MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015183	CGC	2	6	24630	24635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291477
502	NC_015183	CAGC	2	8	24655	24662	25 %	0 %	25 %	50 %	325291477
503	NC_015183	GC	3	6	24696	24701	0 %	0 %	50 %	50 %	325291477
504	NC_015183	CGG	2	6	24772	24777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291477
505	NC_015183	GTT	2	6	24820	24825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291477
506	NC_015183	CCG	2	6	24860	24865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291477
507	NC_015183	GAAAAT	2	12	24910	24921	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325291477
508	NC_015183	GCCA	2	8	24958	24965	25 %	0 %	25 %	50 %	325291477
509	NC_015183	CGC	2	6	25017	25022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291477
510	NC_015183	GCCT	2	8	25060	25067	0 %	25 %	25 %	50 %	325291477
511	NC_015183	AG	3	6	25077	25082	50 %	0 %	50 %	0 %	325291477
512	NC_015183	GTT	2	6	25093	25098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291477
513	NC_015183	CGA	2	6	25193	25198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291477
514	NC_015183	CG	4	8	25251	25258	0 %	0 %	50 %	50 %	325291477
515	NC_015183	CAGG	2	8	25292	25299	25 %	0 %	50 %	25 %	325291477
516	NC_015183	GCC	2	6	25322	25327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291477
517	NC_015183	GCC	2	6	25378	25383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291477
518	NC_015183	GCG	2	6	25539	25544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291477
519	NC_015183	GCG	2	6	25554	25559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291477
520	NC_015183	CGG	2	6	25563	25568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291477
521	NC_015183	TCG	2	6	25571	25576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291477
522	NC_015183	GGC	2	6	25659	25664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291477
523	NC_015183	TCG	2	6	25766	25771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291477
524	NC_015183	TGG	2	6	25815	25820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291477
525	NC_015183	TGC	2	6	25837	25842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291477
526	NC_015183	A	6	6	25845	25850	100 %	0 %	0 %	0 %	325291477
527	NC_015183	CCG	2	6	25851	25856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291477
528	NC_015183	CG	3	6	25855	25860	0 %	0 %	50 %	50 %	325291477
529	NC_015183	ATG	2	6	25910	25915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291477
530	NC_015183	CTC	2	6	26005	26010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291477
531	NC_015183	ACG	3	9	26039	26047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291477
532	NC_015183	CTG	3	9	26082	26090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291477
533	NC_015183	ACG	2	6	26117	26122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291477
534	NC_015183	AGA	2	6	26232	26237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291477
535	NC_015183	CCG	2	6	26259	26264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291477
536	NC_015183	CCA	2	6	26272	26277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291477
537	NC_015183	TTC	2	6	26326	26331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291477
538	NC_015183	CATCG	2	10	26338	26347	20 %	20 %	20 %	40 %	325291477
539	NC_015183	GC	5	10	26361	26370	0 %	0 %	50 %	50 %	325291477
540	NC_015183	GCTG	2	8	26392	26399	0 %	25 %	50 %	25 %	325291477
541	NC_015183	GTG	2	6	26409	26414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291477
542	NC_015183	ATGG	2	8	26422	26429	25 %	25 %	50 %	0 %	325291477
543	NC_015183	GC	3	6	26473	26478	0 %	0 %	50 %	50 %	325291477
544	NC_015183	GCCG	2	8	26490	26497	0 %	0 %	50 %	50 %	325291477
545	NC_015183	GAA	2	6	26548	26553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291477
546	NC_015183	GTC	2	6	26560	26565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291477
547	NC_015183	AGA	2	6	26618	26623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291477
548	NC_015183	GCA	2	6	26640	26645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291477
549	NC_015183	CA	3	6	26742	26747	50 %	0 %	0 %	50 %	325291477
550	NC_015183	GAT	2	6	26853	26858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291478
551	NC_015183	TTCT	2	8	26934	26941	0 %	75 %	0 %	25 %	325291478
552	NC_015183	CAT	2	6	26990	26995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291478
553	NC_015183	CAG	2	6	26997	27002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291478
554	NC_015183	ACC	2	6	27034	27039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291478
555	NC_015183	AG	3	6	27084	27089	50 %	0 %	50 %	0 %	325291478
556	NC_015183	GGT	2	6	27117	27122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291478
557	NC_015183	GAA	2	6	27171	27176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291478
558	NC_015183	TCA	2	6	27305	27310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291478
559	NC_015183	TCG	2	6	27322	27327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291478
560	NC_015183	ATC	2	6	27370	27375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291478
561	NC_015183	GAC	2	6	27399	27404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291478
