MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_015183	GCT	2	6	874447	874452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292311
19002	NC_015183	CCG	2	6	874489	874494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292311
19003	NC_015183	GGCT	2	8	874547	874554	0 %	25 %	50 %	25 %	325292311
19004	NC_015183	GCC	2	6	874555	874560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292311
19005	NC_015183	TGG	2	6	874604	874609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292311
19006	NC_015183	CG	4	8	874660	874667	0 %	0 %	50 %	50 %	325292311
19007	NC_015183	TGG	2	6	874719	874724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292311
19008	NC_015183	CGG	2	6	874749	874754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292311
19009	NC_015183	GCC	2	6	874864	874869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19010	NC_015183	TCCGCC	2	12	874988	874999	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	325292312
19011	NC_015183	TCA	2	6	875055	875060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292312
19012	NC_015183	CAG	2	6	875063	875068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292312
19013	NC_015183	CTG	2	6	875147	875152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292312
19014	NC_015183	CG	3	6	875198	875203	0 %	0 %	50 %	50 %	325292312
19015	NC_015183	CG	3	6	875262	875267	0 %	0 %	50 %	50 %	325292312
19016	NC_015183	CGC	2	6	875276	875281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292312
19017	NC_015183	CGC	2	6	875299	875304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292312
19018	NC_015183	CCG	2	6	875431	875436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292312
19019	NC_015183	CG	3	6	875463	875468	0 %	0 %	50 %	50 %	325292312
19020	NC_015183	CGA	2	6	875560	875565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292312
19021	NC_015183	GCC	2	6	875586	875591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292312
19022	NC_015183	GAT	2	6	875742	875747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292312
19023	NC_015183	CTGG	2	8	875873	875880	0 %	25 %	50 %	25 %	325292313
19024	NC_015183	ATCC	2	8	875912	875919	25 %	25 %	0 %	50 %	325292313
19025	NC_015183	CAT	2	6	875998	876003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292313
19026	NC_015183	GGT	2	6	876050	876055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292313
19027	NC_015183	T	6	6	876116	876121	0 %	100 %	0 %	0 %	325292313
19028	NC_015183	CGA	2	6	876134	876139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292313
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19030	NC_015183	GGCCG	2	10	876203	876212	0 %	0 %	60 %	40 %	325292313
19031	NC_015183	CTCG	2	8	876267	876274	0 %	25 %	25 %	50 %	325292313
19032	NC_015183	GAA	2	6	876276	876281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292313
19033	NC_015183	CGA	2	6	876355	876360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292313
19034	NC_015183	GGC	2	6	876380	876385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292313
19035	NC_015183	TG	4	8	876425	876432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19036	NC_015183	A	7	7	876437	876443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19037	NC_015183	ATG	2	6	876467	876472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19038	NC_015183	TAG	2	6	876485	876490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19039	NC_015183	GAT	2	6	876574	876579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292314
19040	NC_015183	TTA	2	6	876583	876588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325292314
19041	NC_015183	TCA	2	6	876603	876608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292314
19042	NC_015183	CGC	2	6	876613	876618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292314
19043	NC_015183	CAA	2	6	876628	876633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292314
19044	NC_015183	GC	3	6	876686	876691	0 %	0 %	50 %	50 %	325292314
19045	NC_015183	GGA	2	6	876709	876714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292314
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19050	NC_015183	ACC	2	6	876873	876878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292314
19051	NC_015183	GAT	2	6	876899	876904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292314
19052	NC_015183	GCC	2	6	876926	876931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292314
19053	NC_015183	CCCGC	2	10	876965	876974	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
19054	NC_015183	TCG	2	6	876991	876996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292315
19055	NC_015183	CG	3	6	877010	877015	0 %	0 %	50 %	50 %	325292315
19056	NC_015183	TCG	2	6	877063	877068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292315
19057	NC_015183	GTC	2	6	877083	877088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292315
19058	NC_015183	CTT	2	6	877103	877108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292315
19059	NC_015183	ATCGAG	2	12	877167	877178	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325292315
19060	NC_015183	TGG	2	6	877232	877237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292315
19061	NC_015183	TCTG	2	8	877245	877252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19062	NC_015183	CCG	2	6	877366	877371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292316
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19073	NC_015183	GGC	2	6	877848	877853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292316
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19077	NC_015183	TGT	2	6	877934	877939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292316
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19087	NC_015183	TCG	2	6	878327	878332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292316
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19090	NC_015183	GGCA	2	8	878535	878542	25 %	0 %	50 %	25 %	325292316
19091	NC_015183	GC	3	6	878594	878599	0 %	0 %	50 %	50 %	325292316
19092	NC_015183	TGC	2	6	878600	878605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292316
19093	NC_015183	GATC	2	8	878685	878692	25 %	25 %	25 %	25 %	325292316
19094	NC_015183	CGATGC	2	12	878705	878716	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325292316
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19096	NC_015183	TG	3	6	878810	878815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19097	NC_015183	GTG	2	6	878829	878834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292317
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19101	NC_015183	CG	3	6	878912	878917	0 %	0 %	50 %	50 %	325292317
19102	NC_015183	T	6	6	878918	878923	0 %	100 %	0 %	0 %	325292317
19103	NC_015183	TGC	2	6	879014	879019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19104	NC_015183	CAG	2	6	879027	879032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19107	NC_015183	GCG	2	6	879244	879249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292318
