MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_013205	GCCA	2	8	1122779	1122786	25 %	0 %	25 %	50 %	258511049
25503	NC_013205	CG	4	8	1122849	1122856	0 %	0 %	50 %	50 %	258511049
25504	NC_013205	GAAA	2	8	1122897	1122904	75 %	0 %	25 %	0 %	258511049
25505	NC_013205	ATG	2	6	1122985	1122990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511049
25506	NC_013205	GAA	2	6	1123051	1123056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25507	NC_013205	GT	3	6	1123065	1123070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25508	NC_013205	GGC	2	6	1123075	1123080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25509	NC_013205	AGCG	2	8	1123082	1123089	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25510	NC_013205	A	6	6	1123103	1123108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25511	NC_013205	GGT	2	6	1123186	1123191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25512	NC_013205	TCG	2	6	1123212	1123217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25513	NC_013205	GAA	2	6	1123253	1123258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25514	NC_013205	GA	3	6	1123272	1123277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25515	NC_013205	AGC	2	6	1123355	1123360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511050
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25517	NC_013205	GAG	2	6	1123481	1123486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511050
25518	NC_013205	GC	3	6	1123516	1123521	0 %	0 %	50 %	50 %	258511050
25519	NC_013205	GCC	2	6	1123640	1123645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511050
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25522	NC_013205	GTG	2	6	1123781	1123786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511050
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25543	NC_013205	ACG	2	6	1124835	1124840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25544	NC_013205	GGA	2	6	1124845	1124850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25545	NC_013205	GCA	3	9	1124855	1124863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25546	NC_013205	GAG	2	6	1124972	1124977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25547	NC_013205	GT	3	6	1124978	1124983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25548	NC_013205	TCG	2	6	1125018	1125023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511051
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25553	NC_013205	GA	3	6	1125253	1125258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25554	NC_013205	CTG	2	6	1125274	1125279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25555	NC_013205	CGG	2	6	1125424	1125429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25556	NC_013205	CGTC	2	8	1125576	1125583	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25557	NC_013205	CGA	2	6	1125636	1125641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25558	NC_013205	ACC	2	6	1125698	1125703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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25560	NC_013205	CG	3	6	1125811	1125816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25561	NC_013205	CCT	2	6	1125831	1125836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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25563	NC_013205	CTT	2	6	1125873	1125878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25564	NC_013205	ACA	2	6	1125926	1125931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25565	NC_013205	GC	4	8	1125933	1125940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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25591	NC_013205	GA	3	6	1127268	1127273	50 %	0 %	50 %	0 %	258511052
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25605	NC_013205	CG	3	6	1127887	1127892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25606	NC_013205	GCC	2	6	1127986	1127991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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25609	NC_013205	GC	3	6	1128127	1128132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25610	NC_013205	TCC	2	6	1128174	1128179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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25621	NC_013205	CAT	2	6	1128761	1128766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511053
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25862	NC_013205	CGA	2	6	1141284	1141289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511071
25863	NC_013205	GAC	2	6	1141294	1141299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511071
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25993	NC_013205	GA	3	6	1148396	1148401	50 %	0 %	50 %	0 %	258511078
25994	NC_013205	GC	3	6	1148412	1148417	0 %	0 %	50 %	50 %	258511078
25995	NC_013205	GAA	2	6	1148448	1148453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511078
25996	NC_013205	GGT	2	6	1148513	1148518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511078
25997	NC_013205	TG	3	6	1148549	1148554	0 %	50 %	50 %	0 %	258511078
25998	NC_013205	GAT	2	6	1148565	1148570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511078
25999	NC_013205	CATCTG	2	12	1148574	1148585	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258511078
26000	NC_013205	GTG	2	6	1148637	1148642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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