MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_015183	CAGG	2	8	2315806	2315813	25 %	0 %	50 %	25 %	325293750
50002	NC_015183	CGC	2	6	2315866	2315871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293750
50003	NC_015183	A	6	6	2315885	2315890	100 %	0 %	0 %	0 %	325293750
50004	NC_015183	ACG	2	6	2315901	2315906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293750
50005	NC_015183	AAG	2	6	2315918	2315923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293750
50006	NC_015183	GAT	2	6	2315927	2315932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293750
50007	NC_015183	CAG	3	9	2315933	2315941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293750
50008	NC_015183	CCG	2	6	2315946	2315951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293750
50009	NC_015183	GCA	2	6	2316016	2316021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293751
50010	NC_015183	GC	3	6	2316057	2316062	0 %	0 %	50 %	50 %	325293751
50011	NC_015183	ATC	2	6	2316114	2316119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293751
50012	NC_015183	GCC	2	6	2316134	2316139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293751
50013	NC_015183	TTC	2	6	2316147	2316152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293751
50014	NC_015183	CTT	2	6	2316164	2316169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293751
50015	NC_015183	CTGA	2	8	2316212	2316219	25 %	25 %	25 %	25 %	325293751
50016	NC_015183	GGC	2	6	2316257	2316262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293751
50017	NC_015183	GCG	2	6	2316289	2316294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293751
50018	NC_015183	CCG	2	6	2316342	2316347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293751
50019	NC_015183	GAA	2	6	2316374	2316379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293751
50020	NC_015183	CGG	2	6	2316489	2316494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293751
50021	NC_015183	CTTC	2	8	2316523	2316530	0 %	50 %	0 %	50 %	325293751
50022	NC_015183	GGC	2	6	2316532	2316537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293751
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50027	NC_015183	TGG	2	6	2316799	2316804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293751
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50050	NC_015183	GAC	2	6	2317469	2317474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293751
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50053	NC_015183	TCTCGA	2	12	2317594	2317605	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325293751
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50057	NC_015183	TGA	2	6	2317819	2317824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293752
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50061	NC_015183	CTG	2	6	2318130	2318135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293752
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50083	NC_015183	CCGG	2	8	2319335	2319342	0 %	0 %	50 %	50 %	325293755
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50095	NC_015183	CACGC	2	10	2319942	2319951	20 %	0 %	20 %	60 %	325293757
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50100	NC_015183	TCG	2	6	2320025	2320030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293757
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50115	NC_015183	CCG	2	6	2320760	2320765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293758
50116	NC_015183	CCG	2	6	2320772	2320777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293758
50117	NC_015183	GAG	2	6	2320778	2320783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293758
50118	NC_015183	TGA	2	6	2320785	2320790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293758
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50120	NC_015183	TGC	2	6	2320922	2320927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293758
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50135	NC_015183	CGC	2	6	2321627	2321632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293759
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50144	NC_015183	GCGGA	2	10	2322097	2322106	20 %	0 %	60 %	20 %	325293759
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50146	NC_015183	CG	3	6	2322191	2322196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50147	NC_015183	GCA	2	6	2322255	2322260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50148	NC_015183	GCGT	2	8	2322378	2322385	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50149	NC_015183	ATG	2	6	2322481	2322486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293760
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50168	NC_015183	CTGCC	2	10	2323141	2323150	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
50169	NC_015183	C	6	6	2323246	2323251	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50170	NC_015183	GGCAG	2	10	2323269	2323278	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50171	NC_015183	G	6	6	2323280	2323285	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50172	NC_015183	ATCG	2	8	2323354	2323361	25 %	25 %	25 %	25 %	325293761
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50205	NC_015183	GCACG	2	10	2324626	2324635	20 %	0 %	40 %	40 %	325293762
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50215	NC_015183	GCA	2	6	2324929	2324934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293762
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50218	NC_015183	GGC	2	6	2325014	2325019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293762
50219	NC_015183	CGAG	2	8	2325025	2325032	25 %	0 %	50 %	25 %	325293762
50220	NC_015183	AGCGCC	2	12	2325063	2325074	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325293762
50221	NC_015183	AGC	2	6	2325075	2325080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293762
50222	NC_015183	ATG	2	6	2325111	2325116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293762
50223	NC_015183	CAG	2	6	2325152	2325157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293762
50224	NC_015183	GAT	2	6	2325191	2325196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293762
50225	NC_015183	CGATGG	2	12	2325199	2325210	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325293762
50226	NC_015183	GC	4	8	2325226	2325233	0 %	0 %	50 %	50 %	325293762
50227	NC_015183	AGG	2	6	2325234	2325239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293762
50228	NC_015183	CCCTT	2	10	2325264	2325273	0 %	40 %	0 %	60 %	325293763
50229	NC_015183	GAT	2	6	2325313	2325318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293763
50230	NC_015183	TTG	2	6	2325374	2325379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293763
