MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acetohalobium arabaticum DSM 5501 chromosome

Total Repeats: 63051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014378	ATT	2	6	1	6	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014378	TATT	2	8	53	60	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014378	ACA	2	6	68	73	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014378	TTA	2	6	86	91	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014378	T	8	8	121	128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014378	AG	3	6	155	160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014378	TAA	2	6	169	174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014378	T	6	6	205	210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014378	AT	3	6	233	238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014378	TAAAA	2	10	243	252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014378	TATT	2	8	265	272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014378	AAT	2	6	276	281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014378	CAT	3	9	296	304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014378	AGG	2	6	336	341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014378	A	6	6	354	359	100 %	0 %	0 %	0 %	302390798
16	NC_014378	AAG	2	6	382	387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390798
17	NC_014378	TAAG	2	8	412	419	50 %	25 %	25 %	0 %	302390798
18	NC_014378	TAATT	2	10	533	542	40 %	60 %	0 %	0 %	302390798
19	NC_014378	AATT	2	8	559	566	50 %	50 %	0 %	0 %	302390798
20	NC_014378	CTA	2	6	598	603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390798
21	NC_014378	AGA	2	6	608	613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390798
22	NC_014378	A	8	8	627	634	100 %	0 %	0 %	0 %	302390798
23	NC_014378	A	7	7	642	648	100 %	0 %	0 %	0 %	302390798
24	NC_014378	GAT	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390798
25	NC_014378	CTT	2	6	682	687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390798
26	NC_014378	GTA	3	9	724	732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390798
27	NC_014378	TGC	2	6	746	751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390798
28	NC_014378	TTTA	2	8	798	805	25 %	75 %	0 %	0 %	302390798
29	NC_014378	AC	3	6	828	833	50 %	0 %	0 %	50 %	302390798
30	NC_014378	ATGC	2	8	837	844	25 %	25 %	25 %	25 %	302390798
31	NC_014378	ATTAT	2	10	853	862	40 %	60 %	0 %	0 %	302390798
32	NC_014378	AGT	2	6	884	889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390798
33	NC_014378	AATT	3	12	919	930	50 %	50 %	0 %	0 %	302390798
34	NC_014378	TAA	2	6	962	967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390798
35	NC_014378	GAT	2	6	996	1001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390798
36	NC_014378	GAAC	2	8	1023	1030	50 %	0 %	25 %	25 %	302390798
37	NC_014378	AAG	2	6	1033	1038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390798
38	NC_014378	ATA	2	6	1083	1088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390798
39	NC_014378	CCT	2	6	1104	1109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302390798
40	NC_014378	ATTA	2	8	1160	1167	50 %	50 %	0 %	0 %	302390798
41	NC_014378	A	6	6	1215	1220	100 %	0 %	0 %	0 %	302390798
42	NC_014378	TA	3	6	1261	1266	50 %	50 %	0 %	0 %	302390798
43	NC_014378	ATTA	2	8	1310	1317	50 %	50 %	0 %	0 %	302390798
44	NC_014378	AGT	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390798
45	NC_014378	AACA	2	8	1340	1347	75 %	0 %	0 %	25 %	302390798
46	NC_014378	AAG	2	6	1372	1377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390798
47	NC_014378	ATT	2	6	1389	1394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390798
48	NC_014378	CTA	2	6	1396	1401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390798
49	NC_014378	CAGAAG	2	12	1402	1413	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	302390798
50	NC_014378	ATTAA	2	10	1422	1431	60 %	40 %	0 %	0 %	302390798
51	NC_014378	CAA	2	6	1434	1439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302390798
52	NC_014378	TAG	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390798
53	NC_014378	AGA	2	6	1469	1474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390798
54	NC_014378	TTC	2	6	1553	1558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390798
55	NC_014378	GGA	2	6	1584	1589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302390798
56	NC_014378	ACA	2	6	1599	1604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302390798
57	NC_014378	A	6	6	1635	1640	100 %	0 %	0 %	0 %	302390798
58	NC_014378	GAA	2	6	1641	1646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390798
59	NC_014378	AAATA	2	10	1682	1691	80 %	20 %	0 %	0 %	302390798
60	NC_014378	AAT	2	6	1692	1697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390798
61	NC_014378	CA	3	6	1705	1710	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014378	TAA	2	6	1725	1730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014378	ACTT	2	8	1795	1802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014378	AGT	2	6	1840	1845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014378	TAC	4	12	1880	1891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014378	T	6	6	1896	1901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014378	AT	3	6	1904	1909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014378	ATA	2	6	1915	1920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014378	TAA	2	6	1938	1943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014378	AGG	2	6	1953	1958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014378	A	6	6	1986	1991	100 %	0 %	0 %	0 %	302390799
