MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 81968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013851	CG	3	6	48	53	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013851	GCC	2	6	134	139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_013851	TCCAGT	2	12	159	170	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013851	ATC	2	6	179	184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013851	GCG	2	6	188	193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013851	CG	4	8	198	205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013851	CCG	2	6	206	211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_013851	GAC	2	6	224	229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013851	ATCA	2	8	268	275	50 %	25 %	0 %	25 %	288939765
10	NC_013851	CCG	2	6	296	301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939765
11	NC_013851	GCT	2	6	357	362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939765
12	NC_013851	GC	4	8	428	435	0 %	0 %	50 %	50 %	288939765
13	NC_013851	GC	5	10	515	524	0 %	0 %	50 %	50 %	288939765
14	NC_013851	CGCGC	2	10	563	572	0 %	0 %	40 %	60 %	288939765
15	NC_013851	TCG	2	6	611	616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939765
16	NC_013851	CG	3	6	636	641	0 %	0 %	50 %	50 %	288939765
17	NC_013851	CG	3	6	660	665	0 %	0 %	50 %	50 %	288939765
18	NC_013851	GGC	2	6	703	708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939765
19	NC_013851	GC	3	6	773	778	0 %	0 %	50 %	50 %	288939765
20	NC_013851	GTC	2	6	781	786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939765
21	NC_013851	TCG	2	6	806	811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939765
22	NC_013851	GAT	2	6	816	821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939765
23	NC_013851	AAG	2	6	856	861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939765
24	NC_013851	CGA	2	6	891	896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939765
25	NC_013851	TTC	2	6	937	942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939765
26	NC_013851	CTG	2	6	958	963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939765
27	NC_013851	GCA	2	6	972	977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939765
28	NC_013851	AGG	2	6	1007	1012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939765
29	NC_013851	GGA	2	6	1023	1028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939765
30	NC_013851	CCG	2	6	1075	1080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939765
31	NC_013851	CTT	2	6	1155	1160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939765
32	NC_013851	GCG	2	6	1167	1172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939765
33	NC_013851	TGG	2	6	1217	1222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939765
34	NC_013851	ACT	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939765
35	NC_013851	TCGC	2	8	1389	1396	0 %	25 %	25 %	50 %	288939765
36	NC_013851	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939765
37	NC_013851	CACGC	2	10	1504	1513	20 %	0 %	20 %	60 %	288939765
38	NC_013851	GCGAC	2	10	1538	1547	20 %	0 %	40 %	40 %	288939765
39	NC_013851	AC	3	6	1617	1622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013851	CGT	2	6	1748	1753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939766
41	NC_013851	CG	3	6	1803	1808	0 %	0 %	50 %	50 %	288939766
42	NC_013851	GAGGTC	2	12	1839	1850	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	288939766
43	NC_013851	CAG	2	6	1875	1880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939766
44	NC_013851	TGAG	2	8	1933	1940	25 %	25 %	50 %	0 %	288939766
45	NC_013851	GTC	2	6	1980	1985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939766
46	NC_013851	GCT	2	6	2015	2020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939766
47	NC_013851	CGG	3	9	2023	2031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939766
48	NC_013851	GGA	2	6	2051	2056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939766
49	NC_013851	GCA	2	6	2129	2134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939766
50	NC_013851	CTG	3	9	2160	2168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939766
51	NC_013851	CAA	2	6	2279	2284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288939766
52	NC_013851	CGATC	2	10	2324	2333	20 %	20 %	20 %	40 %	288939766
53	NC_013851	GAGC	2	8	2345	2352	25 %	0 %	50 %	25 %	288939766
54	NC_013851	GTG	2	6	2364	2369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939766
