MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_013205	CGC	2	6	1099709	1099714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511023
25003	NC_013205	GCTC	2	8	1099728	1099735	0 %	25 %	25 %	50 %	258511023
25004	NC_013205	CG	4	8	1099818	1099825	0 %	0 %	50 %	50 %	258511023
25005	NC_013205	GACGG	2	10	1099836	1099845	20 %	0 %	60 %	20 %	258511023
25006	NC_013205	CG	3	6	1099866	1099871	0 %	0 %	50 %	50 %	258511023
25007	NC_013205	AGC	2	6	1099880	1099885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511023
25008	NC_013205	GCG	2	6	1099893	1099898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511023
25009	NC_013205	CGC	2	6	1099920	1099925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511023
25010	NC_013205	CGT	2	6	1100013	1100018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511023
25011	NC_013205	GCGG	2	8	1100023	1100030	0 %	0 %	75 %	25 %	258511023
25012	NC_013205	CG	4	8	1100127	1100134	0 %	0 %	50 %	50 %	258511023
25013	NC_013205	GGC	2	6	1100200	1100205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511024
25014	NC_013205	TCGT	2	8	1100231	1100238	0 %	50 %	25 %	25 %	258511024
25015	NC_013205	TGG	2	6	1100248	1100253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511024
25016	NC_013205	CCG	2	6	1100254	1100259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511024
25017	NC_013205	GCTC	2	8	1100267	1100274	0 %	25 %	25 %	50 %	258511024
25018	NC_013205	AG	3	6	1100310	1100315	50 %	0 %	50 %	0 %	258511024
25019	NC_013205	GC	3	6	1100372	1100377	0 %	0 %	50 %	50 %	258511024
25020	NC_013205	CG	3	6	1100432	1100437	0 %	0 %	50 %	50 %	258511024
25021	NC_013205	TCG	2	6	1100442	1100447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511024
25022	NC_013205	GAT	2	6	1100453	1100458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511024
25023	NC_013205	TCC	3	9	1100472	1100480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511024
25024	NC_013205	CAGTTC	2	12	1100483	1100494	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258511024
25025	NC_013205	CG	3	6	1100500	1100505	0 %	0 %	50 %	50 %	258511024
25026	NC_013205	GGC	2	6	1100528	1100533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511024
25027	NC_013205	GCC	2	6	1100555	1100560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511024
25028	NC_013205	TGA	2	6	1100566	1100571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511024
25029	NC_013205	TGA	2	6	1100623	1100628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511024
25030	NC_013205	GAG	2	6	1100666	1100671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511024
25031	NC_013205	CG	4	8	1100686	1100693	0 %	0 %	50 %	50 %	258511024
25032	NC_013205	GAC	2	6	1100723	1100728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511024
25033	NC_013205	C	6	6	1100864	1100869	0 %	0 %	0 %	100 %	258511024
25034	NC_013205	CGA	2	6	1100909	1100914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511024
25035	NC_013205	GGC	2	6	1100950	1100955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511024
25036	NC_013205	GC	4	8	1100975	1100982	0 %	0 %	50 %	50 %	258511024
25037	NC_013205	CAC	3	9	1100993	1101001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511024
25038	NC_013205	CTG	2	6	1101043	1101048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511024
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25040	NC_013205	CCG	2	6	1101161	1101166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511024
25041	NC_013205	TCG	2	6	1101262	1101267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511024
25042	NC_013205	ATCACA	2	12	1101318	1101329	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	258511024
25043	NC_013205	CAT	2	6	1101350	1101355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511024
25044	NC_013205	GGC	2	6	1101410	1101415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511024
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25046	NC_013205	CAC	2	6	1101512	1101517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511024
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25051	NC_013205	GGC	2	6	1101755	1101760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511025
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25053	NC_013205	CG	3	6	1101819	1101824	0 %	0 %	50 %	50 %	258511025
25054	NC_013205	CG	3	6	1101853	1101858	0 %	0 %	50 %	50 %	258511025
25055	NC_013205	ACC	2	6	1101899	1101904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511025
25056	NC_013205	GGC	2	6	1101945	1101950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511025
25057	NC_013205	CCT	2	6	1101994	1101999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25058	NC_013205	TTACG	2	10	1102007	1102016	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25059	NC_013205	TCCG	2	8	1102022	1102029	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25060	NC_013205	GAA	2	6	1102067	1102072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511026
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25068	NC_013205	GC	3	6	1102619	1102624	0 %	0 %	50 %	50 %	258511026
25069	NC_013205	GGC	2	6	1102627	1102632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511026
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25071	NC_013205	CG	3	6	1102664	1102669	0 %	0 %	50 %	50 %	258511026
25072	NC_013205	CGC	2	6	1102728	1102733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511026
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25079	NC_013205	GAG	2	6	1102921	1102926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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25084	NC_013205	TGG	2	6	1103194	1103199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511027
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25089	NC_013205	TGA	2	6	1103440	1103445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511027
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25095	NC_013205	GAG	2	6	1103808	1103813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511027
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25101	NC_013205	T	7	7	1104185	1104191	0 %	100 %	0 %	0 %	258511028
25102	NC_013205	GGC	2	6	1104211	1104216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511028
