MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_015183	ATC	2	6	1126501	1126506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292557
24502	NC_015183	CCGAT	2	10	1126514	1126523	20 %	20 %	20 %	40 %	325292557
24503	NC_015183	CGA	2	6	1126529	1126534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292557
24504	NC_015183	AGC	2	6	1126548	1126553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292557
24505	NC_015183	GAT	2	6	1126581	1126586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292557
24506	NC_015183	CCG	2	6	1126599	1126604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292557
24507	NC_015183	CCG	2	6	1126623	1126628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292557
24508	NC_015183	CGA	2	6	1126638	1126643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292557
24509	NC_015183	GTG	2	6	1126645	1126650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292557
24510	NC_015183	CGG	2	6	1126708	1126713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292557
24511	NC_015183	TCG	2	6	1126721	1126726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292557
24512	NC_015183	GCG	2	6	1126756	1126761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292557
24513	NC_015183	CGA	2	6	1126877	1126882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292557
24514	NC_015183	GGC	2	6	1126944	1126949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292557
24515	NC_015183	CTG	2	6	1126978	1126983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292557
24516	NC_015183	TGC	2	6	1126995	1127000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292557
24517	NC_015183	CCGC	2	8	1127061	1127068	0 %	0 %	25 %	75 %	325292557
24518	NC_015183	GCT	2	6	1127070	1127075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292557
24519	NC_015183	TGA	2	6	1127126	1127131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292558
24520	NC_015183	GCA	2	6	1127168	1127173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292558
24521	NC_015183	GCC	2	6	1127206	1127211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292558
24522	NC_015183	GCC	2	6	1127215	1127220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292558
24523	NC_015183	AGA	2	6	1127328	1127333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292558
24524	NC_015183	GCCGT	2	10	1127368	1127377	0 %	20 %	40 %	40 %	325292558
24525	NC_015183	TGGC	2	8	1127394	1127401	0 %	25 %	50 %	25 %	325292558
24526	NC_015183	CCGG	2	8	1127431	1127438	0 %	0 %	50 %	50 %	325292558
24527	NC_015183	CGA	2	6	1127508	1127513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292558
24528	NC_015183	GGCC	2	8	1127535	1127542	0 %	0 %	50 %	50 %	325292558
24529	NC_015183	CGC	2	6	1127573	1127578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292558
24530	NC_015183	GGC	2	6	1127644	1127649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292558
24531	NC_015183	GGTC	2	8	1127703	1127710	0 %	25 %	50 %	25 %	325292558
24532	NC_015183	CGG	2	6	1127766	1127771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292558
24533	NC_015183	GGT	2	6	1127796	1127801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292558
24534	NC_015183	GAA	2	6	1127905	1127910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292558
24535	NC_015183	TC	3	6	1127949	1127954	0 %	50 %	0 %	50 %	325292558
24536	NC_015183	GAAT	2	8	1127955	1127962	50 %	25 %	25 %	0 %	325292558
24537	NC_015183	CCG	2	6	1127996	1128001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292558
24538	NC_015183	GAC	2	6	1128007	1128012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292558
24539	NC_015183	CGA	2	6	1128015	1128020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292558
24540	NC_015183	CCG	2	6	1128052	1128057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292558
24541	NC_015183	GAT	2	6	1128060	1128065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292558
24542	NC_015183	CCG	2	6	1128107	1128112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292558
24543	NC_015183	GCC	2	6	1128177	1128182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292559
24544	NC_015183	GAT	2	6	1128206	1128211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292559
24545	NC_015183	CCG	2	6	1128311	1128316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292559
24546	NC_015183	TCGA	2	8	1128336	1128343	25 %	25 %	25 %	25 %	325292559
24547	NC_015183	CGG	2	6	1128380	1128385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292559
24548	NC_015183	ATGC	2	8	1128444	1128451	25 %	25 %	25 %	25 %	325292559
24549	NC_015183	GTG	2	6	1128618	1128623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292559
24550	NC_015183	CGG	2	6	1128663	1128668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24551	NC_015183	ATC	2	6	1128675	1128680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24552	NC_015183	ATA	2	6	1128735	1128740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325292560
24553	NC_015183	TGA	2	6	1128769	1128774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292560
24554	NC_015183	GC	3	6	1128949	1128954	0 %	0 %	50 %	50 %	325292560
24555	NC_015183	CAG	2	6	1128983	1128988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292560
24556	NC_015183	CT	3	6	1129016	1129021	0 %	50 %	0 %	50 %	325292560
24557	NC_015183	GTCGCC	2	12	1129065	1129076	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325292560
24558	NC_015183	GGC	2	6	1129094	1129099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292560
24559	NC_015183	TGA	2	6	1129138	1129143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292560
24560	NC_015183	TTGACG	2	12	1129269	1129280	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325292560
24561	NC_015183	CG	3	6	1129312	1129317	0 %	0 %	50 %	50 %	325292560
24562	NC_015183	GC	4	8	1129337	1129344	0 %	0 %	50 %	50 %	325292560
24563	NC_015183	CGG	2	6	1129354	1129359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292560
24564	NC_015183	GCAT	2	8	1129378	1129385	25 %	25 %	25 %	25 %	325292560
24565	NC_015183	CTT	2	6	1129436	1129441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292560
24566	NC_015183	GGT	2	6	1129475	1129480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292560
24567	NC_015183	CTT	2	6	1129518	1129523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292560
24568	NC_015183	ACG	2	6	1129525	1129530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292560
24569	NC_015183	TGC	2	6	1129555	1129560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292560
24570	NC_015183	TCG	2	6	1129579	1129584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292560
