MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015183	GAA	2	6	588752	588757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292024
12502	NC_015183	CGT	2	6	588778	588783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292024
12503	NC_015183	TGACGG	2	12	588807	588818	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325292024
12504	NC_015183	CCGT	2	8	588828	588835	0 %	25 %	25 %	50 %	325292024
12505	NC_015183	CGT	2	6	588928	588933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292024
12506	NC_015183	GC	3	6	588951	588956	0 %	0 %	50 %	50 %	325292024
12507	NC_015183	GGC	2	6	588986	588991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292024
12508	NC_015183	TTC	2	6	589023	589028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292024
12509	NC_015183	ACC	2	6	589061	589066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292024
12510	NC_015183	TGGC	2	8	589126	589133	0 %	25 %	50 %	25 %	325292024
12511	NC_015183	CCA	2	6	589158	589163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292024
12512	NC_015183	GC	3	6	589238	589243	0 %	0 %	50 %	50 %	325292024
12513	NC_015183	T	8	8	589266	589273	0 %	100 %	0 %	0 %	325292024
12514	NC_015183	CCCG	2	8	589281	589288	0 %	0 %	25 %	75 %	325292024
12515	NC_015183	GCC	2	6	589343	589348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292024
12516	NC_015183	CTC	2	6	589354	589359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292024
12517	NC_015183	AGG	2	6	589362	589367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292024
12518	NC_015183	TGG	2	6	589373	589378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292024
12519	NC_015183	GCG	2	6	589410	589415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292024
12520	NC_015183	TGC	2	6	589428	589433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292024
12521	NC_015183	TAT	2	6	589436	589441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325292024
12522	NC_015183	TCCGCC	2	12	589583	589594	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	325292024
12523	NC_015183	GGA	2	6	589627	589632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292024
12524	NC_015183	GAA	2	6	589636	589641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292024
12525	NC_015183	CCG	2	6	589654	589659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292024
12526	NC_015183	AGA	2	6	589698	589703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292024
12527	NC_015183	TGT	2	6	589707	589712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325292024
12528	NC_015183	GGT	2	6	589721	589726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292024
12529	NC_015183	CG	3	6	589793	589798	0 %	0 %	50 %	50 %	325292024
12530	NC_015183	GCA	2	6	589833	589838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292024
12531	NC_015183	TCT	2	6	589863	589868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292024
12532	NC_015183	CAT	2	6	589879	589884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292024
12533	NC_015183	GCC	2	6	589928	589933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292024
12534	NC_015183	CTT	3	9	589957	589965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292024
12535	NC_015183	ATCGGC	2	12	589979	589990	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325292024
12536	NC_015183	CGT	2	6	590010	590015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292024
12537	NC_015183	CGG	2	6	590029	590034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292024
12538	NC_015183	GGC	2	6	590081	590086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292024
12539	NC_015183	CTG	2	6	590102	590107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292024
12540	NC_015183	CGCTGG	2	12	590130	590141	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325292024
12541	NC_015183	CGG	2	6	590149	590154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292024
12542	NC_015183	CTGTTC	2	12	590174	590185	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325292024
12543	NC_015183	CGC	2	6	590202	590207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292024
12544	NC_015183	CGC	2	6	590304	590309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292024
12545	NC_015183	TGC	2	6	590325	590330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292024
12546	NC_015183	GCT	2	6	590396	590401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292024
12547	NC_015183	TGC	2	6	590407	590412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292024
12548	NC_015183	GCA	2	6	590445	590450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292024
12549	NC_015183	TGG	2	6	590476	590481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292024
12550	NC_015183	CCA	2	6	590514	590519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325292024
12551	NC_015183	TCC	2	6	590543	590548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292024
12552	NC_015183	GGT	4	12	590564	590575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292024
12553	NC_015183	GCGGTG	2	12	590589	590600	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325292024
12554	NC_015183	GTG	4	12	590598	590609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292024
12555	NC_015183	CGG	2	6	590628	590633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12556	NC_015183	TGA	2	6	590650	590655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_015183	TCT	2	6	590727	590732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292025
12558	NC_015183	CGCA	2	8	590760	590767	25 %	0 %	25 %	50 %	325292025
12559	NC_015183	GGC	2	6	590778	590783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292025
