MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmid pAACI02

Total Repeats: 1703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013207	AAGC	2	8	51796	51803	50 %	0 %	25 %	25 %	257793089
1002	NC_013207	GAA	2	6	51805	51810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793089
1003	NC_013207	AAC	2	6	52019	52024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793089
1004	NC_013207	TGAA	2	8	52161	52168	50 %	25 %	25 %	0 %	257793089
1005	NC_013207	T	6	6	52199	52204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_013207	GGGA	2	8	52227	52234	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_013207	CGC	2	6	52358	52363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793090
1008	NC_013207	TGT	2	6	52391	52396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793090
1009	NC_013207	ACG	2	6	52451	52456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793090
1010	NC_013207	GCT	2	6	52593	52598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793090
1011	NC_013207	CGATG	2	10	52626	52635	20 %	20 %	40 %	20 %	257793090
1012	NC_013207	GCA	2	6	52653	52658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793090
1013	NC_013207	ACA	2	6	52664	52669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793090
1014	NC_013207	CTATC	2	10	52683	52692	20 %	40 %	0 %	40 %	257793090
1015	NC_013207	CGG	3	9	52710	52718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793090
1016	NC_013207	CGA	2	6	52788	52793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793090
1017	NC_013207	GATGGC	2	12	52813	52824	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257793090
1018	NC_013207	GTC	2	6	52869	52874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_013207	TTTG	2	8	52899	52906	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_013207	CA	3	6	52911	52916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_013207	TAC	2	6	53008	53013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793091
1022	NC_013207	GAG	2	6	53038	53043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793091
1023	NC_013207	GCA	2	6	53051	53056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793091
1024	NC_013207	TTC	2	6	53090	53095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793091
1025	NC_013207	GAA	2	6	53224	53229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793091
1026	NC_013207	AAT	2	6	53311	53316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257793091
1027	NC_013207	CGA	2	6	53381	53386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793091
1028	NC_013207	TCC	2	6	53440	53445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793091
1029	NC_013207	GCC	2	6	53464	53469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793091
1030	NC_013207	GAG	2	6	53527	53532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793091
1031	NC_013207	GAA	2	6	53656	53661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793091
1032	NC_013207	AGA	2	6	53669	53674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793091
1033	NC_013207	GCGG	2	8	53765	53772	0 %	0 %	75 %	25 %	257793091
1034	NC_013207	GAA	2	6	53823	53828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793091
1035	NC_013207	GTG	2	6	53851	53856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793091
1036	NC_013207	AGC	2	6	53912	53917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793091
1037	NC_013207	GC	3	6	54002	54007	0 %	0 %	50 %	50 %	257793091
1038	NC_013207	GCC	2	6	54027	54032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793091
1039	NC_013207	CG	3	6	54103	54108	0 %	0 %	50 %	50 %	257793091
1040	NC_013207	TCA	2	6	54132	54137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793091
1041	NC_013207	CAA	2	6	54178	54183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793091
1042	NC_013207	CGA	2	6	54184	54189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793091
1043	NC_013207	TCG	2	6	54245	54250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793091
1044	NC_013207	GTT	2	6	54279	54284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793091
1045	NC_013207	ATC	2	6	54322	54327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_013207	GCC	3	9	54330	54338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_013207	GTTTT	2	10	54339	54348	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_013207	GCACAA	2	12	54394	54405	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	257793092
1049	NC_013207	AAG	2	6	54472	54477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793092
1050	NC_013207	CAA	2	6	54634	54639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793092
1051	NC_013207	CGAAG	2	10	54738	54747	40 %	0 %	40 %	20 %	257793092
1052	NC_013207	CGA	2	6	54753	54758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793092
1053	NC_013207	GTTG	2	8	54801	54808	0 %	50 %	50 %	0 %	257793092
1054	NC_013207	CAA	2	6	54838	54843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793092
1055	NC_013207	CTG	2	6	55024	55029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793093
1056	NC_013207	CG	4	8	55087	55094	0 %	0 %	50 %	50 %	257793093
1057	NC_013207	TGC	2	6	55313	55318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793093
1058	NC_013207	GAT	2	6	55321	55326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793093
1059	NC_013207	AAG	2	6	55344	55349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793093
1060	NC_013207	GAA	2	6	55355	55360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793093
