MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_013205	GGC	2	6	1148777	1148782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511079
26003	NC_013205	ACG	2	6	1148839	1148844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511079
26004	NC_013205	GTCA	2	8	1148853	1148860	25 %	25 %	25 %	25 %	258511079
26005	NC_013205	GCT	2	6	1149006	1149011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511080
26006	NC_013205	GT	3	6	1149057	1149062	0 %	50 %	50 %	0 %	258511080
26007	NC_013205	CGT	2	6	1149099	1149104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511080
26008	NC_013205	TGA	2	6	1149134	1149139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511080
26009	NC_013205	CGTCG	2	10	1149160	1149169	0 %	20 %	40 %	40 %	258511080
26010	NC_013205	GCT	2	6	1149183	1149188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511080
26011	NC_013205	GAG	2	6	1149256	1149261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511080
26012	NC_013205	GA	3	6	1149301	1149306	50 %	0 %	50 %	0 %	258511080
26013	NC_013205	CGA	2	6	1149467	1149472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511081
26014	NC_013205	GCG	2	6	1149484	1149489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511081
26015	NC_013205	TGG	2	6	1149496	1149501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511081
26016	NC_013205	GTC	2	6	1149556	1149561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511082
26017	NC_013205	GTT	2	6	1149630	1149635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258511082
26018	NC_013205	TCGA	2	8	1149653	1149660	25 %	25 %	25 %	25 %	258511082
26019	NC_013205	GAC	2	6	1149721	1149726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511082
26020	NC_013205	GGA	2	6	1149814	1149819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26021	NC_013205	GTC	2	6	1149914	1149919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511083
26022	NC_013205	AGA	2	6	1149938	1149943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511083
26023	NC_013205	TGG	2	6	1149983	1149988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511083
26024	NC_013205	TCG	2	6	1150034	1150039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511083
26025	NC_013205	CGA	2	6	1150115	1150120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511083
26026	NC_013205	GCC	2	6	1150278	1150283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511084
26027	NC_013205	AC	3	6	1150284	1150289	50 %	0 %	0 %	50 %	258511084
26028	NC_013205	TGG	2	6	1150302	1150307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511084
26029	NC_013205	CGC	2	6	1150383	1150388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511084
26030	NC_013205	TGG	2	6	1150419	1150424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511084
26031	NC_013205	TCG	2	6	1150450	1150455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511084
26032	NC_013205	CCG	2	6	1150466	1150471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511084
26033	NC_013205	GCT	2	6	1150515	1150520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511084
26034	NC_013205	GCT	2	6	1150595	1150600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511084
26035	NC_013205	CCG	2	6	1150641	1150646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26036	NC_013205	GAC	2	6	1150692	1150697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26037	NC_013205	ATG	2	6	1150777	1150782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511085
26038	NC_013205	GTC	2	6	1150813	1150818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511085
26039	NC_013205	CGT	2	6	1150840	1150845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511085
26040	NC_013205	GGT	2	6	1150866	1150871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511085
26041	NC_013205	ATG	2	6	1150982	1150987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26042	NC_013205	GA	3	6	1150988	1150993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26043	NC_013205	CTA	2	6	1151023	1151028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26044	NC_013205	GAG	2	6	1151069	1151074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26045	NC_013205	GAAC	2	8	1151087	1151094	50 %	0 %	25 %	25 %	258511086
26046	NC_013205	TCA	2	6	1151109	1151114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511086
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26051	NC_013205	CGG	2	6	1151420	1151425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511087
26052	NC_013205	GCG	2	6	1151429	1151434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511087
26053	NC_013205	AC	3	6	1151543	1151548	50 %	0 %	0 %	50 %	258511087
26054	NC_013205	GA	3	6	1151553	1151558	50 %	0 %	50 %	0 %	258511087
26055	NC_013205	GTC	2	6	1151633	1151638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511087
26056	NC_013205	CTG	2	6	1151672	1151677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511087
26057	NC_013205	TTAGAA	2	12	1151742	1151753	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26058	NC_013205	GCG	2	6	1151853	1151858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511088
26059	NC_013205	ACGG	2	8	1151970	1151977	25 %	0 %	50 %	25 %	258511088
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26067	NC_013205	AG	3	6	1152331	1152336	50 %	0 %	50 %	0 %	258511088
26068	NC_013205	GA	3	6	1152337	1152342	50 %	0 %	50 %	0 %	258511088
26069	NC_013205	ACA	2	6	1152343	1152348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511088
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26080	NC_013205	GCGAT	2	10	1153010	1153019	20 %	20 %	40 %	20 %	258511090
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26082	NC_013205	TC	3	6	1153215	1153220	0 %	50 %	0 %	50 %	258511090
26083	NC_013205	GTAT	2	8	1153304	1153311	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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26085	NC_013205	AATA	2	8	1153325	1153332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26086	NC_013205	GGGA	2	8	1153345	1153352	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26087	NC_013205	CCA	2	6	1153435	1153440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511091
