MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 51164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013740	ACC	2	6	220445	220450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047572
5002	NC_013740	TGCC	2	8	220451	220458	0 %	25 %	25 %	50 %	284047572
5003	NC_013740	CGG	2	6	220529	220534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047572
5004	NC_013740	TGA	2	6	220554	220559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047572
5005	NC_013740	TGA	2	6	220635	220640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047572
5006	NC_013740	AAG	2	6	220673	220678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_013740	A	6	6	220687	220692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_013740	T	6	6	220703	220708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_013740	A	6	6	220755	220760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_013740	TGA	2	6	220764	220769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_013740	GCTG	2	8	220841	220848	0 %	25 %	50 %	25 %	284047573
5012	NC_013740	ATT	2	6	220849	220854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284047573
5013	NC_013740	CAG	2	6	220872	220877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047573
5014	NC_013740	CGG	2	6	220948	220953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047573
5015	NC_013740	GAA	2	6	221067	221072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047573
5016	NC_013740	CCG	2	6	221075	221080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047573
5017	NC_013740	CAA	2	6	221105	221110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047573
5018	NC_013740	GGC	2	6	221146	221151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047573
5019	NC_013740	TGC	2	6	221167	221172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
5020	NC_013740	G	6	6	221260	221265	0 %	0 %	100 %	0 %	284047573
5021	NC_013740	TGG	2	6	221290	221295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047573
5022	NC_013740	CTG	3	9	221313	221321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
5023	NC_013740	CTG	2	6	221325	221330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
5024	NC_013740	CTG	2	6	221334	221339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
5025	NC_013740	CGG	2	6	221437	221442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047573
5026	NC_013740	TGA	2	6	221470	221475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047573
5027	NC_013740	GGGC	2	8	221499	221506	0 %	0 %	75 %	25 %	284047573
5028	NC_013740	AAC	2	6	221526	221531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047573
5029	NC_013740	GAC	2	6	221574	221579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047573
5030	NC_013740	ATC	2	6	221649	221654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047573
5031	NC_013740	TGC	2	6	221680	221685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
5032	NC_013740	TGC	2	6	221710	221715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
5033	NC_013740	CTG	2	6	221724	221729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
5034	NC_013740	TCC	2	6	221769	221774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047573
5035	NC_013740	AGC	2	6	221782	221787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047573
5036	NC_013740	GGC	2	6	221795	221800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047573
5037	NC_013740	GAA	2	6	221808	221813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047573
5038	NC_013740	CGG	2	6	221868	221873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047573
5039	NC_013740	GAAG	2	8	221876	221883	50 %	0 %	50 %	0 %	284047573
5040	NC_013740	GCT	2	6	221915	221920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
5041	NC_013740	CGG	2	6	221971	221976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047573
5042	NC_013740	CTG	2	6	222060	222065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
5043	NC_013740	GAG	2	6	222084	222089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047573
5044	NC_013740	TCT	2	6	222153	222158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_013740	TAA	2	6	222176	222181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_013740	A	6	6	222193	222198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_013740	GCT	2	6	222253	222258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047574
5048	NC_013740	CGG	2	6	222285	222290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047574
5049	NC_013740	C	6	6	222315	222320	0 %	0 %	0 %	100 %	284047574
5050	NC_013740	AGA	2	6	222390	222395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047574
5051	NC_013740	CGG	2	6	222421	222426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047574
5052	NC_013740	GGTCCT	2	12	222433	222444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047574
5053	NC_013740	TGAA	2	8	222588	222595	50 %	25 %	25 %	0 %	284047574
5054	NC_013740	CAG	2	6	222695	222700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047574
5055	NC_013740	TCC	2	6	222741	222746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047574
5056	NC_013740	AAG	2	6	222786	222791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047574
5057	NC_013740	GAGT	2	8	222792	222799	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_013740	CTT	2	6	222813	222818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047575
5059	NC_013740	GCT	2	6	222874	222879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047575
5060	NC_013740	GGT	2	6	222946	222951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047575
5061	NC_013740	GGC	2	6	222997	223002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047575
5062	NC_013740	GAAG	2	8	223030	223037	50 %	0 %	50 %	0 %	284047575
5063	NC_013740	TGG	2	6	223059	223064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047575
5064	NC_013740	CCA	2	6	223089	223094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047575
