MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_015183	CGG	2	6	1055495	1055500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23002	NC_015183	GAG	2	6	1055502	1055507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23003	NC_015183	GAT	2	6	1055708	1055713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292492
23004	NC_015183	GGC	2	6	1055732	1055737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292492
23005	NC_015183	GCC	2	6	1055745	1055750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292492
23006	NC_015183	CTG	2	6	1055763	1055768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292492
23007	NC_015183	CTA	2	6	1055855	1055860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292492
23008	NC_015183	CAT	2	6	1055864	1055869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292492
23009	NC_015183	TCA	2	6	1055914	1055919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292492
23010	NC_015183	CTG	2	6	1055952	1055957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292492
23011	NC_015183	CTGG	2	8	1055961	1055968	0 %	25 %	50 %	25 %	325292492
23012	NC_015183	GGC	2	6	1055988	1055993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292492
23013	NC_015183	TGG	2	6	1056035	1056040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292492
23014	NC_015183	GTT	2	6	1056188	1056193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292492
23015	NC_015183	GAT	2	6	1056290	1056295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292492
23016	NC_015183	CTGT	2	8	1056299	1056306	0 %	50 %	25 %	25 %	325292492
23017	NC_015183	TGC	2	6	1056313	1056318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292492
23018	NC_015183	GGCGCG	2	12	1056326	1056337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292492
23019	NC_015183	TGC	2	6	1056359	1056364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292492
23020	NC_015183	CGGA	2	8	1056369	1056376	25 %	0 %	50 %	25 %	325292492
23021	NC_015183	GC	3	6	1056401	1056406	0 %	0 %	50 %	50 %	325292492
23022	NC_015183	GCCG	2	8	1056443	1056450	0 %	0 %	50 %	50 %	325292492
23023	NC_015183	CGC	2	6	1056497	1056502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292492
23024	NC_015183	CTG	2	6	1056576	1056581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292492
23025	NC_015183	GTC	2	6	1056633	1056638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292492
23026	NC_015183	CTTC	2	8	1056796	1056803	0 %	50 %	0 %	50 %	325292492
23027	NC_015183	GCC	2	6	1056935	1056940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292492
23028	NC_015183	TGCG	2	8	1057016	1057023	0 %	25 %	50 %	25 %	325292492
23029	NC_015183	TAT	2	6	1057041	1057046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325292492
23030	NC_015183	GCT	2	6	1057073	1057078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292492
23031	NC_015183	CGA	2	6	1057096	1057101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292492
23032	NC_015183	CGT	2	6	1057109	1057114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292492
23033	NC_015183	TCGA	2	8	1057257	1057264	25 %	25 %	25 %	25 %	325292492
23034	NC_015183	GCA	2	6	1057304	1057309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292492
23035	NC_015183	GAT	2	6	1057353	1057358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292492
23036	NC_015183	GAG	2	6	1057407	1057412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292492
23037	NC_015183	GATC	2	8	1057418	1057425	25 %	25 %	25 %	25 %	325292492
23038	NC_015183	AGAGC	2	10	1057538	1057547	40 %	0 %	40 %	20 %	325292492
23039	NC_015183	GCT	2	6	1057550	1057555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292492
23040	NC_015183	CGCC	2	8	1057597	1057604	0 %	0 %	25 %	75 %	325292492
23041	NC_015183	CAT	2	6	1057660	1057665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23042	NC_015183	CTC	2	6	1057720	1057725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292493
23043	NC_015183	GCG	2	6	1057893	1057898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292493
23044	NC_015183	CTTC	2	8	1057977	1057984	0 %	50 %	0 %	50 %	325292493
23045	NC_015183	T	6	6	1057985	1057990	0 %	100 %	0 %	0 %	325292493
23046	NC_015183	GAC	2	6	1057999	1058004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292493
23047	NC_015183	TCC	2	6	1058018	1058023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292493
23048	NC_015183	CCA	2	6	1058058	1058063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292493
23049	NC_015183	TGTCGA	2	12	1058166	1058177	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325292493
23050	NC_015183	TGGT	2	8	1058180	1058187	0 %	50 %	50 %	0 %	325292493
23051	NC_015183	TCG	2	6	1058192	1058197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292493
23052	NC_015183	CAG	2	6	1058239	1058244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292493
23053	NC_015183	CCG	2	6	1058258	1058263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292493
23054	NC_015183	TCT	2	6	1058289	1058294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292493
23055	NC_015183	TGC	2	6	1058411	1058416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292493
23056	NC_015183	AAG	2	6	1058420	1058425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292493
23057	NC_015183	CGCC	2	8	1058457	1058464	0 %	0 %	25 %	75 %	325292493
23058	NC_015183	GCG	2	6	1058466	1058471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292493
23059	NC_015183	TTGCCG	2	12	1058507	1058518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292493
23060	NC_015183	AGC	2	6	1058528	1058533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292493
23061	NC_015183	GTC	2	6	1058542	1058547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292493
23062	NC_015183	GCT	2	6	1058568	1058573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292493
23063	NC_015183	CACCG	2	10	1058602	1058611	20 %	0 %	20 %	60 %	325292493
23064	NC_015183	CGA	2	6	1058622	1058627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292493
23065	NC_015183	GCT	2	6	1058640	1058645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292493
23066	NC_015183	CGG	2	6	1058691	1058696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292493
23067	NC_015183	GC	3	6	1058743	1058748	0 %	0 %	50 %	50 %	325292493
23068	NC_015183	TGG	2	6	1058751	1058756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292493
23069	NC_015183	GC	3	6	1058797	1058802	0 %	0 %	50 %	50 %	325292493
23070	NC_015183	CGT	2	6	1058805	1058810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292493
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23072	NC_015183	TCT	2	6	1058898	1058903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292493
23073	NC_015183	CAG	2	6	1058938	1058943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292493
23074	NC_015183	TGA	2	6	1058958	1058963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292493
23075	NC_015183	CCAG	2	8	1059000	1059007	25 %	0 %	25 %	50 %	325292493
