MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_015183	TTC	2	6	675781	675786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292100
14502	NC_015183	TTC	2	6	675850	675855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292100
14503	NC_015183	CCAG	2	8	675863	675870	25 %	0 %	25 %	50 %	325292100
14504	NC_015183	ATC	2	6	675871	675876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292100
14505	NC_015183	TGCC	2	8	675891	675898	0 %	25 %	25 %	50 %	325292100
14506	NC_015183	GTC	2	6	675913	675918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292100
14507	NC_015183	TTC	2	6	675949	675954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292100
14508	NC_015183	GCTG	2	8	676071	676078	0 %	25 %	50 %	25 %	325292100
14509	NC_015183	TCG	2	6	676109	676114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292100
14510	NC_015183	GC	3	6	676133	676138	0 %	0 %	50 %	50 %	325292100
14511	NC_015183	CGG	2	6	676146	676151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292100
14512	NC_015183	TCA	2	6	676166	676171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292100
14513	NC_015183	ACG	2	6	676256	676261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292100
14514	NC_015183	TGG	2	6	676269	676274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292100
14515	NC_015183	CAA	2	6	676327	676332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14516	NC_015183	GGAAGC	2	12	676357	676368	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	325292101
14517	NC_015183	CTG	2	6	676476	676481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292101
14518	NC_015183	TCT	2	6	676539	676544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292101
14519	NC_015183	GCT	2	6	676546	676551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292101
14520	NC_015183	TAA	2	6	676580	676585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325292101
14521	NC_015183	ACCG	2	8	676696	676703	25 %	0 %	25 %	50 %	325292102
14522	NC_015183	CCG	2	6	676814	676819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292102
14523	NC_015183	TGGC	2	8	676853	676860	0 %	25 %	50 %	25 %	325292102
14524	NC_015183	CGG	2	6	676915	676920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292102
14525	NC_015183	CGC	2	6	677071	677076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292102
14526	NC_015183	GCC	3	9	677135	677143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292102
14527	NC_015183	TCG	2	6	677220	677225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292102
14528	NC_015183	GCC	2	6	677267	677272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292102
14529	NC_015183	CAT	2	6	677320	677325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292103
14530	NC_015183	TTC	2	6	677352	677357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292103
14531	NC_015183	GC	3	6	677411	677416	0 %	0 %	50 %	50 %	325292103
14532	NC_015183	CTG	2	6	677475	677480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292103
14533	NC_015183	AGCGCA	2	12	677491	677502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292103
14534	NC_015183	AGC	2	6	677519	677524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292103
14535	NC_015183	GCC	2	6	677556	677561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292103
14536	NC_015183	CCG	2	6	677566	677571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292103
14537	NC_015183	AGA	2	6	677581	677586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292103
14538	NC_015183	GAA	2	6	677589	677594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292103
14539	NC_015183	TCG	2	6	677596	677601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292103
14540	NC_015183	CCG	2	6	677603	677608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292103
14541	NC_015183	AGA	2	6	677626	677631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292103
14542	NC_015183	GCC	3	9	677670	677678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292103
14543	NC_015183	ACC	2	6	677724	677729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292103
14544	NC_015183	GAAGT	2	10	677769	677778	40 %	20 %	40 %	0 %	325292103
14545	NC_015183	CGC	2	6	677828	677833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14546	NC_015183	T	6	6	677840	677845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14547	NC_015183	TGTC	2	8	677925	677932	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14548	NC_015183	GAA	2	6	678299	678304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292104
14549	NC_015183	CGG	2	6	678305	678310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292104
14550	NC_015183	CGAACC	2	12	678416	678427	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325292104
14551	NC_015183	GGC	2	6	678437	678442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292104
14552	NC_015183	AGG	2	6	678507	678512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292104
14553	NC_015183	GT	3	6	678529	678534	0 %	50 %	50 %	0 %	325292104
14554	NC_015183	CAT	2	6	678584	678589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292104