562	NC_015183	TCT	2	6	27407	27412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291478
563	NC_015183	ATC	2	6	27451	27456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291478
564	NC_015183	CGG	2	6	27527	27532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291478
565	NC_015183	TGCGC	2	10	27748	27757	0 %	20 %	40 %	40 %	325291479
566	NC_015183	ATG	2	6	27762	27767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291479
567	NC_015183	CTCGT	2	10	27806	27815	0 %	40 %	20 %	40 %	325291479
568	NC_015183	ATC	2	6	27918	27923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291479
569	NC_015183	ATA	2	6	28064	28069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325291479
570	NC_015183	CCA	2	6	28126	28131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291479
571	NC_015183	TCGA	2	8	28160	28167	25 %	25 %	25 %	25 %	325291479
572	NC_015183	AGG	2	6	28169	28174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291479
573	NC_015183	TGC	2	6	28186	28191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291479
574	NC_015183	GCG	2	6	28236	28241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291479
575	NC_015183	CCCG	2	8	28306	28313	0 %	0 %	25 %	75 %	325291479
576	NC_015183	AGG	2	6	28323	28328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291479
577	NC_015183	CCG	2	6	28348	28353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291479
578	NC_015183	GC	3	6	28366	28371	0 %	0 %	50 %	50 %	325291479
579	NC_015183	GCG	3	9	28734	28742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291479
580	NC_015183	TCG	2	6	28785	28790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291479
581	NC_015183	GAT	2	6	28874	28879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291479
582	NC_015183	GCG	2	6	29093	29098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291480
583	NC_015183	GCCGG	2	10	29152	29161	0 %	0 %	60 %	40 %	325291480
584	NC_015183	AGGCCA	2	12	29216	29227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291480
585	NC_015183	CCG	2	6	29236	29241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291480
586	NC_015183	CCG	2	6	29243	29248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291480
587	NC_015183	CG	3	6	29253	29258	0 %	0 %	50 %	50 %	325291480
588	NC_015183	CGCTG	2	10	29343	29352	0 %	20 %	40 %	40 %	325291480
589	NC_015183	ATTG	2	8	29389	29396	25 %	50 %	25 %	0 %	325291480
590	NC_015183	GAG	2	6	29404	29409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291480
591	NC_015183	TGA	2	6	29412	29417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291480
592	NC_015183	CCA	2	6	29445	29450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291480
593	NC_015183	CGA	2	6	29472	29477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291480
594	NC_015183	AGT	2	6	29562	29567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291480
595	NC_015183	ATG	2	6	29576	29581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291480
596	NC_015183	AGA	2	6	29627	29632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291480
597	NC_015183	CTGC	2	8	29667	29674	0 %	25 %	25 %	50 %	325291480
598	NC_015183	GCG	2	6	29739	29744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291480
599	NC_015183	TTC	2	6	29780	29785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291480
600	NC_015183	TCG	2	6	29789	29794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291480
601	NC_015183	CGT	2	6	29808	29813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291480
602	NC_015183	GTCA	2	8	29848	29855	25 %	25 %	25 %	25 %	325291480
603	NC_015183	AAT	2	6	29896	29901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325291480
604	NC_015183	TGA	2	6	29976	29981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291480
605	NC_015183	GCCA	2	8	29997	30004	25 %	0 %	25 %	50 %	325291480
606	NC_015183	GGC	2	6	30031	30036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291480
607	NC_015183	CGG	2	6	30075	30080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291480
608	NC_015183	CGTC	2	8	30125	30132	0 %	25 %	25 %	50 %	325291480
609	NC_015183	CGC	2	6	30255	30260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291480
610	NC_015183	GA	3	6	30334	30339	50 %	0 %	50 %	0 %	325291480
611	NC_015183	GCT	2	6	30384	30389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291480
612	NC_015183	CGG	2	6	30402	30407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291480
613	NC_015183	GCCG	2	8	30513	30520	0 %	0 %	50 %	50 %	325291480
614	NC_015183	GAT	2	6	30546	30551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291480
615	NC_015183	GGT	2	6	30598	30603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291480
616	NC_015183	CCGC	2	8	30641	30648	0 %	0 %	25 %	75 %	325291480
617	NC_015183	GAA	2	6	30670	30675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291480
618	NC_015183	ACC	2	6	30692	30697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291480
619	NC_015183	TCT	2	6	30747	30752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291480
620	NC_015183	CG	3	6	30807	30812	0 %	0 %	50 %	50 %	325291480
621	NC_015183	TTCGCC	2	12	30853	30864	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325291480
622	NC_015183	GCC	2	6	30870	30875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291480
