MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_015183	CTGG	2	8	2360391	2360398	0 %	25 %	50 %	25 %	325293797
51002	NC_015183	TCC	2	6	2360447	2360452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293797
51003	NC_015183	CGG	2	6	2360469	2360474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293797
51004	NC_015183	GAT	2	6	2360508	2360513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293797
51005	NC_015183	CAT	2	6	2360550	2360555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293797
51006	NC_015183	CCT	2	6	2360556	2360561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293797
51007	NC_015183	GGC	2	6	2360608	2360613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293797
51008	NC_015183	CAA	2	6	2360638	2360643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293797
51009	NC_015183	TTC	2	6	2360644	2360649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293797
51010	NC_015183	CGG	2	6	2360650	2360655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293797
51011	NC_015183	GC	3	6	2360695	2360700	0 %	0 %	50 %	50 %	325293797
51012	NC_015183	TCG	2	6	2360798	2360803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51013	NC_015183	GTC	2	6	2360891	2360896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293798
51014	NC_015183	TTC	2	6	2360942	2360947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293798
51015	NC_015183	GAT	2	6	2361082	2361087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293798
51016	NC_015183	TGG	2	6	2361187	2361192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293798
51017	NC_015183	GACT	2	8	2361194	2361201	25 %	25 %	25 %	25 %	325293798
51018	NC_015183	ACG	2	6	2361233	2361238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293798
51019	NC_015183	TCGG	2	8	2361309	2361316	0 %	25 %	50 %	25 %	325293798
51020	NC_015183	AGC	2	6	2361468	2361473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293798
51021	NC_015183	GC	3	6	2361481	2361486	0 %	0 %	50 %	50 %	325293798
51022	NC_015183	GC	3	6	2361500	2361505	0 %	0 %	50 %	50 %	325293798
51023	NC_015183	CGGCG	2	10	2361508	2361517	0 %	0 %	60 %	40 %	325293798
51024	NC_015183	CTT	2	6	2361518	2361523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293798
51025	NC_015183	AGC	3	9	2361528	2361536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293798
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51041	NC_015183	AAACCC	2	12	2362205	2362216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51042	NC_015183	GTT	2	6	2362232	2362237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51043	NC_015183	G	6	6	2362320	2362325	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51044	NC_015183	GAA	2	6	2362379	2362384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51045	NC_015183	TCA	2	6	2362423	2362428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293799
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51051	NC_015183	GCCT	2	8	2362591	2362598	0 %	25 %	25 %	50 %	325293799
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51054	NC_015183	GCC	2	6	2362683	2362688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293799
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51065	NC_015183	GGCA	2	8	2363318	2363325	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51066	NC_015183	GA	3	6	2363365	2363370	50 %	0 %	50 %	0 %	325293800
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51083	NC_015183	GTA	2	6	2364152	2364157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293801
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51089	NC_015183	A	7	7	2364396	2364402	100 %	0 %	0 %	0 %	325293801
51090	NC_015183	CGG	2	6	2364472	2364477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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51102	NC_015183	CCG	2	6	2365057	2365062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293802
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51106	NC_015183	GATGC	2	10	2365168	2365177	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51107	NC_015183	AGGA	2	8	2365235	2365242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51108	NC_015183	GCCC	2	8	2365319	2365326	0 %	0 %	25 %	75 %	325293803
51109	NC_015183	GCC	2	6	2365350	2365355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293803
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51112	NC_015183	GCG	2	6	2365724	2365729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293803
51113	NC_015183	GAA	2	6	2365770	2365775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293803
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51115	NC_015183	CCG	2	6	2365789	2365794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293803
51116	NC_015183	GCA	2	6	2365802	2365807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293803
51117	NC_015183	CGA	2	6	2365808	2365813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293803
51118	NC_015183	ACTC	2	8	2365912	2365919	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51119	NC_015183	CGAG	2	8	2365947	2365954	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51120	NC_015183	GTC	2	6	2365967	2365972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51121	NC_015183	GAA	2	6	2365990	2365995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51122	NC_015183	GCT	2	6	2366073	2366078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293804
51123	NC_015183	GC	3	6	2366090	2366095	0 %	0 %	50 %	50 %	325293804
51124	NC_015183	TCG	2	6	2366150	2366155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293804
51125	NC_015183	TGG	2	6	2366175	2366180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293804
51126	NC_015183	CGC	2	6	2366196	2366201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293804
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51128	NC_015183	GCT	2	6	2366295	2366300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293804
51129	NC_015183	GC	4	8	2366353	2366360	0 %	0 %	50 %	50 %	325293804
51130	NC_015183	TCGATG	2	12	2366381	2366392	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325293804
51131	NC_015183	GCC	2	6	2366407	2366412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293804
51132	NC_015183	GCA	2	6	2366427	2366432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293804