1061	NC_013207	GAGG	2	8	55415	55422	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_013207	TGA	2	6	55458	55463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_013207	TCG	2	6	55499	55504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_013207	GCC	2	6	55536	55541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_013207	TGC	2	6	55703	55708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_013207	CGG	2	6	55716	55721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_013207	CTTT	2	8	55724	55731	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_013207	CAC	2	6	55740	55745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_013207	AC	3	6	55744	55749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_013207	GAG	2	6	55758	55763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_013207	TCT	2	6	55820	55825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793094
1072	NC_013207	GT	3	6	55861	55866	0 %	50 %	50 %	0 %	257793094
1073	NC_013207	GACG	2	8	55951	55958	25 %	0 %	50 %	25 %	257793094
1074	NC_013207	GAG	2	6	55960	55965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793094
1075	NC_013207	TGC	2	6	55991	55996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793094
1076	NC_013207	TCG	2	6	56006	56011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793094
1077	NC_013207	CG	3	6	56025	56030	0 %	0 %	50 %	50 %	257793094
1078	NC_013207	CG	3	6	56051	56056	0 %	0 %	50 %	50 %	257793094
1079	NC_013207	GCAACT	2	12	56115	56126	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257793094
1080	NC_013207	CGA	2	6	56181	56186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793094
1081	NC_013207	GAA	2	6	56234	56239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793094
1082	NC_013207	ACC	2	6	56317	56322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793095
1083	NC_013207	CGG	2	6	56372	56377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793095
1084	NC_013207	CAA	2	6	56380	56385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793095
1085	NC_013207	CTG	2	6	56386	56391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793095
1086	NC_013207	CGA	2	6	56640	56645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793095
1087	NC_013207	AGG	2	6	56744	56749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_013207	TTG	2	6	56780	56785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793096
1089	NC_013207	A	6	6	56860	56865	100 %	0 %	0 %	0 %	257793096
1090	NC_013207	ACAT	2	8	56879	56886	50 %	25 %	0 %	25 %	257793096
1091	NC_013207	AAG	2	6	56954	56959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793096
1092	NC_013207	CTT	2	6	56999	57004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793096
1093	NC_013207	GAA	2	6	57144	57149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793096
1094	NC_013207	AC	3	6	57199	57204	50 %	0 %	0 %	50 %	257793096
1095	NC_013207	TGG	3	9	57242	57250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793096
1096	NC_013207	TTCT	2	8	57290	57297	0 %	75 %	0 %	25 %	257793096
1097	NC_013207	GC	3	6	57375	57380	0 %	0 %	50 %	50 %	257793097
1098	NC_013207	GTG	2	6	57493	57498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793097
1099	NC_013207	ACA	2	6	57515	57520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793097
1100	NC_013207	CGA	2	6	57521	57526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793097
1101	NC_013207	CGT	2	6	57558	57563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793097
1102	NC_013207	CAA	2	6	57586	57591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793097
1103	NC_013207	AAC	2	6	57604	57609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793097
1104	NC_013207	CAG	2	6	57652	57657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793097
1105	NC_013207	GGA	2	6	57922	57927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793097
1106	NC_013207	CAC	2	6	58023	58028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793097
1107	NC_013207	CAC	2	6	58056	58061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793097
1108	NC_013207	TCC	2	6	58387	58392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793098
1109	NC_013207	ATG	2	6	58394	58399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793098
1110	NC_013207	GGC	2	6	58414	58419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793099
1111	NC_013207	GCG	2	6	58433	58438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793099
1112	NC_013207	GGC	2	6	58495	58500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793099
1113	NC_013207	GCCGC	2	10	58511	58520	0 %	0 %	40 %	60 %	257793099
1114	NC_013207	GCC	2	6	58564	58569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793099
1115	NC_013207	TCA	2	6	58704	58709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793099
1116	NC_013207	GGC	2	6	58711	58716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793099
1117	NC_013207	TCT	2	6	58776	58781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793099
1118	NC_013207	GCC	2	6	58791	58796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793099
1119	NC_013207	TCG	2	6	58881	58886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793099
1120	NC_013207	TGCC	2	8	58911	58918	0 %	25 %	25 %	50 %	257793099
1121	NC_013207	GCA	2	6	58921	58926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793099
1122	NC_013207	CTT	2	6	58937	58942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793099
1123	NC_013207	GTG	2	6	58949	58954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793099
1124	NC_013207	GAA	2	6	58963	58968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793099
1125	NC_013207	CG	3	6	58969	58974	0 %	0 %	50 %	50 %	257793099
1126	NC_013207	AAG	2	6	58999	59004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_013207	AGC	2	6	59039	59044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793100
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