24571	NC_015183	GC	3	6	1129679	1129684	0 %	0 %	50 %	50 %	325292561
24572	NC_015183	GCC	2	6	1129690	1129695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292561
24573	NC_015183	CCG	2	6	1129752	1129757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292561
24574	NC_015183	TCA	2	6	1129799	1129804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292561
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24576	NC_015183	GCA	2	6	1129851	1129856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292561
24577	NC_015183	GCC	2	6	1129888	1129893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292561
24578	NC_015183	CTGG	2	8	1129896	1129903	0 %	25 %	50 %	25 %	325292561
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24581	NC_015183	GCC	2	6	1129972	1129977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292561
24582	NC_015183	GTCG	2	8	1129992	1129999	0 %	25 %	50 %	25 %	325292561
24583	NC_015183	CAT	2	6	1130019	1130024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292561
24584	NC_015183	GTG	2	6	1130068	1130073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292561
24585	NC_015183	GTG	2	6	1130098	1130103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292561
24586	NC_015183	TCG	2	6	1130117	1130122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292561
24587	NC_015183	TCG	2	6	1130168	1130173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292561
24588	NC_015183	AT	3	6	1130232	1130237	50 %	50 %	0 %	0 %	325292561
24589	NC_015183	GC	3	6	1130238	1130243	0 %	0 %	50 %	50 %	325292561
24590	NC_015183	CGC	2	6	1130266	1130271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292561
24591	NC_015183	ATT	2	6	1130275	1130280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325292561
24592	NC_015183	GCC	2	6	1130394	1130399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292561
24593	NC_015183	TAT	2	6	1130636	1130641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24594	NC_015183	AAT	3	9	1130682	1130690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24595	NC_015183	AC	3	6	1130718	1130723	50 %	0 %	0 %	50 %	325292562
24596	NC_015183	ATCCGG	2	12	1130877	1130888	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325292562
24597	NC_015183	GCCG	2	8	1130965	1130972	0 %	0 %	50 %	50 %	325292562
24598	NC_015183	CT	3	6	1130984	1130989	0 %	50 %	0 %	50 %	325292562
24599	NC_015183	GCG	2	6	1131014	1131019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292562
24600	NC_015183	CGG	2	6	1131219	1131224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292562
24601	NC_015183	TGC	2	6	1131246	1131251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292562
24602	NC_015183	CTG	2	6	1131274	1131279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292562
24603	NC_015183	CGA	2	6	1131293	1131298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292562
24604	NC_015183	CGA	2	6	1131342	1131347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292562
24605	NC_015183	GCG	2	6	1131360	1131365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292562
24606	NC_015183	GCT	2	6	1131375	1131380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292562
24607	NC_015183	GAG	2	6	1131454	1131459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292562
24608	NC_015183	TCA	2	6	1131512	1131517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292562
24609	NC_015183	GCT	2	6	1131518	1131523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292562
24610	NC_015183	GAC	2	6	1131531	1131536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292562
24611	NC_015183	GCT	2	6	1131552	1131557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292562
24612	NC_015183	GC	3	6	1131623	1131628	0 %	0 %	50 %	50 %	325292562
24613	NC_015183	CGGC	2	8	1131638	1131645	0 %	0 %	50 %	50 %	325292562
24614	NC_015183	GGC	2	6	1131649	1131654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292562
24615	NC_015183	CGA	3	9	1131723	1131731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292562
24616	NC_015183	CA	3	6	1131754	1131759	50 %	0 %	0 %	50 %	325292562
24617	NC_015183	CTG	2	6	1131762	1131767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292562
24618	NC_015183	AGG	2	6	1131769	1131774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24619	NC_015183	AAC	2	6	1131850	1131855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292563
24620	NC_015183	CGA	2	6	1132016	1132021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292563
24621	NC_015183	CG	3	6	1132193	1132198	0 %	0 %	50 %	50 %	325292563
24622	NC_015183	CG	4	8	1132209	1132216	0 %	0 %	50 %	50 %	325292563
24623	NC_015183	GGA	2	6	1132230	1132235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292563
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24627	NC_015183	CTT	2	6	1132321	1132326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292563
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24629	NC_015183	CGA	2	6	1132350	1132355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292563
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24641	NC_015183	TTA	2	6	1132958	1132963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24644	NC_015183	GTTTTC	2	12	1133069	1133080	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325292564
24645	NC_015183	CGA	2	6	1133156	1133161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292564
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24647	NC_015183	TCT	2	6	1133357	1133362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292564
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24675	NC_015183	CGG	2	6	1134876	1134881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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24724	NC_015183	TGAA	2	8	1136909	1136916	50 %	25 %	25 %	0 %	325292567
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24732	NC_015183	TCA	2	6	1137188	1137193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292567
24733	NC_015183	CGC	3	9	1137231	1137239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292567
24734	NC_015183	GC	3	6	1137238	1137243	0 %	0 %	50 %	50 %	325292567
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24762	NC_015183	ACCT	2	8	1138730	1138737	25 %	25 %	0 %	50 %	325292569
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24803	NC_015183	ATGG	2	8	1140656	1140663	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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24831	NC_015183	GGCC	2	8	1142125	1142132	0 %	0 %	50 %	50 %	325292572
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