MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 43995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_013416	CTT	2	6	558528	558533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261867323
11503	NC_013416	TA	3	6	558546	558551	50 %	50 %	0 %	0 %	261867323
11504	NC_013416	AAT	2	6	558732	558737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_013416	TAA	2	6	558806	558811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_013416	TAA	2	6	558837	558842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_013416	CCA	2	6	558870	558875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261867324
11508	NC_013416	AAC	2	6	558883	558888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867324
11509	NC_013416	TTG	2	6	558903	558908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867324
11510	NC_013416	GTAA	2	8	559001	559008	50 %	25 %	25 %	0 %	261867324
11511	NC_013416	TTGG	2	8	559034	559041	0 %	50 %	50 %	0 %	261867324
11512	NC_013416	TGA	2	6	559052	559057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867324
11513	NC_013416	T	7	7	559154	559160	0 %	100 %	0 %	0 %	261867324
11514	NC_013416	ATG	2	6	559189	559194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867324
11515	NC_013416	GTT	2	6	559274	559279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867325
11516	NC_013416	GTCG	2	8	559398	559405	0 %	25 %	50 %	25 %	261867325
11517	NC_013416	GCG	2	6	559473	559478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867325
11518	NC_013416	GAA	2	6	559512	559517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261867325
11519	NC_013416	CCG	2	6	559528	559533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867325
11520	NC_013416	GCC	2	6	559690	559695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867325
11521	NC_013416	CCA	2	6	559700	559705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261867325
11522	NC_013416	TGGT	2	8	559785	559792	0 %	50 %	50 %	0 %	261867325
11523	NC_013416	T	7	7	559831	559837	0 %	100 %	0 %	0 %	261867325
11524	NC_013416	CGG	2	6	559901	559906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867325
11525	NC_013416	CGG	2	6	559913	559918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867325
11526	NC_013416	TGA	2	6	559968	559973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867325
11527	NC_013416	TTG	2	6	560002	560007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_013416	TG	3	6	560006	560011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_013416	A	6	6	560075	560080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_013416	GAA	2	6	560101	560106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_013416	ATC	2	6	560216	560221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867326
11532	NC_013416	GCA	2	6	560291	560296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867326
11533	NC_013416	GCA	2	6	560339	560344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867326
11534	NC_013416	GAC	2	6	560354	560359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867326
11535	NC_013416	CG	3	6	560468	560473	0 %	0 %	50 %	50 %	261867326
11536	NC_013416	GC	3	6	560475	560480	0 %	0 %	50 %	50 %	261867326
11537	NC_013416	GCG	2	6	560493	560498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867326
11538	NC_013416	CGG	2	6	560519	560524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867326
11539	NC_013416	GCA	2	6	560575	560580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867326
11540	NC_013416	CGG	2	6	560581	560586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867326
11541	NC_013416	TCT	2	6	560598	560603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261867326
11542	NC_013416	GAAAA	2	10	560688	560697	80 %	0 %	20 %	0 %	261867326
11543	NC_013416	GAT	2	6	560768	560773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867326
11544	NC_013416	GT	3	6	560790	560795	0 %	50 %	50 %	0 %	261867326
11545	NC_013416	GAA	2	6	560891	560896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261867326
11546	NC_013416	T	6	6	560921	560926	0 %	100 %	0 %	0 %	261867326
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11550	NC_013416	ATCA	2	8	561208	561215	50 %	25 %	0 %	25 %	261867326
11551	NC_013416	AGC	2	6	561275	561280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867326
11552	NC_013416	GAA	2	6	561287	561292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261867326
11553	NC_013416	TTA	2	6	561294	561299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867326
11554	NC_013416	A	6	6	561451	561456	100 %	0 %	0 %	0 %	261867327
11555	NC_013416	ATG	2	6	561490	561495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867327
11556	NC_013416	CTG	2	6	561514	561519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867327
11557	NC_013416	T	6	6	561537	561542	0 %	100 %	0 %	0 %	261867327
11558	NC_013416	CCG	2	6	561580	561585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867327
11559	NC_013416	GAA	2	6	561605	561610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261867328
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11561	NC_013416	GTG	2	6	561649	561654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261867328
11562	NC_013416	ATG	2	6	561685	561690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867328