55	NC_013851	CCATGA	2	12	2377	2388	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	288939766
56	NC_013851	TCG	2	6	2398	2403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939766
57	NC_013851	GC	4	8	2483	2490	0 %	0 %	50 %	50 %	288939766
58	NC_013851	GCGT	2	8	2530	2537	0 %	25 %	50 %	25 %	288939766
59	NC_013851	AGG	3	9	2587	2595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939766
60	NC_013851	ACG	2	6	2620	2625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939766
61	NC_013851	GATG	2	8	2663	2670	25 %	25 %	50 %	0 %	288939766
62	NC_013851	CGA	2	6	2684	2689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939766
63	NC_013851	ATC	2	6	2700	2705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939766
64	NC_013851	GCG	2	6	2740	2745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939766
65	NC_013851	G	6	6	2747	2752	0 %	0 %	100 %	0 %	288939766
66	NC_013851	TCG	2	6	2767	2772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939766
67	NC_013851	GGA	2	6	2837	2842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013851	CGG	2	6	2990	2995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939767
69	NC_013851	CG	4	8	3085	3092	0 %	0 %	50 %	50 %	288939767
70	NC_013851	GGCCG	2	10	3115	3124	0 %	0 %	60 %	40 %	288939767
71	NC_013851	CAC	2	6	3127	3132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939767
72	NC_013851	GTG	2	6	3188	3193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939767
73	NC_013851	AAGG	2	8	3209	3216	50 %	0 %	50 %	0 %	288939767
74	NC_013851	CGTG	2	8	3226	3233	0 %	25 %	50 %	25 %	288939767
75	NC_013851	CATC	2	8	3235	3242	25 %	25 %	0 %	50 %	288939767
76	NC_013851	CGC	2	6	3243	3248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939767
77	NC_013851	CTGGA	2	10	3359	3368	20 %	20 %	40 %	20 %	288939767
78	NC_013851	CG	3	6	3417	3422	0 %	0 %	50 %	50 %	288939767
79	NC_013851	TTCG	2	8	3447	3454	0 %	50 %	25 %	25 %	288939767
80	NC_013851	GC	3	6	3520	3525	0 %	0 %	50 %	50 %	288939767
81	NC_013851	GCG	2	6	3567	3572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939767
82	NC_013851	GC	3	6	3674	3679	0 %	0 %	50 %	50 %	288939767
83	NC_013851	GGCC	2	8	3691	3698	0 %	0 %	50 %	50 %	288939767
84	NC_013851	GCG	2	6	3736	3741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939767
85	NC_013851	CG	3	6	3750	3755	0 %	0 %	50 %	50 %	288939767
86	NC_013851	GCC	2	6	3791	3796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939767
87	NC_013851	GCT	2	6	3838	3843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939767
88	NC_013851	CG	3	6	3930	3935	0 %	0 %	50 %	50 %	288939767
89	NC_013851	TG	3	6	4187	4192	0 %	50 %	50 %	0 %	288939768
90	NC_013851	GC	3	6	4204	4209	0 %	0 %	50 %	50 %	288939768
91	NC_013851	CCG	2	6	4214	4219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939768
92	NC_013851	CGC	2	6	4335	4340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939768
93	NC_013851	CGG	2	6	4433	4438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939768
94	NC_013851	AGC	2	6	4477	4482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939768
95	NC_013851	TGTTC	2	10	4525	4534	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_013851	CGTG	2	8	4555	4562	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013851	CGGTC	2	10	4579	4588	0 %	20 %	40 %	40 %	288939769
98	NC_013851	CAG	2	6	4609	4614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939769
99	NC_013851	CAG	2	6	4618	4623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939769
100	NC_013851	GCC	2	6	4634	4639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939769
101	NC_013851	CGCCA	2	10	4640	4649	20 %	0 %	20 %	60 %	288939769
102	NC_013851	AGG	2	6	4673	4678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939769
103	NC_013851	CTC	2	6	4762	4767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939769
104	NC_013851	CAG	2	6	4810	4815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939769
105	NC_013851	GCC	2	6	4931	4936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939769
106	NC_013851	GC	3	6	4981	4986	0 %	0 %	50 %	50 %	288939769
107	NC_013851	GTG	2	6	5005	5010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939769
108	NC_013851	CCG	2	6	5144	5149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939769
109	NC_013851	CGCT	2	8	5162	5169	0 %	25 %	25 %	50 %	288939769
110	NC_013851	CGGGCG	2	12	5174	5185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939769
