MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aciduliprofundum boonei T469 chromosome

Total Repeats: 32047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013926	T	6	6	8	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013926	TCATA	2	10	19	28	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013926	AG	3	6	113	118	50 %	0 %	50 %	0 %	289595679
4	NC_013926	TTAC	2	8	133	140	25 %	50 %	0 %	25 %	289595679
5	NC_013926	CA	3	6	153	158	50 %	0 %	0 %	50 %	289595679
6	NC_013926	GATA	2	8	169	176	50 %	25 %	25 %	0 %	289595679
7	NC_013926	AGT	2	6	265	270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595679
8	NC_013926	GGGAA	2	10	280	289	40 %	0 %	60 %	0 %	289595679
9	NC_013926	AGA	2	6	318	323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595679
10	NC_013926	AT	3	6	335	340	50 %	50 %	0 %	0 %	289595679
11	NC_013926	TCC	2	6	375	380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595679
12	NC_013926	AGA	2	6	403	408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595679
13	NC_013926	TGA	2	6	478	483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595679
14	NC_013926	GTT	2	6	497	502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289595679
15	NC_013926	TGA	2	6	511	516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595679
16	NC_013926	GAT	2	6	545	550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595679
17	NC_013926	CTT	3	9	563	571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595679
18	NC_013926	TC	3	6	690	695	0 %	50 %	0 %	50 %	289595679
19	NC_013926	AT	3	6	720	725	50 %	50 %	0 %	0 %	289595679
20	NC_013926	GA	3	6	731	736	50 %	0 %	50 %	0 %	289595679
21	NC_013926	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595679
22	NC_013926	AGC	2	6	799	804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289595679
23	NC_013926	GA	4	8	866	873	50 %	0 %	50 %	0 %	289595679
24	NC_013926	TTCA	2	8	966	973	25 %	50 %	0 %	25 %	289595679
25	NC_013926	GAG	2	6	1004	1009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289595679
26	NC_013926	ACA	2	6	1017	1022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595679
27	NC_013926	TAC	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595679
28	NC_013926	AAG	2	6	1096	1101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595679
29	NC_013926	GACATG	2	12	1121	1132	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289595679
30	NC_013926	GATT	2	8	1137	1144	25 %	50 %	25 %	0 %	289595679
31	NC_013926	GAA	2	6	1176	1181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595679
32	NC_013926	ATA	2	6	1187	1192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595679
33	NC_013926	AAT	2	6	1225	1230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595679
34	NC_013926	A	6	6	1283	1288	100 %	0 %	0 %	0 %	289595679
35	NC_013926	CCT	2	6	1301	1306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595680
36	NC_013926	TCT	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595680
37	NC_013926	TAA	2	6	1597	1602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595680
38	NC_013926	CAA	2	6	1615	1620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595680
39	NC_013926	ATT	2	6	1650	1655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595680
40	NC_013926	T	7	7	1654	1660	0 %	100 %	0 %	0 %	289595680
41	NC_013926	AAG	2	6	1714	1719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595680
42	NC_013926	TTCCA	2	10	1759	1768	20 %	40 %	0 %	40 %	289595680
43	NC_013926	TAT	2	6	1793	1798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595680
44	NC_013926	TTC	2	6	1864	1869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595680
45	NC_013926	ACA	2	6	1884	1889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595680
46	NC_013926	TAACTA	2	12	1912	1923	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	289595680
47	NC_013926	TGC	2	6	1965	1970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289595680
48	NC_013926	AGG	2	6	1997	2002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289595680
49	NC_013926	AGCATA	2	12	2012	2023	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289595680
50	NC_013926	AG	4	8	2025	2032	50 %	0 %	50 %	0 %	289595680
51	NC_013926	TAT	2	6	2048	2053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595680
52	NC_013926	AAC	2	6	2063	2068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595680
53	NC_013926	TTA	2	6	2100	2105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595680
54	NC_013926	TTC	2	6	2108	2113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595680
55	NC_013926	AAAAAT	2	12	2136	2147	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013926	GAAA	2	8	2153	2160	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013926	TA	3	6	2164	2169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013926	GA	3	6	2212	2217	50 %	0 %	50 %	0 %	289595681
59	NC_013926	GGA	2	6	2243	2248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289595681
60	NC_013926	GTT	2	6	2255	2260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289595681
61	NC_013926	GAT	2	6	2261	2266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595681
62	NC_013926	CAAG	2	8	2295	2302	50 %	0 %	25 %	25 %	289595681
63	NC_013926	AAG	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595681
64	NC_013926	AAT	2	6	2407	2412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595681
65	NC_013926	AG	3	6	2418	2423	50 %	0 %	50 %	0 %	289595681
66	NC_013926	TGA	2	6	2449	2454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595681
67	NC_013926	GAG	2	6	2507	2512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289595681
