MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN01

Total Repeats: 2162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013852	GGC	2	6	46320	46325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947725
1002	NC_013852	CGC	2	6	46334	46339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947725
1003	NC_013852	CG	3	6	46344	46349	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
1004	NC_013852	GCC	2	6	46443	46448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947725
1005	NC_013852	CGGCC	2	10	46482	46491	0 %	0 %	40 %	60 %	288947725
1006	NC_013852	GTCG	2	8	46563	46570	0 %	25 %	50 %	25 %	288947725
1007	NC_013852	CG	3	6	46595	46600	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
1008	NC_013852	GCC	2	6	46612	46617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947725
1009	NC_013852	CG	4	8	46650	46657	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
1010	NC_013852	TAG	2	6	46671	46676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947725
1011	NC_013852	TCG	2	6	46686	46691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1012	NC_013852	TCA	2	6	46765	46770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947725
1013	NC_013852	CGA	2	6	46852	46857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1014	NC_013852	GCGCG	2	10	46909	46918	0 %	0 %	60 %	40 %	288947725
1015	NC_013852	GC	3	6	46989	46994	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
1016	NC_013852	GCG	2	6	47018	47023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947725
1017	NC_013852	CGC	2	6	47029	47034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947725
1018	NC_013852	GCA	2	6	47035	47040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1019	NC_013852	AGC	2	6	47046	47051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1020	NC_013852	CG	3	6	47062	47067	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
1021	NC_013852	GTC	2	6	47090	47095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1022	NC_013852	GCA	2	6	47098	47103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1023	NC_013852	CG	3	6	47166	47171	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
1024	NC_013852	GTG	2	6	47205	47210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947725
1025	NC_013852	CGG	2	6	47272	47277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947725
1026	NC_013852	CGC	2	6	47332	47337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947725
1027	NC_013852	TCGC	2	8	47345	47352	0 %	25 %	25 %	50 %	288947725
1028	NC_013852	CGTC	2	8	47380	47387	0 %	25 %	25 %	50 %	288947725
1029	NC_013852	CG	3	6	47398	47403	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
1030	NC_013852	GAT	2	6	47432	47437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947725
1031	NC_013852	GGC	2	6	47473	47478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947725
1032	NC_013852	CCG	2	6	47526	47531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947725
1033	NC_013852	GTC	3	9	47549	47557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1034	NC_013852	GC	4	8	47599	47606	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
1035	NC_013852	TGA	2	6	47620	47625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947725
1036	NC_013852	TCG	2	6	47658	47663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1037	NC_013852	CAG	2	6	47666	47671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1038	NC_013852	GCA	2	6	47761	47766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1039	NC_013852	TCT	2	6	47782	47787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288947725
1040	NC_013852	CCG	2	6	47917	47922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947725
1041	NC_013852	ATG	2	6	47943	47948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947725
1042	NC_013852	CG	3	6	48004	48009	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
1043	NC_013852	CGGG	2	8	48052	48059	0 %	0 %	75 %	25 %	288947725
1044	NC_013852	GCG	2	6	48060	48065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947725
1045	NC_013852	GGC	2	6	48166	48171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947725
1046	NC_013852	CGC	2	6	48181	48186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947725
1047	NC_013852	CG	3	6	48249	48254	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
1048	NC_013852	GGC	3	9	48334	48342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947725
1049	NC_013852	CG	3	6	48394	48399	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
1050	NC_013852	GCT	2	6	48520	48525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1051	NC_013852	ACC	2	6	48531	48536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947725
1052	NC_013852	GTT	2	6	48542	48547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288947725
1053	NC_013852	CGG	2	6	48597	48602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947725
1054	NC_013852	CGCT	2	8	48603	48610	0 %	25 %	25 %	50 %	288947725
1055	NC_013852	TCGA	2	8	48618	48625	25 %	25 %	25 %	25 %	288947725
1056	NC_013852	GCA	2	6	48637	48642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1057	NC_013852	CCGG	2	8	48666	48673	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
1058	NC_013852	GCG	2	6	48785	48790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947725
1059	NC_013852	GGC	2	6	48805	48810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947725
1060	NC_013852	TCG	2	6	48903	48908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1061	NC_013852	CG	3	6	48916	48921	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
1062	NC_013852	GCA	2	6	48994	48999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1063	NC_013852	TCG	2	6	49044	49049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1064	NC_013852	CAG	2	6	49220	49225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1065	NC_013852	GC	3	6	49226	49231	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
1066	NC_013852	TCC	2	6	49233	49238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288947725
1067	NC_013852	GGCGAT	2	12	49244	49255	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	288947725
1068	NC_013852	GTC	2	6	49280	49285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1069	NC_013852	CAG	2	6	49316	49321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1070	NC_013852	GTG	2	6	49332	49337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947725
1071	NC_013852	ACC	2	6	49341	49346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947725
1072	NC_013852	CAT	2	6	49462	49467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947725
1073	NC_013852	AGC	2	6	49473	49478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1074	NC_013852	CCT	2	6	49519	49524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288947725
