MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_015183	GCT	2	6	809203	809208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17502	NC_015183	ATA	2	6	809289	809294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325292234
17503	NC_015183	TCC	2	6	809326	809331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292234
17504	NC_015183	GCCGGC	2	12	809397	809408	0 %	0 %	50 %	50 %	325292234
17505	NC_015183	ATC	2	6	809422	809427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292234
17506	NC_015183	TGG	2	6	809441	809446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292234
17507	NC_015183	GCC	2	6	809528	809533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292234
17508	NC_015183	CG	3	6	809561	809566	0 %	0 %	50 %	50 %	325292234
17509	NC_015183	ACGC	2	8	809679	809686	25 %	0 %	25 %	50 %	325292234
17510	NC_015183	CGA	2	6	809705	809710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292234
17511	NC_015183	CGTC	2	8	809723	809730	0 %	25 %	25 %	50 %	325292234
17512	NC_015183	GGAT	2	8	809755	809762	25 %	25 %	50 %	0 %	325292234
17513	NC_015183	GC	3	6	809772	809777	0 %	0 %	50 %	50 %	325292234
17514	NC_015183	AAG	2	6	809794	809799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292234
17515	NC_015183	GGC	2	6	809862	809867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292234
17516	NC_015183	GATG	2	8	809892	809899	25 %	25 %	50 %	0 %	325292234
17517	NC_015183	TTC	2	6	809985	809990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292234
17518	NC_015183	CCG	2	6	810041	810046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292234
17519	NC_015183	CATT	2	8	810107	810114	25 %	50 %	0 %	25 %	325292234
17520	NC_015183	CCT	2	6	810194	810199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17521	NC_015183	GC	3	6	810338	810343	0 %	0 %	50 %	50 %	325292235
17522	NC_015183	CGA	2	6	810370	810375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292235
17523	NC_015183	GTC	2	6	810401	810406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292235
17524	NC_015183	CGGA	2	8	810472	810479	25 %	0 %	50 %	25 %	325292235
17525	NC_015183	CAA	2	6	810493	810498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292235
17526	NC_015183	CAT	2	6	810505	810510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292235
17527	NC_015183	GTC	2	6	810526	810531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292235
17528	NC_015183	CGC	2	6	810595	810600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292235
17529	NC_015183	CCGC	2	8	810618	810625	0 %	0 %	25 %	75 %	325292235
17530	NC_015183	CAT	2	6	810637	810642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292235
17531	NC_015183	CGA	2	6	810699	810704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292235
17532	NC_015183	TGCGG	2	10	810709	810718	0 %	20 %	60 %	20 %	325292235
17533	NC_015183	GTG	2	6	810782	810787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292235
17534	NC_015183	AAC	2	6	810903	810908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292235
17535	NC_015183	CGA	2	6	810910	810915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292235
17536	NC_015183	TCG	2	6	810933	810938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292235
17537	NC_015183	CCG	2	6	810948	810953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292235
17538	NC_015183	GCC	3	9	811015	811023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292236
17539	NC_015183	CCA	2	6	811032	811037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292236
17540	NC_015183	AGG	2	6	811040	811045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292236
17541	NC_015183	ACG	2	6	811163	811168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292236
17542	NC_015183	GC	3	6	811171	811176	0 %	0 %	50 %	50 %	325292236
17543	NC_015183	GAT	2	6	811240	811245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292236
17544	NC_015183	CGA	2	6	811275	811280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292236
17545	NC_015183	CGG	2	6	811293	811298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292236
17546	NC_015183	A	6	6	811341	811346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17547	NC_015183	TCCG	2	8	811347	811354	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17548	NC_015183	GCGG	2	8	811447	811454	0 %	0 %	75 %	25 %	325292237
17549	NC_015183	GCC	2	6	811466	811471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292237
17550	NC_015183	GGT	2	6	811516	811521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292237
17551	NC_015183	TCG	2	6	811541	811546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292237
17552	NC_015183	CTGG	2	8	811588	811595	0 %	25 %	50 %	25 %	325292237
17553	NC_015183	CG	3	6	811612	811617	0 %	0 %	50 %	50 %	325292237
17554	NC_015183	GGC	2	6	811621	811626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292237
17555	NC_015183	GCGT	2	8	811651	811658	0 %	25 %	50 %	25 %	325292237
17556	NC_015183	GGC	2	6	811775	811780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292237
