MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acetohalobium arabaticum DSM 5501 chromosome

Total Repeats: 63051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_014378	AGA	2	6	2189352	2189357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302392822
56002	NC_014378	ACA	2	6	2189371	2189376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302392822
56003	NC_014378	AAT	2	6	2189436	2189441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392822
56004	NC_014378	CTAAC	2	10	2189463	2189472	40 %	20 %	0 %	40 %	302392823
56005	NC_014378	CTG	2	6	2189517	2189522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302392823
56006	NC_014378	ATA	2	6	2189529	2189534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392823
56007	NC_014378	AGC	2	6	2189553	2189558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302392823
56008	NC_014378	CGG	2	6	2189577	2189582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302392823
56009	NC_014378	ATA	2	6	2189586	2189591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392823
56010	NC_014378	TTACC	2	10	2189672	2189681	20 %	40 %	0 %	40 %	302392823
56011	NC_014378	TCT	2	6	2189687	2189692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392823
56012	NC_014378	ACT	2	6	2189731	2189736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392823
56013	NC_014378	AGC	2	6	2189751	2189756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302392823
56014	NC_014378	TTAT	2	8	2189767	2189774	25 %	75 %	0 %	0 %	302392823
56015	NC_014378	GCT	2	6	2189786	2189791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302392823
56016	NC_014378	ATT	2	6	2189796	2189801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392823
56017	NC_014378	ACTGAA	2	12	2189832	2189843	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302392823
56018	NC_014378	CAG	2	6	2189862	2189867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302392823
56019	NC_014378	CTA	2	6	2189906	2189911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392823
56020	NC_014378	CTAT	2	8	2189914	2189921	25 %	50 %	0 %	25 %	302392823
56021	NC_014378	CAG	2	6	2189981	2189986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302392823
56022	NC_014378	CAT	2	6	2189987	2189992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392823
56023	NC_014378	AATA	2	8	2190116	2190123	75 %	25 %	0 %	0 %	302392823
56024	NC_014378	GCA	2	6	2190146	2190151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302392823
56025	NC_014378	CTG	2	6	2190159	2190164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302392823
56026	NC_014378	AGC	2	6	2190183	2190188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302392823
56027	NC_014378	CTA	2	6	2190197	2190202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392823
56028	NC_014378	CCT	2	6	2190208	2190213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302392823
56029	NC_014378	CAA	2	6	2190380	2190385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302392823
56030	NC_014378	ATA	2	6	2190392	2190397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392823
56031	NC_014378	CTTC	2	8	2190403	2190410	0 %	50 %	0 %	50 %	302392823
56032	NC_014378	AAC	2	6	2190414	2190419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302392823
56033	NC_014378	TGC	2	6	2190420	2190425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302392823
56034	NC_014378	TCA	2	6	2190433	2190438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392823
56035	NC_014378	GAT	2	6	2190442	2190447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302392823
56036	NC_014378	TCC	2	6	2190521	2190526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302392824
56037	NC_014378	ATT	2	6	2190529	2190534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392824
56038	NC_014378	ATA	2	6	2190538	2190543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392824
56039	NC_014378	CTT	2	6	2190561	2190566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392824
56040	NC_014378	GCT	2	6	2190596	2190601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302392824
56041	NC_014378	CTATC	2	10	2190663	2190672	20 %	40 %	0 %	40 %	302392824
56042	NC_014378	GCC	2	6	2190696	2190701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302392824
56043	NC_014378	AGT	2	6	2190724	2190729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302392824
56044	NC_014378	TA	3	6	2190763	2190768	50 %	50 %	0 %	0 %	302392824
56045	NC_014378	T	6	6	2190787	2190792	0 %	100 %	0 %	0 %	302392824
56046	NC_014378	AAT	2	6	2190801	2190806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392824
56047	NC_014378	CTT	2	6	2190873	2190878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392824
56048	NC_014378	CGC	2	6	2191027	2191032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302392825
56049	NC_014378	ATT	2	6	2191085	2191090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392825
56050	NC_014378	ATCT	2	8	2191120	2191127	25 %	50 %	0 %	25 %	302392825
56051	NC_014378	CTC	2	6	2191145	2191150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302392825
56052	NC_014378	TCT	2	6	2191174	2191179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392825
56053	NC_014378	TA	3	6	2191288	2191293	50 %	50 %	0 %	0 %	302392825
56054	NC_014378	ATT	2	6	2191349	2191354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392825
