MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42001	NC_015183	GCCG	2	8	1947383	1947390	0 %	0 %	50 %	50 %	325293401
42002	NC_015183	CGA	2	6	1947394	1947399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293401
42003	NC_015183	ACCG	2	8	1947488	1947495	25 %	0 %	25 %	50 %	325293401
42004	NC_015183	CTG	2	6	1947509	1947514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293401
42005	NC_015183	GTG	2	6	1947522	1947527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293401
42006	NC_015183	GAA	2	6	1947539	1947544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293401
42007	NC_015183	A	6	6	1947569	1947574	100 %	0 %	0 %	0 %	325293401
42008	NC_015183	CGA	2	6	1947616	1947621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293401
42009	NC_015183	GGA	2	6	1947625	1947630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293401
42010	NC_015183	GCC	2	6	1947662	1947667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293401
42011	NC_015183	TC	3	6	1947685	1947690	0 %	50 %	0 %	50 %	325293401
42012	NC_015183	CAA	2	6	1947784	1947789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293401
42013	NC_015183	ACTGGC	2	12	1947838	1947849	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325293401
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42016	NC_015183	TCAAT	2	10	1948114	1948123	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42017	NC_015183	TGC	2	6	1948161	1948166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42038	NC_015183	TCGC	2	8	1948966	1948973	0 %	25 %	25 %	50 %	325293403
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42043	NC_015183	GGA	2	6	1949192	1949197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42044	NC_015183	TGA	2	6	1949269	1949274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293404
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42053	NC_015183	TCG	2	6	1949992	1949997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293405
42054	NC_015183	GCA	2	6	1950086	1950091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293405
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42089	NC_015183	A	7	7	1951647	1951653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42090	NC_015183	CAC	2	6	1951729	1951734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42091	NC_015183	GTC	2	6	1951788	1951793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42092	NC_015183	A	6	6	1951808	1951813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42093	NC_015183	CTT	2	6	1951824	1951829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42094	NC_015183	TTA	2	6	1951830	1951835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42101	NC_015183	TCGA	2	8	1952151	1952158	25 %	25 %	25 %	25 %	325293406
42102	NC_015183	CGC	2	6	1952177	1952182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293406
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42109	NC_015183	CGT	2	6	1952483	1952488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293406
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42115	NC_015183	CCTTC	2	10	1952648	1952657	0 %	40 %	0 %	60 %	325293406
42116	NC_015183	GAA	2	6	1952673	1952678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293406
42117	NC_015183	GATG	2	8	1952723	1952730	25 %	25 %	50 %	0 %	325293406
42118	NC_015183	CAT	2	6	1952741	1952746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293406
42119	NC_015183	CCG	2	6	1952785	1952790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293406
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42121	NC_015183	CGA	2	6	1952870	1952875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293406
42122	NC_015183	GGC	2	6	1952884	1952889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293406
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42125	NC_015183	GTC	2	6	1953102	1953107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293406
42126	NC_015183	GC	3	6	1953147	1953152	0 %	0 %	50 %	50 %	325293406
42127	NC_015183	GTC	2	6	1953171	1953176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293406
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42129	NC_015183	CCG	2	6	1953202	1953207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293406
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42131	NC_015183	TCA	2	6	1953292	1953297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293406
42132	NC_015183	GACCA	2	10	1953318	1953327	40 %	0 %	20 %	40 %	325293406
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42142	NC_015183	CGG	2	6	1953742	1953747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293406
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42144	NC_015183	TGA	2	6	1953931	1953936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293406
42145	NC_015183	GCC	2	6	1954063	1954068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293407
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42147	NC_015183	GCCA	2	8	1954101	1954108	25 %	0 %	25 %	50 %	325293407
42148	NC_015183	CAC	2	6	1954202	1954207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293407
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42154	NC_015183	GTC	2	6	1954497	1954502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293407
42155	NC_015183	GCC	2	6	1954527	1954532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293407
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42163	NC_015183	TGCCC	2	10	1955007	1955016	0 %	20 %	20 %	60 %	325293408
42164	NC_015183	CGAT	2	8	1955075	1955082	25 %	25 %	25 %	25 %	325293408
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42176	NC_015183	TGA	2	6	1955448	1955453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293408
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42182	NC_015183	GTC	2	6	1955755	1955760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293408
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42185	NC_015183	T	6	6	1955862	1955867	0 %	100 %	0 %	0 %	325293409
