MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 150496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015138	CGC	2	6	235252	235257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315036
6502	NC_015138	CGA	2	6	235289	235294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315036
6503	NC_015138	CCGTG	2	10	235312	235321	0 %	20 %	40 %	40 %	326315036
6504	NC_015138	CGC	2	6	235375	235380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315036
6505	NC_015138	GC	4	8	235402	235409	0 %	0 %	50 %	50 %	326315036
6506	NC_015138	GGA	2	6	235436	235441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315036
6507	NC_015138	GAG	2	6	235532	235537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315036
6508	NC_015138	GCCG	2	8	235556	235563	0 %	0 %	50 %	50 %	326315036
6509	NC_015138	ACG	2	6	235625	235630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_015138	GC	5	10	235648	235657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6511	NC_015138	GTC	2	6	235693	235698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_015138	CATC	2	8	235769	235776	25 %	25 %	0 %	50 %	326315037
6513	NC_015138	CGG	2	6	235804	235809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315037
6514	NC_015138	CGC	2	6	235847	235852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315037
6515	NC_015138	TGC	2	6	235858	235863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315037
6516	NC_015138	CGGG	2	8	235879	235886	0 %	0 %	75 %	25 %	326315037
6517	NC_015138	GCCT	2	8	235920	235927	0 %	25 %	25 %	50 %	326315037
6518	NC_015138	CGG	2	6	236008	236013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315037
6519	NC_015138	GC	3	6	236042	236047	0 %	0 %	50 %	50 %	326315037
6520	NC_015138	GCC	2	6	236087	236092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315037
6521	NC_015138	GGCC	2	8	236126	236133	0 %	0 %	50 %	50 %	326315037
6522	NC_015138	GCCT	2	8	236163	236170	0 %	25 %	25 %	50 %	326315037
6523	NC_015138	GCC	3	9	236171	236179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315037
6524	NC_015138	GGCCC	2	10	236204	236213	0 %	0 %	40 %	60 %	326315037
6525	NC_015138	GAG	2	6	236349	236354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315037
6526	NC_015138	CTA	2	6	236357	236362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315037
6527	NC_015138	TGC	2	6	236422	236427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315037
6528	NC_015138	CTG	2	6	236457	236462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315037
6529	NC_015138	CG	3	6	236468	236473	0 %	0 %	50 %	50 %	326315037
6530	NC_015138	GGCGAG	2	12	236538	236549	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	326315037
6531	NC_015138	GCT	2	6	236561	236566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315037
6532	NC_015138	GAG	2	6	236571	236576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315037
6533	NC_015138	AGG	2	6	236581	236586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315037
6534	NC_015138	GCCC	2	8	236609	236616	0 %	0 %	25 %	75 %	326315037
6535	NC_015138	GCG	2	6	236637	236642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315037
6536	NC_015138	GGA	2	6	236689	236694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_015138	GCC	2	6	236743	236748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315038
6538	NC_015138	CGACCT	2	12	236803	236814	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	326315038
6539	NC_015138	GGC	2	6	236869	236874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315038
6540	NC_015138	CCG	2	6	236875	236880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315038
6541	NC_015138	GGC	2	6	236881	236886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315038
6542	NC_015138	CTG	2	6	236936	236941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6543	NC_015138	GCCG	2	8	237028	237035	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6544	NC_015138	CG	3	6	237041	237046	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6545	NC_015138	GCT	2	6	237079	237084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6546	NC_015138	CG	3	6	237093	237098	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6547	NC_015138	TGGGC	2	10	237225	237234	0 %	20 %	60 %	20 %	326315038
6548	NC_015138	AGG	2	6	237240	237245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315038
6549	NC_015138	TGC	2	6	237268	237273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6550	NC_015138	G	6	6	237301	237306	0 %	0 %	100 %	0 %	326315038
6551	NC_015138	GCCG	2	8	237359	237366	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6552	NC_015138	CTGC	2	8	237367	237374	0 %	25 %	25 %	50 %	326315038
6553	NC_015138	GCT	2	6	237424	237429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6554	NC_015138	TTC	2	6	237464	237469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315038
6555	NC_015138	TGG	2	6	237561	237566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315038
6556	NC_015138	CG	3	6	237567	237572	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6557	NC_015138	CG	4	8	237625	237632	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6558	NC_015138	CG	3	6	237655	237660	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6559	NC_015138	CGG	3	9	237682	237690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315038
