MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 150496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_015138	GAC	2	6	529160	529165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315303
14502	NC_015138	CTG	2	6	529205	529210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315303
14503	NC_015138	GC	3	6	529260	529265	0 %	0 %	50 %	50 %	326315303
14504	NC_015138	GCC	2	6	529307	529312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315303
14505	NC_015138	GC	3	6	529316	529321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14506	NC_015138	TCG	2	6	529341	529346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315304
14507	NC_015138	GCC	2	6	529379	529384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315304
14508	NC_015138	TGG	2	6	529413	529418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315304
14509	NC_015138	CGGC	2	8	529426	529433	0 %	0 %	50 %	50 %	326315304
14510	NC_015138	TGA	2	6	529447	529452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315304
14511	NC_015138	GCC	2	6	529488	529493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315304
14512	NC_015138	GC	3	6	529510	529515	0 %	0 %	50 %	50 %	326315304
14513	NC_015138	TGG	2	6	529516	529521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315304
14514	NC_015138	TCG	2	6	529524	529529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315304
14515	NC_015138	CG	3	6	529563	529568	0 %	0 %	50 %	50 %	326315304
14516	NC_015138	CGGC	2	8	529641	529648	0 %	0 %	50 %	50 %	326315304
14517	NC_015138	CAG	2	6	529682	529687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315304
14518	NC_015138	CGGG	2	8	529713	529720	0 %	0 %	75 %	25 %	326315304
14519	NC_015138	ATC	2	6	529725	529730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315304
14520	NC_015138	GAA	2	6	529775	529780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315304
14521	NC_015138	GTG	2	6	529799	529804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315304
14522	NC_015138	CAC	2	6	529805	529810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315304
14523	NC_015138	GGCC	2	8	529831	529838	0 %	0 %	50 %	50 %	326315304
14524	NC_015138	GC	3	6	529842	529847	0 %	0 %	50 %	50 %	326315304
14525	NC_015138	AGC	2	6	529848	529853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315304
14526	NC_015138	CAG	2	6	529886	529891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315304
14527	NC_015138	GA	3	6	529917	529922	50 %	0 %	50 %	0 %	326315304
14528	NC_015138	CAG	2	6	529931	529936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315304
14529	NC_015138	GCC	2	6	530072	530077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315304
14530	NC_015138	CCG	2	6	530078	530083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315304
14531	NC_015138	GCT	2	6	530095	530100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315304
14532	NC_015138	GTT	2	6	530107	530112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326315304
14533	NC_015138	CGG	3	9	530134	530142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315304
14534	NC_015138	G	6	6	530162	530167	0 %	0 %	100 %	0 %	326315304
14535	NC_015138	CAG	2	6	530189	530194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315304
14536	NC_015138	GGC	2	6	530215	530220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315304
14537	NC_015138	GCC	2	6	530300	530305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315304
14538	NC_015138	GAT	2	6	530360	530365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315304
14539	NC_015138	GCTG	2	8	530386	530393	0 %	25 %	50 %	25 %	326315304
14540	NC_015138	GC	3	6	530397	530402	0 %	0 %	50 %	50 %	326315304
14541	NC_015138	AGCG	2	8	530415	530422	25 %	0 %	50 %	25 %	326315304
14542	NC_015138	TGA	2	6	530431	530436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315304
14543	NC_015138	GTT	2	6	530447	530452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326315304
14544	NC_015138	GC	3	6	530484	530489	0 %	0 %	50 %	50 %	326315304
14545	NC_015138	CGC	2	6	530500	530505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315304
14546	NC_015138	CGC	2	6	530571	530576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315304
14547	NC_015138	CCA	2	6	530626	530631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315304
14548	NC_015138	CCA	2	6	530707	530712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315304
14549	NC_015138	CAT	2	6	530717	530722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315304
14550	NC_015138	GTA	2	6	530831	530836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315304
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14552	NC_015138	GTA	3	9	530915	530923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315304
14553	NC_015138	CGGTCC	2	12	530988	530999	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	326315304
14554	NC_015138	CAG	2	6	531065	531070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315304
14555	NC_015138	CAG	2	6	531083	531088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315304
