MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_015183	TCG	3	9	831091	831099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292259
18002	NC_015183	CGC	2	6	831137	831142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292259
18003	NC_015183	CCG	2	6	831221	831226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292260
18004	NC_015183	TCG	2	6	831230	831235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292260
18005	NC_015183	GGC	2	6	831244	831249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292260
18006	NC_015183	CAC	2	6	831279	831284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292260
18007	NC_015183	ATG	2	6	831344	831349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292260
18008	NC_015183	CGC	2	6	831444	831449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292260
18009	NC_015183	GCC	2	6	831559	831564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292260
18010	NC_015183	GAT	2	6	831579	831584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292260
18011	NC_015183	GCC	2	6	831591	831596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292260
18012	NC_015183	CGG	2	6	831614	831619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292260
18013	NC_015183	TGG	2	6	831643	831648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292260
18014	NC_015183	GCG	2	6	831661	831666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292260
18015	NC_015183	GGC	2	6	831673	831678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292260
18016	NC_015183	CCG	2	6	831696	831701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292260
18017	NC_015183	TGG	2	6	831752	831757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292260
18018	NC_015183	GC	3	6	831758	831763	0 %	0 %	50 %	50 %	325292260
18019	NC_015183	GCC	2	6	831768	831773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292260
18020	NC_015183	CCGCTG	2	12	831796	831807	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325292260
18021	NC_015183	GCC	2	6	831826	831831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292260
18022	NC_015183	CAG	2	6	831898	831903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292260
18023	NC_015183	GCCTT	2	10	831999	832008	0 %	40 %	20 %	40 %	325292261
18024	NC_015183	GCG	2	6	832043	832048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292261
18025	NC_015183	GCCG	2	8	832120	832127	0 %	0 %	50 %	50 %	325292261
18026	NC_015183	CCG	2	6	832159	832164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292261
18027	NC_015183	CAC	2	6	832258	832263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18028	NC_015183	GGA	2	6	832296	832301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18029	NC_015183	CCG	2	6	832343	832348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292262
18030	NC_015183	GCC	2	6	832452	832457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292262
18031	NC_015183	CGC	2	6	832496	832501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292262
18032	NC_015183	GCGA	2	8	832528	832535	25 %	0 %	50 %	25 %	325292262
18033	NC_015183	TCA	2	6	832555	832560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292262
18034	NC_015183	GC	3	6	832580	832585	0 %	0 %	50 %	50 %	325292262
18035	NC_015183	GCC	2	6	832683	832688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292262
18036	NC_015183	CAT	2	6	832727	832732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292262
18037	NC_015183	GCCC	2	8	832757	832764	0 %	0 %	25 %	75 %	325292262
18038	NC_015183	GCCG	2	8	832778	832785	0 %	0 %	50 %	50 %	325292262
18039	NC_015183	CG	4	8	832823	832830	0 %	0 %	50 %	50 %	325292262
18040	NC_015183	GCG	3	9	832828	832836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292262
18041	NC_015183	AGC	2	6	832840	832845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292262
18042	NC_015183	GCGCAA	2	12	832871	832882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292262
18043	NC_015183	GCGCG	2	10	832959	832968	0 %	0 %	60 %	40 %	325292263
18044	NC_015183	GCG	2	6	832996	833001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292263
18045	NC_015183	CGCGGG	2	12	833060	833071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292263
18046	NC_015183	CACG	2	8	833111	833118	25 %	0 %	25 %	50 %	325292263
18047	NC_015183	CGG	2	6	833143	833148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292263
18048	NC_015183	GCA	2	6	833171	833176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292263
18049	NC_015183	CGC	3	9	833277	833285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292263
18050	NC_015183	ATC	2	6	833314	833319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292263
18051	NC_015183	TGCG	2	8	833345	833352	0 %	25 %	50 %	25 %	325292263
18052	NC_015183	ATG	2	6	833359	833364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292263
18053	NC_015183	ACG	2	6	833365	833370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292263
18054	NC_015183	ACA	2	6	833455	833460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18055	NC_015183	GCC	2	6	833463	833468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18056	NC_015183	CGG	2	6	833472	833477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18057	NC_015183	TTG	2	6	833479	833484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18058	NC_015183	GCC	2	6	833502	833507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18059	NC_015183	CGTT	2	8	833550	833557	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18060	NC_015183	TCGA	2	8	833672	833679	25 %	25 %	25 %	25 %	325292264
18061	NC_015183	T	6	6	833742	833747	0 %	100 %	0 %	0 %	325292264
18062	NC_015183	CGG	2	6	833769	833774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292264
18063	NC_015183	GCTG	2	8	833811	833818	0 %	25 %	50 %	25 %	325292264
18064	NC_015183	AGCC	2	8	833881	833888	25 %	0 %	25 %	50 %	325292264
18065	NC_015183	ATA	2	6	833965	833970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325292264
18066	NC_015183	TCG	2	6	833976	833981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292264
18067	NC_015183	AGC	2	6	834049	834054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18068	NC_015183	GGC	3	9	834127	834135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292265
18069	NC_015183	GGC	2	6	834190	834195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292265
18070	NC_015183	GCG	2	6	834212	834217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292265
18071	NC_015183	CCG	2	6	834225	834230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292265
18072	NC_015183	CGC	2	6	834249	834254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292265
18073	NC_015183	TGC	2	6	834271	834276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292265
18074	NC_015183	CGG	2	6	834285	834290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292265
