MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 150496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_015138	GCC	2	6	687369	687374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315456
19002	NC_015138	GCT	2	6	687375	687380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315456
19003	NC_015138	CGG	2	6	687399	687404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315456
19004	NC_015138	CCTG	2	8	687589	687596	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19005	NC_015138	ACA	2	6	687699	687704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19006	NC_015138	ATGC	2	8	687707	687714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19007	NC_015138	TTCCC	2	10	687733	687742	0 %	40 %	0 %	60 %	326315457
19008	NC_015138	CCCGG	2	10	687756	687765	0 %	0 %	40 %	60 %	326315457
19009	NC_015138	GCC	2	6	687768	687773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315457
19010	NC_015138	CGC	2	6	687794	687799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315457
19011	NC_015138	TGC	2	6	687823	687828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315457
19012	NC_015138	GCT	2	6	687863	687868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315457
19013	NC_015138	GC	3	6	687878	687883	0 %	0 %	50 %	50 %	326315457
19014	NC_015138	CG	4	8	687926	687933	0 %	0 %	50 %	50 %	326315457
19015	NC_015138	TGC	2	6	687937	687942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315457
19016	NC_015138	CGC	2	6	687956	687961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315457
19017	NC_015138	CAC	2	6	687969	687974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315457
19018	NC_015138	CCG	2	6	687999	688004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315457
19019	NC_015138	CTG	2	6	688005	688010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315457
19020	NC_015138	GGT	2	6	688028	688033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315457
19021	NC_015138	GCC	2	6	688065	688070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315457
19022	NC_015138	GCT	2	6	688076	688081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315457
19023	NC_015138	GC	3	6	688092	688097	0 %	0 %	50 %	50 %	326315457
19024	NC_015138	GCC	2	6	688107	688112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315457
19025	NC_015138	GAG	2	6	688209	688214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315457
19026	NC_015138	CGG	2	6	688228	688233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315457
19027	NC_015138	GCT	2	6	688241	688246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315457
19028	NC_015138	AGG	2	6	688249	688254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315457
19029	NC_015138	CGG	3	9	688287	688295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315457
19030	NC_015138	GGC	2	6	688296	688301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315457
19031	NC_015138	CAAGC	2	10	688316	688325	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19032	NC_015138	A	8	8	688355	688362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19033	NC_015138	CTA	2	6	688455	688460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19034	NC_015138	GGGA	2	8	688500	688507	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19035	NC_015138	CGT	2	6	688591	688596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19036	NC_015138	TAC	2	6	688612	688617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19037	NC_015138	CCAG	2	8	688641	688648	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19038	NC_015138	TGCAG	2	10	688783	688792	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19039	NC_015138	TTG	2	6	688793	688798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19040	NC_015138	CGG	2	6	688815	688820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19041	NC_015138	CG	3	6	688901	688906	0 %	0 %	50 %	50 %	326315458
19042	NC_015138	GCAG	2	8	688958	688965	25 %	0 %	50 %	25 %	326315458
19043	NC_015138	CTG	2	6	688991	688996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315458
19044	NC_015138	AGC	2	6	689016	689021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315458
19045	NC_015138	CGG	2	6	689027	689032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315458
19046	NC_015138	CGG	2	6	689070	689075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315458
19047	NC_015138	GC	3	6	689078	689083	0 %	0 %	50 %	50 %	326315458
19048	NC_015138	CCG	2	6	689091	689096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315458
19049	NC_015138	AGA	2	6	689121	689126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315458
19050	NC_015138	GGA	2	6	689152	689157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315458
19051	NC_015138	CCGG	2	8	689243	689250	0 %	0 %	50 %	50 %	326315458
19052	NC_015138	ACG	2	6	689282	689287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315458
19053	NC_015138	CCGG	2	8	689311	689318	0 %	0 %	50 %	50 %	326315458
19054	NC_015138	CGGCG	2	10	689356	689365	0 %	0 %	60 %	40 %	326315458
19055	NC_015138	CGC	2	6	689370	689375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315458
19056	NC_015138	GGCG	2	8	689377	689384	0 %	0 %	75 %	25 %	326315458
19057	NC_015138	CGC	2	6	689392	689397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315458
19058	NC_015138	GCC	2	6	689470	689475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315458
19059	NC_015138	CGCCAT	2	12	689476	689487	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	326315458
19060	NC_015138	GC	3	6	689547	689552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19061	NC_015138	AGG	2	6	689572	689577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19062	NC_015138	CCAG	2	8	689605	689612	25 %	0 %	25 %	50 %	326315459
19063	NC_015138	CGC	2	6	689633	689638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315459
19064	NC_015138	GC	3	6	689679	689684	0 %	0 %	50 %	50 %	326315459
19065	NC_015138	GCTG	2	8	689686	689693	0 %	25 %	50 %	25 %	326315459
19066	NC_015138	TGC	2	6	689704	689709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315459
19067	NC_015138	GCC	2	6	689726	689731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315459
19068	NC_015138	TTC	2	6	689739	689744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315459
19069	NC_015138	GGC	2	6	689783	689788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315459
