MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans plasmid S25

Total Repeats: 703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013438	AGA	2	6	29	34	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876183
2	NC_013438	TCAAA	2	10	163	172	60 %	20 %	0 %	20 %	261876183
3	NC_013438	TGA	2	6	248	253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261876183
4	NC_013438	TAC	2	6	438	443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261876184
5	NC_013438	A	8	8	450	457	100 %	0 %	0 %	0 %	261876184
6	NC_013438	T	6	6	478	483	0 %	100 %	0 %	0 %	261876184
7	NC_013438	TTA	2	6	491	496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876184
8	NC_013438	T	6	6	523	528	0 %	100 %	0 %	0 %	261876184
9	NC_013438	ATTT	2	8	533	540	25 %	75 %	0 %	0 %	261876184
10	NC_013438	AC	3	6	543	548	50 %	0 %	0 %	50 %	261876184
11	NC_013438	AATT	2	8	555	562	50 %	50 %	0 %	0 %	261876184
12	NC_013438	AAT	2	6	569	574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013438	AATT	2	8	577	584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013438	TAC	2	6	597	602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013438	T	6	6	632	637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013438	CCG	2	6	739	744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261876185
17	NC_013438	ATT	2	6	864	869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013438	A	6	6	902	907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013438	AAACAA	2	12	954	965	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013438	A	6	6	967	972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013438	A	6	6	974	979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013438	TAT	2	6	982	987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013438	TCA	2	6	1127	1132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261876186
24	NC_013438	TTTC	2	8	1269	1276	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013438	TATT	2	8	1283	1290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013438	A	6	6	1299	1304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013438	A	6	6	1469	1474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013438	A	6	6	1476	1481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013438	T	6	6	1488	1493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013438	AATT	2	8	1561	1568	50 %	50 %	0 %	0 %	261876187
31	NC_013438	TAAC	2	8	1666	1673	50 %	25 %	0 %	25 %	261876187
32	NC_013438	CAA	2	6	1675	1680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261876187
33	NC_013438	AAG	2	6	1681	1686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876187
34	NC_013438	TGA	2	6	1739	1744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261876187
35	NC_013438	TAA	2	6	1763	1768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261876187
36	NC_013438	ATT	2	6	1839	1844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876187
37	NC_013438	TAAA	2	8	1855	1862	75 %	25 %	0 %	0 %	261876187
38	NC_013438	CAA	2	6	1875	1880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261876187
39	NC_013438	ATTTA	2	10	1928	1937	40 %	60 %	0 %	0 %	261876187
40	NC_013438	TTA	2	6	2013	2018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876187
41	NC_013438	TAA	3	9	2162	2170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261876187
42	NC_013438	ACA	2	6	2193	2198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261876187
43	NC_013438	T	6	6	2224	2229	0 %	100 %	0 %	0 %	261876187
44	NC_013438	AGAA	2	8	2248	2255	75 %	0 %	25 %	0 %	261876187
45	NC_013438	GAA	2	6	2262	2267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876187
46	NC_013438	GAA	2	6	2316	2321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876187
47	NC_013438	CAAAA	2	10	2330	2339	80 %	0 %	0 %	20 %	261876187
48	NC_013438	CAAGG	2	10	2357	2366	40 %	0 %	40 %	20 %	261876187
49	NC_013438	ATT	2	6	2419	2424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876187
50	NC_013438	CAAG	2	8	2461	2468	50 %	0 %	25 %	25 %	261876187
51	NC_013438	T	6	6	2478	2483	0 %	100 %	0 %	0 %	261876187
52	NC_013438	T	6	6	2565	2570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013438	TAT	2	6	2578	2583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013438	T	7	7	2675	2681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013438	AGA	2	6	2764	2769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876188
56	NC_013438	T	7	7	2824	2830	0 %	100 %	0 %	0 %	261876188