51133	NC_015183	CGG	2	6	2366481	2366486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293804
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51136	NC_015183	ACCATC	2	12	2366608	2366619	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	325293804
51137	NC_015183	TTG	2	6	2366642	2366647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293804
51138	NC_015183	GCCT	2	8	2366680	2366687	0 %	25 %	25 %	50 %	325293804
51139	NC_015183	CGAG	2	8	2366712	2366719	25 %	0 %	50 %	25 %	325293804
51140	NC_015183	GAC	2	6	2366766	2366771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293804
51141	NC_015183	ATA	2	6	2366836	2366841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325293804
51142	NC_015183	TCT	2	6	2366877	2366882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293804
51143	NC_015183	GTT	2	6	2366920	2366925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293804
51144	NC_015183	GC	3	6	2366929	2366934	0 %	0 %	50 %	50 %	325293804
51145	NC_015183	GTG	2	6	2366956	2366961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293804
51146	NC_015183	GGC	2	6	2367006	2367011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51147	NC_015183	AAG	2	6	2367054	2367059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51148	NC_015183	TGC	2	6	2367060	2367065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51149	NC_015183	TCG	2	6	2367158	2367163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293805
51150	NC_015183	GC	3	6	2367191	2367196	0 %	0 %	50 %	50 %	325293805
51151	NC_015183	TCA	2	6	2367221	2367226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293805
51152	NC_015183	AGGA	2	8	2367230	2367237	50 %	0 %	50 %	0 %	325293805
51153	NC_015183	CGC	2	6	2367241	2367246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293805
51154	NC_015183	CCTCG	2	10	2367247	2367256	0 %	20 %	20 %	60 %	325293805
51155	NC_015183	CGA	2	6	2367270	2367275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293805
51156	NC_015183	CGG	2	6	2367348	2367353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293805
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51180	NC_015183	TGC	2	6	2368289	2368294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51181	NC_015183	GGA	2	6	2368329	2368334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51182	NC_015183	GCG	2	6	2368459	2368464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293806
51183	NC_015183	GCG	2	6	2368471	2368476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293806
51184	NC_015183	GCA	2	6	2368480	2368485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293806
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51192	NC_015183	AAAGC	2	10	2368796	2368805	60 %	0 %	20 %	20 %	325293806
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51202	NC_015183	TTC	2	6	2369410	2369415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293807
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51204	NC_015183	TCG	3	9	2369476	2369484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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51206	NC_015183	TGGC	2	8	2369734	2369741	0 %	25 %	50 %	25 %	325293808
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51209	NC_015183	CAC	2	6	2369788	2369793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293808
51210	NC_015183	CTG	3	9	2369801	2369809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293808
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51213	NC_015183	TG	3	6	2369949	2369954	0 %	50 %	50 %	0 %	325293808
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51217	NC_015183	GCC	2	6	2370014	2370019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293808
51218	NC_015183	CCGG	2	8	2370052	2370059	0 %	0 %	50 %	50 %	325293808
51219	NC_015183	GCA	2	6	2370159	2370164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293809
51220	NC_015183	CGA	2	6	2370195	2370200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293809
51221	NC_015183	CGC	2	6	2370201	2370206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293809
51222	NC_015183	TCGTC	2	10	2370228	2370237	0 %	40 %	20 %	40 %	325293809
51223	NC_015183	GCC	2	6	2370277	2370282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293809
51224	NC_015183	CCG	2	6	2370353	2370358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293809
51225	NC_015183	TGG	2	6	2370398	2370403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293809
51226	NC_015183	AG	3	6	2370438	2370443	50 %	0 %	50 %	0 %	325293809
51227	NC_015183	GCT	3	9	2370507	2370515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293809
51228	NC_015183	CGC	2	6	2370516	2370521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293809
51229	NC_015183	TGT	2	6	2370531	2370536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293809
51230	NC_015183	GCT	2	6	2370543	2370548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293809
51231	NC_015183	CGG	2	6	2370581	2370586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293809
51232	NC_015183	GC	4	8	2370600	2370607	0 %	0 %	50 %	50 %	325293809
51233	NC_015183	GAAAG	2	10	2370652	2370661	60 %	0 %	40 %	0 %	325293809
51234	NC_015183	GCA	2	6	2370681	2370686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293809
51235	NC_015183	GC	3	6	2370697	2370702	0 %	0 %	50 %	50 %	325293809
51236	NC_015183	AAC	2	6	2370719	2370724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293809
51237	NC_015183	CAT	2	6	2370735	2370740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293809
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51239	NC_015183	TCG	2	6	2370866	2370871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293809
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51244	NC_015183	CCG	2	6	2371016	2371021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293810
51245	NC_015183	GCA	2	6	2371091	2371096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293810
51246	NC_015183	GCA	2	6	2371127	2371132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293810
51247	NC_015183	ACG	2	6	2371141	2371146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293810
51248	NC_015183	GCC	2	6	2371174	2371179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293810
51249	NC_015183	GCAG	2	8	2371191	2371198	25 %	0 %	50 %	25 %	325293810
