MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_015183	TCA	2	6	964611	964616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292403
21002	NC_015183	TCG	2	6	964731	964736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292403
21003	NC_015183	GCC	2	6	964829	964834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292403
21004	NC_015183	GCA	2	6	964960	964965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292403
21005	NC_015183	GCA	2	6	964969	964974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292403
21006	NC_015183	CGG	2	6	964999	965004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292403
21007	NC_015183	GGC	2	6	965108	965113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292403
21008	NC_015183	GTTGCC	2	12	965168	965179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292403
21009	NC_015183	TGC	2	6	965189	965194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292403
21010	NC_015183	CGGC	2	8	965310	965317	0 %	0 %	50 %	50 %	325292403
21011	NC_015183	GCG	2	6	965385	965390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292403
21012	NC_015183	GCC	2	6	965424	965429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292403
21013	NC_015183	GAA	2	6	965435	965440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292403
21014	NC_015183	GCCCG	2	10	965453	965462	0 %	0 %	40 %	60 %	325292403
21015	NC_015183	CCG	2	6	965470	965475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292403
21016	NC_015183	AAT	2	6	965488	965493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325292403
21017	NC_015183	CCAG	2	8	965591	965598	25 %	0 %	25 %	50 %	325292403
21018	NC_015183	CGC	2	6	965692	965697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292403
21019	NC_015183	GC	3	6	965696	965701	0 %	0 %	50 %	50 %	325292403
21020	NC_015183	GAT	2	6	965702	965707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292403
21021	NC_015183	CGC	2	6	965709	965714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292403
21022	NC_015183	CCA	2	6	965720	965725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292403
21023	NC_015183	TGC	2	6	965777	965782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292403
21024	NC_015183	CTG	2	6	965798	965803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292403
21025	NC_015183	GC	3	6	965822	965827	0 %	0 %	50 %	50 %	325292403
21026	NC_015183	CAG	2	6	965873	965878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292403
21027	NC_015183	GCA	2	6	965902	965907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292403
21028	NC_015183	CGG	2	6	965908	965913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292403
21029	NC_015183	ATCC	2	8	965996	966003	25 %	25 %	0 %	50 %	325292403
21030	NC_015183	CGG	2	6	966016	966021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292403
21031	NC_015183	CCGG	2	8	966178	966185	0 %	0 %	50 %	50 %	325292403
21032	NC_015183	GC	3	6	966255	966260	0 %	0 %	50 %	50 %	325292403
21033	NC_015183	GCTC	2	8	966289	966296	0 %	25 %	25 %	50 %	325292403
21034	NC_015183	CGG	2	6	966313	966318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292403
21035	NC_015183	CGTGT	2	10	966414	966423	0 %	40 %	40 %	20 %	325292403
21036	NC_015183	CAG	2	6	966535	966540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292403
21037	NC_015183	CGGCA	2	10	966566	966575	20 %	0 %	40 %	40 %	325292403
21038	NC_015183	GGCC	2	8	966589	966596	0 %	0 %	50 %	50 %	325292403
21039	NC_015183	GCC	2	6	966627	966632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292403
21040	NC_015183	TCA	2	6	966667	966672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292403
21041	NC_015183	CTT	2	6	966692	966697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292403
21042	NC_015183	GCG	2	6	966856	966861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21043	NC_015183	T	6	6	966880	966885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21044	NC_015183	TG	3	6	966981	966986	0 %	50 %	50 %	0 %	325292404
21045	NC_015183	GCC	2	6	967118	967123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292404
21046	NC_015183	GCA	2	6	967149	967154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292404
21047	NC_015183	ACG	2	6	967175	967180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292404
21048	NC_015183	GCG	2	6	967244	967249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292404
21049	NC_015183	CAA	2	6	967282	967287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292404
21050	NC_015183	GCT	2	6	967342	967347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292404
21051	NC_015183	GGT	2	6	967348	967353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292404
21052	NC_015183	ACA	2	6	967365	967370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292404
21053	NC_015183	CGC	2	6	967452	967457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292404
21054	NC_015183	GGT	2	6	967462	967467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292404
21055	NC_015183	TCG	2	6	967518	967523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292404
21056	NC_015183	GGC	2	6	967640	967645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292404
21057	NC_015183	GGC	2	6	967702	967707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292404
21058	NC_015183	GGC	2	6	967829	967834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292404
21059	NC_015183	TGA	2	6	967857	967862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292404
21060	NC_015183	TGA	2	6	967920	967925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292404
21061	NC_015183	GC	3	6	967953	967958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21062	NC_015183	CG	3	6	967989	967994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21063	NC_015183	CTTTT	2	10	967996	968005	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21064	NC_015183	ACG	2	6	968010	968015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21065	NC_015183	CAGC	2	8	968108	968115	25 %	0 %	25 %	50 %	325292405
21066	NC_015183	GTG	2	6	968118	968123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292405
21067	NC_015183	ATC	2	6	968169	968174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292405
21068	NC_015183	AAGGC	2	10	968230	968239	40 %	0 %	40 %	20 %	325292405
21069	NC_015183	TCA	2	6	968287	968292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292405
21070	NC_015183	GCCGC	2	10	968339	968348	0 %	0 %	40 %	60 %	325292405