18075	NC_015183	GGC	3	9	834298	834306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292265
18076	NC_015183	GCG	2	6	834311	834316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292265
18077	NC_015183	CG	3	6	834346	834351	0 %	0 %	50 %	50 %	325292265
18078	NC_015183	GCC	2	6	834356	834361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292265
18079	NC_015183	GGT	2	6	834385	834390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292265
18080	NC_015183	CCGGA	2	10	834427	834436	20 %	0 %	40 %	40 %	325292265
18081	NC_015183	GCT	2	6	834448	834453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292265
18082	NC_015183	GTT	2	6	834455	834460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292265
18083	NC_015183	GTC	2	6	834470	834475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292265
18084	NC_015183	A	6	6	834557	834562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18085	NC_015183	C	6	6	834580	834585	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18086	NC_015183	CAA	2	6	834622	834627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292266
18087	NC_015183	TCGC	2	8	834639	834646	0 %	25 %	25 %	50 %	325292266
18088	NC_015183	GAGC	2	8	834680	834687	25 %	0 %	50 %	25 %	325292266
18089	NC_015183	GCG	2	6	834708	834713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292266
18090	NC_015183	TGC	2	6	834717	834722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292266
18091	NC_015183	CGT	2	6	834796	834801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292266
18092	NC_015183	GCG	2	6	834833	834838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292266
18093	NC_015183	CT	3	6	834879	834884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18094	NC_015183	GAC	3	9	834961	834969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292267
18095	NC_015183	ATG	2	6	835073	835078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292267
18096	NC_015183	TCG	2	6	835089	835094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292267
18097	NC_015183	GGTTC	2	10	835104	835113	0 %	40 %	40 %	20 %	325292267
18098	NC_015183	CGG	2	6	835125	835130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292267
18099	NC_015183	TGGC	2	8	835132	835139	0 %	25 %	50 %	25 %	325292267
18100	NC_015183	GC	3	6	835205	835210	0 %	0 %	50 %	50 %	325292267
18101	NC_015183	GCT	2	6	835291	835296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292267
18102	NC_015183	TCG	2	6	835362	835367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292267
18103	NC_015183	GGCCAT	2	12	835430	835441	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325292267
18104	NC_015183	ATCACG	2	12	835491	835502	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325292267
18105	NC_015183	GGC	2	6	835538	835543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292267
18106	NC_015183	AAT	2	6	835550	835555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325292267
18107	NC_015183	GC	3	6	835558	835563	0 %	0 %	50 %	50 %	325292267
18108	NC_015183	GCT	3	9	835618	835626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292267
18109	NC_015183	TCCT	2	8	835646	835653	0 %	50 %	0 %	50 %	325292267
18110	NC_015183	TTG	2	6	835671	835676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292267
18111	NC_015183	GTG	2	6	835682	835687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292267
18112	NC_015183	ACG	2	6	835727	835732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292267
18113	NC_015183	GGA	2	6	835756	835761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292267
18114	NC_015183	GAA	2	6	835796	835801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292267
18115	NC_015183	CGC	2	6	835849	835854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292267
18116	NC_015183	TATTCG	2	12	835981	835992	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325292268
18117	NC_015183	CGG	2	6	836039	836044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292268
18118	NC_015183	GC	3	6	836069	836074	0 %	0 %	50 %	50 %	325292268
18119	NC_015183	GC	3	6	836177	836182	0 %	0 %	50 %	50 %	325292268
18120	NC_015183	GC	3	6	836186	836191	0 %	0 %	50 %	50 %	325292268
18121	NC_015183	CGG	3	9	836300	836308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292268
18122	NC_015183	GCTTGC	2	12	836319	836330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292268
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18125	NC_015183	CGC	2	6	836539	836544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18242	NC_015183	CCAG	2	8	841464	841471	25 %	0 %	25 %	50 %	325292273
18243	NC_015183	GA	3	6	841499	841504	50 %	0 %	50 %	0 %	325292273
18244	NC_015183	CCT	2	6	841533	841538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292273
18245	NC_015183	ATG	2	6	841577	841582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292273
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18469	NC_015183	TC	3	6	851535	851540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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18481	NC_015183	CGT	2	6	852538	852543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292286
18482	NC_015183	CTG	2	6	852605	852610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292286
18483	NC_015183	GC	3	6	852626	852631	0 %	0 %	50 %	50 %	325292286
18484	NC_015183	GCC	2	6	852647	852652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292286
18485	NC_015183	TGG	2	6	852663	852668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292286
18486	NC_015183	GCG	3	9	852675	852683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292286
18487	NC_015183	CTG	3	9	852686	852694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292286
18488	NC_015183	GGC	2	6	852758	852763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292286
18489	NC_015183	AT	3	6	852765	852770	50 %	50 %	0 %	0 %	325292286
18490	NC_015183	ACT	2	6	852799	852804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292286
18491	NC_015183	CGG	2	6	852814	852819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292286
18492	NC_015183	TCT	2	6	852937	852942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292286
18493	NC_015183	CTG	2	6	852989	852994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292286
18494	NC_015183	TTC	2	6	852998	853003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292286
18495	NC_015183	GC	3	6	853026	853031	0 %	0 %	50 %	50 %	325292286
18496	NC_015183	GACC	2	8	853048	853055	25 %	0 %	25 %	50 %	325292286
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18498	NC_015183	CTCG	2	8	853087	853094	0 %	25 %	25 %	50 %	325292286
18499	NC_015183	CTG	2	6	853097	853102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292286
18500	NC_015183	GGC	2	6	853141	853146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292286

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