14556	NC_015138	CAG	2	6	531092	531097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315304
14557	NC_015138	CCAG	2	8	531124	531131	25 %	0 %	25 %	50 %	326315304
14558	NC_015138	GCC	2	6	531157	531162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14559	NC_015138	GGC	2	6	531164	531169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14560	NC_015138	GCG	2	6	531235	531240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14561	NC_015138	CGG	2	6	531241	531246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14562	NC_015138	CCG	2	6	531322	531327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14563	NC_015138	CGC	2	6	531340	531345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14564	NC_015138	CAC	2	6	531381	531386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14565	NC_015138	CG	3	6	531387	531392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14566	NC_015138	GAGC	2	8	531408	531415	25 %	0 %	50 %	25 %	326315305
14567	NC_015138	GGC	2	6	531424	531429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315305
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14569	NC_015138	AGGCG	2	10	531486	531495	20 %	0 %	60 %	20 %	326315305
14570	NC_015138	GGC	2	6	531538	531543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315305
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14572	NC_015138	GC	4	8	531563	531570	0 %	0 %	50 %	50 %	326315305
14573	NC_015138	GC	3	6	531590	531595	0 %	0 %	50 %	50 %	326315305
14574	NC_015138	CAG	2	6	531625	531630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315305
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14578	NC_015138	CAGG	2	8	531745	531752	25 %	0 %	50 %	25 %	326315305
14579	NC_015138	CG	3	6	531756	531761	0 %	0 %	50 %	50 %	326315305
14580	NC_015138	GGT	2	6	531831	531836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315305
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14583	NC_015138	CCCG	2	8	531994	532001	0 %	0 %	25 %	75 %	326315305
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14586	NC_015138	CG	3	6	532090	532095	0 %	0 %	50 %	50 %	326315305
14587	NC_015138	TGGG	2	8	532151	532158	0 %	25 %	75 %	0 %	326315305
14588	NC_015138	GCG	2	6	532196	532201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315305
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14590	NC_015138	CCG	2	6	532342	532347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14591	NC_015138	CGG	2	6	532348	532353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14592	NC_015138	CAT	2	6	532354	532359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14593	NC_015138	CGC	2	6	532377	532382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14594	NC_015138	TCT	2	6	532401	532406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14595	NC_015138	CG	3	6	532424	532429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14596	NC_015138	GC	3	6	532431	532436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14597	NC_015138	CGC	2	6	532473	532478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315306
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14601	NC_015138	CG	3	6	532556	532561	0 %	0 %	50 %	50 %	326315306
14602	NC_015138	CGCGC	2	10	532619	532628	0 %	0 %	40 %	60 %	326315306
14603	NC_015138	GCCG	2	8	532635	532642	0 %	0 %	50 %	50 %	326315306
14604	NC_015138	TGC	2	6	532655	532660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315306
14605	NC_015138	GAC	2	6	532663	532668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315306
14606	NC_015138	TGG	2	6	532685	532690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315306
14607	NC_015138	GCA	2	6	532737	532742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315306
14608	NC_015138	GC	3	6	532744	532749	0 %	0 %	50 %	50 %	326315306
14609	NC_015138	TCG	2	6	532751	532756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315306
14610	NC_015138	GGA	2	6	532818	532823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315306
14611	NC_015138	GCGCG	2	10	532857	532866	0 %	0 %	60 %	40 %	326315306
14612	NC_015138	GCCT	2	8	532870	532877	0 %	25 %	25 %	50 %	326315306
14613	NC_015138	GAG	3	9	532882	532890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315306
14614	NC_015138	CG	3	6	532891	532896	0 %	0 %	50 %	50 %	326315306
14615	NC_015138	TTCG	2	8	532920	532927	0 %	50 %	25 %	25 %	326315306
14616	NC_015138	GGA	2	6	532974	532979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315306
14617	NC_015138	GCCGC	2	10	532984	532993	0 %	0 %	40 %	60 %	326315306
14618	NC_015138	AGG	2	6	533000	533005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315306
14619	NC_015138	GC	3	6	533024	533029	0 %	0 %	50 %	50 %	326315306
14620	NC_015138	TCG	2	6	533039	533044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315306
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14622	NC_015138	GCCC	2	8	533099	533106	0 %	0 %	25 %	75 %	326315306
14623	NC_015138	CG	3	6	533192	533197	0 %	0 %	50 %	50 %	326315306
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14864	NC_015138	TGC	2	6	541332	541337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315313
