MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_015183	TCA	2	6	721151	721156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292151
15502	NC_015183	TCT	2	6	721160	721165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292151
15503	NC_015183	GAT	2	6	721182	721187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292151
15504	NC_015183	CGG	2	6	721188	721193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292151
15505	NC_015183	GAT	2	6	721206	721211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292151
15506	NC_015183	CAA	2	6	721254	721259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292151
15507	NC_015183	CTG	2	6	721294	721299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292151
15508	NC_015183	TCG	2	6	721313	721318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292151
15509	NC_015183	CGG	2	6	721325	721330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292151
15510	NC_015183	GTGG	2	8	721342	721349	0 %	25 %	75 %	0 %	325292151
15511	NC_015183	CCG	2	6	721366	721371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292151
15512	NC_015183	CGG	2	6	721397	721402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292151
15513	NC_015183	TCT	2	6	721415	721420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292151
15514	NC_015183	TCA	2	6	721466	721471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292151
15515	NC_015183	CCA	2	6	721472	721477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292151
15516	NC_015183	GC	3	6	721488	721493	0 %	0 %	50 %	50 %	325292151
15517	NC_015183	CTG	2	6	721558	721563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292151
15518	NC_015183	CTGG	2	8	721579	721586	0 %	25 %	50 %	25 %	325292151
15519	NC_015183	GACC	2	8	721605	721612	25 %	0 %	25 %	50 %	325292151
15520	NC_015183	CGGCA	2	10	721620	721629	20 %	0 %	40 %	40 %	325292151
15521	NC_015183	TTC	2	6	721630	721635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292151
15522	NC_015183	GGC	2	6	721645	721650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292151
15523	NC_015183	GATCC	2	10	721654	721663	20 %	20 %	20 %	40 %	325292151
15524	NC_015183	TTC	2	6	721684	721689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292151
15525	NC_015183	ATCCTG	2	12	721708	721719	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325292151
15526	NC_015183	CAT	2	6	721731	721736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292151
15527	NC_015183	AAG	2	6	721762	721767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292151
15528	NC_015183	GGCAT	2	10	721786	721795	20 %	20 %	40 %	20 %	325292151
15529	NC_015183	CAC	2	6	721840	721845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292151
15530	NC_015183	TCT	2	6	721931	721936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292151
15531	NC_015183	CGA	2	6	721946	721951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292151
15532	NC_015183	CGG	2	6	722022	722027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292151
15533	NC_015183	CTA	2	6	722082	722087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292151
15534	NC_015183	CGT	2	6	722088	722093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292151
15535	NC_015183	TCT	2	6	722243	722248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292151
15536	NC_015183	GCA	2	6	722253	722258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292151
15537	NC_015183	CGT	2	6	722284	722289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292151
15538	NC_015183	AAG	2	6	722404	722409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292151
15539	NC_015183	CAA	2	6	722421	722426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292151
15540	NC_015183	CGA	2	6	722444	722449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292151
15541	NC_015183	CCG	2	6	722473	722478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292151
15542	NC_015183	ACC	2	6	722483	722488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292151
15543	NC_015183	CCGGA	2	10	722521	722530	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15544	NC_015183	CTG	3	9	722620	722628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15545	NC_015183	GCA	2	6	722706	722711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15546	NC_015183	TGC	2	6	722772	722777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15547	NC_015183	GAA	2	6	722880	722885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15548	NC_015183	GC	4	8	722961	722968	0 %	0 %	50 %	50 %	325292152
15549	NC_015183	ATT	2	6	722970	722975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325292152
15550	NC_015183	CG	3	6	722991	722996	0 %	0 %	50 %	50 %	325292152
15551	NC_015183	TCG	2	6	723006	723011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292152
15552	NC_015183	GC	3	6	723114	723119	0 %	0 %	50 %	50 %	325292152
15553	NC_015183	TGA	2	6	723153	723158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292152
15554	NC_015183	GGT	2	6	723244	723249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292152
15555	NC_015183	CCG	2	6	723279	723284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292152
15556	NC_015183	TCT	2	6	723306	723311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292152
15557	NC_015183	CGT	2	6	723316	723321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292152
15558	NC_015183	TGG	2	6	723367	723372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292152
15559	NC_015183	TGC	2	6	723373	723378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292152
15560	NC_015183	GGC	2	6	723419	723424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292152
15561	NC_015183	TCA	2	6	723453	723458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292152
15562	NC_015183	TCT	2	6	723459	723464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292152
15563	NC_015183	GCGCTG	2	12	723488	723499	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325292152
15564	NC_015183	GAT	2	6	723535	723540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292152
15565	NC_015183	GGCG	2	8	723550	723557	0 %	0 %	75 %	25 %	325292152
15566	NC_015183	CCA	2	6	723564	723569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292152
15567	NC_015183	GAT	2	6	723577	723582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292152
15568	NC_015183	CGC	2	6	723661	723666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292152
15569	NC_015183	TGC	2	6	723735	723740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292152
15570	NC_015183	AAG	2	6	723746	723751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292152
15571	NC_015183	TCT	2	6	723786	723791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292152
15572	NC_015183	T	6	6	723846	723851	0 %	100 %	0 %	0 %	325292152