17557	NC_015183	CGA	2	6	811797	811802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292237
17558	NC_015183	GC	3	6	811809	811814	0 %	0 %	50 %	50 %	325292237
17559	NC_015183	GTG	2	6	811859	811864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292237
17560	NC_015183	ATG	2	6	811865	811870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292237
17561	NC_015183	CG	3	6	811935	811940	0 %	0 %	50 %	50 %	325292237
17562	NC_015183	TGC	2	6	811961	811966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292237
17563	NC_015183	CAC	2	6	812062	812067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292237
17564	NC_015183	CGA	2	6	812082	812087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292237
17565	NC_015183	CGT	2	6	812100	812105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292237
17566	NC_015183	CAG	2	6	812110	812115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292237
17567	NC_015183	TCA	3	9	812232	812240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292237
17568	NC_015183	CGG	2	6	812247	812252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292237
17569	NC_015183	CCGT	2	8	812276	812283	0 %	25 %	25 %	50 %	325292237
17570	NC_015183	ATG	2	6	812294	812299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292237
17571	NC_015183	GAA	2	6	812326	812331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292237
17572	NC_015183	CTG	2	6	812344	812349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292237
17573	NC_015183	CAG	2	6	812359	812364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292237
17574	NC_015183	CTGG	2	8	812410	812417	0 %	25 %	50 %	25 %	325292237
17575	NC_015183	CAG	2	6	812449	812454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292237
17576	NC_015183	AGC	2	6	812477	812482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292237
17577	NC_015183	CATC	2	8	812547	812554	25 %	25 %	0 %	50 %	325292237
17578	NC_015183	CAG	3	9	812563	812571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292237
17579	NC_015183	TGG	2	6	812589	812594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292237
17580	NC_015183	AGA	2	6	812631	812636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292237
17581	NC_015183	GCG	2	6	812720	812725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292237
17582	NC_015183	TGCCCG	2	12	812817	812828	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325292237
17583	NC_015183	GTC	2	6	812896	812901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292237
17584	NC_015183	GTCC	2	8	812931	812938	0 %	25 %	25 %	50 %	325292237
17585	NC_015183	ATGC	2	8	812969	812976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17586	NC_015183	CGAT	2	8	812988	812995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17587	NC_015183	TGA	2	6	813078	813083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17588	NC_015183	CAA	2	6	813108	813113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17589	NC_015183	GAA	2	6	813129	813134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292238
17590	NC_015183	GCC	2	6	813167	813172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292238
17591	NC_015183	CGT	2	6	813233	813238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292238
17592	NC_015183	AGG	2	6	813247	813252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292238
17593	NC_015183	CGC	2	6	813281	813286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292239
17594	NC_015183	GGC	2	6	813356	813361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292239
17595	NC_015183	TGG	2	6	813440	813445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292239
17596	NC_015183	CGG	2	6	813446	813451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292239
17597	NC_015183	CTG	2	6	813453	813458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292239
17598	NC_015183	TGA	2	6	813466	813471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292239
17599	NC_015183	CGG	4	12	813479	813490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292239
17600	NC_015183	CAT	2	6	813491	813496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292239
17601	NC_015183	TGA	2	6	813514	813519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292239
17602	NC_015183	CAC	2	6	813545	813550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292239
17603	NC_015183	GCG	2	6	813677	813682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292240
17604	NC_015183	GCGCC	2	10	813699	813708	0 %	0 %	40 %	60 %	325292240
17605	NC_015183	TCT	2	6	813709	813714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292240
17606	NC_015183	TGG	2	6	813724	813729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292240
17607	NC_015183	CGC	2	6	813749	813754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292240
17608	NC_015183	TC	3	6	813773	813778	0 %	50 %	0 %	50 %	325292240
17609	NC_015183	GA	3	6	813780	813785	50 %	0 %	50 %	0 %	325292240