51250	NC_015183	GAC	2	6	2371215	2371220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293810
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51260	NC_015183	CCG	2	6	2371555	2371560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293810
51261	NC_015183	CCGCAA	2	12	2371640	2371651	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325293810
51262	NC_015183	TGC	2	6	2371656	2371661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293810
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51289	NC_015183	TCCA	2	8	2373034	2373041	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51290	NC_015183	CGT	2	6	2373119	2373124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293812
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51308	NC_015183	GGT	2	6	2373989	2373994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51309	NC_015183	CCTC	2	8	2373997	2374004	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51310	NC_015183	TCA	2	6	2374010	2374015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51312	NC_015183	ATC	2	6	2374086	2374091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51315	NC_015183	GCCA	2	8	2374137	2374144	25 %	0 %	25 %	50 %	325293814
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51318	NC_015183	GCA	2	6	2374196	2374201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293814
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51332	NC_015183	CAT	2	6	2374771	2374776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293814
51333	NC_015183	CCGCG	2	10	2374835	2374844	0 %	0 %	40 %	60 %	325293814
51334	NC_015183	GCC	2	6	2374872	2374877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293814
51335	NC_015183	TGCGCC	2	12	2374884	2374895	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325293814
51336	NC_015183	GGC	2	6	2374918	2374923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51337	NC_015183	GCC	2	6	2374931	2374936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51338	NC_015183	TGC	2	6	2375007	2375012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51339	NC_015183	TCG	2	6	2375144	2375149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293815
51340	NC_015183	TCG	2	6	2375189	2375194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293815
51341	NC_015183	GAC	2	6	2375209	2375214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293815
51342	NC_015183	TTC	2	6	2375230	2375235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293815
51343	NC_015183	CGA	2	6	2375267	2375272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293815
51344	NC_015183	GC	3	6	2375423	2375428	0 %	0 %	50 %	50 %	325293815
51345	NC_015183	CGAT	2	8	2375432	2375439	25 %	25 %	25 %	25 %	325293815
51346	NC_015183	TCG	2	6	2375441	2375446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293815
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51465	NC_015183	CGG	3	9	2380000	2380008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293820
51466	NC_015183	CG	3	6	2380021	2380026	0 %	0 %	50 %	50 %	325293820
51467	NC_015183	TGC	2	6	2380041	2380046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293820
51468	NC_015183	GAA	2	6	2380049	2380054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293820
51469	NC_015183	CGG	2	6	2380096	2380101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293820
51470	NC_015183	GCCA	2	8	2380124	2380131	25 %	0 %	25 %	50 %	325293820
51471	NC_015183	TCG	2	6	2380158	2380163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293820
51472	NC_015183	CAA	2	6	2380195	2380200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293820
51473	NC_015183	CGCC	2	8	2380234	2380241	0 %	0 %	25 %	75 %	325293820
51474	NC_015183	TCG	2	6	2380263	2380268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293820
51475	NC_015183	CGC	2	6	2380281	2380286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293820
51476	NC_015183	TCG	2	6	2380305	2380310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293820
51477	NC_015183	A	6	6	2380319	2380324	100 %	0 %	0 %	0 %	325293820
51478	NC_015183	GCG	2	6	2380347	2380352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293820
51479	NC_015183	CGGC	2	8	2380356	2380363	0 %	0 %	50 %	50 %	325293820
51480	NC_015183	CGG	3	9	2380444	2380452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293820
51481	NC_015183	CTG	2	6	2380547	2380552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293820
51482	NC_015183	GAG	2	6	2380565	2380570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293820
51483	NC_015183	CGT	3	9	2380618	2380626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293820
51484	NC_015183	GCT	2	6	2380646	2380651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293820
51485	NC_015183	TGGA	2	8	2380751	2380758	25 %	25 %	50 %	0 %	325293820
51486	NC_015183	CCG	2	6	2380815	2380820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293820
51487	NC_015183	GCC	2	6	2380886	2380891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293821
51488	NC_015183	GCG	2	6	2380900	2380905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293821
51489	NC_015183	TCT	2	6	2380946	2380951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293821
51490	NC_015183	CGGT	2	8	2380991	2380998	0 %	25 %	50 %	25 %	325293821
51491	NC_015183	GTC	2	6	2381122	2381127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293821
51492	NC_015183	GC	4	8	2381206	2381213	0 %	0 %	50 %	50 %	325293821
51493	NC_015183	ATC	2	6	2381278	2381283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293821
51494	NC_015183	GCT	2	6	2381292	2381297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293821
51495	NC_015183	CTGC	2	8	2381308	2381315	0 %	25 %	25 %	50 %	325293821
51496	NC_015183	TGT	2	6	2381333	2381338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293821
51497	NC_015183	CCG	2	6	2381379	2381384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51498	NC_015183	GC	3	6	2381385	2381390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51499	NC_015183	CCGC	2	8	2381413	2381420	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51500	NC_015183	CTG	2	6	2381469	2381474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293822

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