15573	NC_015183	GCG	2	6	723874	723879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292153
15574	NC_015183	A	6	6	723883	723888	100 %	0 %	0 %	0 %	325292153
15575	NC_015183	TGG	2	6	723935	723940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292153
15576	NC_015183	TCA	2	6	723953	723958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292153
15577	NC_015183	CAT	2	6	723960	723965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292153
15578	NC_015183	GGA	2	6	724009	724014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_015183	GAG	2	6	724015	724020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15580	NC_015183	CGGC	2	8	724067	724074	0 %	0 %	50 %	50 %	325292154
15581	NC_015183	GCC	2	6	724150	724155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292154
15582	NC_015183	CGA	2	6	724361	724366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292154
15583	NC_015183	CGG	2	6	724394	724399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292154
15584	NC_015183	CAA	2	6	724437	724442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292154
15585	NC_015183	ACG	2	6	724468	724473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292154
15586	NC_015183	GGT	2	6	724503	724508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292154
15587	NC_015183	GC	3	6	724537	724542	0 %	0 %	50 %	50 %	325292154
15588	NC_015183	GAA	2	6	724548	724553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292154
15589	NC_015183	GAG	2	6	724657	724662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15590	NC_015183	CA	3	6	724715	724720	50 %	0 %	0 %	50 %	325292155
15591	NC_015183	AGA	2	6	724736	724741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292155
15592	NC_015183	CAT	2	6	724755	724760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292155
15593	NC_015183	CGG	2	6	724815	724820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292155
15594	NC_015183	GGCT	2	8	724845	724852	0 %	25 %	50 %	25 %	325292155
15595	NC_015183	TGG	2	6	724936	724941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292155
15596	NC_015183	CGT	2	6	724983	724988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292155
15597	NC_015183	TTC	2	6	725041	725046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292155
15598	NC_015183	CGG	2	6	725124	725129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292155
15599	NC_015183	GCC	2	6	725136	725141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292155
15600	NC_015183	ACA	2	6	725183	725188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292155
15601	NC_015183	CTG	2	6	725239	725244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292155
15602	NC_015183	CTT	2	6	725376	725381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292155
15603	NC_015183	TCG	2	6	725414	725419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292155
15604	NC_015183	CTG	2	6	725431	725436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292155
15605	NC_015183	CTGC	2	8	725439	725446	0 %	25 %	25 %	50 %	325292155
15606	NC_015183	GC	3	6	725448	725453	0 %	0 %	50 %	50 %	325292155
15607	NC_015183	CGG	2	6	725460	725465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292155
15608	NC_015183	AGC	2	6	725496	725501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292155
15609	NC_015183	CGT	2	6	725526	725531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292155
15610	NC_015183	CTGTTC	2	12	725536	725547	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325292155
15611	NC_015183	GGC	2	6	725566	725571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292155
15612	NC_015183	GC	3	6	725576	725581	0 %	0 %	50 %	50 %	325292155
15613	NC_015183	GTTT	2	8	725600	725607	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_015183	GGC	2	6	725620	725625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15615	NC_015183	GCC	2	6	725630	725635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15616	NC_015183	CGGA	2	8	725658	725665	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15617	NC_015183	CAT	2	6	725692	725697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292156
15618	NC_015183	CGG	2	6	725713	725718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292156
15619	NC_015183	GCT	2	6	725757	725762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292156
15620	NC_015183	TCG	2	6	725889	725894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292156
15621	NC_015183	GTC	2	6	725903	725908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292156
15622	NC_015183	GCC	2	6	725941	725946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292156
15623	NC_015183	TGC	3	9	726000	726008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292156
15624	NC_015183	CAT	2	6	726022	726027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292156
15625	NC_015183	CAA	2	6	726046	726051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292156
15626	NC_015183	AGGC	2	8	726061	726068	25 %	0 %	50 %	25 %	325292156
15627	NC_015183	GGC	2	6	726098	726103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292157
15628	NC_015183	GCCGC	2	10	726123	726132	0 %	0 %	40 %	60 %	325292157
15629	NC_015183	AAG	2	6	726199	726204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292157
15630	NC_015183	GGCGC	2	10	726224	726233	0 %	0 %	60 %	40 %	325292157
15631	NC_015183	GCG	2	6	726280	726285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292157
15632	NC_015183	CCAC	2	8	726355	726362	25 %	0 %	0 %	75 %	325292157
15633	NC_015183	AGG	2	6	726457	726462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292157
15634	NC_015183	CGA	2	6	726463	726468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292157
15635	NC_015183	GC	5	10	726516	726525	0 %	0 %	50 %	50 %	325292157
15636	NC_015183	CTG	2	6	726549	726554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292157
15637	NC_015183	TCT	2	6	726580	726585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292157
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15639	NC_015183	CGA	2	6	726662	726667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292157
15640	NC_015183	CGG	2	6	726680	726685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292157
15641	NC_015183	GCG	2	6	726697	726702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292157
15642	NC_015183	CAA	2	6	726722	726727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292157
15643	NC_015183	GGC	3	9	726761	726769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292157
15644	NC_015183	TCG	2	6	726778	726783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292157
15645	NC_015183	CG	3	6	726828	726833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15646	NC_015183	GGCT	2	8	726847	726854	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15647	NC_015183	GGGCAA	2	12	726858	726869	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15648	NC_015183	CG	3	6	726940	726945	0 %	0 %	50 %	50 %	325292158