72	NC_014378	ATG	2	6	1997	2002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390799
73	NC_014378	A	8	8	2081	2088	100 %	0 %	0 %	0 %	302390799
74	NC_014378	GTAGA	2	10	2129	2138	40 %	20 %	40 %	0 %	302390799
75	NC_014378	AGAATT	2	12	2217	2228	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302390799
76	NC_014378	AAAG	2	8	2235	2242	75 %	0 %	25 %	0 %	302390799
77	NC_014378	ATA	2	6	2243	2248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390799
78	NC_014378	TGA	2	6	2301	2306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390799
79	NC_014378	ATT	2	6	2313	2318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390799
80	NC_014378	GAT	2	6	2404	2409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390799
81	NC_014378	TTA	2	6	2437	2442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390799
82	NC_014378	A	6	6	2526	2531	100 %	0 %	0 %	0 %	302390799
83	NC_014378	ATT	2	6	2542	2547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390799
84	NC_014378	TAAG	2	8	2570	2577	50 %	25 %	25 %	0 %	302390799
85	NC_014378	AGA	2	6	2589	2594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390799
86	NC_014378	TAT	2	6	2652	2657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390799
87	NC_014378	AAATT	2	10	2723	2732	60 %	40 %	0 %	0 %	302390799
88	NC_014378	A	6	6	2737	2742	100 %	0 %	0 %	0 %	302390799
89	NC_014378	CTA	2	6	2756	2761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390799
90	NC_014378	ATT	2	6	2797	2802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390799
91	NC_014378	TGA	2	6	2895	2900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390799
92	NC_014378	ATT	2	6	2924	2929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390799
93	NC_014378	GAA	2	6	2959	2964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390799
94	NC_014378	AAG	2	6	3008	3013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390799
95	NC_014378	AGG	2	6	3063	3068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302390799
96	NC_014378	GA	3	6	3077	3082	50 %	0 %	50 %	0 %	302390800
97	NC_014378	TGG	2	6	3149	3154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302390800
98	NC_014378	A	7	7	3173	3179	100 %	0 %	0 %	0 %	302390800
99	NC_014378	A	6	6	3208	3213	100 %	0 %	0 %	0 %	302390800
100	NC_014378	AGAT	2	8	3250	3257	50 %	25 %	25 %	0 %	302390800
101	NC_014378	GAA	2	6	3261	3266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390800
102	NC_014378	TAA	2	6	3274	3279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390800
103	NC_014378	TAA	2	6	3282	3287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390800
104	NC_014378	AAT	2	6	3305	3310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014378	A	6	6	3334	3339	100 %	0 %	0 %	0 %	302390801
106	NC_014378	CTAT	3	12	3435	3446	25 %	50 %	0 %	25 %	302390801
107	NC_014378	TA	3	6	3515	3520	50 %	50 %	0 %	0 %	302390801
108	NC_014378	A	7	7	3580	3586	100 %	0 %	0 %	0 %	302390801
109	NC_014378	ATA	2	6	3603	3608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390801
110	NC_014378	AGA	2	6	3622	3627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390801
111	NC_014378	GAA	2	6	3702	3707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390801
112	NC_014378	TTA	2	6	3711	3716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390801
113	NC_014378	TTA	3	9	3742	3750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390801
114	NC_014378	TAA	2	6	3790	3795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390801
115	NC_014378	CTA	2	6	3797	3802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390801
116	NC_014378	AAT	2	6	3880	3885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390801
117	NC_014378	ATCA	2	8	3981	3988	50 %	25 %	0 %	25 %	302390801
118	NC_014378	CTA	2	6	4014	4019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390801
119	NC_014378	AGA	2	6	4021	4026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390801
120	NC_014378	A	7	7	4045	4051	100 %	0 %	0 %	0 %	302390801
121	NC_014378	AGAA	2	8	4068	4075	75 %	0 %	25 %	0 %	302390801
122	NC_014378	GAG	2	6	4083	4088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302390801
123	NC_014378	GAT	2	6	4112	4117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390801
124	NC_014378	AAAT	2	8	4128	4135	75 %	25 %	0 %	0 %	302390801
125	NC_014378	CAG	2	6	4169	4174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302390801
126	NC_014378	CTG	2	6	4179	4184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390801
127	NC_014378	TAT	2	6	4248	4253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390801
128	NC_014378	GAT	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390801
129	NC_014378	ATA	2	6	4278	4283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390801
130	NC_014378	CAA	2	6	4289	4294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302390801
