MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015183	GGCGT	2	10	517366	517375	0 %	20 %	60 %	20 %	325291957
11002	NC_015183	CG	3	6	517394	517399	0 %	0 %	50 %	50 %	325291957
11003	NC_015183	GCCA	2	8	517422	517429	25 %	0 %	25 %	50 %	325291957
11004	NC_015183	TGG	2	6	517453	517458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291957
11005	NC_015183	CACGA	2	10	517482	517491	40 %	0 %	20 %	40 %	325291957
11006	NC_015183	ATG	2	6	517509	517514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291957
11007	NC_015183	GAAG	2	8	517529	517536	50 %	0 %	50 %	0 %	325291957
11008	NC_015183	GCG	2	6	517560	517565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291957
11009	NC_015183	GC	3	6	517587	517592	0 %	0 %	50 %	50 %	325291957
11010	NC_015183	GGC	2	6	517595	517600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291957
11011	NC_015183	GGT	2	6	517793	517798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291957
11012	NC_015183	GGCAG	2	10	517841	517850	20 %	0 %	60 %	20 %	325291957
11013	NC_015183	GC	3	6	517864	517869	0 %	0 %	50 %	50 %	325291957
11014	NC_015183	GGC	2	6	517880	517885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291957
11015	NC_015183	GAA	2	6	518006	518011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291957
11016	NC_015183	CG	3	6	518076	518081	0 %	0 %	50 %	50 %	325291958
11017	NC_015183	GAC	2	6	518102	518107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291958
11018	NC_015183	CGC	2	6	518160	518165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291958
11019	NC_015183	TCA	2	6	518182	518187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291958
11020	NC_015183	GAG	2	6	518207	518212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291958
11021	NC_015183	CA	3	6	518363	518368	50 %	0 %	0 %	50 %	325291958
11022	NC_015183	AAG	2	6	518393	518398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291958
11023	NC_015183	CGG	3	9	518427	518435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291958
11024	NC_015183	GCAC	2	8	518611	518618	25 %	0 %	25 %	50 %	325291958
11025	NC_015183	CCGGAT	2	12	518643	518654	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325291958
11026	NC_015183	CGG	2	6	518816	518821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291958
11027	NC_015183	TCG	2	6	518912	518917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291958
11028	NC_015183	AGC	2	6	518939	518944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291958
11029	NC_015183	GTC	2	6	518954	518959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291958
11030	NC_015183	GCC	2	6	519065	519070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291958
11031	NC_015183	CAG	2	6	519083	519088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291958
11032	NC_015183	CTT	2	6	519159	519164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291958
11033	NC_015183	CA	3	6	519187	519192	50 %	0 %	0 %	50 %	325291958
11034	NC_015183	CAA	2	6	519196	519201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291958
11035	NC_015183	CAG	2	6	519212	519217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291958
11036	NC_015183	GCA	3	9	519220	519228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291958
11037	NC_015183	GCC	2	6	519239	519244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291958
11038	NC_015183	CGG	2	6	519277	519282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291958
11039	NC_015183	ATGG	2	8	519326	519333	25 %	25 %	50 %	0 %	325291958
11040	NC_015183	CTG	2	6	519357	519362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291958
11041	NC_015183	CCG	2	6	519433	519438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291959
11042	NC_015183	CCT	2	6	519553	519558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291959
11043	NC_015183	GAG	2	6	519564	519569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291959
11044	NC_015183	ATGC	2	8	519626	519633	25 %	25 %	25 %	25 %	325291959
11045	NC_015183	CG	3	6	519671	519676	0 %	0 %	50 %	50 %	325291959
11046	NC_015183	CGC	2	6	519693	519698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291959
11047	NC_015183	GCC	2	6	519711	519716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291959
11048	NC_015183	CAA	2	6	519788	519793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291959
11049	NC_015183	TGG	2	6	519838	519843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291959
11050	NC_015183	AAC	2	6	519895	519900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291959
11051	NC_015183	GA	3	6	519948	519953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_015183	A	6	6	519961	519966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_015183	T	6	6	519981	519986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_015183	AAC	2	6	520033	520038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_015183	TA	4	8	520042	520049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_015183	ATT	2	6	520078	520083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_015183	GAT	2	6	520094	520099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_015183	TGA	2	6	520193	520198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291960
11059	NC_015183	GGC	2	6	520316	520321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291960
11060	NC_015183	ACG	2	6	520389	520394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291960
11061	NC_015183	GCG	2	6	520456	520461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291960
11062	NC_015183	CGA	2	6	520463	520468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291960
11063	NC_015183	GCG	3	9	520512	520520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291960