56055	NC_014378	ACC	2	6	2191383	2191388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302392825
56056	NC_014378	CAT	2	6	2191507	2191512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392825
56057	NC_014378	AGAC	2	8	2191602	2191609	50 %	0 %	25 %	25 %	302392825
56058	NC_014378	TTTC	2	8	2191652	2191659	0 %	75 %	0 %	25 %	302392826
56059	NC_014378	TTA	2	6	2191684	2191689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392826
56060	NC_014378	AAT	2	6	2191698	2191703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392826
56061	NC_014378	TTAA	2	8	2191705	2191712	50 %	50 %	0 %	0 %	302392826
56062	NC_014378	CTC	2	6	2191821	2191826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302392826
56063	NC_014378	GCC	2	6	2191892	2191897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302392826
56064	NC_014378	AAT	2	6	2191963	2191968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392826
56065	NC_014378	ATA	2	6	2192017	2192022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392826
56066	NC_014378	TTTC	2	8	2192069	2192076	0 %	75 %	0 %	25 %	302392826
56067	NC_014378	TTA	2	6	2192087	2192092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392826
56068	NC_014378	TTA	2	6	2192152	2192157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56069	NC_014378	TATAA	2	10	2192179	2192188	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56070	NC_014378	TCT	2	6	2192189	2192194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392827
56071	NC_014378	TTC	2	6	2192203	2192208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392827
56072	NC_014378	ACT	3	9	2192245	2192253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392827
56073	NC_014378	CTG	3	9	2192285	2192293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302392827
56074	NC_014378	GCT	2	6	2192362	2192367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302392827
56075	NC_014378	CTG	2	6	2192375	2192380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302392827
56076	NC_014378	CCAG	2	8	2192416	2192423	25 %	0 %	25 %	50 %	302392827
56077	NC_014378	A	6	6	2192491	2192496	100 %	0 %	0 %	0 %	302392827
56078	NC_014378	ACC	2	6	2192526	2192531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302392827
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56080	NC_014378	CCGG	2	8	2192593	2192600	0 %	0 %	50 %	50 %	302392827
56081	NC_014378	CTA	2	6	2192666	2192671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392827
56082	NC_014378	ATC	2	6	2192719	2192724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392828
56083	NC_014378	TTAA	2	8	2192739	2192746	50 %	50 %	0 %	0 %	302392828
56084	NC_014378	TCC	2	6	2192778	2192783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302392828
56085	NC_014378	GCT	2	6	2192803	2192808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302392828
56086	NC_014378	ATC	2	6	2192810	2192815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392828
56087	NC_014378	CTG	2	6	2192835	2192840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302392828
56088	NC_014378	AT	3	6	2192901	2192906	50 %	50 %	0 %	0 %	302392828
56089	NC_014378	AAT	2	6	2192942	2192947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392828
56090	NC_014378	AGC	2	6	2193119	2193124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302392828
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56095	NC_014378	AT	3	6	2193331	2193336	50 %	50 %	0 %	0 %	302392828
56096	NC_014378	CCTGCT	2	12	2193355	2193366	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	302392828
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56100	NC_014378	TTC	2	6	2193575	2193580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392828
56101	NC_014378	TGA	2	6	2193660	2193665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302392828
56102	NC_014378	TTA	2	6	2193717	2193722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392828
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56106	NC_014378	TTA	2	6	2193978	2193983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392828
56107	NC_014378	ATA	2	6	2194022	2194027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392828
56108	NC_014378	ATA	2	6	2194097	2194102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392828
56109	NC_014378	ACTT	2	8	2194148	2194155	25 %	50 %	0 %	25 %	302392828
56110	NC_014378	CAT	2	6	2194228	2194233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392828
56111	NC_014378	TAAT	2	8	2194251	2194258	50 %	50 %	0 %	0 %	302392828
56112	NC_014378	TTC	2	6	2194271	2194276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392828
56113	NC_014378	AATTA	2	10	2194295	2194304	60 %	40 %	0 %	0 %	302392828
56114	NC_014378	TAAT	2	8	2194344	2194351	50 %	50 %	0 %	0 %	302392828
56115	NC_014378	ATCA	2	8	2194394	2194401	50 %	25 %	0 %	25 %	302392828
56116	NC_014378	TTA	2	6	2194473	2194478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392828
56117	NC_014378	AGTT	2	8	2194483	2194490	25 %	50 %	25 %	0 %	302392828
56118	NC_014378	TCC	2	6	2194518	2194523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302392828
56119	NC_014378	ATT	2	6	2194526	2194531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392828
56120	NC_014378	GCA	2	6	2194579	2194584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302392828
