MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_015183	GCA	2	6	1009305	1009310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292446
22003	NC_015183	GGT	2	6	1009435	1009440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292446
22004	NC_015183	GGC	2	6	1009466	1009471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292446
22005	NC_015183	CCGC	2	8	1009501	1009508	0 %	0 %	25 %	75 %	325292446
22006	NC_015183	CGG	2	6	1009551	1009556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292446
22007	NC_015183	CCA	2	6	1009585	1009590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292446
22008	NC_015183	TC	3	6	1009615	1009620	0 %	50 %	0 %	50 %	325292446
22009	NC_015183	CCCA	2	8	1009655	1009662	25 %	0 %	0 %	75 %	325292446
22010	NC_015183	GAA	2	6	1009675	1009680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292446
22011	NC_015183	CGG	2	6	1009737	1009742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292446
22012	NC_015183	GCA	2	6	1009745	1009750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292446
22013	NC_015183	TCA	2	6	1009758	1009763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292446
22014	NC_015183	GGC	2	6	1009766	1009771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292446
22015	NC_015183	TCA	2	6	1009836	1009841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292446
22016	NC_015183	GGC	2	6	1009934	1009939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292446
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22018	NC_015183	TCA	2	6	1009962	1009967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292446
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22031	NC_015183	CGGAA	2	10	1010582	1010591	40 %	0 %	40 %	20 %	325292447
22032	NC_015183	TG	3	6	1010619	1010624	0 %	50 %	50 %	0 %	325292447
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22039	NC_015183	CAG	2	6	1011092	1011097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292447
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22041	NC_015183	ATT	2	6	1011189	1011194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22042	NC_015183	GAT	2	6	1011320	1011325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22043	NC_015183	TCA	2	6	1011357	1011362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22044	NC_015183	GCCT	2	8	1011385	1011392	0 %	25 %	25 %	50 %	325292448
22045	NC_015183	C	6	6	1011397	1011402	0 %	0 %	0 %	100 %	325292448
22046	NC_015183	GGGCA	2	10	1011530	1011539	20 %	0 %	60 %	20 %	325292448
22047	NC_015183	GCA	2	6	1011597	1011602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292448
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22049	NC_015183	AGCC	2	8	1011617	1011624	25 %	0 %	25 %	50 %	325292448
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22051	NC_015183	TGCG	2	8	1011651	1011658	0 %	25 %	50 %	25 %	325292448
22052	NC_015183	CG	3	6	1011696	1011701	0 %	0 %	50 %	50 %	325292448
22053	NC_015183	CG	3	6	1011752	1011757	0 %	0 %	50 %	50 %	325292448
22054	NC_015183	CTT	2	6	1011766	1011771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292448
22055	NC_015183	CAT	2	6	1011811	1011816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292448
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22073	NC_015183	TGC	2	6	1012687	1012692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292449
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22093	NC_015183	GCCAT	2	10	1013502	1013511	20 %	20 %	20 %	40 %	325292451
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22101	NC_015183	CGC	2	6	1013731	1013736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292451
22102	NC_015183	CCG	2	6	1013745	1013750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292451
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22106	NC_015183	CGTT	2	8	1013878	1013885	0 %	50 %	25 %	25 %	325292452
22107	NC_015183	GCA	2	6	1013903	1013908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292452
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22109	NC_015183	ACGG	2	8	1014031	1014038	25 %	0 %	50 %	25 %	325292452
22110	NC_015183	CAC	2	6	1014208	1014213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22111	NC_015183	CTGCC	2	10	1014217	1014226	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22112	NC_015183	G	6	6	1014244	1014249	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22113	NC_015183	CCTA	2	8	1014271	1014278	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22114	NC_015183	GC	3	6	1014306	1014311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22115	NC_015183	GGCAG	2	10	1014346	1014355	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
22116	NC_015183	GCA	3	9	1014376	1014384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22117	NC_015183	GTC	3	9	1014406	1014414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292453
22118	NC_015183	TCG	2	6	1014472	1014477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292453
22119	NC_015183	TTC	2	6	1014502	1014507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292453
22120	NC_015183	TTC	2	6	1014580	1014585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292453
22121	NC_015183	GCG	2	6	1014604	1014609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292453
22122	NC_015183	GGC	2	6	1014648	1014653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292453
22123	NC_015183	CGG	2	6	1014680	1014685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292453
22124	NC_015183	GTC	2	6	1014699	1014704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292453
22125	NC_015183	GCC	2	6	1014754	1014759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292453