21071	NC_015183	TGC	2	6	968359	968364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292405
21072	NC_015183	GC	3	6	968390	968395	0 %	0 %	50 %	50 %	325292405
21073	NC_015183	ACTGGC	2	12	968471	968482	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325292405
21074	NC_015183	AAG	2	6	968490	968495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292405
21075	NC_015183	GCT	2	6	968552	968557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292405
21076	NC_015183	CAA	2	6	968564	968569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292405
21077	NC_015183	GCC	2	6	968615	968620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21078	NC_015183	CG	3	6	968628	968633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21079	NC_015183	GA	3	6	968636	968641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21080	NC_015183	CGC	2	6	968739	968744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292406
21081	NC_015183	GCC	2	6	968803	968808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292406
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21085	NC_015183	GCC	2	6	968944	968949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292406
21086	NC_015183	TTG	2	6	968989	968994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292406
21087	NC_015183	TCC	2	6	969052	969057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292406
21088	NC_015183	TGA	2	6	969068	969073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292406
21089	NC_015183	CGA	2	6	969134	969139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292406
21090	NC_015183	CG	3	6	969169	969174	0 %	0 %	50 %	50 %	325292406
21091	NC_015183	TCG	2	6	969223	969228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292406
21092	NC_015183	TCT	2	6	969251	969256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292406
21093	NC_015183	CGA	2	6	969258	969263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292406
21094	NC_015183	CAC	2	6	969300	969305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292406
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21099	NC_015183	TGG	2	6	969389	969394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292406
21100	NC_015183	TCC	2	6	969400	969405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292406
21101	NC_015183	CGG	4	12	969407	969418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292406
21102	NC_015183	GCT	2	6	969430	969435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292406
21103	NC_015183	CTG	2	6	969438	969443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292406
21104	NC_015183	GTC	2	6	969462	969467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292406
21105	NC_015183	CG	3	6	969485	969490	0 %	0 %	50 %	50 %	325292406
21106	NC_015183	TTG	2	6	969505	969510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292406
21107	NC_015183	CGA	2	6	969518	969523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292406
21108	NC_015183	GAGGT	2	10	969616	969625	20 %	20 %	60 %	0 %	325292406
21109	NC_015183	GTT	2	6	969651	969656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292406
21110	NC_015183	TGCTCC	2	12	969673	969684	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325292406
21111	NC_015183	TGT	2	6	969700	969705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292406
21112	NC_015183	CGG	2	6	969725	969730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292406
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21114	NC_015183	CGT	2	6	969803	969808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292406
21115	NC_015183	CTT	2	6	969813	969818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292406
21116	NC_015183	CTT	2	6	969822	969827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292406
21117	NC_015183	CCAGCC	2	12	969920	969931	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325292406
21118	NC_015183	GC	3	6	970083	970088	0 %	0 %	50 %	50 %	325292406
21119	NC_015183	GA	3	6	970107	970112	50 %	0 %	50 %	0 %	325292406
21120	NC_015183	GA	3	6	970119	970124	50 %	0 %	50 %	0 %	325292406
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21244	NC_015183	GGC	2	6	975969	975974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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21246	NC_015183	GCTG	2	8	976054	976061	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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21479	NC_015183	GC	3	6	986474	986479	0 %	0 %	50 %	50 %	325292423
21480	NC_015183	AGC	2	6	986480	986485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292423
21481	NC_015183	GCCA	2	8	986493	986500	25 %	0 %	25 %	50 %	325292423
21482	NC_015183	GGC	2	6	986699	986704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292423
21483	NC_015183	CTG	2	6	986734	986739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292423
21484	NC_015183	GGT	2	6	986774	986779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292423
21485	NC_015183	GCG	2	6	986801	986806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292423
21486	NC_015183	AGACCG	2	12	986823	986834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292423
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21488	NC_015183	TCGA	2	8	986889	986896	25 %	25 %	25 %	25 %	325292423
21489	NC_015183	TGA	2	6	986902	986907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292423
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21491	NC_015183	AGCGCC	2	12	986922	986933	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325292423
21492	NC_015183	CAG	2	6	986966	986971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292423
21493	NC_015183	CCG	2	6	987055	987060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292423
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21495	NC_015183	CGA	2	6	987106	987111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292423
21496	NC_015183	CTT	2	6	987115	987120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292423
21497	NC_015183	TCT	3	9	987135	987143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292423
21498	NC_015183	TCCGCC	2	12	987177	987188	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	325292423
21499	NC_015183	AGAGG	2	10	987198	987207	40 %	0 %	60 %	0 %	325292423
21500	NC_015183	GTTT	2	8	987431	987438	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

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