11064	NC_015183	CGC	2	6	520527	520532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291960
11065	NC_015183	TTGCC	2	10	520618	520627	0 %	40 %	20 %	40 %	325291960
11066	NC_015183	GCG	2	6	520628	520633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291960
11067	NC_015183	CGC	2	6	520674	520679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291960
11068	NC_015183	GAT	2	6	520722	520727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291960
11069	NC_015183	CGT	2	6	520742	520747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291960
11070	NC_015183	AAG	2	6	520773	520778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291960
11071	NC_015183	AAG	2	6	520785	520790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291960
11072	NC_015183	ATTG	2	8	520836	520843	25 %	50 %	25 %	0 %	325291960
11073	NC_015183	AAT	2	6	520846	520851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325291960
11074	NC_015183	ATTC	2	8	520852	520859	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11075	NC_015183	GT	3	6	520983	520988	0 %	50 %	50 %	0 %	325291962
11076	NC_015183	ACA	2	6	521031	521036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291962
11077	NC_015183	CAC	2	6	521050	521055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291962
11078	NC_015183	GC	3	6	521065	521070	0 %	0 %	50 %	50 %	325291962
11079	NC_015183	CGT	2	6	521076	521081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291962
11080	NC_015183	CTCG	2	8	521086	521093	0 %	25 %	25 %	50 %	325291962
11081	NC_015183	CTC	2	6	521101	521106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291962
11082	NC_015183	CGG	2	6	521125	521130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291962
11083	NC_015183	TTC	2	6	521222	521227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291962
11084	NC_015183	TGG	2	6	521239	521244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291962
11085	NC_015183	TCGT	2	8	521273	521280	0 %	50 %	25 %	25 %	325291962
11086	NC_015183	GAA	2	6	521281	521286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291962
11087	NC_015183	CGT	2	6	521362	521367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291962
11088	NC_015183	CGTCAA	2	12	521392	521403	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325291962
11089	NC_015183	GCG	2	6	521480	521485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291962
11090	NC_015183	CGA	2	6	521517	521522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291962
11091	NC_015183	GGC	2	6	521651	521656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291962
11092	NC_015183	CAG	2	6	521676	521681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291962
11093	NC_015183	ACCT	2	8	521740	521747	25 %	25 %	0 %	50 %	325291962
11094	NC_015183	GCG	2	6	521781	521786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291962
11095	NC_015183	CGA	2	6	521832	521837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291962
11096	NC_015183	TGG	2	6	521938	521943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291962
11097	NC_015183	CCG	2	6	521944	521949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291962
11098	NC_015183	CGT	2	6	522043	522048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291962
11099	NC_015183	GATG	2	8	522205	522212	25 %	25 %	50 %	0 %	325291962
11100	NC_015183	AATG	2	8	522253	522260	50 %	25 %	25 %	0 %	325291963
11101	NC_015183	CAA	2	6	522299	522304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291963
11102	NC_015183	GACG	2	8	522317	522324	25 %	0 %	50 %	25 %	325291963
11103	NC_015183	CCT	2	6	522443	522448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291963
11104	NC_015183	GAG	2	6	522510	522515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291963
11105	NC_015183	CGG	2	6	522530	522535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291963
11106	NC_015183	CTG	2	6	522576	522581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291963
11107	NC_015183	TGC	2	6	522626	522631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291963
11108	NC_015183	CAA	2	6	522776	522781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291963
11109	NC_015183	CGG	2	6	522806	522811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291963
11110	NC_015183	GCT	2	6	522845	522850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291963
11111	NC_015183	CAT	2	6	522866	522871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291963
11112	NC_015183	CGT	2	6	522881	522886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291963
11113	NC_015183	ACG	2	6	522901	522906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291963
11114	NC_015183	CGG	2	6	522919	522924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291963
11115	NC_015183	ACG	2	6	522985	522990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291963
11116	NC_015183	AGC	2	6	523041	523046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291963
11117	NC_015183	GCA	2	6	523048	523053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291963
11118	NC_015183	GAC	2	6	523098	523103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291963
11119	NC_015183	CGA	2	6	523130	523135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291963
11120	NC_015183	GC	3	6	523140	523145	0 %	0 %	50 %	50 %	325291963
11121	NC_015183	TCA	2	6	523150	523155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291963
11122	NC_015183	TC	3	6	523264	523269	0 %	50 %	0 %	50 %	325291963
11123	NC_015183	ATT	2	6	523308	523313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325291963
11124	NC_015183	TTG	2	6	523335	523340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291963
11125	NC_015183	CGG	2	6	523346	523351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291963
