MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 150496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_015138	GGA	2	6	1046482	1046487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315753
29003	NC_015138	GTG	2	6	1046549	1046554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315753
29004	NC_015138	CGG	2	6	1046557	1046562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315753
29005	NC_015138	GC	3	6	1046581	1046586	0 %	0 %	50 %	50 %	326315753
29006	NC_015138	AGC	2	6	1046590	1046595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315753
29007	NC_015138	GAT	2	6	1046633	1046638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315753
29008	NC_015138	ATG	2	6	1046651	1046656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315753
29009	NC_015138	GGCT	2	8	1046795	1046802	0 %	25 %	50 %	25 %	326315753
29010	NC_015138	CGG	2	6	1046808	1046813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315753
29011	NC_015138	TCG	2	6	1046832	1046837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315753
29012	NC_015138	AGC	2	6	1046961	1046966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29013	NC_015138	GCG	2	6	1047036	1047041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315754
29014	NC_015138	CGG	2	6	1047045	1047050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315754
29015	NC_015138	CCA	2	6	1047059	1047064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315754
29016	NC_015138	CAG	2	6	1047161	1047166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315754
29017	NC_015138	CAT	2	6	1047178	1047183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315754
29018	NC_015138	CGGCT	2	10	1047223	1047232	0 %	20 %	40 %	40 %	326315754
29019	NC_015138	GTA	2	6	1047233	1047238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315754
29020	NC_015138	CCA	2	6	1047281	1047286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315754
29021	NC_015138	TGGC	2	8	1047378	1047385	0 %	25 %	50 %	25 %	326315754
29022	NC_015138	GGCCAG	2	12	1047416	1047427	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	326315754
29023	NC_015138	GCA	2	6	1047478	1047483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315754
29024	NC_015138	GCCT	2	8	1047735	1047742	0 %	25 %	25 %	50 %	326315754
29025	NC_015138	TCC	2	6	1047802	1047807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315754
29026	NC_015138	GTGC	2	8	1047997	1048004	0 %	25 %	50 %	25 %	326315754
29027	NC_015138	TGCG	2	8	1048006	1048013	0 %	25 %	50 %	25 %	326315754
29028	NC_015138	CCCGG	2	10	1048045	1048054	0 %	0 %	40 %	60 %	326315754
29029	NC_015138	GCC	2	6	1048065	1048070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315754
29030	NC_015138	TCGCCG	2	12	1048101	1048112	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	326315754
29031	NC_015138	GTA	2	6	1048175	1048180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315754
29032	NC_015138	GCT	2	6	1048245	1048250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315754
29033	NC_015138	GAT	2	6	1048349	1048354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315754
29034	NC_015138	CAG	2	6	1048370	1048375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315754
29035	NC_015138	GCG	2	6	1048475	1048480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315754
29036	NC_015138	GTT	2	6	1048514	1048519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326315754
29037	NC_015138	GCA	2	6	1048534	1048539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315754
29038	NC_015138	CG	3	6	1048577	1048582	0 %	0 %	50 %	50 %	326315754
29039	NC_015138	CCAG	2	8	1048636	1048643	25 %	0 %	25 %	50 %	326315754
29040	NC_015138	TCG	2	6	1048650	1048655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315754
29041	NC_015138	GCG	2	6	1048710	1048715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315754
29042	NC_015138	CGTG	2	8	1048806	1048813	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29043	NC_015138	GGC	3	9	1048832	1048840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315755
29044	NC_015138	AGC	2	6	1048841	1048846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315755
29045	NC_015138	GGCG	2	8	1048933	1048940	0 %	0 %	75 %	25 %	326315755
29046	NC_015138	GC	4	8	1048986	1048993	0 %	0 %	50 %	50 %	326315755
29047	NC_015138	GCCCAG	2	12	1049054	1049065	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	326315755
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29049	NC_015138	CG	3	6	1049156	1049161	0 %	0 %	50 %	50 %	326315755
29050	NC_015138	CGG	2	6	1049197	1049202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315755
29051	NC_015138	CGC	2	6	1049287	1049292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315755
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29053	NC_015138	TCG	2	6	1049337	1049342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315755
29054	NC_015138	CTT	2	6	1049366	1049371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315755
29055	NC_015138	CTG	3	9	1049372	1049380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315755
29056	NC_015138	GGCG	2	8	1049531	1049538	0 %	0 %	75 %	25 %	326315755
29057	NC_015138	GTC	2	6	1049582	1049587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315755
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29061	NC_015138	AGC	2	6	1049784	1049789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315755
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29070	NC_015138	GAG	2	6	1050107	1050112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315755
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29082	NC_015138	GTC	2	6	1050719	1050724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315755
29083	NC_015138	CAG	2	6	1050728	1050733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315755
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29086	NC_015138	TGG	2	6	1050817	1050822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315755
29087	NC_015138	GGGC	2	8	1050850	1050857	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29088	NC_015138	CGG	2	6	1050946	1050951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29089	NC_015138	G	7	7	1050964	1050970	0 %	0 %	100 %	0 %	326315756
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29102	NC_015138	CGT	2	6	1051394	1051399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315756
29103	NC_015138	CCG	2	6	1051407	1051412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315756
29104	NC_015138	TAG	2	6	1051438	1051443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315756
29105	NC_015138	GCCG	2	8	1051464	1051471	0 %	0 %	50 %	50 %	326315756
29106	NC_015138	TCCGCC	2	12	1051528	1051539	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	326315756
29107	NC_015138	GC	3	6	1051563	1051568	0 %	0 %	50 %	50 %	326315756
29108	NC_015138	CGGA	2	8	1051571	1051578	25 %	0 %	50 %	25 %	326315756
29109	NC_015138	TGG	2	6	1051583	1051588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315756
29110	NC_015138	CGG	2	6	1051617	1051622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315756
