MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 150496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_015138	CGG	2	6	670257	670262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315446
18502	NC_015138	TGC	2	6	670265	670270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315446
18503	NC_015138	GC	3	6	670269	670274	0 %	0 %	50 %	50 %	326315446
18504	NC_015138	CGG	2	6	670278	670283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315446
18505	NC_015138	TGG	2	6	670321	670326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315446
18506	NC_015138	CTG	2	6	670338	670343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315446
18507	NC_015138	CTG	2	6	670357	670362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315446
18508	NC_015138	ACGG	2	8	670396	670403	25 %	0 %	50 %	25 %	326315446
18509	NC_015138	CGA	2	6	670512	670517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315446
18510	NC_015138	CGG	2	6	670563	670568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315446
18511	NC_015138	TGC	2	6	670583	670588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315446
18512	NC_015138	TGC	2	6	670604	670609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315446
18513	NC_015138	TGGAC	2	10	670610	670619	20 %	20 %	40 %	20 %	326315446
18514	NC_015138	GCCG	2	8	670720	670727	0 %	0 %	50 %	50 %	326315446
18515	NC_015138	GCG	2	6	670732	670737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315446
18516	NC_015138	TGCC	2	8	670773	670780	0 %	25 %	25 %	50 %	326315447
18517	NC_015138	TCCC	2	8	670801	670808	0 %	25 %	0 %	75 %	326315447
18518	NC_015138	GCG	2	6	670809	670814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315447
18519	NC_015138	CGGGC	2	10	670820	670829	0 %	0 %	60 %	40 %	326315447
18520	NC_015138	GGA	2	6	670852	670857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315447
18521	NC_015138	TCGC	2	8	670890	670897	0 %	25 %	25 %	50 %	326315447
18522	NC_015138	CCA	2	6	671001	671006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315447
18523	NC_015138	CTGG	2	8	671017	671024	0 %	25 %	50 %	25 %	326315447
18524	NC_015138	CGG	2	6	671025	671030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315447
18525	NC_015138	TCT	2	6	671061	671066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315447
18526	NC_015138	GCG	2	6	671095	671100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315447
18527	NC_015138	GCT	3	9	671125	671133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315447
18528	NC_015138	ACA	2	6	671166	671171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315447
18529	NC_015138	CGA	2	6	671184	671189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315447
18530	NC_015138	GCTCGC	2	12	671191	671202	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	326315447
18531	NC_015138	GCT	2	6	671203	671208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315447
18532	NC_015138	CTT	3	9	671257	671265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315447
18533	NC_015138	GGT	2	6	671329	671334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315447
18534	NC_015138	TCA	2	6	671355	671360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315447
18535	NC_015138	GCG	2	6	671385	671390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315447
18536	NC_015138	GAA	2	6	671407	671412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315447
18537	NC_015138	GCA	2	6	671422	671427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315447
18538	NC_015138	ATGA	2	8	671501	671508	50 %	25 %	25 %	0 %	326315447
18539	NC_015138	CG	3	6	671518	671523	0 %	0 %	50 %	50 %	326315447
18540	NC_015138	TTCG	2	8	671527	671534	0 %	50 %	25 %	25 %	326315447
18541	NC_015138	GCC	2	6	671543	671548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315447
18542	NC_015138	CCG	2	6	671554	671559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315447
18543	NC_015138	GTTC	2	8	671604	671611	0 %	50 %	25 %	25 %	326315447
18544	NC_015138	GCT	2	6	671635	671640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315447
18545	NC_015138	TGG	2	6	671697	671702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315447
18546	NC_015138	GC	3	6	671703	671708	0 %	0 %	50 %	50 %	326315447
18547	NC_015138	GTGG	3	12	671720	671731	0 %	25 %	75 %	0 %	326315447
18548	NC_015138	GC	3	6	671753	671758	0 %	0 %	50 %	50 %	326315447
18549	NC_015138	GGC	2	6	671831	671836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315447
18550	NC_015138	GCCG	2	8	671854	671861	0 %	0 %	50 %	50 %	326315447
18551	NC_015138	CTT	2	6	671878	671883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315447
18552	NC_015138	CAC	2	6	671908	671913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315447
18553	NC_015138	GAT	2	6	671941	671946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315447
18554	NC_015138	GC	3	6	672063	672068	0 %	0 %	50 %	50 %	326315447
18555	NC_015138	CGG	2	6	672079	672084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315447
18556	NC_015138	CTT	2	6	672085	672090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315447
18557	NC_015138	CGC	2	6	672118	672123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315447
18558	NC_015138	CGGG	2	8	672126	672133	0 %	0 %	75 %	25 %	326315447
18559	NC_015138	CGC	2	6	672157	672162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315447
18560	NC_015138	GTG	2	6	672190	672195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315447
18561	NC_015138	TAC	2	6	672197	672202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315447