6560	NC_015138	GGCGCC	2	12	237691	237702	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6561	NC_015138	GCC	2	6	237728	237733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315038
6562	NC_015138	CTA	2	6	237754	237759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315038
6563	NC_015138	CG	3	6	237775	237780	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6564	NC_015138	ACT	3	9	237810	237818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315038
6565	NC_015138	GGC	2	6	237827	237832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315038
6566	NC_015138	GCCA	2	8	237854	237861	25 %	0 %	25 %	50 %	326315038
6567	NC_015138	CTG	2	6	237875	237880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6568	NC_015138	TGG	2	6	237900	237905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315038
6569	NC_015138	CGGC	2	8	237910	237917	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6570	NC_015138	CGC	2	6	237962	237967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315038
6571	NC_015138	GCCG	2	8	237988	237995	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6572	NC_015138	GAA	2	6	237997	238002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315038
6573	NC_015138	GCG	2	6	238018	238023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315038
6574	NC_015138	CTG	2	6	238024	238029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6575	NC_015138	AGC	2	6	238047	238052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6576	NC_015138	GCT	2	6	238090	238095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6577	NC_015138	GCA	2	6	238105	238110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6578	NC_015138	GATG	2	8	238156	238163	25 %	25 %	50 %	0 %	326315038
6579	NC_015138	TGC	2	6	238191	238196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6580	NC_015138	GCT	2	6	238198	238203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6581	NC_015138	CTG	2	6	238217	238222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6582	NC_015138	GCC	2	6	238248	238253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315038
6583	NC_015138	GCC	2	6	238265	238270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315038
6584	NC_015138	TGCG	2	8	238286	238293	0 %	25 %	50 %	25 %	326315038
6585	NC_015138	ACT	2	6	238380	238385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315038
6586	NC_015138	GCAGC	2	10	238448	238457	20 %	0 %	40 %	40 %	326315038
6587	NC_015138	CG	3	6	238471	238476	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6588	NC_015138	CCGGC	2	10	238555	238564	0 %	0 %	40 %	60 %	326315038
6589	NC_015138	CAG	2	6	238582	238587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6590	NC_015138	GCA	2	6	238600	238605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6591	NC_015138	CGC	2	6	238661	238666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315038
6592	NC_015138	AGG	2	6	238671	238676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315038
6593	NC_015138	GC	3	6	238684	238689	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6594	NC_015138	GCC	2	6	238776	238781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315038
6595	NC_015138	ACCT	2	8	238889	238896	25 %	25 %	0 %	50 %	326315038
6596	NC_015138	GTG	2	6	238964	238969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315038
6597	NC_015138	CGA	2	6	238978	238983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6598	NC_015138	CG	3	6	238990	238995	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6599	NC_015138	GCG	2	6	239005	239010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315038
6600	NC_015138	GCT	2	6	239011	239016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6601	NC_015138	GTG	2	6	239023	239028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315038
6602	NC_015138	GCC	2	6	239042	239047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315038
6603	NC_015138	AGC	2	6	239067	239072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6604	NC_015138	CAA	2	6	239085	239090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6605	NC_015138	GGC	2	6	239107	239112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6606	NC_015138	ATC	2	6	239130	239135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6607	NC_015138	CGAG	2	8	239164	239171	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6608	NC_015138	CGC	2	6	239184	239189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6609	NC_015138	CTG	2	6	239198	239203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6610	NC_015138	TGT	2	6	239340	239345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_015138	C	6	6	239445	239450	0 %	0 %	0 %	100 %	326315039
6612	NC_015138	TCG	3	9	239526	239534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315039
6613	NC_015138	GCGG	2	8	239576	239583	0 %	0 %	75 %	25 %	326315039
6614	NC_015138	AG	3	6	239639	239644	50 %	0 %	50 %	0 %	326315039
6615	NC_015138	CTG	2	6	239693	239698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315039
6616	NC_015138	CGG	2	6	239832	239837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315039
6617	NC_015138	CTC	2	6	239849	239854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315039
6618	NC_015138	CGT	2	6	239866	239871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315039
6619	NC_015138	CGC	2	6	239901	239906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315039