29111	NC_015138	TGGT	2	8	1051745	1051752	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29112	NC_015138	CGG	2	6	1051769	1051774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29113	NC_015138	CCA	2	6	1051787	1051792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29114	NC_015138	CGAG	2	8	1051793	1051800	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29115	NC_015138	GC	3	6	1051846	1051851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29116	NC_015138	CGC	3	9	1051849	1051857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29117	NC_015138	CG	3	6	1051901	1051906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29118	NC_015138	CTGC	2	8	1051907	1051914	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29119	NC_015138	GC	4	8	1051913	1051920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29120	NC_015138	GATCCC	2	12	1051944	1051955	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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29124	NC_015138	CGC	2	6	1052076	1052081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315757
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29227	NC_015138	CG	3	6	1055795	1055800	0 %	0 %	50 %	50 %	326315759
29228	NC_015138	GGC	2	6	1055817	1055822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315759
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29230	NC_015138	GAT	2	6	1055849	1055854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315759
29231	NC_015138	GCT	2	6	1055918	1055923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315759
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29233	NC_015138	ACT	2	6	1055953	1055958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315759
29234	NC_015138	GCG	2	6	1055966	1055971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315759
29235	NC_015138	GGC	2	6	1056050	1056055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315759
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29244	NC_015138	GTG	2	6	1056332	1056337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315760
29245	NC_015138	GAG	2	6	1056350	1056355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315760
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29261	NC_015138	GC	4	8	1056823	1056830	0 %	0 %	50 %	50 %	326315760
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29287	NC_015138	GAG	2	6	1057768	1057773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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29342	NC_015138	TGG	2	6	1059827	1059832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315762
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29348	NC_015138	AGGC	2	8	1060109	1060116	25 %	0 %	50 %	25 %	326315762
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29350	NC_015138	GC	3	6	1060175	1060180	0 %	0 %	50 %	50 %	326315762
29351	NC_015138	CGG	2	6	1060185	1060190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315762
29352	NC_015138	GAC	2	6	1060203	1060208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315762
29353	NC_015138	GCC	2	6	1060256	1060261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315762
29354	NC_015138	CGAC	2	8	1060274	1060281	25 %	0 %	25 %	50 %	326315762
29355	NC_015138	GGA	2	6	1060344	1060349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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29371	NC_015138	GCCT	2	8	1060918	1060925	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29372	NC_015138	GCC	2	6	1060998	1061003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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29433	NC_015138	CGG	2	6	1062993	1062998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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29463	NC_015138	ACC	3	9	1063837	1063845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315766
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29465	NC_015138	CTG	2	6	1063893	1063898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315766
29466	NC_015138	GGC	2	6	1063939	1063944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315766
29467	NC_015138	GCC	2	6	1063950	1063955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315766
29468	NC_015138	TCC	2	6	1063978	1063983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315766
29469	NC_015138	CGCC	2	8	1064033	1064040	0 %	0 %	25 %	75 %	326315766
29470	NC_015138	CGAA	2	8	1064054	1064061	50 %	0 %	25 %	25 %	326315766
29471	NC_015138	GCC	2	6	1064088	1064093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315766
29472	NC_015138	ACC	2	6	1064110	1064115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315766
29473	NC_015138	CG	3	6	1064131	1064136	0 %	0 %	50 %	50 %	326315766
29474	NC_015138	GGCTGG	2	12	1064180	1064191	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	326315766
29475	NC_015138	CAC	2	6	1064202	1064207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315766
29476	NC_015138	TGG	2	6	1064246	1064251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315766
29477	NC_015138	CGT	2	6	1064267	1064272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315766
29478	NC_015138	CG	3	6	1064329	1064334	0 %	0 %	50 %	50 %	326315766
29479	NC_015138	GGC	2	6	1064357	1064362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315766
29480	NC_015138	TGT	2	6	1064375	1064380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326315766
29481	NC_015138	GCA	2	6	1064387	1064392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315766
29482	NC_015138	GCA	2	6	1064429	1064434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315766
29483	NC_015138	CAG	2	6	1064436	1064441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315766
29484	NC_015138	TGT	2	6	1064444	1064449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326315766
29485	NC_015138	CAC	2	6	1064490	1064495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315766
29486	NC_015138	TGGCG	2	10	1064508	1064517	0 %	20 %	60 %	20 %	326315766
29487	NC_015138	GTA	2	6	1064595	1064600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315766
29488	NC_015138	ACC	2	6	1064626	1064631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315766
29489	NC_015138	GCCT	2	8	1064640	1064647	0 %	25 %	25 %	50 %	326315766
29490	NC_015138	GCC	2	6	1064650	1064655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315766
29491	NC_015138	GTT	2	6	1064757	1064762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29492	NC_015138	CG	3	6	1064798	1064803	0 %	0 %	50 %	50 %	326315767
29493	NC_015138	AGGT	2	8	1064833	1064840	25 %	25 %	50 %	0 %	326315767
29494	NC_015138	TCG	2	6	1064845	1064850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315767
29495	NC_015138	ACGA	2	8	1064904	1064911	50 %	0 %	25 %	25 %	326315767
29496	NC_015138	TGCCGA	2	12	1064963	1064974	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	326315767
29497	NC_015138	GC	3	6	1065019	1065024	0 %	0 %	50 %	50 %	326315767
29498	NC_015138	CGC	2	6	1065230	1065235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315767
29499	NC_015138	TCC	2	6	1065253	1065258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315767
29500	NC_015138	GCC	2	6	1065262	1065267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315767

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