12560	NC_015183	GAA	2	6	590793	590798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292025
12561	NC_015183	TGG	2	6	590816	590821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325292025
12562	NC_015183	AG	3	6	590822	590827	50 %	0 %	50 %	0 %	325292025
12563	NC_015183	GC	3	6	590845	590850	0 %	0 %	50 %	50 %	325292025
12564	NC_015183	CGC	2	6	590861	590866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292025
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12567	NC_015183	AAG	2	6	590926	590931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292025
12568	NC_015183	ATG	2	6	590993	590998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325292025
12569	NC_015183	TCCGA	2	10	591019	591028	20 %	20 %	20 %	40 %	325292025
12570	NC_015183	CAT	2	6	591051	591056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292025
12571	NC_015183	CAA	2	6	591057	591062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325292025
12572	NC_015183	GCC	2	6	591068	591073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292025
12573	NC_015183	CGG	2	6	591074	591079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292025
12574	NC_015183	CAT	2	6	591108	591113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292025
12575	NC_015183	CCGGC	2	10	591146	591155	0 %	0 %	40 %	60 %	325292025
12576	NC_015183	TCG	2	6	591302	591307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292025
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12583	NC_015183	GAG	2	6	591556	591561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292025
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12585	NC_015183	ATC	2	6	591586	591591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292025
12586	NC_015183	ACCA	2	8	591607	591614	50 %	0 %	0 %	50 %	325292025
12587	NC_015183	CGG	2	6	591699	591704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292025
12588	NC_015183	ATC	2	6	591712	591717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325292025
12589	NC_015183	GTC	2	6	591733	591738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292025
12590	NC_015183	CGCC	2	8	591741	591748	0 %	0 %	25 %	75 %	325292025
12591	NC_015183	AAG	2	6	591844	591849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292025
12592	NC_015183	GC	3	6	591931	591936	0 %	0 %	50 %	50 %	325292025
12593	NC_015183	GCC	2	6	591961	591966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292025
12594	NC_015183	GTC	2	6	591967	591972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292025
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12600	NC_015183	TCG	2	6	592217	592222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292025
12601	NC_015183	GCG	2	6	592282	592287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292025
12602	NC_015183	CCT	2	6	592359	592364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325292025
12603	NC_015183	CTT	2	6	592368	592373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292025
12604	NC_015183	CTG	2	6	592459	592464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292025
12605	NC_015183	CGCC	2	8	592470	592477	0 %	0 %	25 %	75 %	325292025
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12607	NC_015183	CTG	2	6	592525	592530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292025
12608	NC_015183	GC	3	6	592542	592547	0 %	0 %	50 %	50 %	325292025
12609	NC_015183	AAG	2	6	592573	592578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292025
12610	NC_015183	AGA	2	6	592605	592610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325292025
12611	NC_015183	CTG	2	6	592612	592617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325292025
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12613	NC_015183	TCCGC	2	10	592700	592709	0 %	20 %	20 %	60 %	325292025
12614	NC_015183	CG	3	6	592732	592737	0 %	0 %	50 %	50 %	325292025
12615	NC_015183	GAG	2	6	592871	592876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325292025
12616	NC_015183	TCC	2	6	592933	592938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12617	NC_015183	GAT	2	6	592995	593000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12619	NC_015183	G	6	6	593058	593063	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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12740	NC_015183	GC	4	8	598429	598436	0 %	0 %	50 %	50 %	325292030
12741	NC_015183	TCT	2	6	598472	598477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325292030
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12743	NC_015183	GGC	2	6	598544	598549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325292030
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12977	NC_015183	AATC	2	8	608376	608383	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12978	NC_015183	GGGC	2	8	608393	608400	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12979	NC_015183	CCCAA	2	10	608414	608423	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
12980	NC_015183	CAG	2	6	608536	608541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292037
12981	NC_015183	ATCGT	2	10	608612	608621	20 %	40 %	20 %	20 %	325292037
12982	NC_015183	GC	3	6	608674	608679	0 %	0 %	50 %	50 %	325292037
12983	NC_015183	CGC	2	6	608742	608747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325292037
12984	NC_015183	ACGC	2	8	608748	608755	25 %	0 %	25 %	50 %	325292037
12985	NC_015183	T	7	7	608916	608922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12986	NC_015183	GCA	2	6	609018	609023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325292038
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12988	NC_015183	GGGCA	2	10	609352	609361	20 %	0 %	60 %	20 %	325292038
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