MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_015183	TGC	2	6	2381489	2381494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293822
51502	NC_015183	CCG	2	6	2381620	2381625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293822
51503	NC_015183	TCA	2	6	2381632	2381637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293822
51504	NC_015183	TAT	2	6	2381652	2381657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325293822
51505	NC_015183	GGC	2	6	2381658	2381663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293822
51506	NC_015183	ACC	2	6	2381679	2381684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293822
51507	NC_015183	ATCG	2	8	2381717	2381724	25 %	25 %	25 %	25 %	325293822
51508	NC_015183	CAA	2	6	2381741	2381746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293822
51509	NC_015183	CGG	2	6	2381765	2381770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293822
51510	NC_015183	CCG	2	6	2381785	2381790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293822
51511	NC_015183	TCG	2	6	2381803	2381808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293822
51512	NC_015183	TTG	2	6	2381839	2381844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293822
51513	NC_015183	CG	3	6	2381881	2381886	0 %	0 %	50 %	50 %	325293822
51514	NC_015183	TCG	2	6	2381992	2381997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293822
51515	NC_015183	GAC	2	6	2382068	2382073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293822
51516	NC_015183	CGA	2	6	2382137	2382142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293822
51517	NC_015183	TGCC	2	8	2382250	2382257	0 %	25 %	25 %	50 %	325293822
51518	NC_015183	GGT	2	6	2382258	2382263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293822
51519	NC_015183	CCTT	2	8	2382277	2382284	0 %	50 %	0 %	50 %	325293822
51520	NC_015183	GAA	2	6	2382321	2382326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293822
51521	NC_015183	GCC	2	6	2382366	2382371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293822
51522	NC_015183	CGA	2	6	2382424	2382429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293822
51523	NC_015183	CAT	2	6	2382443	2382448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293822
51524	NC_015183	CAG	2	6	2382462	2382467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293822
51525	NC_015183	GCCCG	2	10	2382479	2382488	0 %	0 %	40 %	60 %	325293822
51526	NC_015183	CTG	2	6	2382489	2382494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293822
51527	NC_015183	CCA	2	6	2382499	2382504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293822
51528	NC_015183	TGC	2	6	2382556	2382561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293822
51529	NC_015183	GCT	2	6	2382599	2382604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293822
51530	NC_015183	CTG	2	6	2382639	2382644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293822
51531	NC_015183	CCGT	2	8	2382675	2382682	0 %	25 %	25 %	50 %	325293822
51532	NC_015183	TGC	2	6	2382697	2382702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293822
51533	NC_015183	CAT	2	6	2382725	2382730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293822
51534	NC_015183	CAG	2	6	2382795	2382800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293822
51535	NC_015183	CGACC	2	10	2382830	2382839	20 %	0 %	20 %	60 %	325293822
51536	NC_015183	TGC	2	6	2382841	2382846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293822
51537	NC_015183	TCACC	2	10	2382847	2382856	20 %	20 %	0 %	60 %	325293822
51538	NC_015183	GCC	3	9	2382885	2382893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293822
51539	NC_015183	TCA	2	6	2382907	2382912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293822
51540	NC_015183	CCGCGG	2	12	2382920	2382931	0 %	0 %	50 %	50 %	325293822
51541	NC_015183	GCC	2	6	2382951	2382956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293822
51542	NC_015183	AACA	2	8	2382970	2382977	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51543	NC_015183	TG	3	6	2383044	2383049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51544	NC_015183	GCA	2	6	2383177	2383182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293823
51545	NC_015183	GCA	2	6	2383231	2383236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293823
51546	NC_015183	CGGC	2	8	2383265	2383272	0 %	0 %	50 %	50 %	325293823
51547	NC_015183	GCC	2	6	2383346	2383351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293823
51548	NC_015183	CA	4	8	2383405	2383412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51549	NC_015183	GCT	2	6	2383588	2383593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293824
51550	NC_015183	GCA	2	6	2383595	2383600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293824
51551	NC_015183	GGTTCT	2	12	2383696	2383707	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	325293824
51552	NC_015183	CTCG	2	8	2383717	2383724	0 %	25 %	25 %	50 %	325293824
51553	NC_015183	TCG	2	6	2383881	2383886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293824
51554	NC_015183	CGCC	2	8	2383929	2383936	0 %	0 %	25 %	75 %	325293824
51555	NC_015183	TCGA	2	8	2383946	2383953	25 %	25 %	25 %	25 %	325293824
51556	NC_015183	GAA	2	6	2384021	2384026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293824
51557	NC_015183	A	6	6	2384029	2384034	100 %	0 %	0 %	0 %	325293824
51558	NC_015183	GAT	2	6	2384101	2384106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293824
