MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_015183	GCG	2	6	2451616	2451621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293882
53002	NC_015183	GGC	2	6	2451629	2451634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293882
53003	NC_015183	AG	3	6	2451637	2451642	50 %	0 %	50 %	0 %	325293882
53004	NC_015183	CCG	2	6	2451699	2451704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293882
53005	NC_015183	CA	3	6	2451742	2451747	50 %	0 %	0 %	50 %	325293882
53006	NC_015183	CCT	2	6	2451787	2451792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293882
53007	NC_015183	CAG	2	6	2451806	2451811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293882
53008	NC_015183	GCC	2	6	2451861	2451866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293882
53009	NC_015183	CCG	2	6	2451915	2451920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293882
53010	NC_015183	GAC	2	6	2451935	2451940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293882
53011	NC_015183	GC	3	6	2451992	2451997	0 %	0 %	50 %	50 %	325293882
53012	NC_015183	CTC	2	6	2451998	2452003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293882
53013	NC_015183	CGAC	2	8	2452050	2452057	25 %	0 %	25 %	50 %	325293882
53014	NC_015183	GCG	2	6	2452090	2452095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293882
53015	NC_015183	TCC	2	6	2452122	2452127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53016	NC_015183	GCG	2	6	2452176	2452181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293883
53017	NC_015183	AGC	2	6	2452203	2452208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293883
53018	NC_015183	GTCGT	2	10	2452210	2452219	0 %	40 %	40 %	20 %	325293883
53019	NC_015183	ACC	2	6	2452239	2452244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293883
53020	NC_015183	CGG	2	6	2452290	2452295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293883
53021	NC_015183	GGC	2	6	2452304	2452309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293883
53022	NC_015183	CTC	2	6	2452373	2452378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293883
53023	NC_015183	AGC	2	6	2452461	2452466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293883
53024	NC_015183	GTT	2	6	2452487	2452492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293883
53025	NC_015183	AGA	2	6	2452503	2452508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293883
53026	NC_015183	GGC	2	6	2452512	2452517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293883
53027	NC_015183	CGG	2	6	2452537	2452542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293883
53028	NC_015183	TGA	2	6	2452588	2452593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293883
53029	NC_015183	TCG	2	6	2452621	2452626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293883
53030	NC_015183	TCC	2	6	2452695	2452700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53031	NC_015183	TCT	2	6	2452795	2452800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293884
53032	NC_015183	ACA	2	6	2453030	2453035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293884
53033	NC_015183	TTG	2	6	2453101	2453106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293884
53034	NC_015183	GAA	2	6	2453193	2453198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293884
53035	NC_015183	CAC	2	6	2453408	2453413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53036	NC_015183	GGA	2	6	2453417	2453422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53037	NC_015183	GA	3	6	2453438	2453443	50 %	0 %	50 %	0 %	325293885
53038	NC_015183	GC	3	6	2453535	2453540	0 %	0 %	50 %	50 %	325293885
53039	NC_015183	GCC	2	6	2453569	2453574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293885
53040	NC_015183	CAG	2	6	2453603	2453608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293885
53041	NC_015183	GAA	2	6	2453623	2453628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293885
53042	NC_015183	ATC	2	6	2453650	2453655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293885
53043	NC_015183	ACA	2	6	2453672	2453677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293885
53044	NC_015183	AC	3	6	2453751	2453756	50 %	0 %	0 %	50 %	325293885
53045	NC_015183	CGG	2	6	2453764	2453769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293885
53046	NC_015183	CCG	2	6	2453859	2453864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53047	NC_015183	GCG	2	6	2453879	2453884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53048	NC_015183	GGCC	2	8	2453949	2453956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53049	NC_015183	TGA	2	6	2453958	2453963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53050	NC_015183	CTG	2	6	2453990	2453995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53051	NC_015183	GCC	2	6	2454017	2454022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53052	NC_015183	GCA	2	6	2454083	2454088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293886
53053	NC_015183	GCC	2	6	2454176	2454181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293886
53054	NC_015183	GCA	2	6	2454311	2454316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293886
53055	NC_015183	GCC	3	9	2454343	2454351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293886
53056	NC_015183	TTGCG	2	10	2454360	2454369	0 %	40 %	40 %	20 %	325293886
53057	NC_015183	GAC	2	6	2454379	2454384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293886
53058	NC_015183	GAT	2	6	2454394	2454399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293886
53059	NC_015183	CATC	2	8	2454462	2454469	25 %	25 %	0 %	50 %	325293886
53060	NC_015183	CGG	2	6	2454528	2454533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293886