14865	NC_015138	AGC	2	6	541392	541397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315313
14866	NC_015138	AGG	2	6	541419	541424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315313
14867	NC_015138	GCA	2	6	541429	541434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315313
14868	NC_015138	CCG	2	6	541482	541487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315313
14869	NC_015138	CGA	2	6	541522	541527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315313
14870	NC_015138	CAG	2	6	541538	541543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315313
14871	NC_015138	ACG	2	6	541557	541562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315313
14872	NC_015138	CGG	2	6	541614	541619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315313
14873	NC_015138	CAGCGC	2	12	541660	541671	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	326315313
14874	NC_015138	CGG	2	6	541716	541721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315313
14875	NC_015138	CCA	2	6	541722	541727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315313
14876	NC_015138	GGC	2	6	541733	541738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315313
14877	NC_015138	CGG	2	6	541752	541757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315313
14878	NC_015138	GGT	2	6	541774	541779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315313
14879	NC_015138	CG	3	6	541803	541808	0 %	0 %	50 %	50 %	326315313
14880	NC_015138	GAA	2	6	541813	541818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315313
14881	NC_015138	CG	3	6	541839	541844	0 %	0 %	50 %	50 %	326315313
14882	NC_015138	CAA	2	6	541957	541962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315313
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14884	NC_015138	CGGG	2	8	541983	541990	0 %	0 %	75 %	25 %	326315313
14885	NC_015138	GCC	2	6	542012	542017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315313
14886	NC_015138	CGG	2	6	542037	542042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315313
14887	NC_015138	GCT	2	6	542080	542085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315313
14888	NC_015138	GCT	2	6	542098	542103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315313
14889	NC_015138	TTC	2	6	542138	542143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315313
14890	NC_015138	CACG	2	8	542146	542153	25 %	0 %	25 %	50 %	326315313
14891	NC_015138	TC	3	6	542215	542220	0 %	50 %	0 %	50 %	326315313
14892	NC_015138	CCT	2	6	542230	542235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315313
14893	NC_015138	GC	3	6	542260	542265	0 %	0 %	50 %	50 %	326315313
14894	NC_015138	CG	3	6	542323	542328	0 %	0 %	50 %	50 %	326315313
14895	NC_015138	GCCG	2	8	542383	542390	0 %	0 %	50 %	50 %	326315313
14896	NC_015138	CTG	2	6	542396	542401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315313
14897	NC_015138	GC	3	6	542406	542411	0 %	0 %	50 %	50 %	326315313
14898	NC_015138	GCC	2	6	542417	542422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315313
14899	NC_015138	G	6	6	542446	542451	0 %	0 %	100 %	0 %	326315313
14900	NC_015138	GCC	2	6	542465	542470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315313
14901	NC_015138	GC	3	6	542633	542638	0 %	0 %	50 %	50 %	326315313
14902	NC_015138	CAG	2	6	542639	542644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315313
14903	NC_015138	AGGC	2	8	542723	542730	25 %	0 %	50 %	25 %	326315313
14904	NC_015138	GCTG	2	8	542788	542795	0 %	25 %	50 %	25 %	326315313
14905	NC_015138	CG	3	6	542796	542801	0 %	0 %	50 %	50 %	326315313
14906	NC_015138	GCC	2	6	542888	542893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315313
14907	NC_015138	CGA	3	9	542914	542922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315313
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14909	NC_015138	CTG	2	6	543026	543031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315313
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14914	NC_015138	CGGC	3	12	543266	543277	0 %	0 %	50 %	50 %	326315314
14915	NC_015138	CTG	2	6	543294	543299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315314
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14919	NC_015138	CGC	2	6	543400	543405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315314
14920	NC_015138	GCC	2	6	543411	543416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315314
14921	NC_015138	GCA	2	6	543426	543431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315314
14922	NC_015138	GCC	3	9	543438	543446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315314
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14924	NC_015138	GCCG	2	8	543458	543465	0 %	0 %	50 %	50 %	326315314
14925	NC_015138	TCG	2	6	543610	543615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315314
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14928	NC_015138	GGC	2	6	543762	543767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315314
14929	NC_015138	CG	3	6	543826	543831	0 %	0 %	50 %	50 %	326315314