6620	NC_015138	CCCT	2	8	239939	239946	0 %	25 %	0 %	75 %	326315039
6621	NC_015138	GACC	2	8	240028	240035	25 %	0 %	25 %	50 %	326315039
6622	NC_015138	GAG	2	6	240071	240076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315039
6623	NC_015138	CAC	2	6	240149	240154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315039
6624	NC_015138	CCG	2	6	240210	240215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315039
6625	NC_015138	GCCC	2	8	240287	240294	0 %	0 %	25 %	75 %	326315040
6626	NC_015138	GCGCC	2	10	240298	240307	0 %	0 %	40 %	60 %	326315040
6627	NC_015138	TGCC	2	8	240317	240324	0 %	25 %	25 %	50 %	326315040
6628	NC_015138	GCA	2	6	240355	240360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315040
6629	NC_015138	TCG	2	6	240415	240420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315040
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6631	NC_015138	GCT	2	6	240494	240499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315040
6632	NC_015138	ACG	2	6	240502	240507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315040
6633	NC_015138	ACG	2	6	240522	240527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315040
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6637	NC_015138	GCTC	2	8	240646	240653	0 %	25 %	25 %	50 %	326315040
6638	NC_015138	GC	3	6	240763	240768	0 %	0 %	50 %	50 %	326315040
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6643	NC_015138	GTC	2	6	240975	240980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315040
6644	NC_015138	GGCC	2	8	240983	240990	0 %	0 %	50 %	50 %	326315040
6645	NC_015138	GAA	2	6	241004	241009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315040
6646	NC_015138	CGT	2	6	241043	241048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315040
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6649	NC_015138	CG	3	6	241264	241269	0 %	0 %	50 %	50 %	326315040
6650	NC_015138	TGC	2	6	241276	241281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315040
6651	NC_015138	GCT	2	6	241322	241327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315040
6652	NC_015138	GCA	2	6	241491	241496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6653	NC_015138	GC	3	6	241552	241557	0 %	0 %	50 %	50 %	326315041
6654	NC_015138	GGCC	2	8	241614	241621	0 %	0 %	50 %	50 %	326315041
6655	NC_015138	CG	3	6	241625	241630	0 %	0 %	50 %	50 %	326315041
6656	NC_015138	ACC	2	6	241640	241645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315041
6657	NC_015138	GCA	2	6	241652	241657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315041
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6663	NC_015138	CCG	2	6	241806	241811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315041
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6670	NC_015138	CCCG	2	8	242095	242102	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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6709	NC_015138	GTCGC	2	10	243730	243739	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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6731	NC_015138	GGCCT	2	10	244221	244230	0 %	20 %	40 %	40 %	326315044
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6740	NC_015138	GGA	2	6	244434	244439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315044
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6742	NC_015138	CG	3	6	244490	244495	0 %	0 %	50 %	50 %	326315044
6743	NC_015138	GGC	2	6	244524	244529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315044
6744	NC_015138	GC	3	6	244538	244543	0 %	0 %	50 %	50 %	326315044
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6746	NC_015138	TGC	2	6	244607	244612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315044
6747	NC_015138	GAC	2	6	244624	244629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315044
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6749	NC_015138	GCC	3	9	244677	244685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315044
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6752	NC_015138	GGC	2	6	244752	244757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315044
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6759	NC_015138	A	6	6	244986	244991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6763	NC_015138	GC	3	6	245048	245053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6991	NC_015138	TCG	2	6	253592	253597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315051
6992	NC_015138	GGTGAC	2	12	253605	253616	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	326315051
6993	NC_015138	GGC	2	6	253656	253661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315051
6994	NC_015138	CGT	2	6	253670	253675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315051
6995	NC_015138	CAG	2	6	253704	253709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315051
6996	NC_015138	GCG	2	6	253732	253737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315051
6997	NC_015138	CTG	2	6	253761	253766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315051
6998	NC_015138	GCG	2	6	253829	253834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315051
6999	NC_015138	TGGAA	2	10	253853	253862	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7000	NC_015138	CCG	3	9	253934	253942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315052

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