57	NC_013438	AC	3	6	2843	2848	50 %	0 %	0 %	50 %	261876188
58	NC_013438	TAA	2	6	2893	2898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261876188
59	NC_013438	AAG	2	6	2915	2920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876189
60	NC_013438	TTA	2	6	2923	2928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876189
61	NC_013438	TAT	2	6	2940	2945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876189
62	NC_013438	AG	3	6	2979	2984	50 %	0 %	50 %	0 %	261876189
63	NC_013438	TGCTAT	2	12	3000	3011	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	261876189
64	NC_013438	CCAA	2	8	3036	3043	50 %	0 %	0 %	50 %	261876189
65	NC_013438	A	6	6	3062	3067	100 %	0 %	0 %	0 %	261876189
66	NC_013438	TGA	2	6	3072	3077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261876189
67	NC_013438	ATT	2	6	3098	3103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876189
68	NC_013438	TAA	2	6	3123	3128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261876189
69	NC_013438	TAA	2	6	3234	3239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261876189
70	NC_013438	GTT	2	6	3260	3265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261876189
71	NC_013438	TTTC	2	8	3281	3288	0 %	75 %	0 %	25 %	261876189
72	NC_013438	CAA	2	6	3345	3350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261876189
73	NC_013438	TTG	2	6	3371	3376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261876189
74	NC_013438	A	6	6	3439	3444	100 %	0 %	0 %	0 %	261876189
75	NC_013438	TCAA	2	8	3502	3509	50 %	25 %	0 %	25 %	261876189
76	NC_013438	TCAA	2	8	3531	3538	50 %	25 %	0 %	25 %	261876189
77	NC_013438	TCA	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261876189
78	NC_013438	TAA	2	6	3582	3587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261876190
79	NC_013438	AAAC	2	8	3592	3599	75 %	0 %	0 %	25 %	261876190
80	NC_013438	TCAA	2	8	3637	3644	50 %	25 %	0 %	25 %	261876190
81	NC_013438	AAG	2	6	3653	3658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876190
82	NC_013438	TACT	2	8	3728	3735	25 %	50 %	0 %	25 %	261876190
83	NC_013438	GTA	2	6	3766	3771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261876190
84	NC_013438	GTT	2	6	3772	3777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261876190
85	NC_013438	GGT	2	6	3856	3861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261876190
86	NC_013438	GCA	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261876190
87	NC_013438	ATA	2	6	3936	3941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013438	TATT	2	8	3957	3964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013438	C	6	6	4021	4026	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_013438	GTT	2	6	4066	4071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261876191
91	NC_013438	CTTT	2	8	4119	4126	0 %	75 %	0 %	25 %	261876191
92	NC_013438	GTAT	2	8	4139	4146	25 %	50 %	25 %	0 %	261876191
93	NC_013438	AT	3	6	4157	4162	50 %	50 %	0 %	0 %	261876191
94	NC_013438	TATTT	2	10	4175	4184	20 %	80 %	0 %	0 %	261876191
95	NC_013438	TCT	2	6	4185	4190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261876191
96	NC_013438	A	6	6	4233	4238	100 %	0 %	0 %	0 %	261876191
97	NC_013438	A	6	6	4301	4306	100 %	0 %	0 %	0 %	261876191
98	NC_013438	TTA	2	6	4321	4326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876191
99	NC_013438	A	8	8	4357	4364	100 %	0 %	0 %	0 %	261876191
100	NC_013438	A	7	7	4424	4430	100 %	0 %	0 %	0 %	261876191
101	NC_013438	TTC	2	6	4441	4446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261876191
102	NC_013438	AGA	2	6	4456	4461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876191
103	NC_013438	TGT	2	6	4462	4467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261876191
104	NC_013438	ATG	2	6	4533	4538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261876191
105	NC_013438	A	7	7	4762	4768	100 %	0 %	0 %	0 %	261876191
106	NC_013438	A	6	6	4787	4792	100 %	0 %	0 %	0 %	261876191
107	NC_013438	AGA	2	6	4816	4821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876191
108	NC_013438	ACG	2	6	4904	4909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261876191
109	NC_013438	ACG	2	6	4920	4925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261876191
110	NC_013438	TGATA	2	10	5029	5038	40 %	40 %	20 %	0 %	261876191
111	NC_013438	ACGC	2	8	5123	5130	25 %	0 %	25 %	50 %	261876191
112	NC_013438	TTGA	2	8	5219	5226	25 %	50 %	25 %	0 %	261876191