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14931	NC_015138	AAC	2	6	543873	543878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315314
14932	NC_015138	TCG	2	6	543892	543897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315314
14933	NC_015138	CG	3	6	543903	543908	0 %	0 %	50 %	50 %	326315314
14934	NC_015138	CGG	3	9	543947	543955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315314
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14936	NC_015138	CTG	2	6	543999	544004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315314
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14939	NC_015138	ACA	2	6	544177	544182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315314
14940	NC_015138	CAA	2	6	544199	544204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315314
14941	NC_015138	GGGC	2	8	544218	544225	0 %	0 %	75 %	25 %	326315314
14942	NC_015138	CGC	3	9	544235	544243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315314
14943	NC_015138	CCG	2	6	544282	544287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315314
14944	NC_015138	GACG	2	8	544322	544329	25 %	0 %	50 %	25 %	326315314
14945	NC_015138	GAA	2	6	544340	544345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315314
14946	NC_015138	CGG	2	6	544347	544352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315314
14947	NC_015138	CGC	2	6	544383	544388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14948	NC_015138	CAC	2	6	544417	544422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315315
14949	NC_015138	CGAG	2	8	544488	544495	25 %	0 %	50 %	25 %	326315315
14950	NC_015138	CG	3	6	544575	544580	0 %	0 %	50 %	50 %	326315315
14951	NC_015138	GTA	2	6	544606	544611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315315
14952	NC_015138	GCA	2	6	544665	544670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315315
14953	NC_015138	GCC	2	6	544688	544693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315315
14954	NC_015138	TCCC	2	8	544714	544721	0 %	25 %	0 %	75 %	326315315
14955	NC_015138	TGA	2	6	544722	544727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315315
14956	NC_015138	CCA	2	6	544776	544781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315315
14957	NC_015138	CGT	2	6	544782	544787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315315
14958	NC_015138	TGC	2	6	544875	544880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315315
14959	NC_015138	AGGCGT	2	12	544893	544904	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	326315315
14960	NC_015138	CTT	2	6	544918	544923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315315
14961	NC_015138	CGA	2	6	544932	544937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315315
14962	NC_015138	CGTA	2	8	545034	545041	25 %	25 %	25 %	25 %	326315315
14963	NC_015138	ATG	2	6	545051	545056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315315
14964	NC_015138	TGG	2	6	545064	545069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315315
14965	NC_015138	TCGC	2	8	545129	545136	0 %	25 %	25 %	50 %	326315315
14966	NC_015138	GCC	2	6	545146	545151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315315
14967	NC_015138	TTG	2	6	545162	545167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326315315
14968	NC_015138	ACC	2	6	545174	545179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315315
14969	NC_015138	GAT	2	6	545224	545229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315315
14970	NC_015138	GTCG	2	8	545230	545237	0 %	25 %	50 %	25 %	326315315
14971	NC_015138	C	6	6	545239	545244	0 %	0 %	0 %	100 %	326315315
14972	NC_015138	CTGG	2	8	545276	545283	0 %	25 %	50 %	25 %	326315315
14973	NC_015138	GGC	2	6	545287	545292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315315
14974	NC_015138	CGG	2	6	545313	545318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315315
14975	NC_015138	GCA	2	6	545329	545334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315315
14976	NC_015138	GGC	3	9	545428	545436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315316
14977	NC_015138	GCA	2	6	545512	545517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315316
14978	NC_015138	CGCCT	2	10	545540	545549	0 %	20 %	20 %	60 %	326315316
14979	NC_015138	CCG	2	6	545554	545559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315316
14980	NC_015138	GCC	2	6	545575	545580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315316
14981	NC_015138	CCA	2	6	545581	545586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315316
14982	NC_015138	CAGGGC	2	12	545603	545614	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	326315316
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14984	NC_015138	ACG	2	6	545685	545690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315316
14985	NC_015138	GGC	2	6	545714	545719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315316
14986	NC_015138	GGC	2	6	545731	545736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315316
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