MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acetohalobium arabaticum DSM 5501 chromosome

Total Repeats: 63051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014378	T	6	6	220030	220035	0 %	100 %	0 %	0 %	302391008
5502	NC_014378	ATG	2	6	220036	220041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391008
5503	NC_014378	ATT	2	6	220128	220133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391008
5504	NC_014378	TGG	2	6	220148	220153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302391008
5505	NC_014378	AG	3	6	220173	220178	50 %	0 %	50 %	0 %	302391008
5506	NC_014378	AGTAGC	2	12	220244	220255	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302391008
5507	NC_014378	AGT	2	6	220283	220288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391008
5508	NC_014378	CTGAAG	2	12	220362	220373	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302391008
5509	NC_014378	AGA	2	6	220394	220399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391008
5510	NC_014378	TGA	2	6	220528	220533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391008
5511	NC_014378	TCG	2	6	220580	220585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302391008
5512	NC_014378	AGA	2	6	220637	220642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391008
5513	NC_014378	AGA	2	6	220693	220698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391008
5514	NC_014378	CTT	2	6	220744	220749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302391008
5515	NC_014378	GAA	2	6	220763	220768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391008
5516	NC_014378	ATT	2	6	220815	220820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391008
5517	NC_014378	CA	3	6	220893	220898	50 %	0 %	0 %	50 %	302391008
5518	NC_014378	GAAGGA	2	12	220905	220916	50 %	0 %	50 %	0 %	302391008
5519	NC_014378	AGA	2	6	220976	220981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391008
5520	NC_014378	ATCT	2	8	220983	220990	25 %	50 %	0 %	25 %	302391008
5521	NC_014378	ATG	2	6	221023	221028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391008
5522	NC_014378	TGG	2	6	221134	221139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302391008
5523	NC_014378	AGT	2	6	221197	221202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_014378	CTG	2	6	221224	221229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_014378	TAG	2	6	221252	221257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_014378	ATTA	2	8	221262	221269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_014378	TAGA	2	8	221319	221326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_014378	AGA	2	6	221330	221335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_014378	AAG	2	6	221372	221377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391009
5530	NC_014378	TGC	2	6	221383	221388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302391009
5531	NC_014378	CTA	3	9	221417	221425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302391009
5532	NC_014378	T	6	6	221474	221479	0 %	100 %	0 %	0 %	302391009
5533	NC_014378	CTGT	2	8	221516	221523	0 %	50 %	25 %	25 %	302391009
5534	NC_014378	TAA	2	6	221599	221604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302391009
5535	NC_014378	T	6	6	221612	221617	0 %	100 %	0 %	0 %	302391009
5536	NC_014378	TGC	2	6	221677	221682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302391009
5537	NC_014378	CTG	2	6	221735	221740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302391009
5538	NC_014378	TAT	2	6	221761	221766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391009
5539	NC_014378	TTA	2	6	221789	221794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391009
5540	NC_014378	CTA	2	6	221817	221822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302391009
5541	NC_014378	TTGGAG	2	12	221825	221836	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	302391009
5542	NC_014378	GCT	2	6	221860	221865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302391009
5543	NC_014378	G	6	6	221883	221888	0 %	0 %	100 %	0 %	302391009
5544	NC_014378	T	6	6	221911	221916	0 %	100 %	0 %	0 %	302391009
5545	NC_014378	TTG	2	6	221948	221953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302391009
5546	NC_014378	GTT	2	6	222032	222037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302391009
5547	NC_014378	ATG	2	6	222044	222049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391009
5548	NC_014378	AT	3	6	222069	222074	50 %	50 %	0 %	0 %	302391009
5549	NC_014378	GAA	2	6	222095	222100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391009
5550	NC_014378	A	7	7	222103	222109	100 %	0 %	0 %	0 %	302391009
5551	NC_014378	AG	3	6	222140	222145	50 %	0 %	50 %	0 %	302391009
5552	NC_014378	GTTTTA	2	12	222161	222172	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302391009
5553	NC_014378	GCG	2	6	222234	222239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302391009
5554	NC_014378	TGT	2	6	222250	222255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302391009
5555	NC_014378	GTA	2	6	222260	222265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391009
5556	NC_014378	AT	3	6	222286	222291	50 %	50 %	0 %	0 %	302391009
5557	NC_014378	GGA	2	6	222317	222322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302391009
5558	NC_014378	GTT	2	6	222329	222334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302391009
5559	NC_014378	GTCT	2	8	222422	222429	0 %	50 %	25 %	25 %	302391009
5560	NC_014378	AGC	2	6	222472	222477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302391009
5561	NC_014378	TTC	2	6	222619	222624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302391009
5562	NC_014378	TA	3	6	222692	222697	50 %	50 %	0 %	0 %	302391009
5563	NC_014378	AGG	2	6	222753	222758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_014378	AAT	2	6	222774	222779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302391010
5565	NC_014378	CTTAT	2	10	222781	222790	20 %	60 %	0 %	20 %	302391010
5566	NC_014378	CAG	2	6	222959	222964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302391010
5567	NC_014378	AAG	2	6	222979	222984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391010
5568	NC_014378	GAT	2	6	223135	223140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391010
5569	NC_014378	TAT	2	6	223216	223221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391010
5570	NC_014378	ACA	2	6	223239	223244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302391010
