MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 48350

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_013385	GCC	3	9	1802930	1802938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41002	NC_013385	GAA	2	6	1802963	1802968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41003	NC_013385	GA	3	6	1803042	1803047	50 %	0 %	50 %	0 %	260893647
41004	NC_013385	CGC	2	6	1803058	1803063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893647
41005	NC_013385	CCG	2	6	1803072	1803077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893647
41006	NC_013385	CA	3	6	1803162	1803167	50 %	0 %	0 %	50 %	260893647
41007	NC_013385	CGC	3	9	1803168	1803176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893647
41008	NC_013385	CG	3	6	1803284	1803289	0 %	0 %	50 %	50 %	260893647
41009	NC_013385	CG	3	6	1803309	1803314	0 %	0 %	50 %	50 %	260893647
41010	NC_013385	CTT	2	6	1803381	1803386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893647
41011	NC_013385	TCT	2	6	1803403	1803408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893647
41012	NC_013385	CCT	2	6	1803449	1803454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893647
41013	NC_013385	CACC	2	8	1803557	1803564	25 %	0 %	0 %	75 %	260893647
41014	NC_013385	CGT	2	6	1803575	1803580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893647
41015	NC_013385	TCG	2	6	1803614	1803619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893647
41016	NC_013385	GTC	2	6	1803630	1803635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893647
41017	NC_013385	ACG	2	6	1803721	1803726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893647
41018	NC_013385	CGGA	2	8	1803775	1803782	25 %	0 %	50 %	25 %	260893647
41019	NC_013385	GC	3	6	1803937	1803942	0 %	0 %	50 %	50 %	260893647
41020	NC_013385	GCC	2	6	1804008	1804013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893647
41021	NC_013385	CGC	2	6	1804087	1804092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893647
41022	NC_013385	TTC	2	6	1804093	1804098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893647
41023	NC_013385	CTT	2	6	1804119	1804124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893647
41024	NC_013385	CTT	2	6	1804137	1804142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893647
41025	NC_013385	CTT	3	9	1804209	1804217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893647
41026	NC_013385	TCACGC	2	12	1804255	1804266	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260893647
41027	NC_013385	CTTT	2	8	1804416	1804423	0 %	75 %	0 %	25 %	260893647
41028	NC_013385	GGC	2	6	1804427	1804432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893647
41029	NC_013385	CGC	2	6	1804442	1804447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893647
41030	NC_013385	CAG	2	6	1804503	1804508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893647
41031	NC_013385	CCT	2	6	1804518	1804523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893648
41032	NC_013385	TCCT	2	8	1804544	1804551	0 %	50 %	0 %	50 %	260893648
41033	NC_013385	CGAA	2	8	1804581	1804588	50 %	0 %	25 %	25 %	260893648
41034	NC_013385	CAG	2	6	1804600	1804605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893648
41035	NC_013385	TCC	2	6	1804607	1804612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893648
41036	NC_013385	TTC	2	6	1804618	1804623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893648
41037	NC_013385	TCT	2	6	1804640	1804645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893648
41038	NC_013385	CAC	2	6	1804654	1804659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893648
41039	NC_013385	TTCC	2	8	1804758	1804765	0 %	50 %	0 %	50 %	260893648
41040	NC_013385	TCA	2	6	1804776	1804781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893648
41041	NC_013385	ACC	2	6	1804832	1804837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893648
41042	NC_013385	CGT	2	6	1804842	1804847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893648
41043	NC_013385	CCTG	2	8	1804887	1804894	0 %	25 %	25 %	50 %	260893648
41044	NC_013385	GAG	2	6	1804925	1804930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893648
41045	NC_013385	GC	4	8	1804950	1804957	0 %	0 %	50 %	50 %	260893648
41046	NC_013385	CCT	2	6	1804993	1804998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893648
41047	NC_013385	TCC	2	6	1805022	1805027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893648
41048	NC_013385	C	6	6	1805026	1805031	0 %	0 %	0 %	100 %	260893648
41049	NC_013385	ACC	2	6	1805042	1805047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893648
41050	NC_013385	GCA	2	6	1805229	1805234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893649
41051	NC_013385	CTC	2	6	1805235	1805240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893649
41052	NC_013385	CAC	2	6	1805367	1805372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893649
41053	NC_013385	CTC	2	6	1805451	1805456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893649
41054	NC_013385	TCT	2	6	1805532	1805537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893649
41055	NC_013385	CTT	2	6	1805546	1805551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893649
41056	NC_013385	GCC	2	6	1805611	1805616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893649
41057	NC_013385	GAC	2	6	1805695	1805700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893649
41058	NC_013385	CAG	2	6	1805730	1805735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893649
41059	NC_013385	CCT	2	6	1805765	1805770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893649
41060	NC_013385	CA	3	6	1805778	1805783	50 %	0 %	0 %	50 %	260893649
41061	NC_013385	GGC	2	6	1805784	1805789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893649
41062	NC_013385	CTT	2	6	1805844	1805849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893649
41063	NC_013385	TCC	2	6	1805851	1805856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893649
41064	NC_013385	AGA	2	6	1805863	1805868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893649
41065	NC_013385	GCT	2	6	1805870	1805875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893649
41066	NC_013385	CAG	2	6	1805877	1805882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893649
41067	NC_013385	GCT	2	6	1805888	1805893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893649
41068	NC_013385	CTT	2	6	1805900	1805905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893649
41069	NC_013385	TCGC	2	8	1805954	1805961	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41070	NC_013385	CAATG	2	10	1805971	1805980	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41071	NC_013385	AG	3	6	1806003	1806008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41072	NC_013385	TTA	2	6	1806039	1806044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41073	NC_013385	TGGAA	2	10	1806100	1806109	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41074	NC_013385	A	6	6	1806149	1806154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41075	NC_013385	AGGA	2	8	1806170	1806177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41076	NC_013385	GAG	2	6	1806190	1806195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41077	NC_013385	GAT	2	6	1806204	1806209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41078	NC_013385	G	6	6	1806242	1806247	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41079	NC_013385	CCT	2	6	1806391	1806396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893650