14555	NC_015183	CGA	2	6	678601	678606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292104
14556	NC_015183	AGA	2	6	678631	678636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292104
14557	NC_015183	TTC	2	6	678665	678670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292104
14558	NC_015183	TCT	2	6	678704	678709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14559	NC_015183	GC	3	6	678902	678907	0 %	0 %	50 %	50 %	325292105
14560	NC_015183	CAT	2	6	678979	678984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292105
14561	NC_015183	GAT	2	6	679006	679011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292105
14562	NC_015183	GCG	3	9	679016	679024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292105
14563	NC_015183	TGA	2	6	679050	679055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292105
14564	NC_015183	CGG	2	6	679081	679086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292105
14565	NC_015183	GC	3	6	679166	679171	0 %	0 %	50 %	50 %	325292105
14566	NC_015183	GGCCGG	2	12	679194	679205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292105
14567	NC_015183	AGG	2	6	679206	679211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292105
14568	NC_015183	CGAT	2	8	679221	679228	25 %	25 %	25 %	25 %	325292105
14569	NC_015183	ACC	2	6	679294	679299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292105
14570	NC_015183	GCCT	2	8	679363	679370	0 %	25 %	25 %	50 %	325292105
14571	NC_015183	CTT	2	6	679399	679404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292105
14572	NC_015183	GTG	2	6	679475	679480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292105
14573	NC_015183	CA	4	8	679506	679513	50 %	0 %	0 %	50 %	325292105
14574	NC_015183	GTC	2	6	679598	679603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14575	NC_015183	TCC	2	6	679615	679620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14576	NC_015183	GCG	2	6	679627	679632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14577	NC_015183	GGC	2	6	679655	679660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14578	NC_015183	G	7	7	679668	679674	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_015183	CCG	2	6	679697	679702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14580	NC_015183	CCA	2	6	679743	679748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14581	NC_015183	GC	3	6	679781	679786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14582	NC_015183	AGC	2	6	679832	679837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292106
14583	NC_015183	CGG	2	6	679861	679866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292106
14584	NC_015183	TCG	2	6	679877	679882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292106
14585	NC_015183	CGG	2	6	679898	679903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292106
14586	NC_015183	TCG	2	6	679920	679925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292106
14587	NC_015183	GACAT	2	10	680033	680042	40 %	20 %	20 %	20 %	325292106
14588	NC_015183	GCA	2	6	680067	680072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292106
14589	NC_015183	GCA	3	9	680112	680120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292106
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14591	NC_015183	CAT	2	6	680209	680214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292106
14592	NC_015183	GC	3	6	680282	680287	0 %	0 %	50 %	50 %	325292106
14593	NC_015183	TGC	2	6	680295	680300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292106
14594	NC_015183	CGT	2	6	680320	680325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292106
14595	NC_015183	CTT	2	6	680353	680358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292106
14596	NC_015183	ATG	2	6	680462	680467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292106
14597	NC_015183	CG	3	6	680523	680528	0 %	0 %	50 %	50 %	325292106
14598	NC_015183	AGC	2	6	680561	680566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292106
14599	NC_015183	TGA	2	6	680733	680738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292106
14600	NC_015183	TGC	2	6	680739	680744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292106
14601	NC_015183	CTC	2	6	680785	680790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292106
14602	NC_015183	GCCA	2	8	680799	680806	25 %	0 %	25 %	50 %	325292106
14603	NC_015183	TCG	2	6	680807	680812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292106
14604	NC_015183	GCCC	2	8	680841	680848	0 %	0 %	25 %	75 %	325292106
14605	NC_015183	CAC	2	6	680862	680867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292106
14606	NC_015183	CGA	2	6	680873	680878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292106
14607	NC_015183	AGC	2	6	680953	680958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292106
14608	NC_015183	TC	3	6	680978	680983	0 %	50 %	0 %	50 %	325292106
14609	NC_015183	A	6	6	681118	681123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14610	NC_015183	TTGT	2	8	681161	681168	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14611	NC_015183	CAGTG	2	10	681230	681239	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14612	NC_015183	CG	3	6	681395	681400	0 %	0 %	50 %	50 %	325292107
