MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 150496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_015138	GCC	2	6	1025515	1025520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28503	NC_015138	TGC	2	6	1025539	1025544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28504	NC_015138	GCG	2	6	1025572	1025577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28505	NC_015138	GCCA	2	8	1025637	1025644	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28506	NC_015138	GAA	2	6	1025658	1025663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28507	NC_015138	CTG	2	6	1025704	1025709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315737
28508	NC_015138	GTC	3	9	1025785	1025793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315737
28509	NC_015138	GCT	2	6	1025808	1025813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315737
28510	NC_015138	TGG	3	9	1025849	1025857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315737
28511	NC_015138	CTG	2	6	1025905	1025910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315737
28512	NC_015138	CTG	2	6	1025986	1025991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315737
28513	NC_015138	TTC	2	6	1026033	1026038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315737
28514	NC_015138	ATGA	2	8	1026044	1026051	50 %	25 %	25 %	0 %	326315737
28515	NC_015138	TG	3	6	1026072	1026077	0 %	50 %	50 %	0 %	326315738
28516	NC_015138	GC	3	6	1026149	1026154	0 %	0 %	50 %	50 %	326315738
28517	NC_015138	GTG	2	6	1026227	1026232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315738
28518	NC_015138	GCC	2	6	1026257	1026262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315738
28519	NC_015138	CGGCCC	2	12	1026327	1026338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315738
28520	NC_015138	CGG	2	6	1026370	1026375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315738
28521	NC_015138	GCC	2	6	1026437	1026442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315738
28522	NC_015138	GTG	2	6	1026537	1026542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315738
28523	NC_015138	GC	3	6	1026661	1026666	0 %	0 %	50 %	50 %	326315738
28524	NC_015138	GTG	2	6	1026866	1026871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315738
28525	NC_015138	CG	3	6	1026930	1026935	0 %	0 %	50 %	50 %	326315738
28526	NC_015138	GCG	2	6	1026984	1026989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315738
28527	NC_015138	GCT	2	6	1026991	1026996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315738
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28529	NC_015138	TGG	2	6	1027014	1027019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315738
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28531	NC_015138	TGG	2	6	1027071	1027076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315738
28532	NC_015138	GCG	2	6	1027084	1027089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315738
28533	NC_015138	TCG	2	6	1027110	1027115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315738
28534	NC_015138	GCT	2	6	1027117	1027122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315738
28535	NC_015138	ACG	2	6	1027185	1027190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315738
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28537	NC_015138	AGCCTG	2	12	1027247	1027258	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	326315738
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28539	NC_015138	CG	3	6	1027274	1027279	0 %	0 %	50 %	50 %	326315738
28540	NC_015138	GTG	3	9	1027289	1027297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315738
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28542	NC_015138	TCGCC	2	10	1027384	1027393	0 %	20 %	20 %	60 %	326315738
28543	NC_015138	ATC	2	6	1027418	1027423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315738
28544	NC_015138	GAC	2	6	1027454	1027459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315738
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28546	NC_015138	CGG	2	6	1027509	1027514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28547	NC_015138	ATG	2	6	1027578	1027583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315739
28548	NC_015138	A	7	7	1027584	1027590	100 %	0 %	0 %	0 %	326315739
28549	NC_015138	GTG	2	6	1027599	1027604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315739
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28551	NC_015138	ACG	2	6	1027705	1027710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315739
28552	NC_015138	ACA	2	6	1027762	1027767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315739
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28559	NC_015138	GCT	2	6	1027970	1027975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315739
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28564	NC_015138	TGA	2	6	1028218	1028223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315739
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28573	NC_015138	ACCGGT	3	18	1028580	1028597	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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28577	NC_015138	TCT	2	6	1028777	1028782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315740
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28587	NC_015138	GGCT	2	8	1029217	1029224	0 %	25 %	50 %	25 %	326315740
28588	NC_015138	CTG	2	6	1029241	1029246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315740
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28598	NC_015138	CTGCG	2	10	1029626	1029635	0 %	20 %	40 %	40 %	326315740