18562	NC_015138	GC	3	6	672203	672208	0 %	0 %	50 %	50 %	326315447
18563	NC_015138	CTG	2	6	672226	672231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315447
18564	NC_015138	CGA	2	6	672236	672241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18565	NC_015138	CAGC	2	8	672291	672298	25 %	0 %	25 %	50 %	326315448
18566	NC_015138	CG	3	6	672299	672304	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
18567	NC_015138	GGC	2	6	672316	672321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315448
18568	NC_015138	CCAC	2	8	672401	672408	25 %	0 %	0 %	75 %	326315448
18569	NC_015138	CAG	2	6	672478	672483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315448
18570	NC_015138	CG	3	6	672527	672532	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
18571	NC_015138	GC	4	8	672536	672543	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
18572	NC_015138	TCG	2	6	672671	672676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315448
18573	NC_015138	CGA	2	6	672678	672683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315448
18574	NC_015138	CG	3	6	672729	672734	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
18575	NC_015138	TCG	2	6	672761	672766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315448
18576	NC_015138	GCC	2	6	672769	672774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315448
18577	NC_015138	CCG	2	6	672789	672794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315448
18578	NC_015138	CAT	2	6	672810	672815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315448
18579	NC_015138	CGGC	2	8	672857	672864	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
18580	NC_015138	CGG	2	6	672885	672890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315448
18581	NC_015138	GCC	2	6	672927	672932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315448
18582	NC_015138	CAT	2	6	673002	673007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315448
18583	NC_015138	CTT	2	6	673053	673058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315448
18584	NC_015138	AGCGC	2	10	673229	673238	20 %	0 %	40 %	40 %	326315448
18585	NC_015138	CGA	2	6	673245	673250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315448
18586	NC_015138	CCG	2	6	673257	673262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315448
18587	NC_015138	GTG	2	6	673321	673326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315448
18588	NC_015138	GC	3	6	673347	673352	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
18589	NC_015138	GC	3	6	673417	673422	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
18590	NC_015138	GGA	2	6	673503	673508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315448
18591	NC_015138	GC	3	6	673516	673521	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
18592	NC_015138	GGA	2	6	673569	673574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315448
18593	NC_015138	CGG	2	6	673617	673622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315448
18594	NC_015138	CG	3	6	673668	673673	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
18595	NC_015138	CCGTGC	2	12	673676	673687	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	326315448
18596	NC_015138	CG	4	8	673719	673726	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
18597	NC_015138	GC	3	6	673777	673782	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
18598	NC_015138	CGC	3	9	673800	673808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315448
18599	NC_015138	ACG	3	9	673814	673822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315448
18600	NC_015138	CGCC	2	8	673835	673842	0 %	0 %	25 %	75 %	326315448
18601	NC_015138	CGC	2	6	673865	673870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315448
18602	NC_015138	GC	4	8	673869	673876	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
18603	NC_015138	GC	3	6	673891	673896	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
18604	NC_015138	CGCAC	2	10	673913	673922	20 %	0 %	20 %	60 %	326315448
18605	NC_015138	ATC	2	6	673942	673947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315448
18606	NC_015138	GCG	2	6	673951	673956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315448
18607	NC_015138	CAT	2	6	673995	674000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315448
18608	NC_015138	TGA	2	6	674009	674014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315448
18609	NC_015138	GCG	3	9	674036	674044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315448
18610	NC_015138	CGC	2	6	674129	674134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315448
18611	NC_015138	CAG	2	6	674137	674142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315448
18612	NC_015138	CCA	2	6	674147	674152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315448
18613	NC_015138	CTT	2	6	674154	674159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315448
18614	NC_015138	CGG	2	6	674241	674246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315448
18615	NC_015138	GC	3	6	674268	674273	0 %	0 %	50 %	50 %	326315448
18616	NC_015138	GCTG	2	8	674285	674292	0 %	25 %	50 %	25 %	326315448
18617	NC_015138	GGT	2	6	674328	674333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315448
18618	NC_015138	CGAGGC	2	12	674337	674348	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	326315448
18619	NC_015138	TCG	2	6	674482	674487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315448
18620	NC_015138	CTG	2	6	674518	674523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315448