5065	NC_013740	GCA	2	6	223147	223152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047575
5066	NC_013740	CTG	2	6	223205	223210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047575
5067	NC_013740	GAA	2	6	223220	223225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047575
5068	NC_013740	GTG	2	6	223232	223237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047575
5069	NC_013740	TCCC	2	8	223258	223265	0 %	25 %	0 %	75 %	284047575
5070	NC_013740	CTA	2	6	223306	223311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047575
5071	NC_013740	ATT	2	6	223329	223334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284047575
5072	NC_013740	A	6	6	223390	223395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_013740	GGGC	2	8	223432	223439	0 %	0 %	75 %	25 %	284047576
5074	NC_013740	GCG	2	6	223454	223459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047576
5075	NC_013740	CGG	2	6	223464	223469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047576
5076	NC_013740	TGC	2	6	223491	223496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047576
5077	NC_013740	GATG	2	8	223585	223592	25 %	25 %	50 %	0 %	284047576
5078	NC_013740	GCC	2	6	223613	223618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047576
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5080	NC_013740	CAT	2	6	223651	223656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047576
5081	NC_013740	GTG	2	6	223838	223843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047576
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5084	NC_013740	GAA	2	6	223931	223936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047576
5085	NC_013740	TGC	2	6	224155	224160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047576
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5088	NC_013740	CTG	2	6	224287	224292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047577
5089	NC_013740	AGCC	2	8	224335	224342	25 %	0 %	25 %	50 %	284047577
5090	NC_013740	GGC	2	6	224358	224363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047577
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5092	NC_013740	CGGC	2	8	224524	224531	0 %	0 %	50 %	50 %	284047577
5093	NC_013740	A	6	6	224641	224646	100 %	0 %	0 %	0 %	284047577
5094	NC_013740	AGCC	2	8	224649	224656	25 %	0 %	25 %	50 %	284047577
5095	NC_013740	CCG	2	6	224844	224849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047577
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5097	NC_013740	TCCC	2	8	224985	224992	0 %	25 %	0 %	75 %	284047577
5098	NC_013740	TGG	2	6	225179	225184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047577
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5101	NC_013740	TGG	2	6	225306	225311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_013740	GGC	2	6	225367	225372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_013740	GGC	2	6	225406	225411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_013740	GCC	2	6	225419	225424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5105	NC_013740	GCT	2	6	225447	225452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_013740	CA	3	6	225464	225469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5107	NC_013740	AAC	2	6	225481	225486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_013740	A	6	6	225493	225498	100 %	0 %	0 %	0 %	284047578
5109	NC_013740	TGG	2	6	225584	225589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047578
5110	NC_013740	GAT	2	6	225631	225636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047578
5111	NC_013740	TACCGG	2	12	225660	225671	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284047578
5112	NC_013740	GGC	2	6	225676	225681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047578
5113	NC_013740	GAT	2	6	225697	225702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047578
5114	NC_013740	TTC	2	6	225784	225789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047578
5115	NC_013740	CTGG	2	8	225810	225817	0 %	25 %	50 %	25 %	284047578
5116	NC_013740	CCA	2	6	225822	225827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047578
5117	NC_013740	CCGGA	2	10	226110	226119	20 %	0 %	40 %	40 %	284047579
5118	NC_013740	A	7	7	226160	226166	100 %	0 %	0 %	0 %	284047579
5119	NC_013740	AGA	2	6	226172	226177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047579
5120	NC_013740	AAC	2	6	226288	226293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_013740	T	6	6	226355	226360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_013740	AGG	2	6	226361	226366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_013740	GGC	2	6	226440	226445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047580
5124	NC_013740	GAA	2	6	226497	226502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047580
5125	NC_013740	AAC	2	6	226596	226601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_013740	T	6	6	226642	226647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_013740	GAA	2	6	226675	226680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_013740	ATGGA	2	10	226694	226703	40 %	20 %	40 %	0 %	284047581
5129	NC_013740	CTGG	2	8	226788	226795	0 %	25 %	50 %	25 %	284047581
5130	NC_013740	GAA	2	6	226818	226823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047581
5131	NC_013740	CGC	2	6	226908	226913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047581
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5136	NC_013740	CTG	2	6	227062	227067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047581
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5140	NC_013740	TGG	2	6	227258	227263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047581
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5145	NC_013740	CGGCAG	2	12	227647	227658	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284047582
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5148	NC_013740	TGCCC	2	10	227743	227752	0 %	20 %	20 %	60 %	284047582