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26089	NC_013205	GC	3	6	1153556	1153561	0 %	0 %	50 %	50 %	258511091
26090	NC_013205	GGA	2	6	1153664	1153669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511091
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26094	NC_013205	TCGG	2	8	1153921	1153928	0 %	25 %	50 %	25 %	258511091
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26097	NC_013205	GGCG	2	8	1154219	1154226	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26098	NC_013205	ACC	2	6	1154260	1154265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26099	NC_013205	CT	3	6	1154283	1154288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26100	NC_013205	GGC	2	6	1154319	1154324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26101	NC_013205	ATG	2	6	1154350	1154355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511092
26102	NC_013205	TGCG	2	8	1154367	1154374	0 %	25 %	50 %	25 %	258511092
26103	NC_013205	CACG	2	8	1154385	1154392	25 %	0 %	25 %	50 %	258511092
26104	NC_013205	GCGG	2	8	1154415	1154422	0 %	0 %	75 %	25 %	258511092
26105	NC_013205	GAC	2	6	1154448	1154453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511092
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26109	NC_013205	TTA	2	6	1154539	1154544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26110	NC_013205	AAG	2	6	1154579	1154584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26111	NC_013205	CTG	2	6	1154665	1154670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26112	NC_013205	TC	3	6	1154718	1154723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26113	NC_013205	T	6	6	1154746	1154751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26114	NC_013205	A	6	6	1154800	1154805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26115	NC_013205	TCG	2	6	1154877	1154882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26116	NC_013205	TC	3	6	1154900	1154905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26117	NC_013205	CT	4	8	1155053	1155060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26118	NC_013205	TAT	2	6	1155086	1155091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26119	NC_013205	AAG	2	6	1155251	1155256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26120	NC_013205	GA	3	6	1155273	1155278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26121	NC_013205	ACCAA	2	10	1155294	1155303	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
26122	NC_013205	G	6	6	1155310	1155315	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26123	NC_013205	GAAT	2	8	1155361	1155368	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26124	NC_013205	AGC	2	6	1155446	1155451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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26127	NC_013205	GTTA	2	8	1155550	1155557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26128	NC_013205	GTG	2	6	1155576	1155581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26129	NC_013205	GAA	2	6	1155674	1155679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26130	NC_013205	TAC	2	6	1155682	1155687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26132	NC_013205	ATG	2	6	1155804	1155809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26133	NC_013205	GTG	3	9	1155814	1155822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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26224	NC_013205	CTC	2	6	1161487	1161492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26225	NC_013205	TC	3	6	1161559	1161564	0 %	50 %	0 %	50 %	258511097
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26231	NC_013205	CGCAC	2	10	1161812	1161821	20 %	0 %	20 %	60 %	258511097
26232	NC_013205	ACCA	2	8	1161885	1161892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26233	NC_013205	GAT	2	6	1161954	1161959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511098
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26237	NC_013205	AAC	2	6	1162111	1162116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511098
26238	NC_013205	TC	3	6	1162130	1162135	0 %	50 %	0 %	50 %	258511098
26239	NC_013205	GCC	2	6	1162173	1162178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511098
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26241	NC_013205	TCGT	2	8	1162362	1162369	0 %	50 %	25 %	25 %	258511099
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26265	NC_013205	GGTTC	2	10	1163768	1163777	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26266	NC_013205	GTCT	2	8	1163892	1163899	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26267	NC_013205	TCA	2	6	1163929	1163934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26268	NC_013205	T	6	6	1163972	1163977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26269	NC_013205	GCG	2	6	1163982	1163987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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26273	NC_013205	CGT	2	6	1164250	1164255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26274	NC_013205	CTT	2	6	1164337	1164342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26278	NC_013205	CGT	2	6	1164660	1164665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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26280	NC_013205	CCTT	2	8	1164689	1164696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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26326	NC_013205	GGGA	2	8	1167377	1167384	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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26346	NC_013205	GCCAAG	2	12	1168200	1168211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511103
26347	NC_013205	GCC	2	6	1168218	1168223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511103