14613	NC_015183	TCG	2	6	681406	681411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292107
14614	NC_015183	CG	3	6	681410	681415	0 %	0 %	50 %	50 %	325292107
14615	NC_015183	CGC	2	6	681423	681428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292107
14616	NC_015183	GC	3	6	681478	681483	0 %	0 %	50 %	50 %	325292107
14617	NC_015183	CTG	2	6	681496	681501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292107
14618	NC_015183	CTGT	2	8	681560	681567	0 %	50 %	25 %	25 %	325292107
14619	NC_015183	CG	3	6	681576	681581	0 %	0 %	50 %	50 %	325292107
14620	NC_015183	GCC	2	6	681632	681637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292107
14621	NC_015183	TCC	2	6	681639	681644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292107
14622	NC_015183	GAA	2	6	681669	681674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292107
14623	NC_015183	GCCGC	2	10	681735	681744	0 %	0 %	40 %	60 %	325292107
14624	NC_015183	GAT	2	6	681801	681806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14625	NC_015183	GCT	2	6	681810	681815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14626	NC_015183	GCGG	2	8	681823	681830	0 %	0 %	75 %	25 %	325292108
14627	NC_015183	CGG	2	6	681858	681863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292108
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14693	NC_015183	T	6	6	685029	685034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14694	NC_015183	AG	3	6	685042	685047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14720	NC_015183	CCG	2	6	686361	686366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292112
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14725	NC_015183	TCC	2	6	686756	686761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292113
14726	NC_015183	CGGTCA	2	12	686787	686798	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325292113
14727	NC_015183	CCA	2	6	686808	686813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292113
14728	NC_015183	CGGC	2	8	686931	686938	0 %	0 %	50 %	50 %	325292113
14729	NC_015183	GAT	2	6	686953	686958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292113
14730	NC_015183	CG	3	6	686984	686989	0 %	0 %	50 %	50 %	325292113
14731	NC_015183	TCA	2	6	687009	687014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292113
14732	NC_015183	GCTCGC	2	12	687018	687029	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325292113
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14737	NC_015183	TGG	2	6	687366	687371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292113
14738	NC_015183	GTGCC	2	10	687395	687404	0 %	20 %	40 %	40 %	325292113
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14861	NC_015183	GAC	2	6	693101	693106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292119
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14979	NC_015183	CCCG	2	8	697501	697508	0 %	0 %	25 %	75 %	325292122
14980	NC_015183	GGC	2	6	697540	697545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292122
14981	NC_015183	ATC	2	6	697608	697613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14982	NC_015183	TTG	2	6	697647	697652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14983	NC_015183	CAA	2	6	697701	697706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14984	NC_015183	GAT	2	6	697840	697845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292123
14985	NC_015183	ACC	2	6	698027	698032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292123
14986	NC_015183	CTG	2	6	698071	698076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292123
14987	NC_015183	TGG	2	6	698139	698144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14988	NC_015183	GAT	2	6	698148	698153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14989	NC_015183	CG	3	6	698200	698205	0 %	0 %	50 %	50 %	325292124
14990	NC_015183	GCA	2	6	698305	698310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292124
14991	NC_015183	GTTTTC	2	12	698318	698329	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325292124
14992	NC_015183	GGT	2	6	698453	698458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292124
14993	NC_015183	TCA	2	6	698488	698493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292125
14994	NC_015183	GCG	2	6	698496	698501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292125
14995	NC_015183	GTG	2	6	698580	698585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292125
14996	NC_015183	GCA	2	6	698599	698604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292125
14997	NC_015183	CGG	2	6	698659	698664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292125
14998	NC_015183	CGTCT	2	10	698723	698732	0 %	40 %	20 %	40 %	325292125
14999	NC_015183	GGC	2	6	698749	698754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292125
15000	NC_015183	CAG	2	6	698765	698770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292125

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