5571	NC_014378	T	6	6	223319	223324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_014378	AT	3	6	223336	223341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_014378	AGC	2	6	223359	223364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_014378	AGAA	2	8	223371	223378	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_014378	AT	3	6	223468	223473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_014378	GCA	2	6	223486	223491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_014378	CCCG	2	8	223518	223525	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5578	NC_014378	TTA	2	6	223551	223556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_014378	TTAG	2	8	223623	223630	25 %	50 %	25 %	0 %	302391011
5580	NC_014378	CTT	2	6	223724	223729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302391011
5581	NC_014378	TAT	2	6	223901	223906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391011
5582	NC_014378	T	6	6	223939	223944	0 %	100 %	0 %	0 %	302391011
5583	NC_014378	T	6	6	223969	223974	0 %	100 %	0 %	0 %	302391011
5584	NC_014378	TC	3	6	224016	224021	0 %	50 %	0 %	50 %	302391011
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5587	NC_014378	AG	3	6	224090	224095	50 %	0 %	50 %	0 %	302391011
5588	NC_014378	CTT	2	6	224099	224104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302391011
5589	NC_014378	ATA	2	6	224229	224234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302391011
5590	NC_014378	CTTT	2	8	224235	224242	0 %	75 %	0 %	25 %	302391011
5591	NC_014378	TTA	2	6	224250	224255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391011
5592	NC_014378	AATC	2	8	224314	224321	50 %	25 %	0 %	25 %	302391011
5593	NC_014378	TTTTTA	2	12	224322	224333	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	302391011
5594	NC_014378	ATG	2	6	224372	224377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391011
5595	NC_014378	T	6	6	224402	224407	0 %	100 %	0 %	0 %	302391011
5596	NC_014378	TA	4	8	224503	224510	50 %	50 %	0 %	0 %	302391011
5597	NC_014378	TAT	2	6	224515	224520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391011
5598	NC_014378	GGT	2	6	224538	224543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302391011
5599	NC_014378	AAAG	2	8	224573	224580	75 %	0 %	25 %	0 %	302391011
5600	NC_014378	ATT	2	6	224588	224593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391011
5601	NC_014378	ATA	2	6	224594	224599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302391011
5602	NC_014378	TTG	2	6	224600	224605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302391011
5603	NC_014378	TGAA	2	8	224627	224634	50 %	25 %	25 %	0 %	302391011
5604	NC_014378	AT	3	6	224692	224697	50 %	50 %	0 %	0 %	302391011
5605	NC_014378	ACTA	2	8	224726	224733	50 %	25 %	0 %	25 %	302391011
5606	NC_014378	GTT	2	6	224767	224772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302391011
5607	NC_014378	TTG	2	6	224783	224788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302391011
5608	NC_014378	GTA	2	6	224797	224802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391011
5609	NC_014378	TA	3	6	224801	224806	50 %	50 %	0 %	0 %	302391011
5610	NC_014378	CCT	2	6	224827	224832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5611	NC_014378	TAT	2	6	224845	224850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_014378	A	6	6	224924	224929	100 %	0 %	0 %	0 %	302391012
5613	NC_014378	ACT	2	6	224946	224951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302391012
5614	NC_014378	ATG	2	6	224959	224964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391012
5615	NC_014378	TGA	2	6	225023	225028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391012
5616	NC_014378	AG	3	6	225057	225062	50 %	0 %	50 %	0 %	302391012
5617	NC_014378	AATTTT	2	12	225063	225074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391012
5618	NC_014378	TCA	2	6	225182	225187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302391013
5619	NC_014378	AT	4	8	225251	225258	50 %	50 %	0 %	0 %	302391013
5620	NC_014378	GCA	2	6	225261	225266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302391013
5621	NC_014378	AGGC	2	8	225299	225306	25 %	0 %	50 %	25 %	302391013
5622	NC_014378	TC	3	6	225321	225326	0 %	50 %	0 %	50 %	302391013
5623	NC_014378	TAAT	2	8	225356	225363	50 %	50 %	0 %	0 %	302391013
5624	NC_014378	CTT	2	6	225403	225408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302391013
5625	NC_014378	CTG	2	6	225417	225422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302391013
5626	NC_014378	TAA	2	6	225453	225458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302391013
5627	NC_014378	AGAT	2	8	225468	225475	50 %	25 %	25 %	0 %	302391013
5628	NC_014378	TC	3	6	225480	225485	0 %	50 %	0 %	50 %	302391013
5629	NC_014378	TCT	2	6	225497	225502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302391013
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5632	NC_014378	CTG	2	6	225646	225651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302391013
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5646	NC_014378	TCTTT	2	10	226176	226185	0 %	80 %	0 %	20 %	302391013
5647	NC_014378	GTAT	2	8	226248	226255	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5648	NC_014378	TA	3	6	226354	226359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5649	NC_014378	TATT	2	8	226416	226423	25 %	75 %	0 %	0 %	302391014
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5696	NC_014378	AGG	2	6	228541	228546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5699	NC_014378	TTA	2	6	228665	228670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5700	NC_014378	ATTTAC	2	12	228688	228699	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302391015
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5727	NC_014378	AAAG	2	8	230228	230235	75 %	0 %	25 %	0 %	302391016
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5732	NC_014378	TCAAT	2	10	230368	230377	40 %	40 %	0 %	20 %	302391016
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5734	NC_014378	TAA	2	6	230401	230406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302391016
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5736	NC_014378	TGT	2	6	230437	230442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302391016
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5740	NC_014378	ATG	2	6	230586	230591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391016
5741	NC_014378	TGA	2	6	230608	230613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391016
5742	NC_014378	TGA	2	6	230644	230649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391016
5743	NC_014378	CGG	2	6	230678	230683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302391016
5744	NC_014378	AG	3	6	230699	230704	50 %	0 %	50 %	0 %	302391016
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5999	NC_014378	AGG	2	6	240286	240291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302391023
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