623	NC_015183	TCGA	2	8	30887	30894	25 %	25 %	25 %	25 %	325291480
624	NC_015183	GCGCTC	2	12	30934	30945	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325291480
625	NC_015183	GC	3	6	30968	30973	0 %	0 %	50 %	50 %	325291480
626	NC_015183	GTT	2	6	30976	30981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291480
627	NC_015183	CGA	2	6	30987	30992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291480
628	NC_015183	CG	3	6	30995	31000	0 %	0 %	50 %	50 %	325291480
629	NC_015183	GCC	2	6	31009	31014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291480
630	NC_015183	CGC	2	6	31044	31049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291480
631	NC_015183	GAT	2	6	31127	31132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291480
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633	NC_015183	TGG	2	6	31295	31300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291480
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637	NC_015183	GCGCCA	2	12	31476	31487	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325291480
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641	NC_015183	A	6	6	31801	31806	100 %	0 %	0 %	0 %	325291481
642	NC_015183	CG	3	6	31812	31817	0 %	0 %	50 %	50 %	325291481
643	NC_015183	TCG	2	6	32001	32006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291482
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646	NC_015183	ACG	2	6	32092	32097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291482
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652	NC_015183	CGA	2	6	32281	32286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291482
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654	NC_015183	GGT	3	9	32342	32350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291482
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662	NC_015183	ACTTGG	2	12	32605	32616	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325291482
663	NC_015183	CGTTGA	2	12	32626	32637	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325291482
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679	NC_015183	TTTCGG	2	12	33193	33204	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	325291482
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682	NC_015183	AGC	2	6	33329	33334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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684	NC_015183	TGGGG	2	10	33396	33405	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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705	NC_015183	TGA	2	6	34174	34179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
706	NC_015183	CGTT	2	8	34229	34236	0 %	50 %	25 %	25 %	325291485
707	NC_015183	GCA	2	6	34258	34263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291485
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709	NC_015183	GCA	2	6	34328	34333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291485
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722	NC_015183	AAGGCC	2	12	34807	34818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291486
723	NC_015183	CGGT	3	12	34846	34857	0 %	25 %	50 %	25 %	325291486
724	NC_015183	GC	3	6	34993	34998	0 %	0 %	50 %	50 %	325291486
725	NC_015183	ACG	2	6	35051	35056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291486
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734	NC_015183	GCC	2	6	35528	35533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291486
735	NC_015183	GCC	2	6	35538	35543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291486
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737	NC_015183	TGG	2	6	35559	35564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291486
738	NC_015183	ACA	3	9	35568	35576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291486
739	NC_015183	ATG	2	6	35621	35626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291486
740	NC_015183	TCA	2	6	35793	35798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291486
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742	NC_015183	GCA	2	6	35862	35867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291486
743	NC_015183	CGG	2	6	35923	35928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291486
744	NC_015183	GCA	2	6	36042	36047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291486
745	NC_015183	GGGC	2	8	36099	36106	0 %	0 %	75 %	25 %	325291486
746	NC_015183	CAG	2	6	36133	36138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291486
747	NC_015183	TGATGG	2	12	36150	36161	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	325291486
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750	NC_015183	GCG	2	6	36325	36330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291486
751	NC_015183	GGAT	2	8	36383	36390	25 %	25 %	50 %	0 %	325291486
752	NC_015183	GGC	2	6	36396	36401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291486
753	NC_015183	CAA	2	6	36460	36465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291486
754	NC_015183	CCA	2	6	36479	36484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
755	NC_015183	GGT	2	6	36492	36497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
756	NC_015183	CTT	2	6	36596	36601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291487
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