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19109	NC_015183	GAT	2	6	879325	879330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292318
19110	NC_015183	CACCG	2	10	879383	879392	20 %	0 %	20 %	60 %	325292318
19111	NC_015183	TGA	2	6	879394	879399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292318
19112	NC_015183	GCC	2	6	879417	879422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292318
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19115	NC_015183	GAT	2	6	879587	879592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292318
19116	NC_015183	GGCCG	2	10	879785	879794	0 %	0 %	60 %	40 %	325292318
19117	NC_015183	CGC	2	6	879881	879886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292318
19118	NC_015183	CGC	2	6	879919	879924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292318
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19120	NC_015183	GTCC	2	8	880015	880022	0 %	25 %	25 %	50 %	325292318
19121	NC_015183	ATG	2	6	880059	880064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292318
19122	NC_015183	GAA	2	6	880071	880076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292318
19123	NC_015183	CTG	2	6	880094	880099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292318
19124	NC_015183	GAA	2	6	880130	880135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292318
19125	NC_015183	GCC	2	6	880187	880192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292318
19126	NC_015183	CGT	2	6	880208	880213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292318
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19135	NC_015183	GCC	3	9	880547	880555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292318
19136	NC_015183	CATTGG	2	12	880621	880632	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325292318
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19139	NC_015183	CGG	2	6	880741	880746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292318
19140	NC_015183	ACG	2	6	880758	880763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292318
19141	NC_015183	GAAA	2	8	880822	880829	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19142	NC_015183	CAG	2	6	880886	880891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292319
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19145	NC_015183	GTCC	2	8	880999	881006	0 %	25 %	25 %	50 %	325292319
19146	NC_015183	TGG	2	6	881107	881112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292319
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19149	NC_015183	CG	3	6	881188	881193	0 %	0 %	50 %	50 %	325292319
19150	NC_015183	GTC	2	6	881198	881203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292319
19151	NC_015183	ATGA	2	8	881264	881271	50 %	25 %	25 %	0 %	325292319
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19153	NC_015183	CG	3	6	881317	881322	0 %	0 %	50 %	50 %	325292319
19154	NC_015183	GAC	2	6	881360	881365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292319
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19162	NC_015183	CGT	2	6	881713	881718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292319
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19168	NC_015183	GTC	2	6	881879	881884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292319
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19172	NC_015183	CTT	2	6	882194	882199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292320
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19186	NC_015183	TGA	2	6	882804	882809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292320
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19188	NC_015183	TCC	2	6	882896	882901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292320
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19196	NC_015183	GC	3	6	883274	883279	0 %	0 %	50 %	50 %	325292320
19197	NC_015183	CGGGC	2	10	883289	883298	0 %	0 %	60 %	40 %	325292320
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19205	NC_015183	TCG	2	6	883563	883568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19207	NC_015183	CTT	2	6	883755	883760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292321
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19210	NC_015183	CCGG	2	8	883861	883868	0 %	0 %	50 %	50 %	325292321
19211	NC_015183	TTG	2	6	883889	883894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292321
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19219	NC_015183	GC	3	6	884325	884330	0 %	0 %	50 %	50 %	325292321
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19223	NC_015183	CCG	2	6	884538	884543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292321
19224	NC_015183	CGA	2	6	884622	884627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292321
19225	NC_015183	CAGC	2	8	884715	884722	25 %	0 %	25 %	50 %	325292321
19226	NC_015183	GAC	2	6	884761	884766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292321
19227	NC_015183	T	6	6	884848	884853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19228	NC_015183	GAC	2	6	884907	884912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19229	NC_015183	GCT	2	6	884952	884957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292322
19230	NC_015183	ACC	2	6	885025	885030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292322
19231	NC_015183	GC	3	6	885120	885125	0 %	0 %	50 %	50 %	325292322
19232	NC_015183	CGG	2	6	885170	885175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292322
19233	NC_015183	AGG	2	6	885191	885196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292322
19234	NC_015183	GCA	2	6	885247	885252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292322
19235	NC_015183	GC	3	6	885293	885298	0 %	0 %	50 %	50 %	325292322
19236	NC_015183	ACGC	2	8	885312	885319	25 %	0 %	25 %	50 %	325292322
19237	NC_015183	TCG	2	6	885322	885327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292322
19238	NC_015183	GGA	2	6	885363	885368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19239	NC_015183	GC	3	6	885394	885399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19240	NC_015183	ACCC	2	8	885469	885476	25 %	0 %	0 %	75 %	325292323
19241	NC_015183	TCA	2	6	885480	885485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292323
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19247	NC_015183	CTA	2	6	885950	885955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19485	NC_015183	GCT	2	6	896844	896849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292336
19486	NC_015183	CGG	2	6	896867	896872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292336
19487	NC_015183	TCG	2	6	896875	896880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292336
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