22126	NC_015183	TCA	2	6	1014833	1014838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292453
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22129	NC_015183	GCA	2	6	1014896	1014901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292453
22130	NC_015183	CGC	2	6	1015064	1015069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292453
22131	NC_015183	TCT	2	6	1015214	1015219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292453
22132	NC_015183	TG	3	6	1015220	1015225	0 %	50 %	50 %	0 %	325292453
22133	NC_015183	CG	4	8	1015238	1015245	0 %	0 %	50 %	50 %	325292453
22134	NC_015183	CTG	2	6	1015251	1015256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292453
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22140	NC_015183	GCAG	2	8	1015421	1015428	25 %	0 %	50 %	25 %	325292453
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22142	NC_015183	CGG	2	6	1015460	1015465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292453
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22144	NC_015183	GCA	2	6	1015601	1015606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292453
22145	NC_015183	GC	3	6	1015638	1015643	0 %	0 %	50 %	50 %	325292453
22146	NC_015183	ACAT	2	8	1015684	1015691	50 %	25 %	0 %	25 %	325292453
22147	NC_015183	GGT	2	6	1015857	1015862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22148	NC_015183	ATT	2	6	1015875	1015880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22149	NC_015183	CAG	3	9	1015881	1015889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22150	NC_015183	GTT	2	6	1015899	1015904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22151	NC_015183	TGCCT	2	10	1015909	1015918	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22152	NC_015183	CAC	2	6	1016037	1016042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292454
22153	NC_015183	AGGCG	2	10	1016070	1016079	20 %	0 %	60 %	20 %	325292454
22154	NC_015183	GGC	3	9	1016091	1016099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292454
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22158	NC_015183	CG	3	6	1016322	1016327	0 %	0 %	50 %	50 %	325292454
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22164	NC_015183	ATTC	2	8	1016754	1016761	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22165	NC_015183	CGC	2	6	1016807	1016812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22166	NC_015183	CGCC	2	8	1016831	1016838	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22167	NC_015183	A	6	6	1016841	1016846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22168	NC_015183	ACC	2	6	1016850	1016855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22169	NC_015183	TGC	2	6	1016918	1016923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292455
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22172	NC_015183	AAT	2	6	1016975	1016980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325292455
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22174	NC_015183	TCGA	2	8	1017043	1017050	25 %	25 %	25 %	25 %	325292455
22175	NC_015183	TTGG	2	8	1017108	1017115	0 %	50 %	50 %	0 %	325292455
22176	NC_015183	AGC	2	6	1017118	1017123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292455
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22183	NC_015183	GCTTGA	2	12	1017317	1017328	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325292455
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22193	NC_015183	GAT	2	6	1017669	1017674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292455
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22209	NC_015183	GC	3	6	1018485	1018490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22210	NC_015183	TGCA	2	8	1018493	1018500	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22211	NC_015183	ATT	2	6	1018524	1018529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325292456
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22215	NC_015183	CGA	2	6	1018754	1018759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292456
22216	NC_015183	CG	3	6	1018775	1018780	0 %	0 %	50 %	50 %	325292456
22217	NC_015183	GAT	2	6	1018833	1018838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292456
22218	NC_015183	TGA	2	6	1018859	1018864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292456
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22220	NC_015183	GAC	2	6	1018893	1018898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292456
22221	NC_015183	GGCGAT	2	12	1018911	1018922	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325292456
22222	NC_015183	GTC	2	6	1018926	1018931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292456
22223	NC_015183	GCA	2	6	1018955	1018960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292456
22224	NC_015183	ATA	2	6	1018974	1018979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325292456
22225	NC_015183	GGC	3	9	1018980	1018988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292456
22226	NC_015183	AAC	2	6	1019067	1019072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292456
22227	NC_015183	GTC	2	6	1019207	1019212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292457
22228	NC_015183	GC	3	6	1019249	1019254	0 %	0 %	50 %	50 %	325292457
22229	NC_015183	GCG	2	6	1019337	1019342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292457
22230	NC_015183	CTT	2	6	1019362	1019367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292457
22231	NC_015183	CGG	2	6	1019440	1019445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292457
22232	NC_015183	CCG	2	6	1019523	1019528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292457
22233	NC_015183	CGT	2	6	1019545	1019550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292457
