MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_015183	GCGG	2	8	2041826	2041833	0 %	0 %	75 %	25 %	325293488
44002	NC_015183	GATG	2	8	2041879	2041886	25 %	25 %	50 %	0 %	325293488
44003	NC_015183	CGCC	2	8	2041960	2041967	0 %	0 %	25 %	75 %	325293488
44004	NC_015183	GC	3	6	2041982	2041987	0 %	0 %	50 %	50 %	325293488
44005	NC_015183	ACA	2	6	2041993	2041998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293488
44006	NC_015183	GGA	2	6	2042053	2042058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293488
44007	NC_015183	AG	3	6	2042088	2042093	50 %	0 %	50 %	0 %	325293488
44008	NC_015183	GGT	2	6	2042102	2042107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293488
44009	NC_015183	TCG	2	6	2042142	2042147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293488
44010	NC_015183	GGC	2	6	2042158	2042163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293488
44011	NC_015183	AAT	2	6	2042197	2042202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325293488
44012	NC_015183	GCG	2	6	2042283	2042288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293488
44013	NC_015183	CAG	2	6	2042291	2042296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293488
44014	NC_015183	AAC	2	6	2042306	2042311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293488
44015	NC_015183	CTT	2	6	2042380	2042385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293488
44016	NC_015183	GCCG	2	8	2042465	2042472	0 %	0 %	50 %	50 %	325293488
44017	NC_015183	GCCG	2	8	2042507	2042514	0 %	0 %	50 %	50 %	325293488
44018	NC_015183	CCA	2	6	2042527	2042532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293488
44019	NC_015183	A	6	6	2042667	2042672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44020	NC_015183	GGGC	2	8	2042684	2042691	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44021	NC_015183	GAC	2	6	2042774	2042779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293489
44022	NC_015183	TGA	2	6	2042894	2042899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293489
44023	NC_015183	CTT	2	6	2042930	2042935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293489
44024	NC_015183	TCG	2	6	2042977	2042982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293489
44025	NC_015183	AGC	3	9	2042983	2042991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293489
44026	NC_015183	GCC	2	6	2042997	2043002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293489
44027	NC_015183	ACC	2	6	2043042	2043047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293489
44028	NC_015183	CTG	3	9	2043066	2043074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293489
44029	NC_015183	CGC	2	6	2043077	2043082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293489
44030	NC_015183	TGA	2	6	2043140	2043145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293489
44031	NC_015183	GCC	2	6	2043153	2043158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293489
44032	NC_015183	TCC	2	6	2043166	2043171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293489
44033	NC_015183	CGA	2	6	2043329	2043334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293489
44034	NC_015183	GCC	2	6	2043336	2043341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293489
44035	NC_015183	ACG	2	6	2043418	2043423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293489
44036	NC_015183	CCA	2	6	2043491	2043496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293489
44037	NC_015183	CTG	2	6	2043615	2043620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293489
44038	NC_015183	CCACGG	2	12	2043676	2043687	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325293489
44039	NC_015183	ATC	3	9	2043742	2043750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293489
44040	NC_015183	TGGT	2	8	2043811	2043818	0 %	50 %	50 %	0 %	325293489
44041	NC_015183	TCG	2	6	2043823	2043828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293489
44042	NC_015183	AGC	3	9	2043829	2043837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293489
44043	NC_015183	AGC	3	9	2043853	2043861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293489
44044	NC_015183	CAC	2	6	2043887	2043892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293489
44045	NC_015183	ATG	2	6	2043991	2043996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293489
44046	NC_015183	CCG	2	6	2044019	2044024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293489
44047	NC_015183	TCG	2	6	2044027	2044032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293489
44048	NC_015183	TCA	3	9	2044040	2044048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293489
44049	NC_015183	CGA	2	6	2044064	2044069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293489
44050	NC_015183	TCG	2	6	2044123	2044128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293489
44051	NC_015183	GA	3	6	2044285	2044290	50 %	0 %	50 %	0 %	325293489
44052	NC_015183	CTT	2	6	2044308	2044313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293489
44053	NC_015183	GGCA	2	8	2044497	2044504	25 %	0 %	50 %	25 %	325293490
44054	NC_015183	ATGA	2	8	2044516	2044523	50 %	25 %	25 %	0 %	325293490
44055	NC_015183	GAC	2	6	2044524	2044529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293490
44056	NC_015183	CATC	2	8	2044580	2044587	25 %	25 %	0 %	50 %	325293490
44057	NC_015183	CCA	2	6	2044596	2044601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293490
44058	NC_015183	GC	3	6	2044621	2044626	0 %	0 %	50 %	50 %	325293490
44059	NC_015183	TGA	2	6	2044634	2044639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293490
44060	NC_015183	TGG	2	6	2044652	2044657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293490
44061	NC_015183	GCCG	2	8	2044663	2044670	0 %	0 %	50 %	50 %	325293490
44062	NC_015183	CCG	2	6	2044674	2044679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293490
44063	NC_015183	ATC	2	6	2044727	2044732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293490
44064	NC_015183	GGC	2	6	2044888	2044893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293490
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44066	NC_015183	TGC	2	6	2045000	2045005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293490
44067	NC_015183	GGA	2	6	2045151	2045156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293490