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28607	NC_015138	GCCC	2	8	1030048	1030055	0 %	0 %	25 %	75 %	326315740
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28611	NC_015138	AT	3	6	1030267	1030272	50 %	50 %	0 %	0 %	326315740
28612	NC_015138	GCT	2	6	1030297	1030302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315740
28613	NC_015138	GCC	2	6	1030319	1030324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28614	NC_015138	TGAC	2	8	1030354	1030361	25 %	25 %	25 %	25 %	326315741
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28616	NC_015138	CCA	2	6	1030402	1030407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315741
28617	NC_015138	GACG	2	8	1030493	1030500	25 %	0 %	50 %	25 %	326315741
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28623	NC_015138	CTG	2	6	1031007	1031012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315741
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28720	NC_015138	GCT	2	6	1034895	1034900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315745
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28723	NC_015138	CGC	2	6	1035009	1035014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315745
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28729	NC_015138	GCGGCC	2	12	1035199	1035210	0 %	0 %	50 %	50 %	326315745
28730	NC_015138	GTG	3	9	1035247	1035255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315745
28731	NC_015138	GCT	2	6	1035258	1035263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315745
28732	NC_015138	GAA	2	6	1035291	1035296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315745
28733	NC_015138	CTG	2	6	1035310	1035315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315745
28734	NC_015138	TCT	2	6	1035362	1035367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315745
28735	NC_015138	TGC	2	6	1035395	1035400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315745
28736	NC_015138	GCT	2	6	1035513	1035518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315745
28737	NC_015138	CCG	2	6	1035539	1035544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315745
28738	NC_015138	TG	3	6	1035597	1035602	0 %	50 %	50 %	0 %	326315745
28739	NC_015138	GGC	2	6	1035639	1035644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315745
28740	NC_015138	GGC	2	6	1035657	1035662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315745
28741	NC_015138	GTC	2	6	1035734	1035739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315746
28742	NC_015138	GCG	2	6	1035790	1035795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315746
28743	NC_015138	GAG	2	6	1035857	1035862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315746
28744	NC_015138	GTC	2	6	1035901	1035906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315746
28745	NC_015138	ATCC	2	8	1035916	1035923	25 %	25 %	0 %	50 %	326315746
28746	NC_015138	GCA	2	6	1035925	1035930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315746
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28748	NC_015138	TGC	2	6	1035954	1035959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315746
28749	NC_015138	TGA	2	6	1035969	1035974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315746
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28751	NC_015138	GC	3	6	1036025	1036030	0 %	0 %	50 %	50 %	326315746
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28753	NC_015138	TGC	2	6	1036104	1036109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315746
28754	NC_015138	TGC	2	6	1036173	1036178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315746
28755	NC_015138	CCT	2	6	1036227	1036232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315746
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28758	NC_015138	AGGG	2	8	1036331	1036338	25 %	0 %	75 %	0 %	326315746
28759	NC_015138	GAT	2	6	1036423	1036428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315746
28760	NC_015138	GATG	2	8	1036455	1036462	25 %	25 %	50 %	0 %	326315746
28761	NC_015138	GCGCC	2	10	1036471	1036480	0 %	0 %	40 %	60 %	326315746
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28764	NC_015138	CCTC	2	8	1036629	1036636	0 %	25 %	0 %	75 %	326315747
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28766	NC_015138	CA	3	6	1036676	1036681	50 %	0 %	0 %	50 %	326315747
28767	NC_015138	CCCGA	2	10	1036682	1036691	20 %	0 %	20 %	60 %	326315747
28768	NC_015138	TCGCTG	2	12	1036724	1036735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315747
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28772	NC_015138	CGG	2	6	1036995	1037000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315747
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28774	NC_015138	AGC	2	6	1037163	1037168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315747
28775	NC_015138	TGC	2	6	1037241	1037246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315747
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28778	NC_015138	GCT	2	6	1037446	1037451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315747
28779	NC_015138	GCTGG	2	10	1037479	1037488	0 %	20 %	60 %	20 %	326315747
28780	NC_015138	TTCG	2	8	1037500	1037507	0 %	50 %	25 %	25 %	326315747
28781	NC_015138	GCG	2	6	1037589	1037594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315747
28782	NC_015138	AGC	2	6	1037606	1037611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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28784	NC_015138	TGG	2	6	1037659	1037664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315748
