MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 81968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013851	ATG	2	6	197943	197948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939944
4502	NC_013851	GCCG	2	8	197951	197958	0 %	0 %	50 %	50 %	288939944
4503	NC_013851	GGA	2	6	198016	198021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939944
4504	NC_013851	CAG	2	6	198059	198064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939944
4505	NC_013851	GAC	2	6	198071	198076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939944
4506	NC_013851	TGA	2	6	198079	198084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939944
4507	NC_013851	CG	3	6	198098	198103	0 %	0 %	50 %	50 %	288939944
4508	NC_013851	GCA	2	6	198133	198138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939944
4509	NC_013851	GCC	2	6	198171	198176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939944
4510	NC_013851	GCA	3	9	198181	198189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939944
4511	NC_013851	CAC	2	6	198206	198211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939944
4512	NC_013851	GAT	2	6	198221	198226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939944
4513	NC_013851	CTG	2	6	198254	198259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939944
4514	NC_013851	ACC	2	6	198264	198269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939944
4515	NC_013851	GTC	2	6	198285	198290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939944
4516	NC_013851	GC	3	6	198294	198299	0 %	0 %	50 %	50 %	288939944
4517	NC_013851	CGG	2	6	198305	198310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939944
4518	NC_013851	GAT	2	6	198314	198319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939944
4519	NC_013851	CCG	2	6	198420	198425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939944
4520	NC_013851	ATG	2	6	198426	198431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939944
4521	NC_013851	GCC	2	6	198525	198530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939944
4522	NC_013851	CAG	3	9	198536	198544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939944
4523	NC_013851	CG	3	6	198555	198560	0 %	0 %	50 %	50 %	288939944
4524	NC_013851	GC	3	6	198583	198588	0 %	0 %	50 %	50 %	288939944
4525	NC_013851	GCA	4	12	198721	198732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939944
4526	NC_013851	AGAT	2	8	198759	198766	50 %	25 %	25 %	0 %	288939944
4527	NC_013851	TCA	3	9	198784	198792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939944
4528	NC_013851	GCG	2	6	198878	198883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939945
4529	NC_013851	CCTT	2	8	198904	198911	0 %	50 %	0 %	50 %	288939945
4530	NC_013851	CGGC	2	8	198931	198938	0 %	0 %	50 %	50 %	288939945
4531	NC_013851	CCG	3	9	199085	199093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939945
4532	NC_013851	GTGCC	2	10	199100	199109	0 %	20 %	40 %	40 %	288939945
4533	NC_013851	CGT	3	9	199209	199217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939945
4534	NC_013851	GGC	2	6	199218	199223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939945
4535	NC_013851	CGG	2	6	199229	199234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939945
4536	NC_013851	GCC	2	6	199270	199275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939945
4537	NC_013851	CGT	2	6	199337	199342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939945
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4539	NC_013851	CG	3	6	199475	199480	0 %	0 %	50 %	50 %	288939945
4540	NC_013851	CGC	2	6	199523	199528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939945
4541	NC_013851	GCA	2	6	199529	199534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939945
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4543	NC_013851	GGT	2	6	199548	199553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939945
4544	NC_013851	CGA	2	6	199604	199609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939945
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4551	NC_013851	GGC	2	6	199833	199838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939945
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4553	NC_013851	GAG	2	6	199942	199947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939945
4554	NC_013851	CGG	2	6	199979	199984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939945
4555	NC_013851	GCC	2	6	199996	200001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939945
4556	NC_013851	GGT	2	6	200013	200018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939945
4557	NC_013851	GCA	2	6	200096	200101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939945
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4559	NC_013851	AGT	2	6	200171	200176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939945
4560	NC_013851	CG	3	6	200253	200258	0 %	0 %	50 %	50 %	288939945
4561	NC_013851	CG	3	6	200322	200327	0 %	0 %	50 %	50 %	288939945