18621	NC_015138	GGGCGA	2	12	674556	674567	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	326315448
18622	NC_015138	CTG	2	6	674623	674628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315448
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18728	NC_015138	GGCG	2	8	678674	678681	0 %	0 %	75 %	25 %	326315451
18729	NC_015138	TGC	2	6	678706	678711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315451
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18732	NC_015138	GTG	2	6	678777	678782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315451
18733	NC_015138	TGG	3	9	678796	678804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315451
18734	NC_015138	GCA	2	6	678830	678835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315451
18735	NC_015138	GCGCA	2	10	678873	678882	20 %	0 %	40 %	40 %	326315451
18736	NC_015138	TGC	2	6	678922	678927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315451
18737	NC_015138	CTG	2	6	679032	679037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315451
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18739	NC_015138	GGT	2	6	679049	679054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315451
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18741	NC_015138	CG	3	6	679078	679083	0 %	0 %	50 %	50 %	326315451
18742	NC_015138	CCAGC	2	10	679100	679109	20 %	0 %	20 %	60 %	326315451
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18857	NC_015138	GCGCA	2	10	682572	682581	20 %	0 %	40 %	40 %	326315454
18858	NC_015138	TGC	3	9	682582	682590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315454
18859	NC_015138	CTG	2	6	682644	682649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315454
18860	NC_015138	GCG	2	6	682660	682665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315454
18861	NC_015138	GGC	2	6	682666	682671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315454
18862	NC_015138	GCA	2	6	682691	682696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315454
18863	NC_015138	TCG	2	6	682702	682707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315454
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18865	NC_015138	TGC	2	6	682846	682851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315454
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18872	NC_015138	GCA	2	6	683120	683125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315454
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18874	NC_015138	GCG	2	6	683147	683152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315454
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18877	NC_015138	ATGC	2	8	683252	683259	25 %	25 %	25 %	25 %	326315454
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18924	NC_015138	CCGG	2	8	684738	684745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18925	NC_015138	CGG	2	6	684747	684752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18926	NC_015138	GGCC	2	8	684841	684848	0 %	0 %	50 %	50 %	326315455
18927	NC_015138	G	6	6	684880	684885	0 %	0 %	100 %	0 %	326315455
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18964	NC_015138	AGCA	2	8	685916	685923	50 %	0 %	25 %	25 %	326315455
18965	NC_015138	CAG	2	6	685951	685956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315455
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18968	NC_015138	CGA	3	9	686041	686049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315455
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18972	NC_015138	AG	3	6	686206	686211	50 %	0 %	50 %	0 %	326315455
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18977	NC_015138	CAG	2	6	686566	686571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315455
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18979	NC_015138	GTT	2	6	686599	686604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326315455
18980	NC_015138	CTTG	2	8	686689	686696	0 %	50 %	25 %	25 %	326315455
18981	NC_015138	GGA	2	6	686707	686712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315455
18982	NC_015138	GTC	2	6	686747	686752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315455
18983	NC_015138	GGA	2	6	686776	686781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315455
18984	NC_015138	CGT	2	6	686818	686823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315455
18985	NC_015138	AGG	3	9	686889	686897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315455
18986	NC_015138	GCA	2	6	686938	686943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315455
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18988	NC_015138	TGG	2	6	686982	686987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315455
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18990	NC_015138	CGC	2	6	687101	687106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315455
18991	NC_015138	CGC	2	6	687137	687142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18992	NC_015138	TGT	2	6	687194	687199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326315456
18993	NC_015138	GTA	2	6	687228	687233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315456
18994	NC_015138	GGT	2	6	687239	687244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315456
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18998	NC_015138	CCG	2	6	687317	687322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315456
18999	NC_015138	CG	3	6	687321	687326	0 %	0 %	50 %	50 %	326315456
19000	NC_015138	GGCC	2	8	687354	687361	0 %	0 %	50 %	50 %	326315456

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