23076	NC_015183	TAGT	2	8	1059029	1059036	25 %	50 %	25 %	0 %	325292493
23077	NC_015183	TCG	2	6	1059041	1059046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292493
23078	NC_015183	AGC	2	6	1059047	1059052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292493
23079	NC_015183	AGG	2	6	1059053	1059058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292493
23080	NC_015183	GCC	2	6	1059106	1059111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292493
23081	NC_015183	CCG	2	6	1059189	1059194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292493
23082	NC_015183	CAG	2	6	1059271	1059276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292493
23083	NC_015183	CGG	2	6	1059294	1059299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292493
23084	NC_015183	TTC	2	6	1059322	1059327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292493
23085	NC_015183	GC	3	6	1059361	1059366	0 %	0 %	50 %	50 %	325292493
23086	NC_015183	TGA	2	6	1059414	1059419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292493
23087	NC_015183	GCGG	2	8	1059526	1059533	0 %	0 %	75 %	25 %	325292493
23088	NC_015183	GTAATC	2	12	1059542	1059553	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325292493
23089	NC_015183	GC	5	10	1059593	1059602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23090	NC_015183	CAGAT	2	10	1059608	1059617	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23091	NC_015183	GCT	2	6	1059650	1059655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292494
23092	NC_015183	CAG	2	6	1059722	1059727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292494
23093	NC_015183	CCGA	2	8	1059789	1059796	25 %	0 %	25 %	50 %	325292494
23094	NC_015183	CCG	2	6	1059927	1059932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292494
23095	NC_015183	CTT	2	6	1059953	1059958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292494
23096	NC_015183	TTG	2	6	1059999	1060004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292494
23097	NC_015183	CGG	2	6	1060006	1060011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292494
23098	NC_015183	AGC	2	6	1060056	1060061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292494
23099	NC_015183	GCC	2	6	1060125	1060130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292494
23100	NC_015183	TCA	2	6	1060210	1060215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292494
23101	NC_015183	GCAG	2	8	1060293	1060300	25 %	0 %	50 %	25 %	325292494
23102	NC_015183	CG	3	6	1060368	1060373	0 %	0 %	50 %	50 %	325292494
23103	NC_015183	GCG	2	6	1060483	1060488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292494
23104	NC_015183	T	6	6	1060646	1060651	0 %	100 %	0 %	0 %	325292494
23105	NC_015183	CGCC	2	8	1060654	1060661	0 %	0 %	25 %	75 %	325292494
23106	NC_015183	CCAATA	2	12	1060681	1060692	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23107	NC_015183	TTG	2	6	1060720	1060725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23108	NC_015183	ATT	2	6	1060732	1060737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23109	NC_015183	AGT	2	6	1060845	1060850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23110	NC_015183	TGATT	2	10	1060862	1060871	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23111	NC_015183	GGC	2	6	1060875	1060880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23112	NC_015183	CAT	2	6	1060897	1060902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23113	NC_015183	AGA	2	6	1060912	1060917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23114	NC_015183	GAC	2	6	1060931	1060936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292495
23115	NC_015183	TC	3	6	1060984	1060989	0 %	50 %	0 %	50 %	325292495
23116	NC_015183	GAG	2	6	1061040	1061045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292495
23117	NC_015183	GGA	2	6	1061078	1061083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292495
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23219	NC_015183	T	7	7	1065894	1065900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23220	NC_015183	TCA	2	6	1065997	1066002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292503
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23229	NC_015183	ACC	2	6	1066355	1066360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292503
23230	NC_015183	CTTC	2	8	1066456	1066463	0 %	50 %	0 %	50 %	325292503
23231	NC_015183	GCG	2	6	1066478	1066483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292503
23232	NC_015183	CAT	2	6	1066499	1066504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292503
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23234	NC_015183	CCA	3	9	1066588	1066596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292503
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23350	NC_015183	TGG	2	6	1072086	1072091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292508
23351	NC_015183	CAT	2	6	1072138	1072143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292508
23352	NC_015183	GCG	2	6	1072217	1072222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292508
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23431	NC_015183	CGA	2	6	1076535	1076540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23433	NC_015183	TGCG	2	8	1076586	1076593	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23434	NC_015183	ATA	2	6	1076594	1076599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23442	NC_015183	TGC	2	6	1077139	1077144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292513
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23448	NC_015183	CGC	2	6	1077747	1077752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292514
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23455	NC_015183	GCA	2	6	1078011	1078016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292514
23456	NC_015183	TGA	2	6	1078032	1078037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292514
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23461	NC_015183	CGTGC	2	10	1078401	1078410	0 %	20 %	40 %	40 %	325292515
23462	NC_015183	CCG	2	6	1078463	1078468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292515
23463	NC_015183	GGC	2	6	1078488	1078493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292515
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23466	NC_015183	CGG	2	6	1078628	1078633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292515
23467	NC_015183	CG	3	6	1078652	1078657	0 %	0 %	50 %	50 %	325292515
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23486	NC_015183	TG	3	6	1079564	1079569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23487	NC_015183	GCGCA	2	10	1079594	1079603	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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23499	NC_015183	CTG	2	6	1080092	1080097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292516
23500	NC_015183	GCT	2	6	1080148	1080153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292516

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