4562	NC_013851	CGA	2	6	200330	200335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939945
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4569	NC_013851	GGC	2	6	200538	200543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939945
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4578	NC_013851	GACGG	2	10	200845	200854	20 %	0 %	60 %	20 %	288939946
4579	NC_013851	CGG	2	6	200867	200872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939946
4580	NC_013851	CAG	4	12	200919	200930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939946
4581	NC_013851	ATCAGC	2	12	200956	200967	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	288939946
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4583	NC_013851	TCAT	2	8	200995	201002	25 %	50 %	0 %	25 %	288939946
4584	NC_013851	CGA	2	6	201087	201092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4586	NC_013851	GGCG	2	8	201149	201156	0 %	0 %	75 %	25 %	288939947
4587	NC_013851	CTT	2	6	201168	201173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939947
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4589	NC_013851	T	6	6	201257	201262	0 %	100 %	0 %	0 %	288939947
4590	NC_013851	TCC	2	6	201289	201294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4591	NC_013851	GC	3	6	201316	201321	0 %	0 %	50 %	50 %	288939948
4592	NC_013851	CGA	2	6	201326	201331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939948
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4598	NC_013851	GTT	2	6	201642	201647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4600	NC_013851	CT	3	6	201678	201683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4601	NC_013851	CGG	2	6	201736	201741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939949
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4605	NC_013851	GTCT	2	8	201941	201948	0 %	50 %	25 %	25 %	288939949
4606	NC_013851	TGA	2	6	201969	201974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939949
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4608	NC_013851	TCCTCG	2	12	202026	202037	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	288939949
4609	NC_013851	CGGCG	2	10	202057	202066	0 %	0 %	60 %	40 %	288939949
4610	NC_013851	GGCC	2	8	202072	202079	0 %	0 %	50 %	50 %	288939949
4611	NC_013851	CG	3	6	202315	202320	0 %	0 %	50 %	50 %	288939950
4612	NC_013851	CATC	2	8	202349	202356	25 %	25 %	0 %	50 %	288939950
4613	NC_013851	CGC	2	6	202435	202440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939950
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4616	NC_013851	CTGG	2	8	202586	202593	0 %	25 %	50 %	25 %	288939950
4617	NC_013851	ACT	2	6	202625	202630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939950
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4619	NC_013851	GGC	2	6	202710	202715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939950
4620	NC_013851	CG	3	6	202723	202728	0 %	0 %	50 %	50 %	288939950
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4622	NC_013851	GCC	2	6	202809	202814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939950
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4866	NC_013851	CTG	2	6	213828	213833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939957
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4913	NC_013851	TAT	2	6	215706	215711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4914	NC_013851	TCA	2	6	215777	215782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4932	NC_013851	GCT	2	6	216393	216398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939960
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4983	NC_013851	GCGCC	2	10	218464	218473	0 %	0 %	40 %	60 %	288939963
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4988	NC_013851	GC	3	6	218600	218605	0 %	0 %	50 %	50 %	288939963
4989	NC_013851	GGC	3	9	218606	218614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939963
4990	NC_013851	CAC	2	6	218624	218629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939963
4991	NC_013851	CTG	2	6	218633	218638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939963
4992	NC_013851	CCCG	2	8	218650	218657	0 %	0 %	25 %	75 %	288939963
4993	NC_013851	CGG	2	6	218671	218676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939963
4994	NC_013851	CG	3	6	218719	218724	0 %	0 %	50 %	50 %	288939963
4995	NC_013851	TGC	2	6	218725	218730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939963
4996	NC_013851	GGC	2	6	218780	218785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939963
4997	NC_013851	CG	3	6	218856	218861	0 %	0 %	50 %	50 %	288939963
4998	NC_013851	CTG	2	6	218898	218903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939963
4999	NC_013851	CGG	2	6	218927	218932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939963
5000	NC_013851	TCG	2	6	218950	218955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939963

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