68	NC_013926	AATA	2	8	2595	2602	75 %	25 %	0 %	0 %	289595681
69	NC_013926	T	6	6	2646	2651	0 %	100 %	0 %	0 %	289595682
70	NC_013926	CAT	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595682
71	NC_013926	GTTAT	2	10	2750	2759	20 %	60 %	20 %	0 %	289595682
72	NC_013926	TC	4	8	2773	2780	0 %	50 %	0 %	50 %	289595682
73	NC_013926	TGA	2	6	2820	2825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595682
74	NC_013926	TAC	2	6	2879	2884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595682
75	NC_013926	AAT	2	6	2898	2903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595682
76	NC_013926	TGG	2	6	2907	2912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289595682
77	NC_013926	TGC	2	6	2934	2939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289595682
78	NC_013926	A	7	7	2949	2955	100 %	0 %	0 %	0 %	289595682
79	NC_013926	AAT	2	6	3072	3077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595682
80	NC_013926	AAG	3	9	3104	3112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595682
81	NC_013926	GATT	2	8	3144	3151	25 %	50 %	25 %	0 %	289595682
82	NC_013926	A	7	7	3189	3195	100 %	0 %	0 %	0 %	289595682
83	NC_013926	TATC	2	8	3230	3237	25 %	50 %	0 %	25 %	289595682
84	NC_013926	A	6	6	3315	3320	100 %	0 %	0 %	0 %	289595682
85	NC_013926	CAT	2	6	3321	3326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595682
86	NC_013926	GT	3	6	3370	3375	0 %	50 %	50 %	0 %	289595682
87	NC_013926	CCA	2	6	3376	3381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289595682
88	NC_013926	GTG	2	6	3495	3500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013926	GAA	2	6	3513	3518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595683
90	NC_013926	GAAG	2	8	3522	3529	50 %	0 %	50 %	0 %	289595683
91	NC_013926	CT	3	6	3671	3676	0 %	50 %	0 %	50 %	289595683
92	NC_013926	ACTC	2	8	3700	3707	25 %	25 %	0 %	50 %	289595683
93	NC_013926	A	6	6	3982	3987	100 %	0 %	0 %	0 %	289595683
94	NC_013926	AT	3	6	4067	4072	50 %	50 %	0 %	0 %	289595683
95	NC_013926	TACT	2	8	4189	4196	25 %	50 %	0 %	25 %	289595683
96	NC_013926	TA	3	6	4275	4280	50 %	50 %	0 %	0 %	289595683
97	NC_013926	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595683
98	NC_013926	TGT	2	6	4366	4371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289595683
99	NC_013926	ATG	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595683
100	NC_013926	TAAAA	2	10	4476	4485	80 %	20 %	0 %	0 %	289595684
101	NC_013926	AAT	2	6	4602	4607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595684
102	NC_013926	AT	3	6	4606	4611	50 %	50 %	0 %	0 %	289595684
103	NC_013926	GAG	2	6	4618	4623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289595684
104	NC_013926	CAA	2	6	4740	4745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595684
105	NC_013926	AG	3	6	4750	4755	50 %	0 %	50 %	0 %	289595684
106	NC_013926	AGAT	2	8	4805	4812	50 %	25 %	25 %	0 %	289595684
107	NC_013926	GA	3	6	4825	4830	50 %	0 %	50 %	0 %	289595684
108	NC_013926	TAT	2	6	4837	4842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595684
109	NC_013926	GTT	2	6	4843	4848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289595684
110	NC_013926	ATTA	2	8	4881	4888	50 %	50 %	0 %	0 %	289595684
111	NC_013926	A	6	6	4951	4956	100 %	0 %	0 %	0 %	289595684
112	NC_013926	GAT	3	9	4990	4998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595684
113	NC_013926	TGGA	2	8	5069	5076	25 %	25 %	50 %	0 %	289595684
114	NC_013926	ACT	2	6	5125	5130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595684
115	NC_013926	AGA	2	6	5152	5157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595684
116	NC_013926	AGTT	2	8	5186	5193	25 %	50 %	25 %	0 %	289595684
117	NC_013926	TTG	2	6	5219	5224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289595684
118	NC_013926	AGA	2	6	5352	5357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595684
119	NC_013926	TTAG	2	8	5470	5477	25 %	50 %	25 %	0 %	289595684
120	NC_013926	ATGC	2	8	5587	5594	25 %	25 %	25 %	25 %	289595684
121	NC_013926	CCA	2	6	5632	5637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289595684
122	NC_013926	ATT	2	6	5680	5685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595684
123	NC_013926	GAAG	2	8	5703	5710	50 %	0 %	50 %	0 %	289595684
124	NC_013926	AGG	2	6	5719	5724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289595684
125	NC_013926	TAA	2	6	5774	5779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595684
126	NC_013926	GAA	2	6	5865	5870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595684
127	NC_013926	ATG	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595684
128	NC_013926	AGA	2	6	5905	5910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595684
129	NC_013926	A	6	6	5935	5940	100 %	0 %	0 %	0 %	289595684
130	NC_013926	ATT	2	6	5981	5986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595684
131	NC_013926	AGA	2	6	6009	6014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595684
132	NC_013926	ATT	2	6	6062	6067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595685
133	NC_013926	CTC	2	6	6085	6090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595685
134	NC_013926	CATA	2	8	6136	6143	50 %	25 %	0 %	25 %	289595685
135	NC_013926	CCATA	2	10	6153	6162	40 %	20 %	0 %	40 %	289595685
136	NC_013926	AGA	2	6	6211	6216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595685
137	NC_013926	ATG	2	6	6411	6416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595685
138	NC_013926	ATT	2	6	6420	6425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595685
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