53061	NC_015183	CCA	2	6	2454540	2454545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293886
53062	NC_015183	CTGC	2	8	2454552	2454559	0 %	25 %	25 %	50 %	325293886
53063	NC_015183	CGAT	2	8	2454593	2454600	25 %	25 %	25 %	25 %	325293886
53064	NC_015183	CG	3	6	2454656	2454661	0 %	0 %	50 %	50 %	325293886
53065	NC_015183	GCC	2	6	2454862	2454867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293886
53066	NC_015183	ACG	2	6	2454935	2454940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293886
53067	NC_015183	GCC	2	6	2455181	2455186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293886
53068	NC_015183	GAT	2	6	2455387	2455392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293886
53069	NC_015183	CGA	2	6	2455404	2455409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293886
53070	NC_015183	GGA	2	6	2455410	2455415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293886
53071	NC_015183	TCA	2	6	2455461	2455466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293886
53072	NC_015183	CTT	2	6	2455575	2455580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293887
53073	NC_015183	TCA	2	6	2455624	2455629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293887
53074	NC_015183	CGC	2	6	2455717	2455722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293887
53075	NC_015183	GAT	2	6	2455731	2455736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293887
53076	NC_015183	GCAA	2	8	2455846	2455853	50 %	0 %	25 %	25 %	325293887
53077	NC_015183	ATC	2	6	2455884	2455889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293887
53078	NC_015183	GCGAA	2	10	2455974	2455983	40 %	0 %	40 %	20 %	325293887
53079	NC_015183	CAC	2	6	2456209	2456214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53080	NC_015183	TGGT	2	8	2456215	2456222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53081	NC_015183	TC	3	6	2456265	2456270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53082	NC_015183	CCT	2	6	2456273	2456278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53083	NC_015183	GCT	2	6	2456361	2456366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293888
53084	NC_015183	TCC	2	6	2456432	2456437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293888
53085	NC_015183	GTG	2	6	2456474	2456479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293888
53086	NC_015183	GCAC	2	8	2456483	2456490	25 %	0 %	25 %	50 %	325293888
53087	NC_015183	ATC	2	6	2456584	2456589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293888
53088	NC_015183	TGT	2	6	2456628	2456633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293888
53089	NC_015183	CCAG	2	8	2456649	2456656	25 %	0 %	25 %	50 %	325293888
53090	NC_015183	TGC	2	6	2456721	2456726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293888
53091	NC_015183	CTC	2	6	2456770	2456775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293888
53092	NC_015183	GAA	2	6	2456785	2456790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293888
53093	NC_015183	T	6	6	2456821	2456826	0 %	100 %	0 %	0 %	325293888
53094	NC_015183	GGC	2	6	2456881	2456886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293888
53095	NC_015183	AGCC	2	8	2456891	2456898	25 %	0 %	25 %	50 %	325293888
53096	NC_015183	ATG	2	6	2456942	2456947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293888
53097	NC_015183	TTA	2	6	2457020	2457025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53098	NC_015183	CTT	2	6	2457104	2457109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293889
53099	NC_015183	CAT	2	6	2457148	2457153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293889
53100	NC_015183	GGA	2	6	2457181	2457186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293889
53101	NC_015183	GCG	2	6	2457237	2457242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293889
53102	NC_015183	ATGACG	2	12	2457248	2457259	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325293889
53103	NC_015183	GCCC	2	8	2457288	2457295	0 %	0 %	25 %	75 %	325293889
53104	NC_015183	CAA	2	6	2457301	2457306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293889
53105	NC_015183	GCC	2	6	2457408	2457413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293889
53106	NC_015183	CCA	2	6	2457460	2457465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293889
53107	NC_015183	GAA	2	6	2457493	2457498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293889
53108	NC_015183	CAT	2	6	2457523	2457528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293889
53109	NC_015183	GGCG	2	8	2457562	2457569	0 %	0 %	75 %	25 %	325293889
53110	NC_015183	CGC	2	6	2457624	2457629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293889
53111	NC_015183	GGC	2	6	2457656	2457661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293889
53112	NC_015183	CGA	2	6	2457724	2457729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293889
53113	NC_015183	CCG	2	6	2457753	2457758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293889
53114	NC_015183	GGC	2	6	2457773	2457778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293889
53115	NC_015183	CGC	2	6	2457918	2457923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293889
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53117	NC_015183	CGC	2	6	2457976	2457981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293889
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53218	NC_015183	GCA	2	6	2462289	2462294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293891
53219	NC_015183	AG	3	6	2462317	2462322	50 %	0 %	50 %	0 %	325293891
53220	NC_015183	CAGC	2	8	2462332	2462339	25 %	0 %	25 %	50 %	325293891
53221	NC_015183	GAA	2	6	2462347	2462352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293891