15649	NC_015183	TCG	2	6	726979	726984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292158
15650	NC_015183	GC	3	6	727006	727011	0 %	0 %	50 %	50 %	325292158
15651	NC_015183	TCG	2	6	727084	727089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292158
15652	NC_015183	AGC	2	6	727123	727128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292158
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15658	NC_015183	CTGT	2	8	727425	727432	0 %	50 %	25 %	25 %	325292158
15659	NC_015183	GAT	2	6	727434	727439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292158
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15662	NC_015183	GGC	2	6	727547	727552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292158
15663	NC_015183	GC	3	6	727582	727587	0 %	0 %	50 %	50 %	325292158
15664	NC_015183	TGG	2	6	727612	727617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292158
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15668	NC_015183	TGA	2	6	727748	727753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292158
15669	NC_015183	ATC	2	6	727755	727760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292158
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15672	NC_015183	GCA	2	6	727849	727854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292158
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15674	NC_015183	GAC	2	6	727869	727874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292158
15675	NC_015183	GCC	2	6	727920	727925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292158
15676	NC_015183	TCA	2	6	728012	728017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15677	NC_015183	GAT	2	6	728057	728062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292159
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15679	NC_015183	CTG	2	6	728147	728152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292159
15680	NC_015183	ACG	2	6	728156	728161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292159
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15685	NC_015183	CTG	2	6	728297	728302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292159
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15691	NC_015183	GCT	2	6	728767	728772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292159
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15710	NC_015183	GTC	2	6	729518	729523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15717	NC_015183	GTG	2	6	729942	729947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292162
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15720	NC_015183	GCC	2	6	730034	730039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292162
15721	NC_015183	GATC	2	8	730064	730071	25 %	25 %	25 %	25 %	325292162
15722	NC_015183	TCT	2	6	730089	730094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292162
15723	NC_015183	GCC	2	6	730107	730112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292162
15724	NC_015183	ACGA	2	8	730172	730179	50 %	0 %	25 %	25 %	325292162
15725	NC_015183	CG	3	6	730192	730197	0 %	0 %	50 %	50 %	325292162
15726	NC_015183	GCC	2	6	730338	730343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292162
15727	NC_015183	AAT	2	6	730372	730377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325292162
15728	NC_015183	CGC	2	6	730384	730389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292162
15729	NC_015183	ATA	2	6	730430	730435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325292162
15730	NC_015183	GCC	2	6	730436	730441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292162
15731	NC_015183	TGG	2	6	730444	730449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292162
15732	NC_015183	GCC	2	6	730517	730522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292162
15733	NC_015183	TATCGA	2	12	730525	730536	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325292162
15734	NC_015183	GCC	2	6	730550	730555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292162
15735	NC_015183	AAGGC	2	10	730557	730566	40 %	0 %	40 %	20 %	325292162
15736	NC_015183	CGC	2	6	730576	730581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292162
15737	NC_015183	GAT	2	6	730808	730813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292162
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15739	NC_015183	GGGT	2	8	730972	730979	0 %	25 %	75 %	0 %	325292162
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15978	NC_015183	CGA	2	6	742232	742237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292171
15979	NC_015183	TGG	2	6	742238	742243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292171
15980	NC_015183	CGC	2	6	742250	742255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292171
15981	NC_015183	CAGC	2	8	742259	742266	25 %	0 %	25 %	50 %	325292171
15982	NC_015183	GGCG	2	8	742280	742287	0 %	0 %	75 %	25 %	325292171
15983	NC_015183	GTG	2	6	742321	742326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292171
15984	NC_015183	CGT	2	6	742409	742414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292171
15985	NC_015183	ATC	2	6	742417	742422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292171
15986	NC_015183	CCG	2	6	742450	742455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292171
15987	NC_015183	CG	3	6	742544	742549	0 %	0 %	50 %	50 %	325292171
15988	NC_015183	CAG	2	6	742698	742703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292172
15989	NC_015183	CCG	2	6	742708	742713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292172
15990	NC_015183	T	6	6	742745	742750	0 %	100 %	0 %	0 %	325292172
15991	NC_015183	T	6	6	742784	742789	0 %	100 %	0 %	0 %	325292172
15992	NC_015183	GCT	2	6	742798	742803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292172
15993	NC_015183	CGGTT	2	10	742849	742858	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15994	NC_015183	AGA	2	6	742881	742886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15995	NC_015183	CCG	2	6	742912	742917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292173
15996	NC_015183	GTT	2	6	742935	742940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292173
15997	NC_015183	TCC	2	6	742953	742958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292173
15998	NC_015183	CGG	2	6	742990	742995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292173
15999	NC_015183	GGT	2	6	743018	743023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292173
16000	NC_015183	ACG	2	6	743139	743144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292173

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