28785	NC_015138	CTG	2	6	1037736	1037741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315748
28786	NC_015138	TCG	2	6	1037764	1037769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315748
28787	NC_015138	CGT	2	6	1037789	1037794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315748
28788	NC_015138	CTG	2	6	1037853	1037858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315748
28789	NC_015138	GCT	2	6	1037918	1037923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315748
28790	NC_015138	CCA	2	6	1038007	1038012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315748
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28792	NC_015138	CGG	2	6	1038077	1038082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315748
28793	NC_015138	GCC	2	6	1038121	1038126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315748
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28798	NC_015138	TGG	2	6	1038280	1038285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315748
28799	NC_015138	CCG	2	6	1038293	1038298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315748
28800	NC_015138	GCCT	2	8	1038307	1038314	0 %	25 %	25 %	50 %	326315748
28801	NC_015138	TGA	2	6	1038319	1038324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315748
28802	NC_015138	GGT	2	6	1038380	1038385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315748
28803	NC_015138	GCGG	2	8	1038393	1038400	0 %	0 %	75 %	25 %	326315748
28804	NC_015138	TCG	2	6	1038445	1038450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315748
28805	NC_015138	ACT	2	6	1038523	1038528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315748
28806	NC_015138	CAG	2	6	1038606	1038611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315749
28807	NC_015138	GAC	2	6	1038644	1038649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315749
28808	NC_015138	GGC	2	6	1038712	1038717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315749
28809	NC_015138	TGG	2	6	1038798	1038803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315749
28810	NC_015138	GCG	2	6	1038829	1038834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315749
28811	NC_015138	CGA	2	6	1038847	1038852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315749
28812	NC_015138	GCCG	2	8	1038862	1038869	0 %	0 %	50 %	50 %	326315749
28813	NC_015138	CTA	2	6	1038886	1038891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315749
28814	NC_015138	GGCTCA	2	12	1038909	1038920	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	326315749
28815	NC_015138	AGC	2	6	1038963	1038968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315749
28816	NC_015138	GCC	2	6	1038974	1038979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315749
28817	NC_015138	CAGG	2	8	1039127	1039134	25 %	0 %	50 %	25 %	326315749
28818	NC_015138	GTTC	2	8	1039161	1039168	0 %	50 %	25 %	25 %	326315749
28819	NC_015138	CCA	2	6	1039174	1039179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315749
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28821	NC_015138	TGG	2	6	1039203	1039208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315749
28822	NC_015138	GACG	2	8	1039210	1039217	25 %	0 %	50 %	25 %	326315749
28823	NC_015138	CAC	2	6	1039229	1039234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315749
28824	NC_015138	GCG	2	6	1039296	1039301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315749
28825	NC_015138	TTTCG	2	10	1039331	1039340	0 %	60 %	20 %	20 %	326315749
28826	NC_015138	TGC	2	6	1039341	1039346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315749
28827	NC_015138	GTG	2	6	1039377	1039382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315749
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28829	NC_015138	CG	3	6	1039441	1039446	0 %	0 %	50 %	50 %	326315749
28830	NC_015138	GGA	2	6	1039465	1039470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315749
28831	NC_015138	CAG	2	6	1039507	1039512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315749
28832	NC_015138	TGG	2	6	1039569	1039574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315749
28833	NC_015138	GCC	2	6	1039602	1039607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315749
28834	NC_015138	TCG	2	6	1039611	1039616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315749
28835	NC_015138	CGGC	2	8	1039669	1039676	0 %	0 %	50 %	50 %	326315749
28836	NC_015138	ACC	2	6	1039722	1039727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315749
28837	NC_015138	GCT	2	6	1039753	1039758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315749
28838	NC_015138	CGG	2	6	1039822	1039827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315750
28839	NC_015138	CTC	2	6	1039837	1039842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315750
28840	NC_015138	GGC	2	6	1039851	1039856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315750
28841	NC_015138	GCT	2	6	1039875	1039880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315750
28842	NC_015138	AGG	2	6	1039955	1039960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315750
28843	NC_015138	GCG	2	6	1039961	1039966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315750
28844	NC_015138	TTC	2	6	1039978	1039983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315750
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28846	NC_015138	CTGG	2	8	1040085	1040092	0 %	25 %	50 %	25 %	326315750
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