5149	NC_013740	CTG	2	6	227855	227860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047582
5150	NC_013740	TGG	2	6	227940	227945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047582
5151	NC_013740	TGGCCC	2	12	227949	227960	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284047582
5152	NC_013740	GCC	2	6	227978	227983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047582
5153	NC_013740	AAGG	2	8	228032	228039	50 %	0 %	50 %	0 %	284047582
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5159	NC_013740	CTGG	2	8	228202	228209	0 %	25 %	50 %	25 %	284047582
5160	NC_013740	G	6	6	228295	228300	0 %	0 %	100 %	0 %	284047582
5161	NC_013740	TGC	2	6	228303	228308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047582
5162	NC_013740	GGC	2	6	228310	228315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047582
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5166	NC_013740	TCCT	2	8	228440	228447	0 %	50 %	0 %	50 %	284047582
5167	NC_013740	ATC	2	6	228473	228478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047582
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5174	NC_013740	GGC	2	6	228739	228744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047582
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5179	NC_013740	A	7	7	228874	228880	100 %	0 %	0 %	0 %	284047583
5180	NC_013740	TGA	2	6	228881	228886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047583
5181	NC_013740	CTG	2	6	228907	228912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047583
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5188	NC_013740	A	7	7	229478	229484	100 %	0 %	0 %	0 %	284047583
5189	NC_013740	TG	3	6	229502	229507	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5191	NC_013740	T	6	6	229565	229570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5192	NC_013740	T	6	6	229621	229626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5193	NC_013740	ATA	3	9	229627	229635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5230	NC_013740	CTGC	2	8	231445	231452	0 %	25 %	25 %	50 %	284047585
5231	NC_013740	CAGC	2	8	231470	231477	25 %	0 %	25 %	50 %	284047585
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5239	NC_013740	TCCT	2	8	231833	231840	0 %	50 %	0 %	50 %	284047585
5240	NC_013740	CGC	2	6	232004	232009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047585
5241	NC_013740	ATG	2	6	232012	232017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047585
5242	NC_013740	CGG	2	6	232088	232093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047585
5243	NC_013740	AAC	2	6	232162	232167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047585
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5245	NC_013740	ACC	2	6	232287	232292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047585
5246	NC_013740	GGC	2	6	232302	232307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047585
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5249	NC_013740	GGA	2	6	232424	232429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047585
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5352	NC_013740	CGG	2	6	236810	236815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047585
5353	NC_013740	GC	3	6	236846	236851	0 %	0 %	50 %	50 %	284047585
5354	NC_013740	TGAAAG	2	12	236905	236916	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284047585
5355	NC_013740	CGA	2	6	236924	236929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047585
5356	NC_013740	GCT	2	6	236940	236945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047585
5357	NC_013740	AGCC	2	8	237035	237042	25 %	0 %	25 %	50 %	284047585
5358	NC_013740	AGA	2	6	237043	237048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047585
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5362	NC_013740	CGTC	2	8	237100	237107	0 %	25 %	25 %	50 %	284047585
5363	NC_013740	CGG	2	6	237136	237141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047585
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5365	NC_013740	CGG	2	6	237217	237222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047585
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5483	NC_013740	ACGGC	2	10	242230	242239	20 %	0 %	40 %	40 %	284047585
5484	NC_013740	TGA	2	6	242258	242263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047585
5485	NC_013740	AAG	2	6	242280	242285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047585
5486	NC_013740	GTC	2	6	242364	242369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047585
5487	NC_013740	TCC	2	6	242395	242400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047585
5488	NC_013740	CGG	2	6	242422	242427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047585
5489	NC_013740	CGGC	2	8	242455	242462	0 %	0 %	50 %	50 %	284047585
5490	NC_013740	CGG	2	6	242504	242509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047585
5491	NC_013740	CAA	2	6	242564	242569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047585
5492	NC_013740	ATG	3	9	242620	242628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047585
5493	NC_013740	TCAATG	2	12	242689	242700	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284047585
5494	NC_013740	TCA	2	6	242821	242826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047585
5495	NC_013740	GACG	2	8	242873	242880	25 %	0 %	50 %	25 %	284047585
5496	NC_013740	CTA	2	6	242906	242911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047585
5497	NC_013740	CGG	2	6	242957	242962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047585
5498	NC_013740	TCA	2	6	243082	243087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047585
5499	NC_013740	CAA	2	6	243089	243094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047585
5500	NC_013740	GCA	2	6	243157	243162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047585

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