11563	NC_013416	CG	3	6	561709	561714	0 %	0 %	50 %	50 %	261867328
11564	NC_013416	AAT	2	6	561744	561749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261867328
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11570	NC_013416	ATTT	2	8	561949	561956	25 %	75 %	0 %	0 %	261867328
11571	NC_013416	CCCG	2	8	561982	561989	0 %	0 %	25 %	75 %	261867328
11572	NC_013416	TGAT	2	8	562006	562013	25 %	50 %	25 %	0 %	261867328
11573	NC_013416	CCG	2	6	562091	562096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867328
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11577	NC_013416	CAAG	2	8	562363	562370	50 %	0 %	25 %	25 %	261867328
11578	NC_013416	TTAT	2	8	562415	562422	25 %	75 %	0 %	0 %	261867328
11579	NC_013416	TGC	2	6	562426	562431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867328
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11581	NC_013416	GAT	2	6	562481	562486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867328
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11586	NC_013416	ACCA	2	8	562602	562609	50 %	0 %	0 %	50 %	261867328
11587	NC_013416	AGA	2	6	562657	562662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261867328
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11589	NC_013416	TAT	2	6	562696	562701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_013416	TTG	2	6	562756	562761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_013416	TA	3	6	562775	562780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_013416	TAA	2	6	562810	562815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_013416	A	7	7	562855	562861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_013416	CAC	2	6	562873	562878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11595	NC_013416	GGT	2	6	562936	562941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_013416	CAC	2	6	562959	562964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11597	NC_013416	TCC	2	6	562968	562973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11598	NC_013416	CAG	2	6	563029	563034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11599	NC_013416	GAG	2	6	563035	563040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_013416	T	7	7	563080	563086	0 %	100 %	0 %	0 %	261867329
11601	NC_013416	TG	3	6	563102	563107	0 %	50 %	50 %	0 %	261867329
11602	NC_013416	A	6	6	563118	563123	100 %	0 %	0 %	0 %	261867329
11603	NC_013416	T	6	6	563179	563184	0 %	100 %	0 %	0 %	261867329
11604	NC_013416	CCA	2	6	563239	563244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261867330
11605	NC_013416	CG	3	6	563289	563294	0 %	0 %	50 %	50 %	261867330
11606	NC_013416	GTGC	2	8	563309	563316	0 %	25 %	50 %	25 %	261867330
11607	NC_013416	GCA	2	6	563454	563459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867330
11608	NC_013416	TGT	2	6	563508	563513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867330
11609	NC_013416	TTG	2	6	563519	563524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867330
11610	NC_013416	CTG	2	6	563586	563591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867330
11611	NC_013416	GTG	2	6	563619	563624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261867330
11612	NC_013416	CGG	2	6	563635	563640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867330
11613	NC_013416	CATT	2	8	563650	563657	25 %	50 %	0 %	25 %	261867330
11614	NC_013416	GT	3	6	563689	563694	0 %	50 %	50 %	0 %	261867330
11615	NC_013416	TAA	2	6	563717	563722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261867330
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11617	NC_013416	TAAA	2	8	563794	563801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_013416	ATT	2	6	563853	563858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_013416	T	6	6	563860	563865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_013416	GAT	2	6	563873	563878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_013416	ACA	2	6	563888	563893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867331
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11989	NC_013416	GC	4	8	581677	581684	0 %	0 %	50 %	50 %	261867354
11990	NC_013416	ATA	2	6	581815	581820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261867354
11991	NC_013416	TAA	2	6	581852	581857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261867354
11992	NC_013416	TTC	3	9	581891	581899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261867354
11993	NC_013416	GCA	2	6	581905	581910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867354
11994	NC_013416	T	6	6	581933	581938	0 %	100 %	0 %	0 %	261867354
11995	NC_013416	CTT	2	6	581941	581946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261867354
11996	NC_013416	CGCC	2	8	581947	581954	0 %	0 %	25 %	75 %	261867354
11997	NC_013416	CGG	2	6	582004	582009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867354
11998	NC_013416	GCG	2	6	582038	582043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867354
11999	NC_013416	AAT	2	6	582044	582049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261867354
12000	NC_013416	GCA	2	6	582055	582060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867354

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