113	NC_013438	AGA	2	6	5254	5259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876191
114	NC_013438	CAA	2	6	5273	5278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261876191
115	NC_013438	TAT	2	6	5286	5291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876191
116	NC_013438	ATGT	2	8	5319	5326	25 %	50 %	25 %	0 %	261876191
117	NC_013438	ATC	2	6	5334	5339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261876191
118	NC_013438	AAG	2	6	5373	5378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876191
119	NC_013438	A	6	6	5382	5387	100 %	0 %	0 %	0 %	261876191
120	NC_013438	ATA	2	6	5553	5558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261876191
121	NC_013438	AAAC	2	8	5613	5620	75 %	0 %	0 %	25 %	261876191
122	NC_013438	TCA	2	6	5647	5652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261876191
123	NC_013438	ATTT	2	8	5825	5832	25 %	75 %	0 %	0 %	261876191
124	NC_013438	CGTG	2	8	5860	5867	0 %	25 %	50 %	25 %	261876191
125	NC_013438	A	7	7	5934	5940	100 %	0 %	0 %	0 %	261876191
126	NC_013438	AGA	2	6	6022	6027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876191
127	NC_013438	CGTG	2	8	6040	6047	0 %	25 %	50 %	25 %	261876191
128	NC_013438	CGT	2	6	6143	6148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261876191
129	NC_013438	A	6	6	6161	6166	100 %	0 %	0 %	0 %	261876191
130	NC_013438	AATC	2	8	6274	6281	50 %	25 %	0 %	25 %	261876191
131	NC_013438	TGA	2	6	6460	6465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261876191
132	NC_013438	ATT	2	6	6593	6598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876191
133	NC_013438	GAT	2	6	6611	6616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261876191
134	NC_013438	A	6	6	6635	6640	100 %	0 %	0 %	0 %	261876191
135	NC_013438	ATG	2	6	6818	6823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261876191
136	NC_013438	AAT	2	6	6824	6829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261876191
137	NC_013438	TAT	2	6	6846	6851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013438	AAT	2	6	6852	6857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013438	ATT	2	6	6863	6868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013438	TAA	2	6	6870	6875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013438	TTA	2	6	6877	6882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013438	TAA	2	6	6891	6896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_013438	AGA	2	6	19122	19127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876210
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415	NC_013438	A	6	6	19477	19482	100 %	0 %	0 %	0 %	261876210
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450	NC_013438	TTAA	2	8	21073	21080	50 %	50 %	0 %	0 %	261876210
451	NC_013438	A	8	8	21140	21147	100 %	0 %	0 %	0 %	261876210
452	NC_013438	GTAAAA	2	12	21184	21195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261876210
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454	NC_013438	AAT	2	6	21233	21238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_013438	A	6	6	21255	21260	100 %	0 %	0 %	0 %	261876211
456	NC_013438	A	6	6	21310	21315	100 %	0 %	0 %	0 %	261876211
457	NC_013438	AT	3	6	21329	21334	50 %	50 %	0 %	0 %	261876211
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485	NC_013438	CT	3	6	22450	22455	0 %	50 %	0 %	50 %	261876214
486	NC_013438	T	6	6	22467	22472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_013438	TAA	2	6	22526	22531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_013438	ATTAA	2	10	22543	22552	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_013438	TAA	2	6	22566	22571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_013438	TAT	2	6	22596	22601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_013438	ATT	2	6	22615	22620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_013438	TAA	2	6	22633	22638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_013438	TAA	2	6	22641	22646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
494	NC_013438	A	6	6	22657	22662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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496	NC_013438	AAAG	2	8	22688	22695	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
497	NC_013438	TCTT	2	8	22763	22770	0 %	75 %	0 %	25 %	261876215
498	NC_013438	AAAAG	2	10	22808	22817	80 %	0 %	20 %	0 %	261876215
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