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42191	NC_015183	ACG	2	6	1956320	1956325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293409
42192	NC_015183	CGCC	2	8	1956342	1956349	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42193	NC_015183	ATT	2	6	1956359	1956364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325293410
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42207	NC_015183	CACC	2	8	1956923	1956930	25 %	0 %	0 %	75 %	325293410
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42212	NC_015183	CCT	2	6	1957118	1957123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42213	NC_015183	AG	3	6	1957143	1957148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42214	NC_015183	GAAG	2	8	1957189	1957196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42215	NC_015183	ACG	2	6	1957218	1957223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293411
42216	NC_015183	CAT	2	6	1957250	1957255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293411
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42218	NC_015183	CGGC	2	8	1957378	1957385	0 %	0 %	50 %	50 %	325293411
42219	NC_015183	TCCG	2	8	1957443	1957450	0 %	25 %	25 %	50 %	325293411
42220	NC_015183	GCG	2	6	1957495	1957500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293411
42221	NC_015183	TCG	2	6	1957536	1957541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293411
42222	NC_015183	TCA	2	6	1957554	1957559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293411
42223	NC_015183	GCC	2	6	1957571	1957576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293411
42224	NC_015183	TCG	2	6	1957599	1957604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293411
42225	NC_015183	CGT	2	6	1957879	1957884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293411
42226	NC_015183	AGCC	2	8	1957911	1957918	25 %	0 %	25 %	50 %	325293411
42227	NC_015183	CGG	2	6	1957920	1957925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293411
42228	NC_015183	GCT	2	6	1957945	1957950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293411
42229	NC_015183	CGA	2	6	1957951	1957956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293411
42230	NC_015183	ACCGAT	2	12	1957988	1957999	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325293411
42231	NC_015183	CCG	2	6	1958004	1958009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293411
42232	NC_015183	TCACC	2	10	1958041	1958050	20 %	20 %	0 %	60 %	325293411
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42332	NC_015183	AGAA	2	8	1961894	1961901	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42333	NC_015183	ACGG	2	8	1961923	1961930	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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42339	NC_015183	TTCA	2	8	1962148	1962155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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42346	NC_015183	GGC	2	6	1962714	1962719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293415
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42469	NC_015183	CTG	2	6	1968737	1968742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293421
42470	NC_015183	CCG	2	6	1968748	1968753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293421
42471	NC_015183	CAG	2	6	1968755	1968760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293421
42472	NC_015183	ACG	2	6	1968804	1968809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293421
42473	NC_015183	GCG	2	6	1968895	1968900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293421
42474	NC_015183	CTG	2	6	1968923	1968928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293421
42475	NC_015183	TCGACC	2	12	1969017	1969028	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325293421
42476	NC_015183	CAC	2	6	1969043	1969048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293421
42477	NC_015183	GCT	2	6	1969091	1969096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293421
42478	NC_015183	GCA	2	6	1969131	1969136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293421
42479	NC_015183	TCG	2	6	1969224	1969229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293421
42480	NC_015183	TCCAG	2	10	1969312	1969321	20 %	20 %	20 %	40 %	325293421
42481	NC_015183	GGAAA	2	10	1969394	1969403	60 %	0 %	40 %	0 %	325293421
42482	NC_015183	GCG	2	6	1969447	1969452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293421
42483	NC_015183	TCCG	2	8	1969454	1969461	0 %	25 %	25 %	50 %	325293421
42484	NC_015183	GC	3	6	1969473	1969478	0 %	0 %	50 %	50 %	325293421
42485	NC_015183	AAGGGA	2	12	1969498	1969509	50 %	0 %	50 %	0 %	325293421
42486	NC_015183	CAC	3	9	1969535	1969543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293421
42487	NC_015183	CTT	2	6	1969544	1969549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293421
42488	NC_015183	CGG	2	6	1969584	1969589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293421
42489	NC_015183	AGC	2	6	1969620	1969625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293421
42490	NC_015183	CAC	2	6	1969637	1969642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293421
42491	NC_015183	CAG	2	6	1969646	1969651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293421
42492	NC_015183	AGC	2	6	1969742	1969747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42493	NC_015183	CAAT	2	8	1969757	1969764	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42494	NC_015183	GA	3	6	1969824	1969829	50 %	0 %	50 %	0 %	325293422
42495	NC_015183	GC	3	6	1969840	1969845	0 %	0 %	50 %	50 %	325293422
42496	NC_015183	CTT	2	6	1969868	1969873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293422
42497	NC_015183	CGA	2	6	1970048	1970053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293422
42498	NC_015183	CCA	2	6	1970096	1970101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293422
42499	NC_015183	GCG	2	6	1970159	1970164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293422
42500	NC_015183	TTG	2	6	1970212	1970217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293422

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