11126	NC_015183	GGTGG	2	10	523514	523523	0 %	20 %	80 %	0 %	325291963
11127	NC_015183	GC	3	6	523570	523575	0 %	0 %	50 %	50 %	325291963
11128	NC_015183	CCT	2	6	523594	523599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291963
11129	NC_015183	GAG	2	6	523629	523634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291963
11130	NC_015183	GCT	2	6	523640	523645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291963
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11133	NC_015183	CGA	2	6	523697	523702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291963
11134	NC_015183	TTCAT	2	10	523752	523761	20 %	60 %	0 %	20 %	325291964
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11149	NC_015183	GGT	2	6	524459	524464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291964
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11152	NC_015183	CAG	3	9	524625	524633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291964
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11158	NC_015183	TGA	2	6	524841	524846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291964
11159	NC_015183	GGC	2	6	524855	524860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11160	NC_015183	GGA	2	6	524907	524912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291965
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11189	NC_015183	CGA	2	6	526174	526179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291968
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11238	NC_015183	GT	3	6	528244	528249	0 %	50 %	50 %	0 %	325291969
11239	NC_015183	TCG	2	6	528322	528327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291969
11240	NC_015183	GCA	2	6	528350	528355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291969
11241	NC_015183	GCG	2	6	528361	528366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291969
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11243	NC_015183	TCG	2	6	528463	528468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291969
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11249	NC_015183	CATC	2	8	528999	529006	25 %	25 %	0 %	50 %	325291970
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11272	NC_015183	TTGA	2	8	529935	529942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11341	NC_015183	CGAA	3	12	533495	533506	50 %	0 %	25 %	25 %	325291976
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11347	NC_015183	CA	3	6	533696	533701	50 %	0 %	0 %	50 %	325291976
11348	NC_015183	TCT	2	6	533756	533761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291976
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11350	NC_015183	TGA	2	6	533801	533806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291976
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11352	NC_015183	GCG	2	6	533961	533966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291976
11353	NC_015183	C	6	6	534052	534057	0 %	0 %	0 %	100 %	325291976
11354	NC_015183	GAC	2	6	534059	534064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291976
11355	NC_015183	AGGCCG	2	12	534121	534132	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325291976
11356	NC_015183	CGA	2	6	534203	534208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291976
11357	NC_015183	TTGC	2	8	534241	534248	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11358	NC_015183	CAG	2	6	534288	534293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11359	NC_015183	AAAGGC	2	12	534325	534336	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	325291977
11360	NC_015183	TCG	2	6	534420	534425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291977
11361	NC_015183	GCCA	2	8	534437	534444	25 %	0 %	25 %	50 %	325291977
11362	NC_015183	GAA	2	6	534515	534520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291977
11363	NC_015183	TCCA	2	8	534572	534579	25 %	25 %	0 %	50 %	325291977
11364	NC_015183	ATC	2	6	534629	534634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291977
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11367	NC_015183	CG	3	6	534944	534949	0 %	0 %	50 %	50 %	325291977
11368	NC_015183	ATG	2	6	535068	535073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291977
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11373	NC_015183	GAC	2	6	535247	535252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291978
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11382	NC_015183	GCG	2	6	535649	535654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291978
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11398	NC_015183	CCTCT	2	10	536282	536291	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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11401	NC_015183	TAAG	2	8	536363	536370	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11402	NC_015183	CAATGA	2	12	536429	536440	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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11430	NC_015183	AACGG	2	10	537922	537931	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11431	NC_015183	GCGCG	2	10	537952	537961	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11432	NC_015183	AGGG	2	8	537972	537979	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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11479	NC_015183	CGTG	2	8	540119	540126	0 %	25 %	50 %	25 %	325291981
11480	NC_015183	CAA	2	6	540227	540232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291982
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11482	NC_015183	ACCG	2	8	540324	540331	25 %	0 %	25 %	50 %	325291982
11483	NC_015183	CTT	2	6	540380	540385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291982
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