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44069	NC_015183	AC	3	6	2045361	2045366	50 %	0 %	0 %	50 %	325293490
44070	NC_015183	CGC	2	6	2045433	2045438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293490
44071	NC_015183	CGT	2	6	2045451	2045456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293490
44072	NC_015183	TCA	2	6	2045682	2045687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293491
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44074	NC_015183	CCA	2	6	2045787	2045792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293491
44075	NC_015183	TCG	2	6	2045811	2045816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293491
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44082	NC_015183	CCG	2	6	2046367	2046372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293491
44083	NC_015183	CCG	2	6	2046402	2046407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293491
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44085	NC_015183	GC	3	6	2046434	2046439	0 %	0 %	50 %	50 %	325293491
44086	NC_015183	GCG	2	6	2046460	2046465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293491
44087	NC_015183	TCT	2	6	2046505	2046510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293491
44088	NC_015183	CCGG	2	8	2046536	2046543	0 %	0 %	50 %	50 %	325293491
44089	NC_015183	CGC	2	6	2046672	2046677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293491
44090	NC_015183	GCCCGA	2	12	2046690	2046701	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325293491
44091	NC_015183	ACG	2	6	2046758	2046763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293491
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44096	NC_015183	CG	3	6	2046995	2047000	0 %	0 %	50 %	50 %	325293492
44097	NC_015183	CCA	2	6	2047010	2047015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293492
44098	NC_015183	CGGC	2	8	2047022	2047029	0 %	0 %	50 %	50 %	325293492
44099	NC_015183	ATTCC	2	10	2047049	2047058	20 %	40 %	0 %	40 %	325293492
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44101	NC_015183	CGC	2	6	2047129	2047134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293492
44102	NC_015183	TGGG	2	8	2047156	2047163	0 %	25 %	75 %	0 %	325293492
44103	NC_015183	CGA	2	6	2047170	2047175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293492
44104	NC_015183	GC	3	6	2047177	2047182	0 %	0 %	50 %	50 %	325293492
44105	NC_015183	GCC	2	6	2047229	2047234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293492
44106	NC_015183	GTG	2	6	2047243	2047248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293492
44107	NC_015183	CGC	2	6	2047344	2047349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293492
44108	NC_015183	TCA	2	6	2047388	2047393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293492
44109	NC_015183	CGG	2	6	2047395	2047400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293492
44110	NC_015183	GAA	2	6	2047414	2047419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293492
44111	NC_015183	GCT	2	6	2047469	2047474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293492
44112	NC_015183	TCGGCA	2	12	2047529	2047540	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325293492
44113	NC_015183	GTG	2	6	2047582	2047587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293492
44114	NC_015183	CGG	2	6	2047593	2047598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293492
44115	NC_015183	TCC	2	6	2047618	2047623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293492
44116	NC_015183	GAT	2	6	2047738	2047743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293492
44117	NC_015183	TCG	2	6	2047745	2047750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293492
44118	NC_015183	TTC	2	6	2047758	2047763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293492
44119	NC_015183	CGC	2	6	2047782	2047787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293492
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44121	NC_015183	CTTAC	2	10	2047820	2047829	20 %	40 %	0 %	40 %	325293492
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44123	NC_015183	GAT	2	6	2047909	2047914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293492
44124	NC_015183	CCG	2	6	2047974	2047979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293492
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44128	NC_015183	ATG	2	6	2048101	2048106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293492
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44134	NC_015183	CAT	2	6	2048358	2048363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293492
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44136	NC_015183	CGG	2	6	2048616	2048621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293493
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44143	NC_015183	TGG	2	6	2048965	2048970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293493
44144	NC_015183	CG	3	6	2049064	2049069	0 %	0 %	50 %	50 %	325293493
44145	NC_015183	AGC	2	6	2049228	2049233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293493
44146	NC_015183	GCTT	2	8	2049244	2049251	0 %	50 %	25 %	25 %	325293493
44147	NC_015183	CTC	2	6	2049303	2049308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44148	NC_015183	CAT	2	6	2049309	2049314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44149	NC_015183	CAA	2	6	2049417	2049422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44150	NC_015183	A	6	6	2049421	2049426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44151	NC_015183	AG	3	6	2049478	2049483	50 %	0 %	50 %	0 %	325293494
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44182	NC_015183	AAT	2	6	2051210	2051215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44185	NC_015183	GGC	2	6	2051382	2051387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293497
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44187	NC_015183	GC	3	6	2051411	2051416	0 %	0 %	50 %	50 %	325293497
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44190	NC_015183	CTG	2	6	2051557	2051562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293497
44191	NC_015183	CAG	2	6	2051587	2051592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293497