51559	NC_015183	GGCT	2	8	2384159	2384166	0 %	25 %	50 %	25 %	325293824
51560	NC_015183	GCC	3	9	2384327	2384335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293824
51561	NC_015183	CCA	2	6	2384359	2384364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293824
51562	NC_015183	GAA	2	6	2384377	2384382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293824
51563	NC_015183	GGC	2	6	2384410	2384415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293824
51564	NC_015183	CAG	2	6	2384425	2384430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293824
51565	NC_015183	CAC	2	6	2384446	2384451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293824
51566	NC_015183	GAA	2	6	2384485	2384490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293824
51567	NC_015183	TCC	2	6	2384558	2384563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51568	NC_015183	CCT	2	6	2384643	2384648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293825
51569	NC_015183	TCG	2	6	2384681	2384686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293825
51570	NC_015183	CTC	2	6	2384752	2384757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293825
51571	NC_015183	TCA	2	6	2384822	2384827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293825
51572	NC_015183	CAC	2	6	2384874	2384879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293825
51573	NC_015183	CCG	2	6	2384885	2384890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293825
51574	NC_015183	TGG	2	6	2384951	2384956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293825
51575	NC_015183	CCG	2	6	2384957	2384962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293825
51576	NC_015183	GCTG	2	8	2384970	2384977	0 %	25 %	50 %	25 %	325293825
51577	NC_015183	TGC	2	6	2385026	2385031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293825
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51582	NC_015183	TGC	2	6	2385107	2385112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293825
51583	NC_015183	TGC	2	6	2385152	2385157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293825
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51585	NC_015183	CGC	2	6	2385213	2385218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293825
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51587	NC_015183	CAC	2	6	2385255	2385260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293825
51588	NC_015183	CCG	2	6	2385279	2385284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293825
51589	NC_015183	CGT	4	12	2385327	2385338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293825
51590	NC_015183	TGA	2	6	2385392	2385397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293825
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51592	NC_015183	GC	4	8	2385486	2385493	0 %	0 %	50 %	50 %	325293825
51593	NC_015183	GTT	2	6	2385540	2385545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293825
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51596	NC_015183	GC	3	6	2385598	2385603	0 %	0 %	50 %	50 %	325293826
51597	NC_015183	TGC	2	6	2385612	2385617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293826
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51601	NC_015183	TGAT	2	8	2385882	2385889	25 %	50 %	25 %	0 %	325293826
51602	NC_015183	GCT	2	6	2385919	2385924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293826
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51616	NC_015183	CAT	2	6	2386411	2386416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293826
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51967	NC_015183	GCC	2	6	2402938	2402943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293840
51968	NC_015183	AGGCG	2	10	2402949	2402958	20 %	0 %	60 %	20 %	325293840
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51970	NC_015183	GGTG	2	8	2402982	2402989	0 %	25 %	75 %	0 %	325293840
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51980	NC_015183	GTC	2	6	2403302	2403307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293840
51981	NC_015183	CG	3	6	2403368	2403373	0 %	0 %	50 %	50 %	325293840
51982	NC_015183	CGC	2	6	2403384	2403389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293840
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51989	NC_015183	GCC	2	6	2403584	2403589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293840
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51991	NC_015183	ACCGG	2	10	2403755	2403764	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51992	NC_015183	AAG	2	6	2403778	2403783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51993	NC_015183	AAG	2	6	2403916	2403921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293841
51994	NC_015183	CGTCAT	2	12	2403951	2403962	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325293841
51995	NC_015183	TCGG	2	8	2403985	2403992	0 %	25 %	50 %	25 %	325293841
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51997	NC_015183	GCG	2	6	2404198	2404203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293841
51998	NC_015183	CGCCA	2	10	2404362	2404371	20 %	0 %	20 %	60 %	325293841
51999	NC_015183	CAA	2	6	2404416	2404421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293841
52000	NC_015183	CAT	2	6	2404425	2404430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293841

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