
44982	NC_015183	TCG	2	6	2088291	2088296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293528
44983	NC_015183	CGGT	3	12	2088300	2088311	0 %	25 %	50 %	25 %	325293528
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44985	NC_015183	CCG	2	6	2088342	2088347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293528
44986	NC_015183	CGC	2	6	2088361	2088366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293528
44987	NC_015183	TCG	2	6	2088390	2088395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293528
44988	NC_015183	CTT	2	6	2088499	2088504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293528
44989	NC_015183	CTT	2	6	2088551	2088556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293528
44990	NC_015183	GGC	2	6	2088557	2088562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293528
44991	NC_015183	ATC	2	6	2088567	2088572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293528
44992	NC_015183	CCGT	2	8	2088609	2088616	0 %	25 %	25 %	50 %	325293528
44993	NC_015183	CGTT	2	8	2088627	2088634	0 %	50 %	25 %	25 %	325293528
44994	NC_015183	CTT	2	6	2088640	2088645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293528
44995	NC_015183	ATCT	2	8	2088669	2088676	25 %	50 %	0 %	25 %	325293528
44996	NC_015183	CCG	2	6	2088706	2088711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44997	NC_015183	TGCT	2	8	2088842	2088849	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44998	NC_015183	GCA	2	6	2089018	2089023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44999	NC_015183	CCGG	2	8	2089095	2089102	0 %	0 %	50 %	50 %	325293529
45000	NC_015183	GAT	2	6	2089122	2089127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293529

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