111	NC_013851	CGC	2	6	5221	5226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939769
112	NC_013851	GCC	2	6	5227	5232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939769
113	NC_013851	TGG	2	6	5282	5287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939769
114	NC_013851	GGC	2	6	5431	5436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939769
115	NC_013851	GCC	2	6	5471	5476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939769
116	NC_013851	GTTG	2	8	5515	5522	0 %	50 %	50 %	0 %	288939769
117	NC_013851	GAG	2	6	5556	5561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939769
118	NC_013851	CGA	2	6	5762	5767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939770
119	NC_013851	GTC	2	6	5782	5787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939770
120	NC_013851	GCGG	2	8	5793	5800	0 %	0 %	75 %	25 %	288939770
121	NC_013851	ACG	2	6	5809	5814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939770
122	NC_013851	CCG	2	6	5816	5821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939770
123	NC_013851	GC	3	6	6000	6005	0 %	0 %	50 %	50 %	288939770
124	NC_013851	CAT	2	6	6009	6014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939770
125	NC_013851	ATCC	2	8	6082	6089	25 %	25 %	0 %	50 %	288939770
126	NC_013851	GC	3	6	6092	6097	0 %	0 %	50 %	50 %	288939770
127	NC_013851	TAA	2	6	6164	6169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288939770
128	NC_013851	TCC	2	6	6269	6274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939770
129	NC_013851	ATC	2	6	6322	6327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939770
130	NC_013851	GCG	2	6	6383	6388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939770
131	NC_013851	AGC	2	6	6446	6451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939770
132	NC_013851	ACGC	2	8	6496	6503	25 %	0 %	25 %	50 %	288939770
133	NC_013851	GAA	2	6	6505	6510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939770
134	NC_013851	TCG	2	6	6533	6538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939770
135	NC_013851	ACC	2	6	6567	6572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939770
136	NC_013851	GGTC	2	8	6660	6667	0 %	25 %	50 %	25 %	288939770
137	NC_013851	CGC	2	6	6700	6705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939770
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151	NC_013851	GCCGA	2	10	7525	7534	20 %	0 %	40 %	40 %	288939771
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213	NC_013851	ATGTC	2	10	10270	10279	20 %	40 %	20 %	20 %	288939773
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251	NC_013851	GCGCC	2	10	12422	12431	0 %	0 %	40 %	60 %	288939776
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257	NC_013851	GC	4	8	12743	12750	0 %	0 %	50 %	50 %	288939776
258	NC_013851	CTGG	2	8	12753	12760	0 %	25 %	50 %	25 %	288939776
259	NC_013851	GGCG	2	8	12761	12768	0 %	0 %	75 %	25 %	288939776
260	NC_013851	TTC	2	6	12780	12785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939776
261	NC_013851	AGCC	2	8	12787	12794	25 %	0 %	25 %	50 %	288939776
262	NC_013851	CGGG	2	8	12839	12846	0 %	0 %	75 %	25 %	288939776
263	NC_013851	GATC	2	8	12854	12861	25 %	25 %	25 %	25 %	288939776
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266	NC_013851	GC	3	6	12965	12970	0 %	0 %	50 %	50 %	288939776
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268	NC_013851	CGG	2	6	13088	13093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939776
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490	NC_013851	ACTG	2	8	21866	21873	25 %	25 %	25 %	25 %	288939784
491	NC_013851	CGA	2	6	21919	21924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939784
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493	NC_013851	CG	3	6	22016	22021	0 %	0 %	50 %	50 %	288939784
494	NC_013851	CGG	2	6	22031	22036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939784
495	NC_013851	CGC	2	6	22146	22151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939784
496	NC_013851	TCG	2	6	22270	22275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939784
497	NC_013851	CGA	2	6	22304	22309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939784
498	NC_013851	GCA	2	6	22310	22315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939784
499	NC_013851	GC	3	6	22385	22390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
500	NC_013851	GCA	2	6	22457	22462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939785

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