MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_015183	TGG	2	6	853158	853163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292286
18502	NC_015183	CAT	2	6	853204	853209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292286
18503	NC_015183	CGG	2	6	853246	853251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292286
18504	NC_015183	GCA	2	6	853283	853288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292286
18505	NC_015183	GGCC	2	8	853309	853316	0 %	0 %	50 %	50 %	325292286
18506	NC_015183	GCC	2	6	853318	853323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292286
18507	NC_015183	CTT	2	6	853324	853329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292286
18508	NC_015183	AGG	2	6	853344	853349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292286
18509	NC_015183	TAT	2	6	853355	853360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325292286
18510	NC_015183	CGTGC	2	10	853382	853391	0 %	20 %	40 %	40 %	325292286
18511	NC_015183	CTG	3	9	853511	853519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292286
18512	NC_015183	GCT	2	6	853534	853539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292286
18513	NC_015183	CT	3	6	853563	853568	0 %	50 %	0 %	50 %	325292286
18514	NC_015183	GC	3	6	853628	853633	0 %	0 %	50 %	50 %	325292286
18515	NC_015183	GCT	2	6	853684	853689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292286
18516	NC_015183	CCG	2	6	853728	853733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292286
18517	NC_015183	CGT	2	6	853897	853902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292286
18518	NC_015183	GCT	2	6	853903	853908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292286
18519	NC_015183	CATTGC	2	12	853987	853998	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325292286
18520	NC_015183	CAT	2	6	854047	854052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292286
18521	NC_015183	CTG	2	6	854093	854098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292286
18522	NC_015183	GC	3	6	854103	854108	0 %	0 %	50 %	50 %	325292286
18523	NC_015183	ACC	2	6	854199	854204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292286
18524	NC_015183	CGT	2	6	854292	854297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292286
18525	NC_015183	ACA	2	6	854322	854327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292286
18526	NC_015183	TCA	2	6	854370	854375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292286
18527	NC_015183	TCG	2	6	854376	854381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292286
18528	NC_015183	GGT	2	6	854416	854421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292286
18529	NC_015183	GAT	2	6	854422	854427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292286
18530	NC_015183	CATCCG	2	12	854452	854463	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325292286
18531	NC_015183	GCT	2	6	854468	854473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292286
18532	NC_015183	GAA	3	9	854500	854508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292286
18533	NC_015183	GTT	2	6	854574	854579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292287
18534	NC_015183	TGC	2	6	854594	854599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292287
18535	NC_015183	GCG	2	6	854618	854623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292287
18536	NC_015183	CGG	2	6	854631	854636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292287
18537	NC_015183	GC	3	6	854697	854702	0 %	0 %	50 %	50 %	325292287
18538	NC_015183	GCT	2	6	854739	854744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292287
18539	NC_015183	TGT	2	6	854753	854758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292287
18540	NC_015183	GTCTC	2	10	854762	854771	0 %	40 %	20 %	40 %	325292287
18541	NC_015183	GAA	2	6	854920	854925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292287
18542	NC_015183	TCG	2	6	854962	854967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292288
18543	NC_015183	T	7	7	854973	854979	0 %	100 %	0 %	0 %	325292288
18544	NC_015183	ATCT	2	8	854988	854995	25 %	50 %	0 %	25 %	325292288
18545	NC_015183	TGC	2	6	855022	855027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292288
18546	NC_015183	CCT	2	6	855059	855064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292288
18547	NC_015183	CGG	2	6	855073	855078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292288
18548	NC_015183	CG	3	6	855088	855093	0 %	0 %	50 %	50 %	325292288
18549	NC_015183	GCC	2	6	855098	855103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292288
18550	NC_015183	CGG	2	6	855133	855138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292288
18551	NC_015183	GCC	2	6	855141	855146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292288
18552	NC_015183	TTTCCT	2	12	855187	855198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292288
18553	NC_015183	TCT	2	6	855199	855204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292288
18554	NC_015183	CTG	2	6	855210	855215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292288
18555	NC_015183	GC	3	6	855227	855232	0 %	0 %	50 %	50 %	325292288
18556	NC_015183	CGA	2	6	855251	855256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292288
18557	NC_015183	CGA	2	6	855260	855265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292288
18558	NC_015183	GCC	2	6	855299	855304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292288
18559	NC_015183	GCGGG	2	10	855318	855327	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
18560	NC_015183	CCA	2	6	855348	855353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292289
18561	NC_015183	ATC	2	6	855419	855424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292289
18562	NC_015183	GGTGC	2	10	855452	855461	0 %	20 %	60 %	20 %	325292289
18563	NC_015183	TGA	2	6	855462	855467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292289
18564	NC_015183	TGC	2	6	855468	855473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292289
18565	NC_015183	CTG	2	6	855521	855526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292289
18566	NC_015183	TGC	2	6	855538	855543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292289
18567	NC_015183	GCTG	2	8	855594	855601	0 %	25 %	50 %	25 %	325292289
18568	NC_015183	GCT	2	6	855643	855648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292289
18569	NC_015183	TCGC	2	8	855650	855657	0 %	25 %	25 %	50 %	325292289
18570	NC_015183	CGC	3	9	855655	855663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292289