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53224	NC_015183	CGG	2	6	2462477	2462482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53225	NC_015183	CAG	2	6	2462568	2462573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293892
53226	NC_015183	CTTC	2	8	2462648	2462655	0 %	50 %	0 %	50 %	325293892
53227	NC_015183	TTG	2	6	2462671	2462676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293892
53228	NC_015183	TGA	2	6	2462780	2462785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293892
53229	NC_015183	CAT	2	6	2462870	2462875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293892
53230	NC_015183	GCC	2	6	2462914	2462919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293892
53231	NC_015183	CTT	2	6	2462970	2462975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293892
53232	NC_015183	ATCG	2	8	2462982	2462989	25 %	25 %	25 %	25 %	325293892
53233	NC_015183	CGAG	2	8	2463014	2463021	25 %	0 %	50 %	25 %	325293892
53234	NC_015183	CAG	2	6	2463093	2463098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293892
53235	NC_015183	GC	3	6	2463167	2463172	0 %	0 %	50 %	50 %	325293892
53236	NC_015183	GCC	2	6	2463283	2463288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293892
53237	NC_015183	CCA	2	6	2463315	2463320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293892
53238	NC_015183	CGCA	2	8	2463348	2463355	25 %	0 %	25 %	50 %	325293892
53239	NC_015183	GAC	2	6	2463447	2463452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293892
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53243	NC_015183	TGC	2	6	2463629	2463634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53244	NC_015183	CTGT	2	8	2463639	2463646	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53245	NC_015183	CCA	2	6	2463758	2463763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293893
53246	NC_015183	ATC	2	6	2463769	2463774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293893
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53263	NC_015183	GCCAT	2	10	2464627	2464636	20 %	20 %	20 %	40 %	325293893
53264	NC_015183	CGC	2	6	2464668	2464673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53265	NC_015183	ACCGC	2	10	2464756	2464765	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
53266	NC_015183	GAA	2	6	2464770	2464775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53267	NC_015183	ATG	3	9	2464869	2464877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53268	NC_015183	GGA	2	6	2464881	2464886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53269	NC_015183	TCG	2	6	2464922	2464927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293894
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53271	NC_015183	GCTG	2	8	2464979	2464986	0 %	25 %	50 %	25 %	325293894
53272	NC_015183	GC	4	8	2464994	2465001	0 %	0 %	50 %	50 %	325293894
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53331	NC_015183	GTT	2	6	2467793	2467798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53332	NC_015183	TTC	2	6	2467833	2467838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53333	NC_015183	CT	3	6	2467842	2467847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53334	NC_015183	CGT	2	6	2467881	2467886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293896
53335	NC_015183	CG	3	6	2467935	2467940	0 %	0 %	50 %	50 %	325293896
53336	NC_015183	GGC	2	6	2467984	2467989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293896
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53340	NC_015183	TCC	2	6	2468284	2468289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293896
53341	NC_015183	CGG	2	6	2468322	2468327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293896
53342	NC_015183	AGC	2	6	2468372	2468377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293896
53343	NC_015183	GC	3	6	2468386	2468391	0 %	0 %	50 %	50 %	325293896
53344	NC_015183	TCC	2	6	2468398	2468403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293896
53345	NC_015183	TCG	2	6	2468441	2468446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293896
53346	NC_015183	GGC	2	6	2468505	2468510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293896
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53348	NC_015183	GAC	2	6	2468613	2468618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293896
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53450	NC_015183	TCC	2	6	2473244	2473249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293901
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53460	NC_015183	GAC	2	6	2473679	2473684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293901
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53462	NC_015183	CGAGGC	2	12	2473756	2473767	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325293901
53463	NC_015183	GGA	2	6	2473843	2473848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293901
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53466	NC_015183	GCT	2	6	2474137	2474142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293901
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53491	NC_015183	AG	3	6	2475304	2475309	50 %	0 %	50 %	0 %	325293902
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53493	NC_015183	TGA	2	6	2475462	2475467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293903
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53499	NC_015183	TCG	2	6	2475650	2475655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293903
53500	NC_015183	CCG	2	6	2475684	2475689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293903

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