41080	NC_013385	CT	3	6	1806401	1806406	0 %	50 %	0 %	50 %	260893650
41081	NC_013385	GAA	2	6	1806411	1806416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893650
41082	NC_013385	GAA	2	6	1806423	1806428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893650
41083	NC_013385	GTA	2	6	1806480	1806485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893650
41084	NC_013385	GCA	2	6	1806494	1806499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893650
41085	NC_013385	CAGGAA	2	12	1806528	1806539	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	260893650
41086	NC_013385	TGC	2	6	1806610	1806615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893650
41087	NC_013385	CAGC	2	8	1806641	1806648	25 %	0 %	25 %	50 %	260893650
41088	NC_013385	GCT	2	6	1806671	1806676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893650
41089	NC_013385	GGT	2	6	1806704	1806709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893650
41090	NC_013385	CCA	2	6	1806781	1806786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893650
41091	NC_013385	GGA	2	6	1806893	1806898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893650
41092	NC_013385	GGA	2	6	1806929	1806934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893650
41093	NC_013385	GGT	2	6	1807023	1807028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893651
41094	NC_013385	CTG	2	6	1807054	1807059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893651
41095	NC_013385	GCC	2	6	1807097	1807102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893651
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41097	NC_013385	ATA	2	6	1807177	1807182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260893651
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41099	NC_013385	TG	3	6	1807253	1807258	0 %	50 %	50 %	0 %	260893651
41100	NC_013385	GGA	2	6	1807308	1807313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893651
41101	NC_013385	CTT	2	6	1807361	1807366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893651
41102	NC_013385	AGA	3	9	1807456	1807464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893652
41103	NC_013385	AGC	2	6	1807491	1807496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893652
41104	NC_013385	TAC	2	6	1807528	1807533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893652
41105	NC_013385	A	9	9	1807609	1807617	100 %	0 %	0 %	0 %	260893652
41106	NC_013385	GCC	2	6	1807652	1807657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893652
41107	NC_013385	AAG	2	6	1807720	1807725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893652
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41109	NC_013385	CGC	2	6	1807826	1807831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893652
41110	NC_013385	CGG	2	6	1807914	1807919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893653
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41115	NC_013385	TGG	2	6	1808153	1808158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893653
41116	NC_013385	CTTCT	2	10	1808203	1808212	0 %	60 %	0 %	40 %	260893653
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41118	NC_013385	AAG	2	6	1808310	1808315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893653
41119	NC_013385	TACC	2	8	1808324	1808331	25 %	25 %	0 %	50 %	260893653
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41122	NC_013385	GAG	2	6	1808430	1808435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893653
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41145	NC_013385	AGG	2	6	1809457	1809462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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41252	NC_013385	T	6	6	1814321	1814326	0 %	100 %	0 %	0 %	260893659
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41347	NC_013385	GAAGCA	2	12	1818304	1818315	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	260893663
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41353	NC_013385	CCA	2	6	1818506	1818511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893663
41354	NC_013385	GCA	2	6	1818518	1818523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893663
41355	NC_013385	GTG	2	6	1818562	1818567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893663
41356	NC_013385	CGG	2	6	1818604	1818609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893663
41357	NC_013385	CGG	2	6	1818617	1818622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893663
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41359	NC_013385	GTG	2	6	1818658	1818663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893663
41360	NC_013385	AAG	2	6	1818745	1818750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893663
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41384	NC_013385	CAG	2	6	1820172	1820177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893663
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41388	NC_013385	CCA	2	6	1820243	1820248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893663
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41469	NC_013385	ACC	2	6	1823905	1823910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893666
41470	NC_013385	GGAAG	2	10	1823924	1823933	40 %	0 %	60 %	0 %	260893666
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41472	NC_013385	GCC	3	9	1823992	1824000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893666
41473	NC_013385	TCC	2	6	1824097	1824102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893666
41474	NC_013385	TGT	2	6	1824113	1824118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260893666
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41477	NC_013385	CTC	2	6	1824303	1824308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893666
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41480	NC_013385	CCA	2	6	1824359	1824364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893666
41481	NC_013385	GCG	2	6	1824501	1824506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893666
41482	NC_013385	TCG	2	6	1824529	1824534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893666
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41485	NC_013385	GTG	2	6	1824564	1824569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893666
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41492	NC_013385	CCA	2	6	1824788	1824793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893666
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41497	NC_013385	CAG	2	6	1824885	1824890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893666
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41500	NC_013385	GCC	2	6	1825121	1825126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893667

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