19070	NC_015138	GCC	3	9	689826	689834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315459
19071	NC_015138	G	6	6	689855	689860	0 %	0 %	100 %	0 %	326315459
19072	NC_015138	GCC	2	6	689881	689886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315459
19073	NC_015138	GTC	2	6	689924	689929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315459
19074	NC_015138	TGG	2	6	689965	689970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315459
19075	NC_015138	CTG	2	6	689979	689984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315459
19076	NC_015138	CTG	2	6	689995	690000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315459
19077	NC_015138	GCTG	2	8	690020	690027	0 %	25 %	50 %	25 %	326315459
19078	NC_015138	CCAT	2	8	690028	690035	25 %	25 %	0 %	50 %	326315459
19079	NC_015138	GAA	2	6	690056	690061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315459
19080	NC_015138	CGC	2	6	690098	690103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315459
19081	NC_015138	G	6	6	690122	690127	0 %	0 %	100 %	0 %	326315459
19082	NC_015138	TGG	2	6	690133	690138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315459
19083	NC_015138	CCTG	2	8	690185	690192	0 %	25 %	25 %	50 %	326315459
19084	NC_015138	TCG	2	6	690193	690198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315459
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19086	NC_015138	CTG	2	6	690282	690287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315459
19087	NC_015138	CTG	2	6	690297	690302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315459
19088	NC_015138	GCT	2	6	690305	690310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315459
19089	NC_015138	TGG	2	6	690348	690353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315459
19090	NC_015138	CTG	2	6	690363	690368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315459
19091	NC_015138	CGTG	2	8	690373	690380	0 %	25 %	50 %	25 %	326315459
19092	NC_015138	GCT	2	6	690383	690388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315459
19093	NC_015138	GCT	2	6	690455	690460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315459
19094	NC_015138	GCTGC	2	10	690473	690482	0 %	20 %	40 %	40 %	326315459
19095	NC_015138	GCC	2	6	690489	690494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315459
19096	NC_015138	TTC	2	6	690522	690527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315459
19097	NC_015138	TCT	2	6	690532	690537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315459
19098	NC_015138	CAG	2	6	690546	690551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315459
19099	NC_015138	GTG	2	6	690684	690689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315459
19100	NC_015138	CCA	2	6	690731	690736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315459
19101	NC_015138	TGC	2	6	690751	690756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315459
19102	NC_015138	CT	3	6	690846	690851	0 %	50 %	0 %	50 %	326315459
19103	NC_015138	CGGCG	2	10	690881	690890	0 %	0 %	60 %	40 %	326315459
19104	NC_015138	G	6	6	690909	690914	0 %	0 %	100 %	0 %	326315459
19105	NC_015138	CTT	2	6	690917	690922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315459
19106	NC_015138	A	6	6	691067	691072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19107	NC_015138	CAC	3	9	691123	691131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315460
19108	NC_015138	GTC	2	6	691168	691173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315460
19109	NC_015138	GCCAG	2	10	691203	691212	20 %	0 %	40 %	40 %	326315460
19110	NC_015138	CTG	3	9	691216	691224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315460
19111	NC_015138	CCT	2	6	691257	691262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315460
19112	NC_015138	GCCTCG	2	12	691334	691345	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	326315460
19113	NC_015138	ACC	2	6	691367	691372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315460
19114	NC_015138	GGAGTC	2	12	691378	691389	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	326315460
19115	NC_015138	CCGGA	2	10	691514	691523	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19116	NC_015138	GCGCC	2	10	691530	691539	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19117	NC_015138	GCC	2	6	691656	691661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19118	NC_015138	CGCA	2	8	691666	691673	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19119	NC_015138	GGC	2	6	691676	691681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19120	NC_015138	GCT	2	6	691696	691701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315461
19121	NC_015138	GCGG	2	8	691756	691763	0 %	0 %	75 %	25 %	326315461
19122	NC_015138	GCCA	2	8	691784	691791	25 %	0 %	25 %	50 %	326315461
19123	NC_015138	TCG	2	6	691805	691810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315461
19124	NC_015138	CGCGG	2	10	691815	691824	0 %	0 %	60 %	40 %	326315461
19125	NC_015138	GGT	2	6	691927	691932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315461
19126	NC_015138	GCC	2	6	691973	691978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315461
19127	NC_015138	GGC	2	6	692035	692040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315461
19128	NC_015138	GCC	2	6	692047	692052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315461
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19130	NC_015138	CGG	2	6	692142	692147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315461
19131	NC_015138	CGC	2	6	692157	692162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315461
19132	NC_015138	GCGAGC	2	12	692172	692183	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	326315461
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19134	NC_015138	TCG	2	6	692228	692233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315461
19135	NC_015138	TTC	2	6	692273	692278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315461
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19139	NC_015138	CGG	2	6	692403	692408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315461
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19147	NC_015138	GC	3	6	692524	692529	0 %	0 %	50 %	50 %	326315461
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19151	NC_015138	CGG	2	6	692671	692676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315461
