MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_015183	TGC	2	6	1970284	1970289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293422
42503	NC_015183	GCC	2	6	1970299	1970304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293422
42504	NC_015183	TCA	2	6	1970395	1970400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293422
42505	NC_015183	GC	3	6	1970412	1970417	0 %	0 %	50 %	50 %	325293422
42506	NC_015183	GCC	2	6	1970461	1970466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293422
42507	NC_015183	CGA	2	6	1970567	1970572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293422
42508	NC_015183	CGA	2	6	1970598	1970603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293422
42509	NC_015183	GCG	2	6	1970613	1970618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293422
42510	NC_015183	CAA	2	6	1970645	1970650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293422
42511	NC_015183	CGG	2	6	1970651	1970656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293422
42512	NC_015183	GCC	2	6	1970730	1970735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293422
42513	NC_015183	GATC	2	8	1970756	1970763	25 %	25 %	25 %	25 %	325293422
42514	NC_015183	CG	3	6	1970807	1970812	0 %	0 %	50 %	50 %	325293422
42515	NC_015183	CGTCA	2	10	1970829	1970838	20 %	20 %	20 %	40 %	325293422
42516	NC_015183	ATG	2	6	1970860	1970865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293422
42517	NC_015183	CAC	2	6	1970982	1970987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293422
42518	NC_015183	CAT	2	6	1970996	1971001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293422
42519	NC_015183	GAC	2	6	1971018	1971023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293422
42520	NC_015183	GGT	3	9	1971051	1971059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293422
42521	NC_015183	TGC	2	6	1971067	1971072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293422
42522	NC_015183	GCT	3	9	1971110	1971118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293422
42523	NC_015183	CCG	2	6	1971211	1971216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42524	NC_015183	AC	3	6	1971299	1971304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42525	NC_015183	CCG	2	6	1971324	1971329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293423
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42528	NC_015183	CG	3	6	1971365	1971370	0 %	0 %	50 %	50 %	325293423
42529	NC_015183	CAG	2	6	1971436	1971441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293423
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42542	NC_015183	AGG	2	6	1971965	1971970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293423
42543	NC_015183	GCT	3	9	1972056	1972064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293423
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42551	NC_015183	TGC	2	6	1972446	1972451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293423
42552	NC_015183	TTG	2	6	1972538	1972543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293423
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42560	NC_015183	GTTC	2	8	1972806	1972813	0 %	50 %	25 %	25 %	325293423
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42590	NC_015183	CAT	2	6	1974111	1974116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293423
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42594	NC_015183	GCGCC	2	10	1974267	1974276	0 %	0 %	40 %	60 %	325293423
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42599	NC_015183	ACGG	2	8	1974507	1974514	25 %	0 %	50 %	25 %	325293424
42600	NC_015183	CAC	2	6	1974515	1974520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293424
42601	NC_015183	TC	3	6	1974713	1974718	0 %	50 %	0 %	50 %	325293424
42602	NC_015183	CGGATG	2	12	1974790	1974801	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325293424
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42613	NC_015183	CG	3	6	1975243	1975248	0 %	0 %	50 %	50 %	325293424
42614	NC_015183	ACG	2	6	1975264	1975269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293424
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42839	NC_015183	AATC	2	8	1986168	1986175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42840	NC_015183	TTTG	2	8	1986191	1986198	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42841	NC_015183	GCCG	2	8	1986202	1986209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42842	NC_015183	GCG	2	6	1986223	1986228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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42846	NC_015183	CGA	2	6	1986369	1986374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293437
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42848	NC_015183	ATT	2	6	1986424	1986429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325293437
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42850	NC_015183	TGG	2	6	1986567	1986572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293437
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42916	NC_015183	CAAA	2	8	1989378	1989385	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42917	NC_015183	GA	3	6	1989417	1989422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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42923	NC_015183	TCC	2	6	1989647	1989652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42924	NC_015183	CAGGAA	2	12	1989663	1989674	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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42950	NC_015183	GAC	2	6	1991296	1991301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293442
42951	NC_015183	GGCC	2	8	1991374	1991381	0 %	0 %	50 %	50 %	325293442
42952	NC_015183	CGGGA	2	10	1991479	1991488	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
42953	NC_015183	CGG	2	6	1991525	1991530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293443
42954	NC_015183	CCGTG	2	10	1991543	1991552	0 %	20 %	40 %	40 %	325293443
42955	NC_015183	AAG	2	6	1991574	1991579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293443
42956	NC_015183	ACG	2	6	1991581	1991586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293443
42957	NC_015183	CAG	2	6	1991679	1991684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293443
42958	NC_015183	ATG	2	6	1991791	1991796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293443
42959	NC_015183	CATG	2	8	1991834	1991841	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42960	NC_015183	GCCT	2	8	1991843	1991850	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42961	NC_015183	GCC	2	6	1991855	1991860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42962	NC_015183	TTCC	2	8	1991922	1991929	0 %	50 %	0 %	50 %	325293444
42963	NC_015183	CGG	2	6	1991934	1991939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293444
42964	NC_015183	CAT	2	6	1991958	1991963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293444
42965	NC_015183	CGC	2	6	1992014	1992019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293444
42966	NC_015183	TCA	2	6	1992035	1992040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293444
42967	NC_015183	GCG	2	6	1992047	1992052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293444
42968	NC_015183	GCC	2	6	1992080	1992085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293444
42969	NC_015183	CAT	2	6	1992123	1992128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293444
42970	NC_015183	CGG	2	6	1992141	1992146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293444
42971	NC_015183	TGG	2	6	1992164	1992169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293444
42972	NC_015183	ATG	2	6	1992184	1992189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293444
42973	NC_015183	CAT	2	6	1992225	1992230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293444
42974	NC_015183	GAA	2	6	1992235	1992240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293444
42975	NC_015183	CGA	2	6	1992318	1992323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293444
42976	NC_015183	GC	3	6	1992328	1992333	0 %	0 %	50 %	50 %	325293444
42977	NC_015183	ATA	2	6	1992365	1992370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42978	NC_015183	CTC	2	6	1992424	1992429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42979	NC_015183	CAG	2	6	1992537	1992542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42980	NC_015183	CTG	2	6	1992586	1992591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293445
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42983	NC_015183	AGAT	2	8	1992659	1992666	50 %	25 %	25 %	0 %	325293445
42984	NC_015183	GAC	2	6	1992700	1992705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293445
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42988	NC_015183	TTC	2	6	1992845	1992850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293445
42989	NC_015183	CGA	2	6	1992969	1992974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293445
42990	NC_015183	ACA	2	6	1993002	1993007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293445
42991	NC_015183	CAAA	2	8	1993020	1993027	75 %	0 %	0 %	25 %	325293445
42992	NC_015183	TCATCG	2	12	1993041	1993052	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325293445
42993	NC_015183	ACA	2	6	1993113	1993118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293446
42994	NC_015183	T	6	6	1993121	1993126	0 %	100 %	0 %	0 %	325293446
42995	NC_015183	TGC	2	6	1993129	1993134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293446
42996	NC_015183	CGGC	2	8	1993161	1993168	0 %	0 %	50 %	50 %	325293446
42997	NC_015183	GCC	2	6	1993224	1993229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293446
42998	NC_015183	CGCAG	2	10	1993241	1993250	20 %	0 %	40 %	40 %	325293446
42999	NC_015183	ACG	2	6	1993251	1993256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293446
43000	NC_015183	CGG	2	6	1993264	1993269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293446

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