1075	NC_013852	CGGC	2	8	49632	49639	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
1076	NC_013852	TCC	2	6	49647	49652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288947725
1077	NC_013852	GCC	2	6	49682	49687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947725
1078	NC_013852	TCT	2	6	49747	49752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288947725
1079	NC_013852	GGCG	2	8	49753	49760	0 %	0 %	75 %	25 %	288947725
1080	NC_013852	AGA	2	6	49762	49767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288947725
1081	NC_013852	GCC	2	6	49775	49780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947725
1082	NC_013852	GCA	2	6	49810	49815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1083	NC_013852	GCTTG	2	10	49825	49834	0 %	40 %	40 %	20 %	288947725
1084	NC_013852	CGC	2	6	49879	49884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947725
1085	NC_013852	GCG	2	6	49929	49934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947725
1086	NC_013852	GTC	2	6	49937	49942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1087	NC_013852	GAC	2	6	49943	49948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1088	NC_013852	TGGCGG	2	12	49957	49968	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	288947725
1089	NC_013852	TGA	2	6	50011	50016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947725
1090	NC_013852	GACA	2	8	50064	50071	50 %	0 %	25 %	25 %	288947725
1091	NC_013852	TCG	2	6	50079	50084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1092	NC_013852	GGC	2	6	50093	50098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947725
1093	NC_013852	CGA	2	6	50155	50160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1094	NC_013852	CAGCCG	2	12	50180	50191	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	288947725
1095	NC_013852	GGCGC	2	10	50201	50210	0 %	0 %	60 %	40 %	288947725
1096	NC_013852	CG	4	8	50257	50264	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
1097	NC_013852	TCA	2	6	50287	50292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947725
1098	NC_013852	CAC	2	6	50312	50317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947725
1099	NC_013852	GC	3	6	50323	50328	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
1100	NC_013852	CCCG	2	8	50381	50388	0 %	0 %	25 %	75 %	288947725
1101	NC_013852	GTC	2	6	50410	50415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1102	NC_013852	CGA	2	6	50431	50436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1103	NC_013852	AGCG	2	8	50448	50455	25 %	0 %	50 %	25 %	288947725
1104	NC_013852	GGC	2	6	50585	50590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947725
1105	NC_013852	CCGC	2	8	50649	50656	0 %	0 %	25 %	75 %	288947725
1106	NC_013852	TAA	2	6	50722	50727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288947725
1107	NC_013852	TCC	2	6	50790	50795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288947725
1108	NC_013852	GGC	2	6	50802	50807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947725
1109	NC_013852	GC	3	6	50806	50811	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
1110	NC_013852	CGC	2	6	50857	50862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947725
1111	NC_013852	CAG	2	6	50882	50887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1112	NC_013852	TCG	2	6	50889	50894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947725
1113	NC_013852	GCC	2	6	50904	50909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947725
1114	NC_013852	GTG	2	6	50988	50993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947725
1115	NC_013852	GAT	2	6	51134	51139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947725
1116	NC_013852	CGGT	2	8	51282	51289	0 %	25 %	50 %	25 %	288947725
1117	NC_013852	TCCA	2	8	51336	51343	25 %	25 %	0 %	50 %	288947725
1118	NC_013852	GCG	2	6	51411	51416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_013852	CCG	2	6	51431	51436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_013852	CG	3	6	51498	51503	0 %	0 %	50 %	50 %	288947726
1121	NC_013852	CGG	2	6	51524	51529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947726
1122	NC_013852	CGC	2	6	51536	51541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947726
1123	NC_013852	GGC	2	6	51548	51553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947726
1124	NC_013852	CCA	2	6	51562	51567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947726
1125	NC_013852	CG	3	6	51593	51598	0 %	0 %	50 %	50 %	288947726
1126	NC_013852	TCA	2	6	51718	51723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947726
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1237	NC_013852	AAGT	2	8	57859	57866	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1255	NC_013852	CAA	2	6	58782	58787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288947735
1256	NC_013852	TGA	2	6	58792	58797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947735
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1260	NC_013852	GC	3	6	58970	58975	0 %	0 %	50 %	50 %	288947736
1261	NC_013852	CGG	2	6	58982	58987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947736
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1286	NC_013852	CTG	2	6	60322	60327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1287	NC_013852	ATCC	2	8	60367	60374	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1288	NC_013852	CGC	2	6	60385	60390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1289	NC_013852	CGG	3	9	60394	60402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1359	NC_013852	AGCA	2	8	62829	62836	50 %	0 %	25 %	25 %	288947741
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1378	NC_013852	CG	4	8	63758	63765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1379	NC_013852	GAA	2	6	63807	63812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1380	NC_013852	CGA	2	6	63854	63859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1381	NC_013852	CCA	2	6	63920	63925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1382	NC_013852	GC	3	6	63951	63956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1383	NC_013852	T	6	6	64027	64032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1384	NC_013852	T	6	6	64117	64122	0 %	100 %	0 %	0 %	288947744
1385	NC_013852	AAC	2	6	64251	64256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1386	NC_013852	TTA	2	6	64266	64271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1387	NC_013852	CAAACC	2	12	64289	64300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1388	NC_013852	GAT	2	6	64407	64412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1391	NC_013852	GC	3	6	64508	64513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1432	NC_013852	ACG	2	6	66395	66400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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