18571	NC_015183	CCAT	2	8	855684	855691	25 %	25 %	0 %	50 %	325292289
18572	NC_015183	TGC	2	6	855819	855824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292289
18573	NC_015183	CG	3	6	855861	855866	0 %	0 %	50 %	50 %	325292289
18574	NC_015183	ACG	2	6	855914	855919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292289
18575	NC_015183	CGGT	2	8	855933	855940	0 %	25 %	50 %	25 %	325292289
18576	NC_015183	TGA	2	6	856020	856025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292289
18577	NC_015183	GGC	3	9	856063	856071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292289
18578	NC_015183	CCT	2	6	856098	856103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292289
18579	NC_015183	CGC	2	6	856110	856115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292289
18580	NC_015183	TCG	2	6	856119	856124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292289
18581	NC_015183	CGG	2	6	856138	856143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292289
18582	NC_015183	GCT	2	6	856171	856176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292289
18583	NC_015183	GTCATG	2	12	856181	856192	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325292289
18584	NC_015183	GAG	2	6	856211	856216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292289
18585	NC_015183	GCG	2	6	856241	856246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292289
18586	NC_015183	CCG	2	6	856294	856299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292289
18587	NC_015183	ATG	2	6	856337	856342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292289
18588	NC_015183	TGA	2	6	856413	856418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292289
18589	NC_015183	CGC	2	6	856432	856437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292289
18590	NC_015183	CGC	2	6	856444	856449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292289
18591	NC_015183	GGC	2	6	856457	856462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292289
18592	NC_015183	GCC	2	6	856555	856560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292289
18593	NC_015183	GGT	2	6	856582	856587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292289
18594	NC_015183	CGAT	2	8	856602	856609	25 %	25 %	25 %	25 %	325292289
18595	NC_015183	TGG	2	6	856619	856624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292289
18596	NC_015183	GCC	3	9	856628	856636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292289
18597	NC_015183	CCA	2	6	856659	856664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292289
18598	NC_015183	CGGG	2	8	856672	856679	0 %	0 %	75 %	25 %	325292289
18599	NC_015183	CTGC	2	8	856736	856743	0 %	25 %	25 %	50 %	325292289
18600	NC_015183	GGC	2	6	856753	856758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292289
18601	NC_015183	CTT	2	6	856761	856766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292289
18602	NC_015183	TGG	2	6	856794	856799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292289
18603	NC_015183	TTC	2	6	856802	856807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292289
18604	NC_015183	CAGC	2	8	856837	856844	25 %	0 %	25 %	50 %	325292289
18605	NC_015183	GGC	3	9	856846	856854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292289
18606	NC_015183	GGCGCT	2	12	857010	857021	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325292290
18607	NC_015183	GGC	2	6	857050	857055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292290
18608	NC_015183	GTCCG	2	10	857069	857078	0 %	20 %	40 %	40 %	325292290
18609	NC_015183	GCT	4	12	857088	857099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292290
18610	NC_015183	TTC	2	6	857101	857106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292290
18611	NC_015183	GAC	2	6	857202	857207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292290
18612	NC_015183	GCT	2	6	857223	857228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292290
18613	NC_015183	TCA	2	6	857237	857242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292290
18614	NC_015183	AAC	2	6	857286	857291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292290
18615	NC_015183	CGAT	2	8	857306	857313	25 %	25 %	25 %	25 %	325292290
18616	NC_015183	GCA	2	6	857315	857320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292290
18617	NC_015183	GCC	2	6	857329	857334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292290
18618	NC_015183	A	7	7	857360	857366	100 %	0 %	0 %	0 %	325292290
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18742	NC_015183	TGA	2	6	863083	863088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292298
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18744	NC_015183	GC	3	6	863216	863221	0 %	0 %	50 %	50 %	325292298
18745	NC_015183	TCA	2	6	863236	863241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292298
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18984	NC_015183	GAA	2	6	873614	873619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292309
18985	NC_015183	TGA	2	6	873649	873654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292309
18986	NC_015183	GAT	2	6	873695	873700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292309
18987	NC_015183	AAGG	2	8	873734	873741	50 %	0 %	50 %	0 %	325292309
18988	NC_015183	CTT	2	6	873773	873778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292309
18989	NC_015183	GCCG	2	8	873824	873831	0 %	0 %	50 %	50 %	325292309
18990	NC_015183	CAGGT	2	10	873852	873861	20 %	20 %	40 %	20 %	325292309
18991	NC_015183	CTT	2	6	873872	873877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292309
18992	NC_015183	CCA	2	6	873931	873936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292309
18993	NC_015183	CAG	2	6	873986	873991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292309
18994	NC_015183	TTC	2	6	874028	874033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292309
18995	NC_015183	CAACG	2	10	874059	874068	40 %	0 %	20 %	40 %	325292310
18996	NC_015183	CTG	2	6	874127	874132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292310
18997	NC_015183	CGG	2	6	874146	874151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292310
18998	NC_015183	CGATA	2	10	874220	874229	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18999	NC_015183	ATGA	2	8	874295	874302	50 %	25 %	25 %	0 %	325292311
19000	NC_015183	GTG	2	6	874421	874426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292311

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