131	NC_014378	TATT	2	8	4295	4302	25 %	75 %	0 %	0 %	302390801
132	NC_014378	AAAT	2	8	4347	4354	75 %	25 %	0 %	0 %	302390801
133	NC_014378	A	7	7	4371	4377	100 %	0 %	0 %	0 %	302390801
134	NC_014378	TAA	2	6	4442	4447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390802
135	NC_014378	AATTTA	2	12	4470	4481	50 %	50 %	0 %	0 %	302390802
136	NC_014378	AAAGA	2	10	4494	4503	80 %	0 %	20 %	0 %	302390802
137	NC_014378	A	7	7	4544	4550	100 %	0 %	0 %	0 %	302390802
138	NC_014378	TTTA	2	8	4583	4590	25 %	75 %	0 %	0 %	302390802
139	NC_014378	TAA	2	6	4598	4603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390802
140	NC_014378	TCA	2	6	4616	4621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390802
141	NC_014378	T	7	7	4627	4633	0 %	100 %	0 %	0 %	302390802
142	NC_014378	AGA	2	6	4637	4642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390802
143	NC_014378	TAAA	2	8	4657	4664	75 %	25 %	0 %	0 %	302390802
144	NC_014378	A	6	6	4662	4667	100 %	0 %	0 %	0 %	302390802
145	NC_014378	A	6	6	4675	4680	100 %	0 %	0 %	0 %	302390802
146	NC_014378	TCAA	2	8	4710	4717	50 %	25 %	0 %	25 %	302390802
147	NC_014378	ATTTA	2	10	4757	4766	40 %	60 %	0 %	0 %	302390802
148	NC_014378	AGA	2	6	4787	4792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390802
149	NC_014378	ACTAA	2	10	4809	4818	60 %	20 %	0 %	20 %	302390802
150	NC_014378	A	7	7	4875	4881	100 %	0 %	0 %	0 %	302390802
151	NC_014378	GAAA	2	8	4892	4899	75 %	0 %	25 %	0 %	302390802
152	NC_014378	AAG	2	6	4900	4905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390802
153	NC_014378	ATT	2	6	4921	4926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390802
154	NC_014378	AGA	2	6	5003	5008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390802
155	NC_014378	GAA	2	6	5040	5045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390802
156	NC_014378	CTT	2	6	5054	5059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390802
157	NC_014378	AATT	2	8	5101	5108	50 %	50 %	0 %	0 %	302390802
158	NC_014378	AAAAG	2	10	5129	5138	80 %	0 %	20 %	0 %	302390802
159	NC_014378	CAA	2	6	5153	5158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302390802
160	NC_014378	AAT	2	6	5163	5168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390802
161	NC_014378	AAG	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390802
162	NC_014378	AAG	2	6	5263	5268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390802
163	NC_014378	AGG	2	6	5310	5315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014378	TGT	2	6	5326	5331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302390803
165	NC_014378	CTA	2	6	5359	5364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390803
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168	NC_014378	TTA	2	6	5449	5454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390803
169	NC_014378	AT	3	6	5518	5523	50 %	50 %	0 %	0 %	302390803
170	NC_014378	ATT	2	6	5575	5580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390803
171	NC_014378	TCA	2	6	5594	5599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_014378	ATG	2	6	5662	5667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390804
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174	NC_014378	CAT	2	6	5754	5759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390804
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176	NC_014378	TTA	2	6	5827	5832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390804
177	NC_014378	GTA	2	6	5847	5852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390804
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181	NC_014378	CAG	2	6	5911	5916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302390804
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184	NC_014378	GGAGTA	2	12	5994	6005	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302390804
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235	NC_014378	ATGCA	2	10	7736	7745	40 %	20 %	20 %	20 %	302390805
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251	NC_014378	TAAA	2	8	8534	8541	75 %	25 %	0 %	0 %	302390805
252	NC_014378	ATT	2	6	8578	8583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390805
253	NC_014378	AGT	2	6	8664	8669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390805
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255	NC_014378	AGT	2	6	8760	8765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390805
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261	NC_014378	GAA	2	6	9091	9096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390805
262	NC_014378	ATA	2	6	9116	9121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390805
263	NC_014378	AAT	2	6	9180	9185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390805
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265	NC_014378	ATT	2	6	9337	9342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390805
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270	NC_014378	AGAAC	2	10	9451	9460	60 %	0 %	20 %	20 %	302390805
271	NC_014378	ACA	2	6	9507	9512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302390805
272	NC_014378	ATG	2	6	9515	9520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390805
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