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26350	NC_013205	GACG	2	8	1168352	1168359	25 %	0 %	50 %	25 %	258511103
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26355	NC_013205	CAT	2	6	1168745	1168750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511103
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26357	NC_013205	GACG	2	8	1168880	1168887	25 %	0 %	50 %	25 %	258511103
26358	NC_013205	GAT	2	6	1168914	1168919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511103
26359	NC_013205	TCG	2	6	1169104	1169109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511103
26360	NC_013205	CGA	2	6	1169129	1169134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511103
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26362	NC_013205	CGG	2	6	1169167	1169172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511103
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26364	NC_013205	GAT	2	6	1169285	1169290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511103
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26369	NC_013205	GGC	2	6	1169459	1169464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511103
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26377	NC_013205	CTG	2	6	1169727	1169732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511103
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26381	NC_013205	CA	3	6	1169797	1169802	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26382	NC_013205	AC	3	6	1169803	1169808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26383	NC_013205	GAC	2	6	1169810	1169815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26384	NC_013205	ACA	2	6	1169855	1169860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511104
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26389	NC_013205	TCC	2	6	1170181	1170186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511105
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26401	NC_013205	AGTT	2	8	1170550	1170557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26402	NC_013205	GAA	2	6	1170582	1170587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26424	NC_013205	CG	3	6	1171583	1171588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26425	NC_013205	TCG	2	6	1171590	1171595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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26428	NC_013205	AAG	2	6	1171679	1171684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26458	NC_013205	GGCT	2	8	1173290	1173297	0 %	25 %	50 %	25 %	258511110
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26465	NC_013205	GTC	2	6	1173602	1173607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511110
26466	NC_013205	CCG	2	6	1173628	1173633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511110
26467	NC_013205	CGT	2	6	1173783	1173788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26468	NC_013205	GTT	2	6	1173789	1173794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26469	NC_013205	ACA	2	6	1173806	1173811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26470	NC_013205	CGA	2	6	1173814	1173819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26471	NC_013205	T	7	7	1173834	1173840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26472	NC_013205	CCCT	2	8	1173844	1173851	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26473	NC_013205	CAG	2	6	1173898	1173903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26474	NC_013205	CGA	2	6	1174015	1174020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26475	NC_013205	CAA	2	6	1174064	1174069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511111
26476	NC_013205	ACA	2	6	1174078	1174083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511111
26477	NC_013205	CTT	2	6	1174095	1174100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511111
26478	NC_013205	CTT	2	6	1174131	1174136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511111
26479	NC_013205	GAC	2	6	1174138	1174143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511111
26480	NC_013205	CCAGCG	2	12	1174152	1174163	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258511111
26481	NC_013205	CAC	2	6	1174181	1174186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511111
26482	NC_013205	ACA	2	6	1174208	1174213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511111
26483	NC_013205	TGC	2	6	1174251	1174256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511111
26484	NC_013205	TCT	2	6	1174305	1174310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511111
26485	NC_013205	ATG	2	6	1174334	1174339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511111
26486	NC_013205	ATCG	2	8	1174405	1174412	25 %	25 %	25 %	25 %	258511111
26487	NC_013205	GCAA	2	8	1174433	1174440	50 %	0 %	25 %	25 %	258511111
26488	NC_013205	CAG	2	6	1174441	1174446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511111
26489	NC_013205	T	6	6	1174473	1174478	0 %	100 %	0 %	0 %	258511111
26490	NC_013205	GAT	2	6	1174561	1174566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511111
26491	NC_013205	ATG	2	6	1174607	1174612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511111
26492	NC_013205	CCG	2	6	1174629	1174634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511111
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26494	NC_013205	TCCT	2	8	1174722	1174729	0 %	50 %	0 %	50 %	258511112
26495	NC_013205	CGA	2	6	1174902	1174907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511112
26496	NC_013205	TTC	2	6	1174929	1174934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511112
26497	NC_013205	TTG	2	6	1174969	1174974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258511112
26498	NC_013205	CGA	2	6	1175001	1175006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511112
26499	NC_013205	GTCT	2	8	1175057	1175064	0 %	50 %	25 %	25 %	258511112
26500	NC_013205	CAA	2	6	1175092	1175097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511112

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