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25104	NC_013205	TCA	2	6	1104240	1104245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511028
25105	NC_013205	CCG	2	6	1104338	1104343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511028
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25110	NC_013205	CAC	2	6	1104688	1104693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511028
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25112	NC_013205	GC	3	6	1104725	1104730	0 %	0 %	50 %	50 %	258511028
25113	NC_013205	ACG	2	6	1104780	1104785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511028
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25115	NC_013205	GAAG	2	8	1104823	1104830	50 %	0 %	50 %	0 %	258511028
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25118	NC_013205	GCC	2	6	1104962	1104967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511028
25119	NC_013205	CGTC	2	8	1104978	1104985	0 %	25 %	25 %	50 %	258511028
25120	NC_013205	GCCG	2	8	1105000	1105007	0 %	0 %	50 %	50 %	258511028
25121	NC_013205	GC	3	6	1105062	1105067	0 %	0 %	50 %	50 %	258511028
25122	NC_013205	CCG	2	6	1105074	1105079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511028
25123	NC_013205	TTC	2	6	1105109	1105114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511028
25124	NC_013205	CTTC	2	8	1105127	1105134	0 %	50 %	0 %	50 %	258511028
25125	NC_013205	GTC	2	6	1105141	1105146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511028
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25149	NC_013205	CGCTT	2	10	1106175	1106184	0 %	40 %	20 %	40 %	258511029
25150	NC_013205	TGG	2	6	1106228	1106233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25151	NC_013205	GTA	2	6	1106281	1106286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511030
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25193	NC_013205	CG	4	8	1108069	1108076	0 %	0 %	50 %	50 %	258511032
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25200	NC_013205	GAC	2	6	1108357	1108362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511032
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25215	NC_013205	GTC	2	6	1109030	1109035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511032
25216	NC_013205	TCCG	2	8	1109045	1109052	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25217	NC_013205	CG	3	6	1109055	1109060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25218	NC_013205	AGG	2	6	1109062	1109067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25219	NC_013205	CGG	2	6	1109112	1109117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511033
25220	NC_013205	GAC	2	6	1109192	1109197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511033
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25222	NC_013205	TC	3	6	1109344	1109349	0 %	50 %	0 %	50 %	258511033
25223	NC_013205	CGGA	2	8	1109355	1109362	25 %	0 %	50 %	25 %	258511033
25224	NC_013205	ACG	2	6	1109379	1109384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511033
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25226	NC_013205	ACG	2	6	1109435	1109440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511033
25227	NC_013205	GATC	2	8	1109446	1109453	25 %	25 %	25 %	25 %	258511033
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25230	NC_013205	GTC	2	6	1109653	1109658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511034
25231	NC_013205	GGA	2	6	1109662	1109667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511034
25232	NC_013205	GGC	2	6	1109693	1109698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511034
25233	NC_013205	GTG	2	6	1109750	1109755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511034
25234	NC_013205	GCA	2	6	1109761	1109766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511034
25235	NC_013205	AG	3	6	1109791	1109796	50 %	0 %	50 %	0 %	258511034
25236	NC_013205	CGA	2	6	1109833	1109838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511034
25237	NC_013205	CAA	2	6	1109863	1109868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511034
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25239	NC_013205	TCGG	2	8	1109979	1109986	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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25353	NC_013205	CGG	2	6	1115192	1115197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511042
25354	NC_013205	GCC	2	6	1115198	1115203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511042
25355	NC_013205	GAC	2	6	1115277	1115282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511042
25356	NC_013205	ACG	2	6	1115363	1115368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511042
25357	NC_013205	CG	3	6	1115388	1115393	0 %	0 %	50 %	50 %	258511042
25358	NC_013205	CG	3	6	1115417	1115422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25359	NC_013205	CGGCG	2	10	1115424	1115433	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25360	NC_013205	CAA	2	6	1115443	1115448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25378	NC_013205	TCAT	2	8	1116335	1116342	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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25382	NC_013205	CGA	2	6	1116604	1116609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511044
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25392	NC_013205	CGA	2	6	1117258	1117263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511044
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25409	NC_013205	TCAC	2	8	1118117	1118124	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25410	NC_013205	A	6	6	1118126	1118131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25411	NC_013205	TCC	2	6	1118144	1118149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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25431	NC_013205	CCTT	2	8	1119488	1119495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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25474	NC_013205	ATCG	2	8	1121569	1121576	25 %	25 %	25 %	25 %	258511048
25475	NC_013205	TAGGC	2	10	1121592	1121601	20 %	20 %	40 %	20 %	258511048
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25477	NC_013205	CCCG	2	8	1121673	1121680	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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