17610	NC_015183	GCG	2	6	813831	813836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292240
17611	NC_015183	TCT	2	6	813881	813886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292240
17612	NC_015183	AAGCG	2	10	813922	813931	40 %	0 %	40 %	20 %	325292240
17613	NC_015183	GAT	2	6	813990	813995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292240
17614	NC_015183	GCG	2	6	814037	814042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292240
17615	NC_015183	CGG	2	6	814073	814078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292240
17616	NC_015183	TCA	2	6	814220	814225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292241
17617	NC_015183	GGC	2	6	814231	814236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292241
17618	NC_015183	CAA	2	6	814281	814286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292241
17619	NC_015183	GTC	2	6	814288	814293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292241
17620	NC_015183	GCC	3	9	814301	814309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292241
17621	NC_015183	GCC	2	6	814333	814338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292241
17622	NC_015183	CGAC	2	8	814370	814377	25 %	0 %	25 %	50 %	325292241
17623	NC_015183	TCA	2	6	814409	814414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292241
17624	NC_015183	TCA	2	6	814439	814444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292241
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17636	NC_015183	GAAA	2	8	814704	814711	75 %	0 %	25 %	0 %	325292241
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17645	NC_015183	TGG	2	6	815180	815185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292242
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17653	NC_015183	T	6	6	815396	815401	0 %	100 %	0 %	0 %	325292242
17654	NC_015183	CGA	2	6	815445	815450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292242
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17740	NC_015183	CAT	2	6	819717	819722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17742	NC_015183	TCA	2	6	819753	819758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17855	NC_015183	GAG	2	6	824693	824698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292251
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17863	NC_015183	TGC	2	6	824908	824913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292251
17864	NC_015183	GCT	2	6	824971	824976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292251
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17881	NC_015183	TCA	2	6	825563	825568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17883	NC_015183	GGCT	2	8	825627	825634	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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17968	NC_015183	T	7	7	829541	829547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17973	NC_015183	CGGG	2	8	829820	829827	0 %	0 %	75 %	25 %	325292258
17974	NC_015183	TCC	2	6	829873	829878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292258
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17976	NC_015183	GGC	2	6	829897	829902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292258
17977	NC_015183	GCGAT	2	10	829922	829931	20 %	20 %	40 %	20 %	325292258
17978	NC_015183	CG	3	6	829934	829939	0 %	0 %	50 %	50 %	325292258
17979	NC_015183	CCT	2	6	829985	829990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292258
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17982	NC_015183	TGC	2	6	830186	830191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292258
17983	NC_015183	TGG	2	6	830204	830209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292258
17984	NC_015183	GCG	2	6	830225	830230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292258
17985	NC_015183	CGC	2	6	830240	830245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292258
17986	NC_015183	TGGC	2	8	830278	830285	0 %	25 %	50 %	25 %	325292258
17987	NC_015183	GGT	2	6	830287	830292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292258
17988	NC_015183	GGC	2	6	830361	830366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292258
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17990	NC_015183	GCA	2	6	830439	830444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292258
17991	NC_015183	CGC	2	6	830484	830489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292258
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17993	NC_015183	CCCA	2	8	830593	830600	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17994	NC_015183	TTCC	2	8	830629	830636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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17998	NC_015183	GTG	2	6	830913	830918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17999	NC_015183	CCG	2	6	830955	830960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18000	NC_015183	GCC	2	6	831027	831032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292259

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