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56165	NC_014378	TA	3	6	2196921	2196926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56166	NC_014378	A	7	7	2196926	2196932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56167	NC_014378	TA	3	6	2196933	2196938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56168	NC_014378	AAT	2	6	2196989	2196994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56181	NC_014378	ATA	2	6	2197370	2197375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392833
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56203	NC_014378	CCGGA	2	10	2198579	2198588	20 %	0 %	40 %	40 %	302392833
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56219	NC_014378	TCT	2	6	2199246	2199251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392833
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56221	NC_014378	TTC	2	6	2199291	2199296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392833
56222	NC_014378	TATC	2	8	2199358	2199365	25 %	50 %	0 %	25 %	302392833
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56226	NC_014378	TAA	2	6	2199487	2199492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392833
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56229	NC_014378	CCT	2	6	2199614	2199619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56230	NC_014378	A	6	6	2199703	2199708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56231	NC_014378	CTT	2	6	2199750	2199755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392834
56232	NC_014378	TCA	3	9	2199812	2199820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392834
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56234	NC_014378	AT	3	6	2199875	2199880	50 %	50 %	0 %	0 %	302392834
56235	NC_014378	GCT	2	6	2199918	2199923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302392834
56236	NC_014378	ATC	2	6	2199998	2200003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392834
56237	NC_014378	TAT	2	6	2200006	2200011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392834
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56270	NC_014378	CAATA	2	10	2201121	2201130	60 %	20 %	0 %	20 %	302392836
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56305	NC_014378	GATT	2	8	2202884	2202891	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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56472	NC_014378	AGC	2	6	2209457	2209462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302392841
56473	NC_014378	GTA	2	6	2209490	2209495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302392841
56474	NC_014378	CGC	2	6	2209530	2209535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302392841
56475	NC_014378	GCC	2	6	2209606	2209611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302392841
56476	NC_014378	TAC	2	6	2209660	2209665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392841
56477	NC_014378	GCCG	2	8	2209701	2209708	0 %	0 %	50 %	50 %	302392841
56478	NC_014378	CTA	2	6	2209734	2209739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392841
56479	NC_014378	ATT	2	6	2209763	2209768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392841
56480	NC_014378	ATCGCC	2	12	2209771	2209782	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	302392841
56481	NC_014378	TCT	2	6	2209814	2209819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392841
56482	NC_014378	CAG	2	6	2209821	2209826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302392841
56483	NC_014378	GCT	2	6	2209949	2209954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302392841
56484	NC_014378	GCA	2	6	2209961	2209966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302392841
56485	NC_014378	CAA	2	6	2209968	2209973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302392841
56486	NC_014378	CTT	2	6	2210020	2210025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392841
56487	NC_014378	CTC	2	6	2210050	2210055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302392841
56488	NC_014378	AGA	2	6	2210109	2210114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302392841
56489	NC_014378	TCA	2	6	2210138	2210143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392841
56490	NC_014378	TCC	2	6	2210221	2210226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302392841
56491	NC_014378	CTA	2	6	2210256	2210261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392841
56492	NC_014378	ATG	2	6	2210273	2210278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302392841
56493	NC_014378	CAAC	2	8	2210319	2210326	50 %	0 %	0 %	50 %	302392841
56494	NC_014378	CCT	2	6	2210391	2210396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302392841
56495	NC_014378	ATT	2	6	2210536	2210541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56496	NC_014378	TTA	2	6	2210627	2210632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392842
56497	NC_014378	GGA	2	6	2210695	2210700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302392842
56498	NC_014378	TGA	2	6	2210756	2210761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302392842
56499	NC_014378	ATC	2	6	2210779	2210784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392842
56500	NC_014378	AAT	2	6	2210824	2210829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392842

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