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44201	NC_015183	CAC	2	6	2051868	2051873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293497
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44216	NC_015183	TCAG	2	8	2052813	2052820	25 %	25 %	25 %	25 %	325293498
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44220	NC_015183	GCA	2	6	2052867	2052872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293499
44221	NC_015183	GCC	2	6	2052899	2052904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293499
44222	NC_015183	GC	3	6	2052996	2053001	0 %	0 %	50 %	50 %	325293499
44223	NC_015183	TGG	2	6	2053018	2053023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293499
44224	NC_015183	GGC	2	6	2053046	2053051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293499
44225	NC_015183	CCA	2	6	2053126	2053131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293499
44226	NC_015183	CGGCG	2	10	2053187	2053196	0 %	0 %	60 %	40 %	325293499
44227	NC_015183	CTG	2	6	2053204	2053209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293499
44228	NC_015183	GCG	2	6	2053276	2053281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293499
44229	NC_015183	TCG	2	6	2053282	2053287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293499
44230	NC_015183	GCA	2	6	2053305	2053310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293499
44231	NC_015183	CGCC	2	8	2053331	2053338	0 %	0 %	25 %	75 %	325293499
44232	NC_015183	GGC	2	6	2053358	2053363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293499
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44264	NC_015183	CG	3	6	2054618	2054623	0 %	0 %	50 %	50 %	325293500
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44285	NC_015183	ACA	2	6	2055590	2055595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44331	NC_015183	CCAT	2	8	2057800	2057807	25 %	25 %	0 %	50 %	325293504
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44335	NC_015183	GCC	2	6	2057925	2057930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293504
44336	NC_015183	TGA	2	6	2058014	2058019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293504
44337	NC_015183	CGCC	2	8	2058035	2058042	0 %	0 %	25 %	75 %	325293504
44338	NC_015183	CGA	2	6	2058044	2058049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293504
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44348	NC_015183	GC	3	6	2058459	2058464	0 %	0 %	50 %	50 %	325293504
44349	NC_015183	CGG	2	6	2058473	2058478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293504
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44409	NC_015183	GCCA	2	8	2061551	2061558	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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44464	NC_015183	ATC	2	6	2064568	2064573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293509
44465	NC_015183	GAA	2	6	2064603	2064608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293509
44466	NC_015183	TGGA	2	8	2064724	2064731	25 %	25 %	50 %	0 %	325293509
44467	NC_015183	CGA	2	6	2064744	2064749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293509
44468	NC_015183	TGGC	2	8	2064759	2064766	0 %	25 %	50 %	25 %	325293509
44469	NC_015183	GCC	2	6	2064846	2064851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293509
44470	NC_015183	GCA	2	6	2064853	2064858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293509
44471	NC_015183	CAA	2	6	2064903	2064908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293509
44472	NC_015183	GCC	2	6	2064910	2064915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293509
44473	NC_015183	CGG	2	6	2064921	2064926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293509
44474	NC_015183	CGT	2	6	2064936	2064941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293509
44475	NC_015183	CTT	2	6	2065002	2065007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44476	NC_015183	ATA	2	6	2065109	2065114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44477	NC_015183	AGAC	2	8	2065126	2065133	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44478	NC_015183	CAAC	2	8	2065170	2065177	50 %	0 %	0 %	50 %	325293510
44479	NC_015183	CGG	2	6	2065180	2065185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293510
44480	NC_015183	GAA	2	6	2065200	2065205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293510
44481	NC_015183	CGT	2	6	2065228	2065233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293510
44482	NC_015183	CTG	2	6	2065253	2065258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293510
44483	NC_015183	CGA	2	6	2065272	2065277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293510
44484	NC_015183	CGG	2	6	2065401	2065406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293510
44485	NC_015183	CGC	3	9	2065435	2065443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293510
44486	NC_015183	GGT	2	6	2065454	2065459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293510
44487	NC_015183	TCGCA	2	10	2065503	2065512	20 %	20 %	20 %	40 %	325293510
44488	NC_015183	TCGCCT	2	12	2065530	2065541	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325293510
44489	NC_015183	CTC	2	6	2065613	2065618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293510
44490	NC_015183	TTC	2	6	2065664	2065669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293510
44491	NC_015183	TGA	2	6	2065680	2065685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293510
44492	NC_015183	TCA	3	9	2065689	2065697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293510
44493	NC_015183	TGG	2	6	2065779	2065784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293510
44494	NC_015183	TCC	2	6	2065794	2065799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293510
44495	NC_015183	GCT	2	6	2065825	2065830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293510
44496	NC_015183	CGGTG	2	10	2065846	2065855	0 %	20 %	60 %	20 %	325293510
44497	NC_015183	TCG	2	6	2065880	2065885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293510
44498	NC_015183	TCG	2	6	2065977	2065982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293510
44499	NC_015183	GC	3	6	2066017	2066022	0 %	0 %	50 %	50 %	325293510
44500	NC_015183	GAA	2	6	2066046	2066051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293510

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