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19153	NC_015138	GCGGTG	2	12	692718	692729	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	326315461
19154	NC_015138	GCG	2	6	692765	692770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315461
19155	NC_015138	CGG	2	6	692791	692796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315461
19156	NC_015138	CCGG	2	8	692829	692836	0 %	0 %	50 %	50 %	326315461
19157	NC_015138	GCC	2	6	692848	692853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315461
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19161	NC_015138	CGCGG	2	10	692925	692934	0 %	0 %	60 %	40 %	326315461
19162	NC_015138	GCG	2	6	692940	692945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19163	NC_015138	GGCA	2	8	692957	692964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19164	NC_015138	TGCC	2	8	692978	692985	0 %	25 %	25 %	50 %	326315462
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19183	NC_015138	CCAGGC	2	12	693589	693600	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	326315462
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19188	NC_015138	GC	3	6	693833	693838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19189	NC_015138	GTC	2	6	693910	693915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315463
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19195	NC_015138	CG	3	6	694042	694047	0 %	0 %	50 %	50 %	326315463
19196	NC_015138	CG	3	6	694094	694099	0 %	0 %	50 %	50 %	326315463
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19202	NC_015138	GGT	2	6	694296	694301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315463
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19231	NC_015138	TGG	2	6	695469	695474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315464
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19233	NC_015138	CGA	2	6	695608	695613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315464
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19235	NC_015138	CG	4	8	695671	695678	0 %	0 %	50 %	50 %	326315464
19236	NC_015138	CTG	2	6	695726	695731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315464
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19239	NC_015138	GC	4	8	695822	695829	0 %	0 %	50 %	50 %	326315464
19240	NC_015138	CG	3	6	695846	695851	0 %	0 %	50 %	50 %	326315464
19241	NC_015138	GC	3	6	695877	695882	0 %	0 %	50 %	50 %	326315464
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19243	NC_015138	CTG	2	6	695915	695920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315464
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19363	NC_015138	CG	3	6	700659	700664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19364	NC_015138	GCT	2	6	700761	700766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19365	NC_015138	ACT	2	6	700829	700834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19366	NC_015138	CAG	2	6	700895	700900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19367	NC_015138	GCT	3	9	700926	700934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19368	NC_015138	CG	4	8	701007	701014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19369	NC_015138	TACG	2	8	701120	701127	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19370	NC_015138	T	7	7	701133	701139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19371	NC_015138	GAT	2	6	701192	701197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19372	NC_015138	CTC	2	6	701207	701212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19373	NC_015138	GCT	2	6	701238	701243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19374	NC_015138	ATCCGA	2	12	701246	701257	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19375	NC_015138	TGA	2	6	701321	701326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19376	NC_015138	TCA	2	6	701347	701352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19377	NC_015138	GCT	2	6	701576	701581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19378	NC_015138	TGC	2	6	701603	701608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19379	NC_015138	CTG	2	6	701662	701667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19380	NC_015138	TCC	2	6	701677	701682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19381	NC_015138	GCT	2	6	701761	701766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19382	NC_015138	CATT	2	8	701806	701813	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19383	NC_015138	TCG	2	6	701826	701831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19385	NC_015138	TTG	2	6	701907	701912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19386	NC_015138	GTG	2	6	701931	701936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19387	NC_015138	GCT	2	6	702006	702011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19388	NC_015138	TGC	2	6	702022	702027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19389	NC_015138	TCG	2	6	702031	702036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19390	NC_015138	CCCA	2	8	702045	702052	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19391	NC_015138	TCC	2	6	702141	702146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19392	NC_015138	GC	3	6	702162	702167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19393	NC_015138	CGG	2	6	702169	702174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19394	NC_015138	CGT	2	6	702184	702189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19395	NC_015138	T	6	6	702191	702196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19396	NC_015138	GCCT	2	8	702270	702277	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19397	NC_015138	GGA	2	6	702304	702309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19398	NC_015138	GCAACA	2	12	702345	702356	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	326315470
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19400	NC_015138	GTT	2	6	702414	702419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326315470
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19486	NC_015138	GCTG	2	8	705603	705610	0 %	25 %	50 %	25 %	326315470
19487	NC_015138	CGG	2	6	705616	705621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315470
19488	NC_015138	TTG	2	6	705638	705643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19490	NC_015138	AGT	2	6	705783	705788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315471
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