50231	NC_015183	CCG	2	6	2325431	2325436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293763
50232	NC_015183	ACC	3	9	2325440	2325448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293763
50233	NC_015183	GAT	2	6	2325460	2325465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293763
50234	NC_015183	GCG	2	6	2325601	2325606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293763
50235	NC_015183	GC	3	6	2325620	2325625	0 %	0 %	50 %	50 %	325293763
50236	NC_015183	CAG	2	6	2325661	2325666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293763
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50242	NC_015183	GGC	2	6	2325925	2325930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293763
50243	NC_015183	ATC	2	6	2326019	2326024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293763
50244	NC_015183	TGA	2	6	2326047	2326052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293763
50245	NC_015183	GGC	2	6	2326087	2326092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293763
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50247	NC_015183	CGC	2	6	2326225	2326230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293763
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50254	NC_015183	CGG	3	9	2326437	2326445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293763
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50258	NC_015183	TTG	3	9	2326517	2326525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293763
50259	NC_015183	CCG	2	6	2326542	2326547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293763
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50262	NC_015183	GCA	2	6	2326709	2326714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293763
50263	NC_015183	GCG	2	6	2326805	2326810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293763
50264	NC_015183	GATCG	2	10	2326850	2326859	20 %	20 %	40 %	20 %	325293763
50265	NC_015183	GCG	2	6	2326879	2326884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50266	NC_015183	C	6	6	2326918	2326923	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50267	NC_015183	AGG	2	6	2326951	2326956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50268	NC_015183	GGCAG	2	10	2327055	2327064	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50269	NC_015183	G	6	6	2327066	2327071	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50270	NC_015183	GCC	2	6	2327149	2327154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293764
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50300	NC_015183	CTT	2	6	2328235	2328240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293764
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50302	NC_015183	CGT	2	6	2328280	2328285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293764
50303	NC_015183	GCA	2	6	2328318	2328323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293764
50304	NC_015183	ATCGT	2	10	2328335	2328344	20 %	40 %	20 %	20 %	325293764
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50310	NC_015183	GCT	2	6	2328483	2328488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50311	NC_015183	CTT	2	6	2328627	2328632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50312	NC_015183	AGAC	2	8	2328682	2328689	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50313	NC_015183	TCA	2	6	2328705	2328710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50314	NC_015183	GAA	2	6	2328744	2328749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50315	NC_015183	GTC	2	6	2328785	2328790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293765
50316	NC_015183	TCG	2	6	2328798	2328803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293765
50317	NC_015183	TGA	2	6	2328816	2328821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293765
50318	NC_015183	CG	3	6	2328905	2328910	0 %	0 %	50 %	50 %	325293765
50319	NC_015183	CCG	2	6	2328912	2328917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293765
50320	NC_015183	TTTG	2	8	2328982	2328989	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50321	NC_015183	A	9	9	2329049	2329057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50322	NC_015183	CGT	2	6	2329145	2329150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50323	NC_015183	GCA	2	6	2329257	2329262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50324	NC_015183	GAA	2	6	2329321	2329326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50325	NC_015183	GCAT	2	8	2329356	2329363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50326	NC_015183	AGC	2	6	2329564	2329569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293766
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50328	NC_015183	ATG	2	6	2329701	2329706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293766
50329	NC_015183	GCAT	2	8	2329724	2329731	25 %	25 %	25 %	25 %	325293766
50330	NC_015183	CG	3	6	2329740	2329745	0 %	0 %	50 %	50 %	325293766
50331	NC_015183	CGA	3	9	2329754	2329762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293766
50332	NC_015183	TCT	2	6	2329795	2329800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293766
50333	NC_015183	GCC	2	6	2329810	2329815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293766
50334	NC_015183	GAA	2	6	2329914	2329919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293766
50335	NC_015183	GC	3	6	2330021	2330026	0 %	0 %	50 %	50 %	325293766
50336	NC_015183	CTG	3	9	2330055	2330063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293766
50337	NC_015183	GCAT	2	8	2330140	2330147	25 %	25 %	25 %	25 %	325293766
50338	NC_015183	CCA	2	6	2330158	2330163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293766
50339	NC_015183	GGC	2	6	2330181	2330186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293766
50340	NC_015183	ACC	2	6	2330263	2330268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293766
50341	NC_015183	CAA	2	6	2330366	2330371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293766
50342	NC_015183	CGT	2	6	2330397	2330402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293766
50343	NC_015183	CGT	2	6	2330438	2330443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293766
50344	NC_015183	GCT	2	6	2330481	2330486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293766
50345	NC_015183	CCGGA	2	10	2330553	2330562	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50346	NC_015183	AAG	2	6	2330697	2330702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50347	NC_015183	A	6	6	2330722	2330727	100 %	0 %	0 %	0 %	325293767
50348	NC_015183	TC	4	8	2330729	2330736	0 %	50 %	0 %	50 %	325293767
50349	NC_015183	CAT	2	6	2330751	2330756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293767
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