22234	NC_015183	CGC	2	6	1019566	1019571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292457
22235	NC_015183	CGGCG	3	15	1019629	1019643	0 %	0 %	60 %	40 %	325292457
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22261	NC_015183	TGG	2	6	1020650	1020655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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22335	NC_015183	ATG	2	6	1024088	1024093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292462
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22337	NC_015183	CTG	3	9	1024124	1024132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292462
22338	NC_015183	CGC	2	6	1024152	1024157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292462
22339	NC_015183	A	6	6	1024163	1024168	100 %	0 %	0 %	0 %	325292462
22340	NC_015183	CTG	2	6	1024289	1024294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292462
22341	NC_015183	CGT	2	6	1024312	1024317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292462
22342	NC_015183	TATAG	2	10	1024450	1024459	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22343	NC_015183	AAT	2	6	1024542	1024547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22344	NC_015183	TTG	2	6	1024564	1024569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22345	NC_015183	AAT	2	6	1024623	1024628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22346	NC_015183	A	6	6	1024647	1024652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22347	NC_015183	TCA	3	9	1024665	1024673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22348	NC_015183	GCTC	2	8	1024731	1024738	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22349	NC_015183	ATC	2	6	1024741	1024746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22350	NC_015183	TAA	2	6	1024781	1024786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22351	NC_015183	GAAA	2	8	1024845	1024852	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22352	NC_015183	A	7	7	1024866	1024872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22353	NC_015183	GAA	2	6	1024978	1024983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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22357	NC_015183	GAA	2	6	1025316	1025321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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22359	NC_015183	A	6	6	1025385	1025390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22467	NC_015183	GCC	2	6	1029709	1029714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292466
22468	NC_015183	CGTG	2	8	1029751	1029758	0 %	25 %	50 %	25 %	325292466
22469	NC_015183	GAC	2	6	1029766	1029771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292466
22470	NC_015183	AGG	2	6	1029825	1029830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292466
22471	NC_015183	CGA	2	6	1029859	1029864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292466
22472	NC_015183	GCAGGC	2	12	1029883	1029894	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325292466
22473	NC_015183	CAG	2	6	1029941	1029946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292466
22474	NC_015183	CGC	2	6	1029952	1029957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292466
22475	NC_015183	GGC	2	6	1029982	1029987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292466
22476	NC_015183	GC	3	6	1029996	1030001	0 %	0 %	50 %	50 %	325292466
22477	NC_015183	TCA	2	6	1030050	1030055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292466
22478	NC_015183	ATC	2	6	1030175	1030180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292466
22479	NC_015183	GATC	2	8	1030243	1030250	25 %	25 %	25 %	25 %	325292466
22480	NC_015183	ATG	2	6	1030359	1030364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292466
22481	NC_015183	CGC	2	6	1030451	1030456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292466
22482	NC_015183	TCA	2	6	1030512	1030517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292466
22483	NC_015183	GGT	2	6	1030627	1030632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292466
22484	NC_015183	CGG	2	6	1030674	1030679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292466
22485	NC_015183	C	6	6	1030827	1030832	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22486	NC_015183	GGCAG	2	10	1030850	1030859	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
22487	NC_015183	G	6	6	1030861	1030866	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22488	NC_015183	CA	3	6	1030876	1030881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22489	NC_015183	A	7	7	1030898	1030904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22490	NC_015183	TCG	4	12	1030958	1030969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292467
22491	NC_015183	GAA	2	6	1030990	1030995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292467
22492	NC_015183	CGG	2	6	1031040	1031045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292467
22493	NC_015183	CTT	2	6	1031079	1031084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292467
22494	NC_015183	GTGCAG	2	12	1031131	1031142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325292467
22495	NC_015183	GTTCA	2	10	1031179	1031188	20 %	40 %	20 %	20 %	325292467
22496	NC_015183	ACG	2	6	1031234	1031239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292467
22497	NC_015183	AGC	2	6	1031245	1031250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292467
22498	NC_015183	ACG	2	6	1031291	1031296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292467
22499	NC_015183	GC	3	6	1031375	1031380	0 %	0 %	50 %	50 %	325292467
22500	NC_015183	TTG	2	6	1031399	1031404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292467

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